Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1J9RIF2

Protein Details
Accession A0A1J9RIF2    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
24-80ELTPKNVPQPKAKGPRRRTKTGCLTCRKRRIKCGEEKPTCNNCKKSKRDCEGYAQRVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
33-41PKAKGPRRR
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto_nucl 12, cyto 7, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021858  Fun_TF  
IPR036864  Zn2-C6_fun-type_DNA-bd_sf  
IPR001138  Zn2Cys6_DnaBD  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0000981  F:DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF11951  Fungal_trans_2  
PF00172  Zn_clus  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00463  ZN2_CY6_FUNGAL_1  
PS50048  ZN2_CY6_FUNGAL_2  
CDD cd00067  GAL4  
Amino Acid Sequences MEGNDPPSPKQTEIPLASPAVPPELTPKNVPQPKAKGPRRRTKTGCLTCRKRRIKCGEEKPTCNNCKKSKRDCEGYAQRVIFRNPVGPMSHMGHGPIPPNYLQPRPGADPLPFIRRPLSSTTLHEDASAARQSFIPLAPRPTQSPDNVVYDESQFVSSLEHQPGHVHVHPDPQSDTVPQDYCTQPYNFESAEQTISPHSQAQPVILKSELGEASAQQFLHDDSLQDQSSQPTTSLQQTTHYHPHIPSGQRQTGPLYDQSNITPSLQQPYRMAYLLTLSLSPSRCSNSTVIGKPQYDTYKIEAQPSAGSFSPSCSYHDGGQPANYYYEEEIDDYYDVETDEEMEIQTTHNYTEPYEQQSATPQQLAYSFRSTTAFLGDETSLMSYIPSPFASPLMDPEVTRIFCHFITAVAPVLSIFERHPVNPTVILSASAIPPSQQSLWTYTVPTLALRNQGLLHAILALSSHHIAKAQGLSLMASFRHYHYAIRRVSKAVKLPSRRKQTATLAATLLLGFYEVMSAEHSKWNSHVAGASHLIQESDLGRTTRDIRSMRARAKQEHMRLTQSMPWLGMGTSYFGIRFENDLFADKEADINDDFISTIMGRPMSYNNFGDVEGINPATPSERNLTEGDIEEYRIRSDLYWFYYKQDVYQSMISGNQLLLSYNRWGACPPRAGIGKLDAVYGSNDHLILLLARTTDFVARDRARKIQVTKQNSGRWRPPPGFFPPGMGRGGPPGPQQGQGAGAPPPPGPPQGPPGPPGHPSDTASSSNNRENSPPMYGMVPNTGPVRLPSGFAETSHRSPSPKSDNESDDLETQTRKAEVEWKEIVAAYDAFEKALGPGFAPLPADSAPPIATPFGPALQYRTHTIACIWAIFYTGRIILERGQPGMPPEAMVAAGICALCTGQLANSIGRIVAGIYYPQQFDGETANLIPSLSAVLIELLIPLFYAGVQYTDPAQRGWTVAKLRNIARLTGGGSATAVASGCETAWTKAFEAGRGPPYQRTMSPMAHVDRGQGTVSLMPSDERKFVTVNRSASLTWAMGLLSLQGDYTRPDERADGDGQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.41
3 0.39
4 0.38
5 0.36
6 0.31
7 0.26
8 0.22
9 0.19
10 0.23
11 0.27
12 0.28
13 0.31
14 0.36
15 0.44
16 0.5
17 0.54
18 0.56
19 0.58
20 0.66
21 0.73
22 0.76
23 0.76
24 0.81
25 0.88
26 0.87
27 0.89
28 0.85
29 0.85
30 0.86
31 0.86
32 0.86
33 0.86
34 0.88
35 0.88
36 0.92
37 0.92
38 0.89
39 0.89
40 0.89
41 0.89
42 0.89
43 0.9
44 0.9
45 0.89
46 0.87
47 0.87
48 0.86
49 0.85
50 0.83
51 0.81
52 0.8
53 0.81
54 0.85
55 0.86
56 0.87
57 0.87
58 0.87
59 0.83
60 0.84
61 0.84
62 0.79
63 0.77
64 0.67
65 0.62
66 0.58
67 0.55
68 0.48
69 0.39
70 0.37
71 0.31
72 0.33
73 0.3
74 0.27
75 0.29
76 0.28
77 0.29
78 0.25
79 0.25
80 0.24
81 0.24
82 0.26
83 0.23
84 0.22
85 0.21
86 0.27
87 0.31
88 0.32
89 0.32
90 0.32
91 0.36
92 0.38
93 0.41
94 0.37
95 0.33
96 0.37
97 0.38
98 0.43
99 0.39
100 0.36
101 0.35
102 0.34
103 0.36
104 0.35
105 0.36
106 0.31
107 0.35
108 0.4
109 0.39
