FuNGI

A0A1J9QYM0

Protein Details

Accession

A0A1J9QYM0

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
792-811	VANCHTSRRSHRPRDLPPGL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 14, cyto 6, pero 4, cyto_mito 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR016197 Chromo-like_dom_sf IPR000953 Chromo/chromo_shadow_dom IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR041588 Integrase_H2C2 IPR043128 Rev_trsase/Diguanyl_cyclase IPR012337 RNaseH-like_sf IPR000477 RT_dom IPR041373 RT_RNaseH
Pfam	View protein in Pfam PF17921 Integrase_H2C2 PF17917 RT_RNaseH PF00078 RVT_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50013 CHROMO_2
CDD	cd00024 CD_CSD cd09274 RNase_HI_RT_Ty3 cd01647 RT_LTR

Amino Acid Sequences

MEESTPIATHFIRLDLEIGGRRIRNQPFVILHLGKNELIVGRRWLEVHDIWLDVLNRRLLWPSDREHKAQQNPVPDEAGEPLIQSGREITILRRDLEPPKANRSHQADVACRERLFDEEDKELGQPTQPRIHTAAAPPVLTLFPYWKRTEKKDQTISLRSMKQALPDRVVYKSQTPEKKDMGRATHDTTPGRLDIAMIGAVGMKHNLHSESCEVFSSTIYELDHMLELKSGRQERDSEREQQEAELEKALDQKASDQLAPVKEEARLKIELAAPNNLSFSPLYKHTYEELKEMKRYLVDNLDKGFITPSTAPFAAPILFARKVNGGLRFCVDYRQLNAITKKDQYPLPLIDELLQRVSAAKVFTKIDIRQAFHKIRIDLESEDLTTFRTRYGSYKYCVVPFGLTNGPAVFQHCAGMAERSWIAGRPVKKTEFHVKRTKYLGFVVTTEGIEVDPDKTAAVRTRSVPSTVQGVQSFLGFCNYYRRFIRDYGRIARPLNQLTRKDTNFDFNATCMDAFIKLKKALLSAPILYHYNPNRRTKIESDTSDGVVAGVLSQLQDDNFWHPIAYYSKSMLPAESNYAIHDKELLAIVSCMKEWRCELQGLQTTYPIEVYSDHKSLEYFMTKRQLNMRQAGWAEYLSRFVFVIMYRTGKSNRLADALSRQEDVLGEQRAGREEYRKQIILATDRLSPEVQADVGHIQAELSAMDPGLTVVDQILRQSRDDPELEKYREEARTNREGPWNLCQGLLLCHNRLLLDEVHKQPLMAHPGKAKIRRLVMERYYWKRMGLDIDQYVANCHTSRRSHRPRDLPPGLLKPLPIPQRPWQHISMDFMSFTEDRHGYDTVYVIVDRLGKRSRSIPCTRKATAKDMARLFITYQSMGYQRPLYLTEAPNLSPISGTSYIEQGFQPRLSFDWQDHSGKTLPLKEKINRQDAEKYARRMQEDTGRPAKKLDFLMAGPWPITEKVGNSYRVQLPASVKVHPIFSPDKLRRDPNKPLPGQVPDSPPPIEVVGELEYDVDEVIAVRTRRGKLQYQVQWTGYDDALSGILQQISGIVLLPCVASMSCIHLNPVHHGT

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.17
2	0.15
3	0.19
4	0.2
5	0.22
6	0.25
7	0.25
8	0.29
9	0.36
10	0.4
11	0.44
12	0.42
13	0.47
14	0.45
15	0.48
16	0.52
17	0.47
18	0.43
19	0.39
20	0.4
21	0.32
22	0.29
23	0.27
24	0.21
25	0.2
26	0.21
27	0.22
28	0.21
29	0.23
30	0.23
31	0.23
32	0.26
33	0.25
34	0.26
35	0.23
36	0.22
37	0.21
38	0.24
39	0.25
40	0.21
41	0.24
42	0.23
43	0.21
44	0.22
45	0.25
46	0.24
47	0.28
48	0.31
49	0.33
50	0.41
51	0.46
52	0.49
53	0.54
54	0.61
55	0.64
56	0.68
57	0.66
58	0.66
59	0.65
60	0.62
61	0.55
62	0.46
63	0.39
64	0.32
65	0.3
66	0.19
67	0.16
68	0.14
69	0.14
70	0.14
71	0.13
72	0.12
73	0.1
74	0.13
75	0.14
76	0.15
77	0.23
78	0.26
79	0.27
80	0.28
81	0.32
82	0.35
83	0.44
84	0.5
85	0.46
86	0.53
87	0.58
88	0.58
89	0.63
90	0.65
91	0.6
92	0.57
93	0.58
94	0.54
95	0.53
96	0.56
97	0.52
98	0.44
99	0.4
100	0.36
101	0.32
102	0.31
103	0.3
104	0.29
105	0.27
106	0.28
107	0.28
108	0.27
109	0.26
110	0.21
111	0.21
112	0.22
113	0.24
114	0.31
115	0.31
116	0.34
117	0.36
118	0.38
119	0.38
120	0.36
121	0.39
122	0.34
123	0.33
124	0.29
125	0.27
126	0.24
127	0.21
128	0.18
129	0.16
130	0.2
131	0.25
132	0.29
133	0.36
134	0.42
135	0.5
136	0.6
137	0.64
138	0.69
139	0.73
140	0.77
141	0.77
142	0.78
143	0.76
144	0.73
145	0.66
146	0.57
147	0.53
148	0.46
149	0.45
150	0.47
151	0.46
152	0.42
153	0.43
154	0.43
155	0.42
156	0.44
157	0.39
158	0.35
159	0.39
160	0.43
161	0.47
162	0.51
163	0.54
164	0.58
165	0.62
166	0.64
167	0.62
168	0.59
169	0.58
170	0.57
171	0.55
172	0.54
173	0.52
174	0.46
175	0.4
176	0.37
177	0.31
178	0.27
179	0.21
180	0.16
181	0.12
182	0.12
183	0.1
184	0.07
185	0.07
186	0.06
187	0.07
188	0.07
189	0.07
190	0.06
191	0.07
192	0.09
193	0.11
194	0.1
195	0.13
196	0.16
197	0.17
198	0.18
199	0.18
200	0.17
201	0.16
202	0.16
203	0.16
204	0.13
205	0.12
206	0.11
207	0.11
208	0.11
209	0.11
210	0.12
211	0.1
212	0.1
213	0.1
214	0.1
215	0.12
216	0.19
217	0.21
218	0.22
219	0.24
220	0.29
221	0.33
222	0.4
223	0.42
224	0.44
225	0.44
226	0.46
227	0.44
228	0.39
229	0.38
230	0.33
231	0.3
232	0.22
233	0.19
234	0.17
235	0.21
236	0.2
237	0.17
238	0.14
239	0.15
240	0.17
241	0.19
242	0.18
243	0.16
244	0.21
245	0.22
246	0.24
247	0.22
248	0.19
249	0.2
250	0.24
251	0.23
252	0.23
253	0.21
254	0.2
255	0.23
256	0.27
257	0.27
258	0.26
259	0.28
260	0.25
261	0.25
262	0.25
263	0.21
264	0.18
265	0.14
266	0.14
267	0.13
268	0.15
269	0.19
270	0.18
271	0.21
272	0.22
273	0.28
274	0.28
275	0.32
276	0.35
277	0.36
278	0.38
279	0.37
280	0.35
281	0.32
282	0.31
283	0.28
284	0.3
285	0.29
286	0.29
287	0.3
288	0.3
289	0.27
290	0.26
291	0.24
292	0.15
293	0.15
294	0.13
295	0.13
296	0.15
297	0.16
298	0.15
299	0.15
300	0.16
301	0.13
302	0.12
303	0.12
304	0.12
305	0.14
306	0.14
307	0.15
308	0.15
309	0.18
310	0.21
311	0.26
312	0.23
313	0.23
314	0.25
315	0.25
316	0.24
317	0.25
318	0.24
319	0.2
320	0.21
321	0.25
322	0.25
323	0.28
324	0.32
325	0.32
326	0.32
327	0.33
328	0.33
329	0.31
330	0.3
331	0.28
332	0.29
333	0.28
334	0.28
335	0.25
336	0.24
337	0.23
338	0.23
339	0.21
340	0.17
341	0.15
342	0.11
343	0.11
344	0.11
345	0.1
346	0.09
347	0.09
348	0.12
349	0.13
350	0.15
351	0.19
352	0.19
353	0.26
354	0.29
355	0.3
356	0.31
357	0.39
358	0.39
359	0.39
360	0.43
361	0.35
362	0.32
363	0.33
364	0.31
365	0.24
366	0.24
367	0.2
368	0.16
369	0.16
370	0.14
371	0.13
372	0.11
373	0.11
374	0.09
375	0.09
376	0.1
377	0.13
378	0.21
379	0.23
380	0.24
381	0.3
382	0.31
383	0.31
384	0.31
385	0.29
386	0.22
387	0.18
388	0.2
389	0.15
390	0.14
391	0.13
392	0.12
393	0.12
394	0.11
395	0.12
396	0.09
397	0.08
398	0.08
399	0.08
400	0.08
401	0.08
402	0.1
403	0.08
404	0.09
405	0.09
406	0.09
407	0.09
408	0.09
409	0.11
410	0.14
411	0.17
412	0.19
413	0.24
414	0.27
415	0.28
416	0.33
417	0.41
418	0.45
419	0.5
420	0.55
421	0.53
422	0.55
423	0.58
424	0.55
425	0.46
426	0.4
427	0.35
428	0.27
429	0.25
430	0.22
431	0.17
432	0.16
433	0.13
434	0.11
435	0.08
436	0.07
437	0.07
438	0.05
439	0.05
440	0.05
441	0.05
442	0.05
443	0.06
444	0.1
445	0.12
446	0.14
447	0.16
448	0.2
449	0.21
450	0.23
451	0.22
452	0.19
453	0.21
454	0.21
455	0.21
456	0.18
457	0.17
458	0.16
459	0.15
460	0.15
461	0.1
462	0.1
463	0.07
464	0.07
465	0.16
466	0.17
467	0.21
468	0.22
469	0.25
470	0.26
471	0.3
472	0.36
473	0.33
474	0.38
475	0.41
476	0.43
477	0.44
478	0.42
479	0.44
480	0.42
481	0.39
482	0.4
483	0.4
484	0.38
485	0.41
486	0.46
487	0.41
488	0.39
489	0.36
490	0.35
491	0.29
492	0.29
493	0.24
494	0.17
495	0.18
496	0.15
497	0.14
498	0.09
499	0.08
500	0.07
501	0.08
502	0.09
503	0.11
504	0.11
505	0.12
506	0.13
507	0.13
508	0.13
509	0.14
510	0.15
511	0.12
512	0.12
513	0.13
514	0.13
515	0.13
516	0.18
517	0.19
518	0.26
519	0.31
520	0.37
521	0.38
522	0.39
523	0.43
524	0.41
525	0.43
526	0.42
527	0.37
528	0.36
529	0.35
530	0.33
531	0.29
532	0.25
533	0.19
534	0.12
535	0.09
536	0.05
