Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q7SBB9

Protein Details
Accession Q7SBB9    Localization Confidence High Confidence Score 25.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-25MNRIQGSKPRLKPTNPKAKLPSNPKHydrophilic
83-102LEILSRFHHRNKNQHRLSKWHydrophilic
123-158WCDKEPEREGKRRKEEARRKKKEKYERLGRVEKKQDBasic
333-359TGENRQGKNKSEKKKRPRDDEDDKNDDBasic
366-419SSGPTPPVSEQKKKKKRKAGDDGTDIDDIFASFDKPSQRKKKDKAEKSVVASKTHydrophilic
469-518DIFASLEKPKKKKTKVKKTDDLDDIFASFDKPKTKKKKKKAGAGAGADEFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
129-156EREGKRRKEEARRKKKEKYERLGRVEKK
339-350GKNKSEKKKRPR
377-384KKKKKRKA
405-407KKK
476-486KPKKKKTKVKK
499-510KPKTKKKKKKAG
Subcellular Location(s) nucl 21, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR047205  RMP1  
IPR047204  RMP1_RBD  
Gene Ontology GO:0000172  C:ribonuclease MRP complex  
GO:0042134  F:rRNA primary transcript binding  
GO:0000466  P:maturation of 5.8S rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000294  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, RNase MRP-dependent  
KEGG ncr:NCU06204  -  
CDD cd22573  RMP1_RBD  
Amino Acid Sequences MNRIQGSKPRLKPTNPKAKLPSNPKPTTTQPPSSSSSSSNLLILQQSQDPQSLPATKTTPSPSSNPSDPTTPSSLLPILTPALEILSRFHHRNKNQHRLSKWWAEADMLRRHLRKLIEAANEWCDKEPEREGKRRKEEARRKKKEKYERLGRVEKKQDGVGQKGGEEEVKGEDREEEEEEEDREAREVRLRAEYLRGKLGPRAYFAFSQLSADRQFAHLGLMLLGVLAQVDKALSAFASVPIDENDDAAADEAAEDRGPNLNATVMGQLADEVPNQRHNDIGVAVSREELLAMMSESTTASGPTDGSLARSDARDHPLPTTETDSGAAPPPVTGENRQGKNKSEKKKRPRDDEDDKNDDEDKDDFSSGPTPPVSEQKKKKKRKAGDDGTDIDDIFASFDKPSQRKKKDKAEKSVVASKTTTVTTSIATATTTTTKVKTTTDSSVPTTTTTTTTTPAEAETQHGKDDLDDIFASLEKPKKKKTKVKKTDDLDDIFASFDKPKTKKKKKKAGAGAGADEFDDIFGGL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.83
2 0.78
3 0.79
4 0.78
5 0.79
6 0.8
7 0.8
8 0.79
9 0.78
10 0.79
11 0.73
12 0.71
13 0.69
14 0.7
15 0.67
16 0.66
17 0.6
18 0.6
19 0.61
20 0.59
21 0.55
22 0.47
23 0.43
24 0.38
25 0.34
26 0.3
27 0.25
28 0.23
29 0.21
30 0.2
31 0.19
32 0.18
33 0.19
34 0.2
35 0.21
36 0.19
37 0.2
38 0.23
39 0.26
40 0.25
41 0.27
42 0.28
43 0.27
44 0.32
45 0.36
46 0.36
47 0.34
48 0.38
49 0.38
50 0.43
51 0.46
52 0.45
53 0.42
54 0.4
55 0.4
56 0.4
57 0.4
58 0.34
59 0.3
60 0.29
61 0.28
62 0.24
63 0.22
64 0.18
65 0.14
66 0.12
67 0.12
68 0.09
69 0.09
70 0.09
71 0.09
72 0.09
73 0.15
74 0.19
75 0.22
76 0.3
77 0.38
78 0.45
79 0.56
80 0.65
81 0.7
82 0.75
83 0.8
84 0.76
85 0.75
86 0.76
87 0.74
88 0.67
89 0.58
90 0.5
91 0.44
92 0.44
93 0.43
94 0.42
95 0.39
96 0.41
97 0.39
98 0.4
99 0.42
100 0.4
101 0.36
102 0.36
103 0.37
104 0.37
105 0.39
106 0.4
107 0.41
108 0.41
109 0.38
110 0.32
111 0.27
112 0.23
113 0.24
114 0.28
115 0.32
116 0.38
117 0.48
118 0.56
119 0.64
120 0.72
121 0.77
122 0.79
123 0.81
124 0.84
125 0.86
126 0.88
127 0.89
128 0.89
129 0.89
130 0.91
131 0.9
132 0.9
133 0.89
134 0.89
135 0.88
136 0.88
137 0.88
138 0.83
139 0.81
140 0.79
141 0.71
142 0.62
143 0.55
144 0.51
145 0.46
146 0.44
147 0.39
148 0.31
149 0.28
150 0.26
151 0.25
152 0.2
153 0.15
154 0.11
155 0.1
156 0.12
157 0.12
158 0.11
159 0.12
160 0.12
161 0.14
162 0.15
163 0.13