110 0.38
111 0.35
112 0.29
113 0.25
114 0.27
115 0.27
116 0.2
117 0.18
118 0.19
119 0.2
120 0.21
121 0.22
122 0.23
123 0.21
124 0.27
125 0.31
126 0.33
127 0.35
128 0.39
129 0.42
130 0.38
131 0.4
132 0.38
133 0.38
134 0.37
135 0.35
136 0.3
137 0.26
138 0.26
139 0.21
140 0.18
141 0.13
142 0.12
143 0.13
144 0.15
145 0.19
146 0.21
147 0.2
148 0.2
149 0.21
150 0.23
151 0.27
152 0.27
153 0.25
154 0.23
155 0.32
156 0.34
157 0.36
158 0.35
159 0.31
160 0.3
161 0.28
162 0.29
163 0.25
164 0.23
165 0.22
166 0.25
167 0.24
168 0.25
169 0.27
170 0.26
171 0.24
172 0.25
173 0.27
174 0.22
175 0.22
176 0.23
177 0.2
178 0.22
179 0.19
180 0.18
181 0.17
182 0.18
183 0.18
184 0.19
185 0.18
186 0.19
187 0.19
188 0.22
189 0.26
190 0.25
191 0.26
192 0.23
193 0.22
194 0.19
195 0.23
196 0.19
197 0.13
198 0.13
199 0.11
200 0.14
201 0.16
202 0.15
203 0.11
204 0.11
205 0.11
206 0.14
207 0.13
208 0.12
209 0.11
210 0.16
211 0.16
212 0.16
213 0.16
214 0.16
215 0.18
216 0.18
217 0.16
218 0.14
219 0.16
220 0.21
221 0.22
222 0.21
223 0.25
224 0.28
225 0.34
226 0.4
227 0.39
228 0.37
229 0.35
230 0.4
231 0.41
232 0.42
233 0.43
234 0.44
235 0.47
236 0.45
237 0.46
238 0.43
239 0.39
240 0.37
241 0.34
242 0.27
243 0.23
244 0.23
245 0.23
246 0.22
247 0.21
248 0.19
249 0.17
250 0.16
251 0.23
252 0.23
253 0.25
254 0.23
255 0.26
256 0.27
257 0.25
258 0.24
259 0.16
260 0.16
261 0.15
262 0.14
263 0.11
264 0.09
265 0.13
266 0.14
267 0.15
268 0.15
269 0.17
270 0.17
271 0.2
272 0.2
273 0.23
274 0.29
275 0.31
276 0.35
277 0.38
278 0.38
279 0.35
280 0.39
281 0.36
282 0.32
283 0.32
284 0.3
285 0.33
286 0.33
287 0.36
288 0.31
289 0.29
290 0.28
291 0.26
292 0.24
293 0.16
294 0.17
295 0.13
296 0.15
297 0.17
298 0.16
299 0.18
300 0.18
301 0.19
302 0.2
303 0.24
304 0.24
305 0.23
306 0.24
307 0.23
308 0.21
309 0.2
310 0.18
311 0.15
312 0.13
313 0.14
314 0.12
315 0.11
316 0.1
317 0.1
318 0.1
319 0.09
320 0.08
321 0.07
322 0.07
323 0.06
324 0.06
325 0.06
326 0.06
327 0.06
328 0.06
329 0.06
330 0.06
331 0.06
332 0.07
333 0.06
334 0.07
335 0.08
336 0.09
337 0.09
338 0.14
339 0.16
340 0.21
341 0.22
342 0.22
343 0.21
344 0.25
345 0.27
346 0.24
347 0.23
348 0.18
349 0.16
350 0.19
351 0.22
352 0.2
353 0.2
354 0.19
355 0.18
356 0.2
357 0.2
358 0.17
359 0.16
360 0.14
361 0.1
362 0.12
363 0.11
364 0.1
365 0.09
366 0.09
367 0.07
368 0.06
369 0.06
370 0.05
371 0.06
372 0.07
373 0.07
374 0.07
375 0.07
376 0.08
377 0.09
378 0.08
379 0.1
380 0.12
381 0.13
382 0.12
383 0.14
384 0.17
385 0.17
386 0.17
387 0.16
388 0.14
389 0.14
390 0.15
391 0.13
392 0.09
393 0.1
394 0.1
395 0.1
396 0.08
397 0.08
398 0.06
399 0.07
400 0.07
401 0.07
402 0.06
403 0.09
404 0.1
405 0.11
406 0.14
407 0.14
408 0.16
409 0.16
410 0.16
411 0.14
412 0.13
413 0.13
414 0.11
415 0.1
416 0.1
417 0.09
418 0.08
419 0.07
420 0.07
421 0.08
422 0.08
423 0.09
424 0.09
425 0.13
426 0.16
427 0.16
428 0.17
429 0.15
430 0.16
431 0.15
432 0.14
433 0.12
434 0.1
435 0.13
436 0.12
437 0.13
438 0.12
439 0.12
440 0.13
441 0.11
442 0.09
443 0.06
444 0.06
445 0.05
446 0.05
447 0.04
448 0.05
449 0.05
450 0.05
451 0.05
452 0.06
453 0.06
454 0.08
455 0.08
456 0.08
457 0.08
458 0.08
459 0.08
460 0.08
461 0.08
462 0.07
463 0.08
464 0.08
465 0.08
466 0.11
467 0.12
468 0.14
469 0.18
470 0.26
471 0.28
472 0.32
473 0.32
474 0.32
475 0.35
476 0.35
477 0.37
478 0.36
479 0.4
480 0.45
481 0.53
482 0.59
483 0.65
484 0.65
485 0.62
486 0.6
487 0.59
488 0.59
489 0.52
490 0.44
491 0.35
492 0.32
493 0.29
494 0.24
495 0.17
496 0.07
497 0.05
498 0.03
499 0.03
500 0.03
501 0.03
502 0.03
503 0.04
504 0.05
505 0.06
506 0.09
507 0.09
508 0.1
509 0.1
510 0.13
511 0.12
512 0.11
513 0.12
514 0.1
515 0.12
516 0.13
517 0.13
518 0.11
519 0.11
520 0.1
521 0.08
522 0.09
523 0.07
524 0.07
525 0.07
526 0.07
527 0.07
528 0.09
529 0.12
530 0.13
531 0.18
532 0.18
533 0.2
534 0.29
535 0.35
536 0.39
537 0.43
538 0.46
539 0.43
540 0.49
541 0.53
542 0.5
543 0.51
544 0.48
545 0.44
546 0.41
547 0.39
548 0.35
549 0.29
550 0.24
551 0.17
552 0.15
553 0.12
554 0.11
555 0.1
556 0.06
557 0.06
558 0.06
559 0.06
560 0.06
561 0.06
562 0.06
563 0.06
564 0.08
565 0.07
566 0.08
567 0.09
568 0.11
569 0.11
570 0.12
571 0.12
572 0.1
573 0.11
574 0.09
575 0.11
576 0.08
577 0.09
578 0.08
579 0.07
580 0.07
581 0.06
582 0.06
583 0.05
584 0.05
585 0.05
586 0.06
587 0.06
588 0.06
589 0.09
590 0.11
591 0.14
592 0.14
593 0.15
594 0.15
595 0.15
596 0.15
597 0.13
598 0.11
599 0.09
600 0.08
601 0.07
602 0.06
603 0.06
604 0.07
605 0.07
606 0.08
607 0.1
608 0.1
609 0.13
610 0.14
611 0.15
612 0.14
613 0.15
614 0.15
615 0.13
616 0.14
617 0.12
618 0.12
619 0.11
620 0.1
621 0.1
622 0.08
623 0.11
624 0.12
625 0.16
626 0.2
627 0.2
628 0.22
629 0.26
630 0.25
631 0.24
632 0.25
633 0.22
634 0.21
635 0.21
636 0.2
637 0.16
638 0.17
639 0.15
640 0.12
641 0.1
642 0.08
643 0.07
644 0.07
645 0.07
646 0.08
647 0.09
648 0.11
649 0.12
650 0.11
651 0.12
652 0.15
653 0.19
654 0.2
655 0.19
656 0.22
657 0.23
658 0.24
659 0.24
660 0.24
661 0.23
662 0.2
663 0.19
664 0.14
665 0.13
666 0.12
667 0.12
668 0.09
669 0.07
670 0.07
671 0.06
672 0.07
673 0.06
674 0.06
675 0.05
676 0.05
677 0.05
678 0.05
679 0.05
680 0.06
681 0.07
682 0.08
683 0.1
684 0.17
685 0.2
686 0.24
687 0.26
688 0.31
689 0.33
690 0.38
691 0.41
692 0.43
693 0.49
694 0.53
695 0.57
696 0.59
697 0.62
698 0.63
699 0.65
700 0.63
701 0.6
702 0.61
703 0.58
704 0.53
705 0.51
706 0.51
707 0.5
708 0.42
709 0.41
710 0.36
711 0.35
712 0.33
713 0.28
714 0.21
715 0.2
716 0.21
717 0.18
718 0.16
719 0.19
720 0.19
721 0.21
722 0.21
723 0.18
724 0.19
725 0.17
726 0.17
727 0.13
728 0.13
729 0.13
730 0.13
731 0.14
732 0.14
733 0.16
734 0.15
735 0.16
736 0.21
737 0.26
738 0.27
739 0.28
740 0.3
741 0.31
742 0.32
743 0.34
744 0.33
745 0.29
746 0.29
747 0.3
748 0.3
749 0.3
750 0.3
751 0.29
752 0.29
753 0.32
754 0.33
755 0.31
756 0.28
757 0.29
758 0.29
759 0.29
760 0.25
761 0.21
762 0.2
763 0.2
764 0.19
765 0.19
766 0.17
767 0.15
768 0.15
769 0.15
770 0.13
771 0.13
772 0.17
773 0.14
774 0.15
775 0.15
776 0.19
777 0.19
778 0.19
779 0.25
780 0.25
781 0.27
782 0.3
783 0.3
784 0.26
785 0.28
786 0.35
787 0.38
788 0.39
789 0.42
790 0.44
791 0.46
792 0.47
793 0.49
794 0.42
795 0.35
796 0.32
797 0.28
798 0.22
799 0.19
800 0.18
801 0.16
802 0.14
803 0.13
804 0.19
805 0.21
806 0.27
807 0.28
808 0.27
809 0.27
810 0.27
811 0.26
812 0.2
813 0.17
814 0.11
815 0.12
816 0.12
817 0.11
818 0.11
819 0.1
820 0.09
821 0.11
822 0.1
823 0.07
824 0.09
825 0.09
826 0.1
827 0.11
828 0.11
829 0.1
830 0.11
831 0.11
832 0.1
833 0.11
834 0.11
835 0.1
836 0.11
837 0.1
838 0.1
839 0.1
840 0.11
841 0.12
842 0.13
843 0.13
844 0.15
845 0.17
846 0.2
847 0.21
848 0.24
849 0.23
850 0.21
851 0.21
852 0.23
853 0.2
854 0.19
855 0.16
856 0.12
857 0.14
858 0.13
859 0.13
860 0.1
861 0.11
862 0.1
863 0.11
864 0.12
865 0.14
866 0.2
867 0.21
868 0.22
869 0.21
870 0.21
871 0.23
872 0.25
873 0.21
874 0.16
875 0.14
876 0.13
877 0.12
878 0.11
879 0.09
880 0.05
881 0.06
882 0.06
883 0.05
884 0.04
885 0.04
886 0.04
887 0.05
888 0.05
889 0.04
890 0.09
891 0.1
892 0.11
893 0.12
894 0.12
895 0.12
896 0.11
897 0.11
898 0.07
899 0.06
900 0.06
901 0.07
902 0.1
903 0.12
904 0.13
905 0.14
906 0.14
907 0.13
908 0.14
909 0.16
910 0.14
911 0.13
912 0.13
913 0.13
914 0.12
915 0.12
916 0.11
917 0.07
918 0.07
919 0.06
920 0.05
921 0.05
922 0.05
923 0.05
924 0.05
925 0.06
926 0.05
927 0.04
928 0.04
929 0.04
930 0.04
931 0.04
932 0.04
933 0.04
934 0.06
935 0.06
936 0.07
937 0.11
938 0.14
939 0.15
940 0.15
941 0.16
942 0.16
943 0.18
944 0.2
945 0.23
946 0.27
947 0.33
948 0.38
949 0.43
950 0.44
951 0.51
952 0.5
953 0.44
954 0.39
955 0.34
956 0.3
957 0.27
958 0.25
959 0.17
960 0.16
961 0.15
962 0.13
963 0.11
964 0.09
965 0.06
966 0.06
967 0.06
968 0.06
969 0.09
970 0.1
971 0.11
972 0.14
973 0.16
974 0.17
975 0.22
976 0.23
977 0.22
978 0.24
979 0.29
980 0.31
981 0.34
982 0.35
983 0.35
984 0.39
985 0.41
986 0.38
987 0.39
988 0.39
989 0.37
990 0.39
991 0.41
992 0.39
993 0.4
994 0.39
995 0.36
996 0.33
997 0.32
998 0.28
999 0.22
1000 0.2
1001 0.18
1002 0.19
1003 0.16
1004 0.14
1005 0.14
1006 0.18
1007 0.2
1008 0.22
1009 0.21
1010 0.22
1011 0.24
1012 0.28
1013 0.35
1014 0.38
1015 0.38
1016 0.37
1017 0.38
1018 0.36
1019 0.36
1020 0.35
1021 0.26
1022 0.19
1023 0.16
1024 0.14
1025 0.12
1026 0.12
1027 0.1
1028 0.07
1029 0.07
1030 0.07
1031 0.07
1032 0.08
1033 0.1
1034 0.14
1035 0.16
1036 0.17
1037 0.18
1038 0.21
1039 0.23