537	0.03
538	0.03
539	0.03
540	0.03
541	0.03
542	0.03
543	0.04
544	0.04
545	0.07
546	0.08
547	0.08
548	0.08
549	0.08
550	0.1
551	0.12
552	0.14
553	0.13
554	0.13
555	0.15
556	0.17
557	0.17
558	0.15
559	0.13
560	0.12
561	0.14
562	0.14
563	0.12
564	0.12
565	0.13
566	0.13
567	0.12
568	0.12
569	0.08
570	0.08
571	0.08
572	0.07
573	0.06
574	0.06
575	0.07
576	0.06
577	0.06
578	0.07
579	0.07
580	0.08
581	0.09
582	0.12
583	0.13
584	0.14
585	0.14
586	0.2
587	0.25
588	0.26
589	0.25
590	0.24
591	0.22
592	0.21
593	0.21
594	0.14
595	0.08
596	0.08
597	0.11
598	0.14
599	0.14
600	0.14
601	0.14
602	0.14
603	0.15
604	0.17
605	0.18
606	0.15
607	0.17
608	0.24
609	0.24
610	0.26
611	0.32
612	0.37
613	0.37
614	0.4
615	0.38
616	0.34
617	0.34
618	0.34
619	0.28
620	0.2
621	0.17
622	0.13
623	0.15
624	0.11
625	0.11
626	0.09
627	0.09
628	0.1
629	0.08
630	0.11
631	0.1
632	0.12
633	0.12
634	0.15
635	0.17
636	0.19
637	0.22
638	0.22
639	0.22
640	0.22
641	0.21
642	0.2
643	0.25
644	0.25
645	0.24
646	0.21
647	0.2
648	0.18
649	0.18
650	0.18
651	0.16
652	0.13
653	0.12
654	0.12
655	0.13
656	0.15
657	0.16
658	0.16
659	0.16
660	0.19
661	0.25
662	0.28
663	0.28
664	0.27
665	0.28
666	0.3
667	0.29
668	0.28
669	0.24
670	0.22
671	0.22
672	0.23
673	0.21
674	0.17
675	0.14
676	0.12
677	0.1
678	0.07
679	0.08
680	0.07
681	0.07
682	0.07
683	0.06
684	0.06
685	0.05
686	0.06
687	0.04
688	0.04
689	0.04
690	0.04
691	0.04
692	0.04
693	0.04
694	0.04
695	0.04
696	0.03
697	0.03
698	0.05
699	0.05
700	0.07
701	0.11
702	0.12
703	0.13
704	0.15
705	0.17
706	0.19
707	0.21
708	0.22
709	0.24
710	0.31
711	0.32
712	0.3
713	0.3
714	0.32
715	0.36
716	0.36
717	0.35
718	0.33
719	0.41
720	0.42
721	0.44
722	0.45
723	0.44
724	0.44
725	0.44
726	0.42
727	0.34
728	0.32
729	0.28
730	0.22
731	0.21
732	0.25
733	0.22
734	0.19
735	0.19
736	0.2
737	0.19
738	0.19
739	0.19
740	0.15
741	0.18
742	0.24
743	0.25
744	0.28
745	0.28
746	0.27
747	0.26
748	0.28
749	0.31
750	0.26
751	0.27
752	0.27
753	0.34
754	0.4
755	0.45
756	0.45
757	0.42
758	0.45
759	0.47
760	0.48
761	0.5
762	0.47
763	0.5
764	0.54
765	0.55
766	0.56
767	0.52
768	0.49
769	0.41
770	0.39
771	0.35
772	0.3
773	0.29
774	0.24
775	0.24
776	0.24
777	0.23
778	0.22
779	0.18
780	0.16
781	0.11
782	0.12
783	0.16
784	0.22
785	0.31
786	0.41
787	0.51
788	0.59
789	0.68
790	0.77
791	0.79
792	0.83
793	0.79
794	0.74
795	0.69
796	0.65
797	0.59
798	0.51
799	0.43
800	0.34
801	0.37
802	0.38
803	0.35
804	0.34
805	0.39
806	0.49
807	0.53
808	0.55
809	0.51
810	0.48
811	0.47
812	0.47
813	0.42
814	0.33
815	0.28
816	0.24
817	0.24
818	0.2
819	0.18
820	0.18
821	0.15
822	0.15
823	0.18
824	0.19
825	0.15
826	0.16
827	0.16
828	0.12
829	0.13
830	0.12
831	0.09
832	0.1
833	0.15
834	0.14
835	0.19
836	0.23
837	0.23
838	0.26
839	0.33
840	0.39
841	0.43
842	0.53
843	0.55
844	0.59
845	0.65
846	0.66
847	0.67
848	0.64
849	0.62
850	0.6
851	0.59
852	0.58
853	0.52
854	0.52
855	0.44
856	0.4
857	0.35
858	0.31
859	0.26
860	0.19
861	0.17
862	0.17
863	0.18
864	0.18
865	0.2
866	0.18
867	0.16
868	0.17
869	0.19
870	0.2
871	0.25
872	0.26
873	0.27
874	0.27
875	0.26
876	0.28
877	0.26
878	0.22
879	0.16
880	0.14
881	0.17
882	0.16
883	0.17
884	0.15
885	0.18
886	0.18
887	0.2
888	0.2
889	0.17
890	0.18
891	0.19
892	0.18
893	0.16
894	0.18
895	0.21
896	0.22
897	0.21
898	0.25
899	0.28
900	0.31
901	0.3
902	0.32
903	0.3
904	0.3
905	0.33
906	0.34
907	0.35
908	0.38
909	0.45
910	0.47
911	0.55
912	0.62
913	0.67
914	0.6
915	0.6
916	0.62
917	0.6
918	0.64
919	0.61
920	0.59
921	0.57
922	0.6
923	0.58
924	0.52
925	0.51
926	0.51
927	0.51
928	0.53
929	0.56
930	0.53
931	0.5
932	0.52
933	0.49
934	0.44
935	0.39
936	0.35
937	0.28
938	0.27
939	0.3
940	0.29
941	0.28
942	0.22
943	0.2
944	0.19
945	0.16
946	0.17
947	0.14
948	0.14
949	0.2
950	0.26
951	0.29
952	0.29
953	0.35
954	0.37
955	0.38
956	0.37
957	0.35
958	0.33
959	0.39
960	0.39
961	0.35
962	0.35
963	0.33
964	0.35
965	0.3
966	0.32
967	0.27
968	0.3
969	0.39
970	0.42
971	0.49
972	0.53
973	0.62
974	0.66
975	0.7
976	0.75
977	0.75
978	0.79
979	0.73
980	0.73
981	0.7
982	0.67
983	0.65
984	0.6
985	0.56
986	0.5
987	0.51
988	0.46
989	0.39
990	0.35
991	0.3
992	0.24
993	0.17
994	0.16
995	0.13
996	0.13
997	0.12
998	0.11
999	0.1
1000	0.1
1001	0.09
1002	0.06
1003	0.04
1004	0.05
1005	0.06
1006	0.11
1007	0.12
1008	0.15
1009	0.22
1010	0.25
1011	0.32
1012	0.37
1013	0.44
1014	0.47
1015	0.57
1016	0.62
1017	0.64
1018	0.69
1019	0.63
1020	0.6
1021	0.55
1022	0.49
1023	0.39
1024	0.3
1025	0.22
1026	0.16
1027	0.15
1028	0.13
1029	0.1
1030	0.09
1031	0.09
1032	0.09
1033	0.08
1034	0.08
1035	0.07
1036	0.08
1037	0.08
1038	0.06
1039	0.06
1040	0.06
1041	0.07
1042	0.06
1043	0.07
1044	0.06
1045	0.07
1046	0.08
1047	0.14
1048	0.18
1049	0.18
1050	0.21
1051	0.24
1052	0.26

A0A1J9QYM0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer