Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1J9QBP4

Protein Details
Accession A0A1J9QBP4    Localization Confidence High Confidence Score 21.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
51-107IKQSNAPRDERRQRSRSRDRDGRRRDRSRSRDRKDRSRSRSRERRDRDRDRDRAGRRBasic
154-177TTSTRPRRSRSPPRQRGGRTNRRDBasic
249-273NNIYGVRKEKKTQYRQYMNRQGGFNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
58-117RDERRQRSRSRDRDGRRRDRSRSRDRKDRSRSRSRERRDRDRDRDRAGRRDRDRSGSRDR
158-179RPRRSRSPPRQRGGRTNRRDAP
Subcellular Location(s) nucl 26.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013957  SNRNP27  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF08648  SNRNP27  
Amino Acid Sequences MAEPPAKRVRRTDSSSMWEMNDSKSITGDHDSNEVDGGISRRDTGSTRDDIKQSNAPRDERRQRSRSRDRDGRRRDRSRSRDRKDRSRSRSRERRDRDRDRDRAGRRDRDRSGSRDRYTRQGDYGKSARYRERGRDRSWTRSLSPTLSPTRNGTTSTRPRRSRSPPRQRGGRTNRRDAPPRDQVRESGRVNGTFESRRHGSIKPQTQPMPDSMNMDVDGADGDELDQLIRKTMGFSSFRTTQNTKVPGNNIYGVRKEKKTQYRQYMNRQGGFNRPLSPTR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.65
2 0.66
3 0.61
4 0.54
5 0.48
6 0.42
7 0.36
8 0.33
9 0.27
10 0.22
11 0.21
12 0.21
13 0.2
14 0.22
15 0.21
16 0.18
17 0.2
18 0.2
19 0.2
20 0.19
21 0.16
22 0.13
23 0.13
24 0.13
25 0.11
26 0.11
27 0.12
28 0.12
29 0.13
30 0.15
31 0.18
32 0.21
33 0.25
34 0.29
35 0.33
36 0.36
37 0.36
38 0.39
39 0.42
40 0.42
41 0.45
42 0.46
43 0.48
44 0.51
45 0.59
46 0.65
47 0.68
48 0.73
49 0.73
50 0.76
51 0.82
52 0.86
53 0.85
54 0.85
55 0.85
56 0.85
57 0.87
58 0.89
59 0.89
60 0.88
61 0.88
62 0.87
63 0.88
64 0.88
65 0.89
66 0.89
67 0.87
68 0.86
69 0.86
70 0.87
71 0.87
72 0.88
73 0.86
74 0.86
75 0.86
76 0.87
77 0.89
78 0.88
79 0.88
80 0.86
81 0.88
82 0.87
83 0.89
84 0.88
85 0.88
86 0.86
87 0.82
88 0.83
89 0.77
90 0.77
91 0.74
92 0.74
93 0.69
94 0.7
95 0.66
96 0.66
97 0.64
98 0.61
99 0.62
100 0.61
101 0.58
102 0.57
103 0.55
104 0.55
105 0.55
106 0.5
107 0.45
108 0.41
109 0.39
110 0.38
111 0.4
112 0.36
113 0.33
114 0.35
115 0.34
116 0.36
117 0.39
118 0.42
119 0.49
120 0.52
121 0.52
122 0.59
123 0.6
124 0.61
125 0.62
126 0.55
127 0.46
128 0.44
129 0.43
130 0.35
131 0.32
132 0.29
133 0.29
134 0.27
135 0.27
136 0.24
137 0.26
138 0.24
139 0.25
140 0.23
141 0.27
142 0.36
143 0.45
144 0.52
145 0.54
146 0.57
147 0.63
148 0.7
149 0.73
150 0.74
151 0.75
152 0.76
153 0.79
154 0.85
155 0.81
156 0.81
157 0.81
158 0.8
159 0.76
160 0.75
161 0.75
162 0.71
163 0.75
164 0.69
165 0.66
166 0.66
167 0.65
168 0.61
169 0.55
170 0.54
171 0.51
172 0.54
173 0.46
174 0.43
175 0.39
176 0.35
177 0.35
178 0.32
179 0.31
180 0.27
181 0.27
182 0.26
183 0.25
184 0.27
185 0.28
186 0.28
187 0.34
188 0.39
189 0.47
190 0.47
191 0.52
192 0.52
193 0.52
194 0.52
195 0.46
196 0.42
197 0.34
198 0.32
199 0.26
200 0.24
201 0.22
202 0.2
203 0.17
204 0.11
205 0.1
206 0.07
207 0.06
208 0.04
209 0.04
210 0.04
211 0.04
212 0.04
213 0.06
214 0.06
215 0.08
216 0.09
217 0.08
218 0.1
219 0.12
220 0.19
221 0.19
222 0.21
223 0.26
224 0.32
225 0.35
226 0.4
227 0.41
228 0.4
229 0.47
230 0.51
231 0.47
232 0.46
233 0.48
234 0.45
235 0.46
236 0.45
237 0.41
238 0.39
239 0.42
240 0.45
241 0.48
242 0.49
243 0.52
244 0.56
245 0.63
246 0.69
247 0.74
248 0.77
249 0.81
250 0.86
251 0.9
252 0.91
253 0.88
254 0.83
255 0.77
256 0.69
257 0.67
258 0.63
259 0.55
260 0.49