164 0.13
165 0.14
166 0.14
167 0.14
168 0.14
169 0.12
170 0.11
171 0.11
172 0.1
173 0.15
174 0.15
175 0.16
176 0.19
177 0.2
178 0.2
179 0.27
180 0.3
181 0.27
182 0.3
183 0.29
184 0.27
185 0.29
186 0.34
187 0.27
188 0.26
189 0.26
190 0.24
191 0.24
192 0.25
193 0.23
194 0.18
195 0.19
196 0.16
197 0.16
198 0.15
199 0.14
200 0.13
201 0.12
202 0.13
203 0.1
204 0.11
205 0.09
206 0.08
207 0.08
208 0.07
209 0.06
210 0.05
211 0.05
212 0.04
213 0.03
214 0.02
215 0.02
216 0.02
217 0.02
218 0.02
219 0.02
220 0.02
221 0.02
222 0.03
223 0.04
224 0.05
225 0.05
226 0.05
227 0.06
228 0.06
229 0.08
230 0.08
231 0.08
232 0.07
233 0.06
234 0.06
235 0.06
236 0.05
237 0.03
238 0.03
239 0.03
240 0.04
241 0.03
242 0.03
243 0.04
244 0.05
245 0.06
246 0.06
247 0.06
248 0.06
249 0.06
250 0.07
251 0.07
252 0.05
253 0.05
254 0.05
255 0.05
256 0.05
257 0.05
258 0.05
259 0.06
260 0.07
261 0.12
262 0.13
263 0.13
264 0.13
265 0.12
266 0.13
267 0.12
268 0.12
269 0.09
270 0.09
271 0.09
272 0.09
273 0.08
274 0.07
275 0.07
276 0.06
277 0.04
278 0.03
279 0.04
280 0.03
281 0.03
282 0.04
283 0.04
284 0.04
285 0.04
286 0.04
287 0.04
288 0.05
289 0.05
290 0.05
291 0.06
292 0.05
293 0.07
294 0.07
295 0.08
296 0.09
297 0.09
298 0.12
299 0.14
300 0.19
301 0.21
302 0.21
303 0.21
304 0.23
305 0.24
306 0.23
307 0.24
308 0.2
309 0.18
310 0.18
311 0.17
312 0.15
313 0.16
314 0.14
315 0.09
316 0.09
317 0.09
318 0.1
319 0.11
320 0.12
321 0.19
322 0.27
323 0.32
324 0.38
325 0.39
326 0.43
327 0.52
328 0.59
329 0.61
330 0.64
331 0.7
332 0.76
333 0.84
334 0.88
335 0.88
336 0.89
337 0.88
338 0.86
339 0.87
340 0.84
341 0.79
342 0.7
343 0.62
344 0.54
345 0.45
346 0.36
347 0.27
348 0.2
349 0.16
350 0.16
351 0.14
352 0.13
353 0.16
354 0.15
355 0.16
356 0.14
357 0.13
358 0.14
359 0.23
360 0.29
361 0.36
362 0.46
363 0.55
364 0.66
365 0.75
366 0.84
367 0.85
368 0.88
369 0.9
370 0.91
371 0.9
372 0.88
373 0.84
374 0.77
375 0.7
376 0.6
377 0.49
378 0.38
379 0.27
380 0.18
381 0.12
382 0.09
383 0.07
384 0.06
385 0.09
386 0.17
387 0.22
388 0.33
389 0.43
390 0.53
391 0.62
392 0.72
393 0.8
394 0.83
395 0.88
396 0.88
397 0.88
398 0.85
399 0.81
400 0.8
401 0.71
402 0.63
403 0.53
404 0.44
405 0.36
406 0.3
407 0.24
408 0.17
409 0.16
410 0.13
411 0.14
412 0.13
413 0.11
414 0.11
415 0.11
416 0.11
417 0.12
418 0.14
419 0.14
420 0.15
421 0.17
422 0.19
423 0.2
424 0.23
425 0.25
426 0.29
427 0.32
428 0.34
429 0.36
430 0.36
431 0.35
432 0.32
433 0.29
434 0.25
435 0.22
436 0.21
437 0.18
438 0.19
439 0.19
440 0.19
441 0.18
442 0.18
443 0.18
444 0.16
445 0.19
446 0.23
447 0.23
448 0.23
449 0.23
450 0.22
451 0.2
452 0.22
453 0.18
454 0.14
455 0.13
456 0.12
457 0.12
458 0.13
459 0.13
460 0.16
461 0.22
462 0.27
463 0.34
464 0.44
465 0.53
466 0.64
467 0.74
468 0.8
469 0.85
470 0.88
471 0.92
472 0.93
473 0.89
474 0.88
475 0.85
476 0.78
477 0.7
478 0.6
479 0.49
480 0.4
481 0.33
482 0.25
483 0.2
484 0.2
485 0.25
486 0.3
487 0.4
488 0.51
489 0.62
490 0.71
491 0.8
492 0.88
493 0.89
494 0.94
495 0.94
496 0.94
497 0.93
498 0.88
499 0.82
500 0.72
501 0.63
502 0.51
503 0.4
504 0.29
505 0.19