Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q7SBC3

Protein Details
Accession Q7SBC3    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
426-448KKYLEKEREREAKRQTKKMTTRABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
407-415KQRKAKRDA
421-443DAKAQKKYLEKEREREAKRQTKK
Subcellular Location(s) cyto 11.5, cyto_nucl 10.5, nucl 8.5, E.R. 3, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012879  CCDC47  
Gene Ontology GO:0005783  C:endoplasmic reticulum  
GO:0016020  C:membrane  
GO:0005509  F:calcium ion binding  
GO:0032469  P:endoplasmic reticulum calcium ion homeostasis  
KEGG ncr:NCU06200  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF07946  CCDC47  
Amino Acid Sequences MANVINNLFGGAKPASVIPDKSGDSDFADFAEGADPSPIPISPITTTLAGAQPEKTAVPYTKWYNVHERHSLSEFKAEGFILAAIIVVLILHLFGARLNRSKAKKWIRAHASTLGSEFALVGFSGVPRALSDKSGDELTQALADANAQKGDAILKEKSLFEFATYATGRVNVAFVDVKLTLVKRFNPFVTLAENVIGFFWDSYAQPSDSVEATLYPFDGKEALTVPAMPGAAELRQNDKKSTFDGFVWAIVHKESMKQVRDERYDVSLTYTKDNNKLPQWLTVMTESAEITDALLTPELIKAAESAGDLLEYLIVSDQPLDKPKTVEETNPRKRIFLKYRLPSDNNYEPLLPIFQYFLRMTDQLVQVAHFRPEVLRKVKSVRDEMIKGIQKANEQEKAEELAIEREKQRKAKRDAELAAMDAKAQKKYLEKEREREAKRQTKKMTTRA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.16
3 0.19
4 0.21
5 0.19
6 0.24
7 0.25
8 0.27
9 0.27
10 0.25
11 0.25
12 0.25
13 0.22
14 0.18
15 0.18
16 0.15
17 0.14
18 0.15
19 0.11
20 0.1
21 0.11
22 0.1
23 0.09
24 0.1
25 0.1
26 0.1
27 0.1
28 0.13
29 0.13
30 0.15
31 0.17
32 0.16
33 0.17
34 0.17
35 0.2
36 0.19
37 0.19
38 0.18
39 0.16
40 0.17
41 0.17
42 0.16
43 0.17
44 0.18
45 0.2
46 0.26
47 0.3
48 0.37
49 0.4
50 0.43
51 0.49
52 0.53
53 0.56
54 0.56
55 0.54
56 0.5
57 0.51
58 0.51
59 0.42
60 0.41
61 0.35
62 0.29
63 0.28
64 0.23
65 0.19
66 0.15
67 0.14
68 0.08
69 0.07
70 0.06
71 0.04
72 0.04
73 0.03
74 0.02
75 0.02
76 0.02
77 0.02
78 0.02
79 0.02
80 0.02
81 0.04
82 0.08
83 0.11
84 0.16
85 0.2
86 0.28
87 0.33
88 0.39
89 0.48
90 0.55
91 0.62
92 0.64
93 0.7
94 0.7
95 0.71
96 0.69
97 0.66
98 0.59
99 0.5
100 0.45
101 0.35
102 0.26
103 0.21
104 0.17
105 0.09
106 0.06
107 0.05
108 0.05
109 0.04
110 0.04
111 0.05
112 0.05
113 0.05
114 0.05
115 0.08
116 0.09
117 0.1
118 0.12
119 0.12
120 0.14
121 0.15
122 0.14
123 0.12
124 0.12
125 0.11
126 0.09
127 0.08
128 0.06
129 0.05
130 0.06
131 0.07
132 0.07
133 0.07
134 0.06
135 0.06
136 0.06
137 0.08
138 0.09
139 0.11
140 0.11
141 0.12
142 0.14
143 0.15
144 0.15
145 0.16
146 0.14
147 0.12
148 0.12
149 0.11
150 0.15
151 0.15
152 0.14
153 0.12
154 0.13
155 0.12
156 0.11
157 0.11
158 0.05
159 0.07
160 0.07
161 0.07
162 0.08
163 0.08
164 0.09
165 0.1
166 0.11
167 0.12
168 0.14
169 0.18
170 0.18
171 0.21
172 0.21
173 0.22
174 0.22
175 0.2
176 0.21
177 0.18
178 0.15
179 0.13
180 0.13
181 0.1
182 0.09
183 0.08
184 0.05
185 0.04
186 0.04
187 0.04
188 0.05
189 0.06
190 0.08
191 0.08
192 0.08
193 0.09
194 0.1
195 0.09
196 0.09
197 0.07
198 0.06
199 0.07
200 0.06
201 0.06
202 0.05
203 0.05
204 0.05
205 0.05
206 0.05
207 0.05
208 0.06
209 0.07
210 0.07
211 0.07
212 0.07
213 0.07
214 0.07
215 0.06
216 0.05
217 0.05
218 0.06
219 0.08
220 0.08
221 0.13
222 0.18
223 0.19
224 0.21
225 0.22
226 0.22
227 0.22
228 0.24
229 0.2
230 0.16
231 0.17
232 0.16
233 0.16
234 0.15
235 0.13
236 0.11
237 0.09
238 0.1
239 0.07
240 0.09
241 0.12
242 0.17
243 0.19
244 0.22
245 0.28
246 0.34
247 0.37
248 0.37
249 0.35
250 0.32
251 0.31
252 0.27
253 0.26
254 0.23
255 0.21
256 0.22
257 0.24
258 0.23
259 0.28
260 0.31
261 0.31
262 0.3
263 0.34
264 0.32
265 0.33
266 0.33
267 0.29
268 0.27
269 0.24
270 0.22
271 0.16
272 0.16
273 0.11
274 0.1
275 0.09
276 0.07
277 0.06
278 0.06
279 0.06
280 0.05
281 0.05
282 0.05
283 0.05
284 0.05
285 0.05
286 0.05
287 0.05
288 0.05
289 0.05
290 0.06
291 0.05
292 0.05
293 0.05
294 0.05
295 0.05
296 0.05
297 0.05
298 0.04
299 0.04
300 0.04
301 0.04
302 0.04
303 0.05
304 0.06
305 0.08
306 0.14
307 0.17
308 0.18
309 0.19
310 0.21
311 0.26
312 0.27
313 0.32
314 0.37
315 0.45
316 0.54
317 0.61
318 0.61
319 0.56
320 0.58
321 0.62
322 0.61
323 0.6
324 0.6
325 0.6
326 0.68
327 0.74
328 0.73
329 0.66
330 0.65
331 0.61
332 0.54
333 0.47
334 0.39
335 0.32
336 0.3
337 0.28
338 0.2
339 0.13
340 0.12
341 0.11
342 0.15
343 0.15
344 0.15
345 0.17
346 0.17
347 0.18
348 0.22
349 0.23
350 0.21
351 0.21
352 0.2
353 0.2
354 0.22
355 0.22
356 0.16
357 0.15
358 0.16
359 0.22
360 0.3
361 0.33
362 0.34
363 0.37
364 0.44
365 0.48
366 0.52
367 0.51
368 0.49
369 0.5
370 0.49
371 0.49
372 0.51
373 0.52
374 0.47
375 0.46
376 0.42
377 0.39
378 0.43
379 0.47
380 0.44
381 0.4
382 0.4
383 0.38
384 0.39
385 0.35
386 0.29
387 0.24
388 0.24
389 0.25
390 0.28
391 0.31
392 0.34
393 0.4
394 0.48
395 0.56
396 0.59
397 0.65
398 0.7
399 0.74
400 0.76
401 0.73
402 0.71
403 0.63
404 0.55
405 0.49
406 0.39
407 0.32
408 0.28
409 0.27
410 0.23
411 0.22
412 0.24
413 0.29
414 0.37
415 0.47
416 0.53
417 0.58
418 0.64
419 0.73
420 0.79
421 0.77
422 0.77
423 0.78
424 0.77
425 0.78
426 0.81
427 0.8
428 0.8