FuNGI

A0A1J9RAL8

Protein Details

Accession

A0A1J9RAL8

Localization Confidence

High

Confidence Score

25.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
20-53	GPPMRIRRLKVDPLVRPKQKRTPRLQGQGHPGAG	Hydrophilic
527-548	GTDTSRKKPKSKHSDAQPGSRP	Hydrophilic
597-616	STTAGAKKRKPNQPGVMSRT	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
13-78	RAAPGQPGPPMRIRRLKVDPLVRPKQKRTPRLQGQGHPGAGPVANGRVGSPKPRPPQAAPRPAPAK
472-479	ARKEKGKE
495-520	SGRPKHTDPLNKKAAARASRKRPGSP
531-553	SRKKPKSKHSDAQPGSRPMSPGP
557-557	R

Subcellular Location(s)

nucl 23, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MSSTPPNPPPPGRAAPGQPGPPMRIRRLKVDPLVRPKQKRTPRLQGQGHPGAGPVANGRVGSPKPRPPQAAPRPAPAKPAIPSIEDLTVNGFSGPLLSETYVDYPLVTTKRAWREGLKHHVAKFASKKNIDPRDESSFTRPVRLQRRDPRALNTGPAVERDDQHRRRGGELNEAEQEELEAKKAAREKERAENLAQIAPSATVTQKKMNAPKPRTQQVFKSEMTPAEIAKARIKYEEALPWHLDDFDNKGTWVGSYEAAMSGTYAMFVLQNDGKMRMVPLDKWYKFTTKTPFKTLTIEEAEKFMARKAKDPQWVMEKEQDRAQKKALEDYARQSRLFTGRREGFSGVSEGFEGDDLDFEEDRFADDEEHVGIHDDDEDAKAAEKRIKEDQLKANIFNLKDEHMYDEEENQEKKEKEALKNFGKHVRKALQRREKNFDYSSGSDANPYSDESSDDSETERLKEEQQKLEEERARKEKGKESDKNSGMSTKGTNTPSGRPKHTDPLNKKAAARASRKRPGSPNLSEASGTDTSRKKPKSKHSDAQPGSRPMSPGPSGQRKPGVPADQAGMKRSRNGPAGSGSGSDGERGVGSAAEMSDSTTAGAKKRKPNQPGVMSRTGTPRGSRAGSPAGLVPPRTGPGSGVNSPAPPTRTSTPGLPSSANLAFPTASEVHSAIPPAGIASAELLKIFRPRIGDSKENHRKFIAIVRDVSIYGKEDKLLRPGVLKDGSA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.5
2	0.52
3	0.55
4	0.54
5	0.51
6	0.48
7	0.49
8	0.51
9	0.53
10	0.53
11	0.56
12	0.55
13	0.59
14	0.64
15	0.68
16	0.69
17	0.71
18	0.72
19	0.73
20	0.81
21	0.82
22	0.82
23	0.82
24	0.83
25	0.84
26	0.85
27	0.84
28	0.85
29	0.86
30	0.88
31	0.88
32	0.85
33	0.84
34	0.82
35	0.73
36	0.62
37	0.51
38	0.43
39	0.34
40	0.27
41	0.19
42	0.13
43	0.13
44	0.13
45	0.14
46	0.18
47	0.2
48	0.27
49	0.33
50	0.4
51	0.46
52	0.54
53	0.6
54	0.61
55	0.7
56	0.73
57	0.77
58	0.71
59	0.73
60	0.71
61	0.66
62	0.65
63	0.57
64	0.51
65	0.42
66	0.46
67	0.38
68	0.35
69	0.36
70	0.33
71	0.33
72	0.28
73	0.26
74	0.22
75	0.2
76	0.18
77	0.15
78	0.12
79	0.08
80	0.08
81	0.09
82	0.07
83	0.08
84	0.08
85	0.08
86	0.1
87	0.13
88	0.13
89	0.12
90	0.11
91	0.11
92	0.15
93	0.16
94	0.16
95	0.17
96	0.24
97	0.33
98	0.37
99	0.4
100	0.42
101	0.49
102	0.57
103	0.64
104	0.65
105	0.63
106	0.6
107	0.63
108	0.57
109	0.57
110	0.56
111	0.55
112	0.55
113	0.51
114	0.56
115	0.6
116	0.68
117	0.64
118	0.6
119	0.57
120	0.57
121	0.57
122	0.54
123	0.49
124	0.48
125	0.44
126	0.45
127	0.43
128	0.43
129	0.51
130	0.56
131	0.6
132	0.63
133	0.72
134	0.75
135	0.75
136	0.72
137	0.69
138	0.63
139	0.55
140	0.48
141	0.42
142	0.34
143	0.32
144	0.3
145	0.24
146	0.24
147	0.28
148	0.36
149	0.36
150	0.42
151	0.46
152	0.44
153	0.47
154	0.52
155	0.48
156	0.47
157	0.45
158	0.43
159	0.4
160	0.39
161	0.35
162	0.27
163	0.25
164	0.16
165	0.14
166	0.11
167	0.1
168	0.09
169	0.13
170	0.18
171	0.23
172	0.29
173	0.35
174	0.39
175	0.47
176	0.53
177	0.53
178	0.49
179	0.48
180	0.43
181	0.4
182	0.34
183	0.25
184	0.18
185	0.15
186	0.14
187	0.11
188	0.11
189	0.12
190	0.15
191	0.19
192	0.23
193	0.29
194	0.38
195	0.45
196	0.53
197	0.55
198	0.62
199	0.67
200	0.71
201	0.71
202	0.66
203	0.65
204	0.62
205	0.62
206	0.54
207	0.48
208	0.42
209	0.36
210	0.35
211	0.29
212	0.21
213	0.19
214	0.21
215	0.19
216	0.22
217	0.23
218	0.21
219	0.22
220	0.23
221	0.2
222	0.21
223	0.25
224	0.23
225	0.24
226	0.24
227	0.24
228	0.23
229	0.22
230	0.19
231	0.15
232	0.16
233	0.15
234	0.14
235	0.13
236	0.13
237	0.13
238	0.12
239	0.13
240	0.1
241	0.08
242	0.08
243	0.08
244	0.08
245	0.08
246	0.08
247	0.06
248	0.06
249	0.05
250	0.05
251	0.04
252	0.04
253	0.04
254	0.04
255	0.07
256	0.07
257	0.09
258	0.1
259	0.12
260	0.12
261	0.11
262	0.12
263	0.13
264	0.13
265	0.13
266	0.19
267	0.28
268	0.28
269	0.32
270	0.34
271	0.34
272	0.35
273	0.39
274	0.43
275	0.43
276	0.46
277	0.49
278	0.5
279	0.48
280	0.49
281	0.44
282	0.4
283	0.34
284	0.32
285	0.26
286	0.23
287	0.22
288	0.19
289	0.18
290	0.15
291	0.16
292	0.15
293	0.19
294	0.24
295	0.31
296	0.37
297	0.38
298	0.39
299	0.43
300	0.44
301	0.42
302	0.43
303	0.38
304	0.33
305	0.36
306	0.4
307	0.34
308	0.34
309	0.34
310	0.3
311	0.29
312	0.33
313	0.32
314	0.3
315	0.29
316	0.33
317	0.39
318	0.37
319	0.37
320	0.32
321	0.3
322	0.33
323	0.35
324	0.3
325	0.3
326	0.32
327	0.33
328	0.35
329	0.33
330	0.26
331	0.23
332	0.23
333	0.15
334	0.11
335	0.1
336	0.08
337	0.07
338	0.06
339	0.06
340	0.04
341	0.04
342	0.04
343	0.05
344	0.05
345	0.05
346	0.05
347	0.05
348	0.06
349	0.06
350	0.06
351	0.05
352	0.05
353	0.06
354	0.06
355	0.06
356	0.05
357	0.06
358	0.05
359	0.05
360	0.05
361	0.04
362	0.05
363	0.05
364	0.05
365	0.05
366	0.06
367	0.06
368	0.08
369	0.11
370	0.11
371	0.14
372	0.19
373	0.25
374	0.27
375	0.33
376	0.38
377	0.44
378	0.45
379	0.43
380	0.41
381	0.38
382	0.35
383	0.3
384	0.24
385	0.17
386	0.16
387	0.16
388	0.15
389	0.12
390	0.14
391	0.13
392	0.14
393	0.15
394	0.17
395	0.17
396	0.16
397	0.21
398	0.19
399	0.19
400	0.25
401	0.28
402	0.31
403	0.39
404	0.46
405	0.48
406	0.52
407	0.54
408	0.56
409	0.54
410	0.5
411	0.48
412	0.48
413	0.49
414	0.53
415	0.61
416	0.63
417	0.67
418	0.71
419	0.73
420	0.68
421	0.66
422	0.58
423	0.51
424	0.46
425	0.39
426	0.36
427	0.3
428	0.27
429	0.22
430	0.21
431	0.19
432	0.14
433	0.13
434	0.11
435	0.09
436	0.1
437	0.11
438	0.14
439	0.13
440	0.13
441	0.13
442	0.14
443	0.14
444	0.14
445	0.15
446	0.13
447	0.17
448	0.25
449	0.29
450	0.33
451	0.35
452	0.39
453	0.39
454	0.46
455	0.46
456	0.41
457	0.43
458	0.43
459	0.46
460	0.47
461	0.49
462	0.49
463	0.53
464	0.61
465	0.61
466	0.61
467	0.67
468	0.63
469	0.61
470	0.54
471	0.47
472	0.37
473	0.32
474	0.27
475	0.2
476	0.23
477	0.23
478	0.26
479	0.26
480	0.32
481	0.38
482	0.42
483	0.43
484	0.43
485	0.46
486	0.5
487	0.56
488	0.59
489	0.58
490	0.62
491	0.65
492	0.63
493	0.59
494	0.55
495	0.55
496	0.53
497	0.55
498	0.55
499	0.57
500	0.63
501	0.66
502	0.67
503	0.66
504	0.66
505	0.65
506	0.6
507	0.55
508	0.49
509	0.47
510	0.41
511	0.34
512	0.32
513	0.25
514	0.22
515	0.22
516	0.23
517	0.27
518	0.36
519	0.42
520	0.43
521	0.5
522	0.61
523	0.66
524	0.73
525	0.77
526	0.78
527	0.84
528	0.8
529	0.8
530	0.77
531	0.71
532	0.64
533	0.56
534	0.47
535	0.37
536	0.39
537	0.31
538	0.29
539	0.32
540	0.4
541	0.4
542	0.44
543	0.49
544	0.44
545	0.47
546	0.49
547	0.46
548	0.37
549	0.37
550	0.35
551	0.34
552	0.35
553	0.34
554	0.31
555	0.27
556	0.31
557	0.33
558	0.36
559	0.35
560	0.36
561	0.34
562	0.33
563	0.35
564	0.3
565	0.28
566	0.22
567	0.19
568	0.18
569	0.16
570	0.12
571	0.1
572	0.09
573	0.08
574	0.08
575	0.05
576	0.05
577	0.06
578	0.06
579	0.06
580	0.06
581	0.07
582	0.07
583	0.07
584	0.07
585	0.1
586	0.11
587	0.16
588	0.23
589	0.3
590	0.39
591	0.49
592	0.57
593	0.62
594	0.71
595	0.76
596	0.79
597	0.81
598	0.79
599	0.78
600	0.7
601	0.64
602	0.61
603	0.55
604	0.47
605	0.4
606	0.35
607	0.32
608	0.34
609	0.33
610	0.31
611	0.32
612	0.3
613	0.29
614	0.28
615	0.28
616	0.27
617	0.27
618	0.24
619	0.21
620	0.22
621	0.22
622	0.2
623	0.17
624	0.21
625	0.27
626	0.27
627	0.29
628	0.28
629	0.28
630	0.3
631	0.33
632	0.28
633	0.23
634	0.27
635	0.27
636	0.3
637	0.32
638	0.34
639	0.35
640	0.37
641	0.39
642	0.34
643	0.31
644	0.33
645	0.31
646	0.28
647	0.22
648	0.19
649	0.16
650	0.15
651	0.19
652	0.15
653	0.14
654	0.14
655	0.15
656	0.15
657	0.16
658	0.17
659	0.13
660	0.12
661	0.11
662	0.09
663	0.09
664	0.07
665	0.06
666	0.08
667	0.09
668	0.09
669	0.1
670	0.1
671	0.11
672	0.16
673	0.17
674	0.18
675	0.2
676	0.24
677	0.33
678	0.4
679	0.45
680	0.46
681	0.56
682	0.65
683	0.64
684	0.63
685	0.55
686	0.49
687	0.44
688	0.48
689	0.46
690	0.4
691	0.39
692	0.38
693	0.39
694	0.38
695	0.37
696	0.3
697	0.24
698	0.22
699	0.21
700	0.21
701	0.24
702	0.27
703	0.32
704	0.34
705	0.33
706	0.34
707	0.35
708	0.4

A0A1J9RAL8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer