Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1J9PU02

Protein Details
Accession A0A1J9PU02    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
13-37SPTVNRSYRRAKWVTKQELEKRRTEHydrophilic
228-252FRLWVEKYRKPRFKPKSHSDPRGERBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
237-243KPRFKPK
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 12, cyto 8.5, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016197  Chromo-like_dom_sf  
IPR000953  Chromo/chromo_shadow_dom  
IPR023780  Chromo_domain  
IPR021109  Peptidase_aspartic_dom_sf  
IPR001878  Znf_CCHC  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006338  P:chromatin remodeling  
Pfam View protein in Pfam  
PF00385  Chromo  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50013  CHROMO_2  
PS50158  ZF_CCHC  
CDD cd00024  CD_CSD  
cd00303  retropepsin_like  
Amino Acid Sequences MMDWEPTGPLTESPTVNRSYRRAKWVTKQELEKRRTEGRCLRCGGSEHRIKDCPYQAAQRPLAGRVTHVVAPLLESDEETERSEVSEQGKRVALAQRRIDRLANANALPDSGCNTFALIDSSFARKHHLQRLSITARDIFAYGDDSPSERVDTVVRFYLDVGGISSDVWAYEVQSLKDYDVILGTPWLKENNVVILPKKPSLLFKNHAIEIPSILPSINICQISASAFRLWVEKYRKPRFKPKSHSDPRGERIIQKLSNAVELAQASMATSQESYELYANSRRQPAPEYKIGDKVWLDLRNIRTDRPSEKLDRRCSKFPVIEKIGSHAYRLNTPPGIHPVFHTWLLRPAKNNRLPSQTQTDWQPPAIIAENGDEEYEVEEIVDERTNRRGQTEYRVRWRGWHDLTWEPAAHLEETIALDVWQRACMNTD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.31
3 0.34
4 0.38
5 0.41
6 0.46
7 0.52
8 0.58
9 0.62
10 0.66
11 0.72
12 0.78
13 0.81
14 0.79
15 0.82
16 0.83
17 0.85
18 0.81
19 0.77
20 0.72
21 0.71
22 0.67
23 0.66
24 0.66
25 0.64
26 0.68
27 0.66
28 0.62
29 0.56
30 0.57
31 0.54
32 0.54
33 0.54
34 0.49
35 0.51
36 0.53
37 0.52
38 0.55
39 0.54
40 0.5
41 0.46
42 0.51
43 0.52
44 0.57
45 0.56
46 0.53
47 0.49
48 0.45
49 0.45
50 0.37
51 0.31
52 0.25
53 0.27
54 0.24
55 0.23
56 0.21
57 0.16
58 0.17
59 0.16
60 0.15
61 0.11
62 0.1
63 0.11
64 0.13
65 0.14
66 0.15
67 0.15
68 0.13
69 0.14
70 0.15
71 0.16
72 0.18
73 0.22
74 0.21
75 0.24
76 0.26
77 0.25
78 0.28
79 0.32
80 0.35
81 0.37
82 0.45
83 0.48
84 0.51
85 0.53
86 0.5
87 0.46
88 0.44
89 0.41
90 0.37
91 0.3
92 0.28
93 0.26
94 0.24
95 0.21
96 0.16
97 0.14
98 0.1
99 0.11
100 0.09
101 0.1
102 0.1
103 0.1
104 0.12
105 0.09
106 0.1
107 0.11
108 0.14
109 0.15
110 0.15
111 0.2
112 0.23
113 0.29
114 0.37
115 0.41
116 0.41
117 0.43
118 0.52
119 0.51
120 0.47
121 0.42
122 0.34
123 0.29
124 0.26
125 0.23
126 0.14
127 0.1
128 0.11
129 0.1
130 0.09
131 0.09
132 0.09
133 0.1
134 0.11
135 0.11
136 0.09
137 0.09
138 0.1
139 0.11
140 0.12
141 0.14
142 0.14
143 0.13
144 0.13
145 0.14
146 0.12
147 0.11
148 0.09
149 0.07
150 0.06
151 0.06
152 0.06
153 0.04
154 0.04
155 0.05
156 0.04
157 0.05
158 0.08
159 0.09
160 0.1
161 0.11
162 0.12
163 0.11
164 0.13
165 0.12
166 0.09
167 0.08
168 0.08
169 0.06
170 0.08
171 0.08
172 0.07
173 0.07
174 0.08
175 0.08
176 0.09
177 0.09
178 0.1
179 0.12
180 0.13
181 0.13
182 0.17
183 0.19
184 0.19
185 0.2
186 0.17
187 0.2
188 0.23
189 0.29
190 0.28
191 0.32
192 0.35
193 0.35
194 0.35
195 0.32
196 0.27
197 0.22
198 0.19
199 0.13
200 0.1
201 0.09
202 0.08
203 0.07
204 0.08
205 0.09
206 0.09
207 0.08
208 0.08
209 0.08
210 0.1
211 0.1
212 0.11
213 0.08
214 0.08
215 0.08
216 0.1
217 0.1
218 0.17
219 0.22
220 0.26
221 0.36
222 0.46
223 0.54
224 0.58
225 0.68
226 0.71
227 0.75
228 0.8
229 0.8
230 0.81
231 0.82
232 0.86
233 0.82
234 0.8
235 0.73
236 0.71
237 0.62
238 0.53
239 0.49
240 0.46
241 0.39
242 0.32
243 0.32
244 0.24
245 0.24
246 0.22
247 0.17
248 0.12
249 0.11
250 0.11
251 0.08
252 0.07
253 0.06
254 0.06
255 0.06
256 0.05
257 0.05
258 0.04
259 0.05
260 0.06
261 0.07
262 0.08
263 0.08
264 0.1
265 0.16
266 0.19
267 0.22
268 0.28
269 0.27
270 0.27
271 0.32
272 0.38
273 0.39
274 0.42
275 0.43
276 0.4
277 0.46
278 0.44
279 0.42
280 0.35
281 0.31
282 0.31
283 0.29
284 0.29
285 0.28
286 0.31
287 0.36
288 0.37
289 0.36
290 0.34
291 0.35
292 0.37
293 0.36
294 0.39
295 0.39
296 0.47
297 0.54
298 0.61
299 0.66
300 0.69
301 0.69
302 0.69
303 0.69
304 0.66
305 0.63
306 0.62
307 0.58
308 0.55
309 0.5
310 0.49
311 0.48
312 0.41
313 0.37
314 0.31
315 0.27
316 0.29
317 0.3
318 0.31
319 0.27
320 0.27
321 0.29
322 0.33
323 0.33
324 0.28
325 0.28
326 0.29
327 0.3
328 0.32
329 0.3
330 0.24
331 0.3
332 0.36
333 0.37
334 0.38
335 0.42
336 0.5
337 0.56
338 0.63
339 0.59
340 0.61
341 0.62
342 0.61
343 0.63
344 0.54
345 0.51
346 0.49
347 0.5
348 0.44
349 0.41
350 0.36
351 0.27
352 0.28
353 0.27
354 0.22
355 0.16
356 0.15
357 0.16
358 0.16
359 0.16
360 0.12
361 0.1
362 0.1
363 0.1
364 0.08
365 0.06
366 0.06
367 0.06
368 0.08
369 0.11
370 0.11
371 0.13
372 0.2
373 0.24
374 0.25
375 0.27
376 0.31
377 0.32
378 0.42
379 0.51
380 0.54
381 0.6
382 0.66
383 0.63
384 0.65
385 0.67
386 0.66
387 0.6
388 0.57
389 0.51
390 0.51
391 0.55
392 0.51
393 0.46
394 0.37
395 0.34
396 0.3
397 0.26
398 0.2
399 0.16
400 0.13
401 0.14
402 0.14
403 0.12
404 0.1
405 0.11
406 0.14
407 0.15
408 0.17
409 0.16