Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1J9QHL1

Protein Details
Accession A0A1J9QHL1    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
29-49QYDPSSRFPHRPRYDSRRSSIHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto 7, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039745  Vps54  
IPR012501  Vps54_C  
IPR019515  VPS54_N  
Gene Ontology GO:0005829  C:cytosol  
GO:0000938  C:GARP complex  
GO:0015031  P:protein transport  
GO:0042147  P:retrograde transport, endosome to Golgi  
Pfam View protein in Pfam  
PF07928  Vps54  
PF10475  Vps54_N  
Amino Acid Sequences MTSPDRRKSVESLASIRSVTSSTQLSSSQYDPSSRFPHRPRYDSRRSSITSSITGGIGGALDSSLHHGPIAEAGHNAISTLLQQPIVRTGLLPQASALSNGYKPPTTRDIPPVTLTNIPHVEPKAFQPYISQVGSLYDAFRRSKENGDEKEPQLFRSSSAVSLSGDIYTLLSSQLERRQSGQQSFLAPAPEHATPRRRSSGQRGRGPTTAPLSTIPNIYFDENFHLENPRTFDVVSERSEVIRSPSKPPDEKAANGTFDPRPSSGRKALATNAILQEKLSWYLDTVEIHLISSISTASTSFFTALGSLQELHSEATDSVQKIQSLRKDLAKLDNDMALGGLKIVSLCRRRENVRKLADAVCQLKEIIACVSQCEQMVENGDIEKALDELDNVERLTAGEQVLIDRGDRRDRSQLPETLIDLRGIKALEGASHDLSQLRHRIGLGYERRFLDCLIGDLKRHVETVPPDLTLLRLGDAFQRSRRGHRKVVSGLPTYMTVDSEFRSRLKTELAGLGRAKYTTPAATSFKTSVLREMKSAIRRHLPSSSDDDNESIVSASTHGGRRLSQQEKSSILARNLRALDPDDSFLMLNKIYTGVSESLRRLSVQVKVLLDITSGLGSPPSTGGIRSPGRSPSLNSLDTITRTRASPVIAQEEILEILDMSSLLGQAVDIVQSQIVKILKVRSEQIAHSSLEQFLRYFSLNKLFADECEAISGRSGAALKNVVDSQIKDFISHFGDSRKHRIVQVMDSDRWNAKDFGDEENILLSRILRASTQDIEFWISTSRIWESEDSSQESATAQANAEVNGNSVSGTGKDKVRGAIVDEQKYILPQSALLILSIIDEFQHLMTGIPSMVQDIALSFLECLKLFNSRSSQLILGAGAMRSVGLKNITTKHLALASQALSFVTALIPYIREFVRRHHTSPTLMAEFDKVKRLYQEHQSGIHEKLVDIMSSRAAIRVNSMKKIDWDQQQGAPAVNSYMETLTEETGTLHRVLAKHLPETTVMMIMGPVFTSYREQWTKAFQAASLKTESGKQRMISDVEYFKAKIDKIDGSGDLGDHLVGIVRAKSVASSPKLQSSPSPPPAREVEQLPPPAEKNEASNSDES
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.49
2 0.45
3 0.39
4 0.31
5 0.25
6 0.2
7 0.18
8 0.17
9 0.16
10 0.18
11 0.19
12 0.21
13 0.24
14 0.25
15 0.26
16 0.26
17 0.29
18 0.29
19 0.35
20 0.4
21 0.42
22 0.5
23 0.52
24 0.61
25 0.66
26 0.71
27 0.74
28 0.77
29 0.82
30 0.81
31 0.8
32 0.77
33 0.72
34 0.7
35 0.65
36 0.6
37 0.51
38 0.45
39 0.4
40 0.31
41 0.27
42 0.22
43 0.16
44 0.11
45 0.08
46 0.06
47 0.04
48 0.04
49 0.04
50 0.09
51 0.1
52 0.1
53 0.1
54 0.1
55 0.1
56 0.14
57 0.16
58 0.13
59 0.12
60 0.13
61 0.14
62 0.14
63 0.14
64 0.1
65 0.08
66 0.09
67 0.11
68 0.12
69 0.13
70 0.14
71 0.15
72 0.19
73 0.2
74 0.18
75 0.16
76 0.17
77 0.22
78 0.23
79 0.21
80 0.17
81 0.19
82 0.2
83 0.2
84 0.19
85 0.15
86 0.16
87 0.19
88 0.21
89 0.21
90 0.22
91 0.27
92 0.33
93 0.33
94 0.37
95 0.43
96 0.46
97 0.47
98 0.5
99 0.47
100 0.43
101 0.44
102 0.39
103 0.37
104 0.33
105 0.31
106 0.32
107 0.31
108 0.29
109 0.26
110 0.3
111 0.32
112 0.3
113 0.29
114 0.28
115 0.31
116 0.35
117 0.34
118 0.29
119 0.2
120 0.21
121 0.24
122 0.21
123 0.18
124 0.14
125 0.19
126 0.2
127 0.21
128 0.24
129 0.25
130 0.32
131 0.4
132 0.46
133 0.47
134 0.53
135 0.59
136 0.57
137 0.63
138 0.56
139 0.48
140 0.44
141 0.39
142 0.33
143 0.31
144 0.3
145 0.22
146 0.23
147 0.23
148 0.18
149 0.19
150 0.18
151 0.13
152 0.11
153 0.1
154 0.09
155 0.08
156 0.07
157 0.06
158 0.06
159 0.07
160 0.12
161 0.17
162 0.21
163 0.22
164 0.25
165 0.33
166 0.4
167 0.42
168 0.42
169 0.39
170 0.38
171 0.39
172 0.37
173 0.32
174 0.25
175 0.23
176 0.22
177 0.22
178 0.23
179 0.27
180 0.33
181 0.35
182 0.42
183 0.47
184 0.48
185 0.52
186 0.6
187 0.65
188 0.66
189 0.71
190 0.7
191 0.68
192 0.67
193 0.62
194 0.56
195 0.5
196 0.41
197 0.33
198 0.28
199 0.27
200 0.26
201 0.26
202 0.22
203 0.19
204 0.2
205 0.2
206 0.19
207 0.16
208 0.21
209 0.2
210 0.2
211 0.19
212 0.23
213 0.22
214 0.24
215 0.28
216 0.24
217 0.23
218 0.22
219 0.22
220 0.23
221 0.26
222 0.25
223 0.24
224 0.22
225 0.22
226 0.23
227 0.22
228 0.22
229 0.26
230 0.26
231 0.29
232 0.36
233 0.43
234 0.46
235 0.48
236 0.52
237 0.48
238 0.48
239 0.49
240 0.46
241 0.4
242 0.37
243 0.4
244 0.32
245 0.29
246 0.3
247 0.24
248 0.24
249 0.26
250 0.32
251 0.33
252 0.36
253 0.37
254 0.37
255 0.38
256 0.4
257 0.37
258 0.35
259 0.33
260 0.29
261 0.27
262 0.24
263 0.22
264 0.17
265 0.18
266 0.15
267 0.11
268 0.11
269 0.13
270 0.15
271 0.14
272 0.14
273 0.14
274 0.13
275 0.12
276 0.12
277 0.1
278 0.08
279 0.08
280 0.06
281 0.04
282 0.05
283 0.05
284 0.06
285 0.07
286 0.07
287 0.08
288 0.07
289 0.07
290 0.08
291 0.08
292 0.07
293 0.08
294 0.08
295 0.07
296 0.08
297 0.08
298 0.08
299 0.08
300 0.08
301 0.07
302 0.08
303 0.12
304 0.12
305 0.14
306 0.16
307 0.17
308 0.18
309 0.23
310 0.26
311 0.28
312 0.3
313 0.32
314 0.33
315 0.35
316 0.42
317 0.4
318 0.37
319 0.33
320 0.32
321 0.27
322 0.24
323 0.21
324 0.13
325 0.1
326 0.07
327 0.05
328 0.04
329 0.04
330 0.05
331 0.11
332 0.16
333 0.19
334 0.25
335 0.3
336 0.37
337 0.47
338 0.55
339 0.58
340 0.58
341 0.58
342 0.56
343 0.54
344 0.51
345 0.47
346 0.41
347 0.32
348 0.27
349 0.24
350 0.21
351 0.18
352 0.16
353 0.11
354 0.1
355 0.09
356 0.1
357 0.12
358 0.12
359 0.13
360 0.13
361 0.12
362 0.11
363 0.14
364 0.13
365 0.11
366 0.1
367 0.1
368 0.09
369 0.09
370 0.08
371 0.05
372 0.05
373 0.04
374 0.04
375 0.06
376 0.07
377 0.08
378 0.08
379 0.08
380 0.07
381 0.08
382 0.09
383 0.08
384 0.07
385 0.07
386 0.07
387 0.07
388 0.08
389 0.08
390 0.08
391 0.09
392 0.11
393 0.17
394 0.19
395 0.21
396 0.29
397 0.32
398 0.38
399 0.41
400 0.42
401 0.39
402 0.39
403 0.38
404 0.33
405 0.3
406 0.25
407 0.19
408 0.16
409 0.15
410 0.13
411 0.11
412 0.09
413 0.08
414 0.08
415 0.09
416 0.11
417 0.11
418 0.11
419 0.11
420 0.12
421 0.13
422 0.15
423 0.17
424 0.15
425 0.15
426 0.15
427 0.15
428 0.15
429 0.23
430 0.27
431 0.27
432 0.3
433 0.3
434 0.31
435 0.3
436 0.29
437 0.23
438 0.16
439 0.14
440 0.13
441 0.13
442 0.12
443 0.13
444 0.15
445 0.13
446 0.14
447 0.12
448 0.13
449 0.14
450 0.19
451 0.19
452 0.17
453 0.17
454 0.16
455 0.17
456 0.14
457 0.12
458 0.07
459 0.06
460 0.06
461 0.1
462 0.12
463 0.14
464 0.15
465 0.23
466 0.24
467 0.33
468 0.42
469 0.44
470 0.49
471 0.52
472 0.57
473 0.53
474 0.59
475 0.55
476 0.48
477 0.43
478 0.36
479 0.32
480 0.26
481 0.21
482 0.15
483 0.1
484 0.09
485 0.09
486 0.1
487 0.1
488 0.1
489 0.12
490 0.12
491 0.12
492 0.13
493 0.13
494 0.13
495 0.18
496 0.18
497 0.19
498 0.19
499 0.19
500 0.17
501 0.17
502 0.15
503 0.11
504 0.11
505 0.08
506 0.09
507 0.12
508 0.14
509 0.14
510 0.17
511 0.16
512 0.18
513 0.2
514 0.19
515 0.22
516 0.24
517 0.24
518 0.22
519 0.24
520 0.27
521 0.3
522 0.33
523 0.29
524 0.32
525 0.32
526 0.34
527 0.35
528 0.32
529 0.28
530 0.32
531 0.31
532 0.26
533 0.25
534 0.23
535 0.19
536 0.18
537 0.15
538 0.09
539 0.06
540 0.05
541 0.05
542 0.05
543 0.07
544 0.08
545 0.09
546 0.1
547 0.1
548 0.15
549 0.22
550 0.25
551 0.27
552 0.28
553 0.3
554 0.31
555 0.32
556 0.32
557 0.26
558 0.26
559 0.27
560 0.25
561 0.27
562 0.26
563 0.25
564 0.22
565 0.21
566 0.2
567 0.16
568 0.16
569 0.12
570 0.11
571 0.11
572 0.1
573 0.09
574 0.07
575 0.06
576 0.05
577 0.06
578 0.05
579 0.05
580 0.07
581 0.07
582 0.09
583 0.11
584 0.12
585 0.13
586 0.13
587 0.14
588 0.13
589 0.13
590 0.17
591 0.17
592 0.2
593 0.19
594 0.19
595 0.19
596 0.18
597 0.16
598 0.12
599 0.09
600 0.06
601 0.05
602 0.05
603 0.04
604 0.04
605 0.04
606 0.04
607 0.05
608 0.05
609 0.05
610 0.06
611 0.12
612 0.14
613 0.15
614 0.17
615 0.18
616 0.21
617 0.22
618 0.23
619 0.24
620 0.27
621 0.26
622 0.25
623 0.25
624 0.23
625 0.24
626 0.24
627 0.19
628 0.14
629 0.14
630 0.15
631 0.14
632 0.15
633 0.16
634 0.17
635 0.19
636 0.18
637 0.18
638 0.17
639 0.16
640 0.14
641 0.11
642 0.09
643 0.04
644 0.04
645 0.04
646 0.03
647 0.03
648 0.03
649 0.03
650 0.03
651 0.03
652 0.02
653 0.03
654 0.03
655 0.03
656 0.03
657 0.03
658 0.04
659 0.04
660 0.04
661 0.08
662 0.08
663 0.08
664 0.1
665 0.13
666 0.16
667 0.17
668 0.19
669 0.19
670 0.21
671 0.22
672 0.24
673 0.23
674 0.21
675 0.21
676 0.2
677 0.19
678 0.17
679 0.17
680 0.13
681 0.11
682 0.12
683 0.11
684 0.12
685 0.12
686 0.18
687 0.19
688 0.18
689 0.21
690 0.2
691 0.19
692 0.23
693 0.22
694 0.15
695 0.16
696 0.16
697 0.12
698 0.12
699 0.13
700 0.07
701 0.07
702 0.08
703 0.06
704 0.08
705 0.1
706 0.09
707 0.11
708 0.11
709 0.12
710 0.12
711 0.13
712 0.14
713 0.19
714 0.19
715 0.17
716 0.18
717 0.19
718 0.2
719 0.2
720 0.18
721 0.17
722 0.23
723 0.26
724 0.33
725 0.35
726 0.34
727 0.35
728 0.39
729 0.38
730 0.36
731 0.42
732 0.4
733 0.38
734 0.37
735 0.38
736 0.34
737 0.33
738 0.3
739 0.22
740 0.16
741 0.2
742 0.2
743 0.22
744 0.23
745 0.22
746 0.19
747 0.2
748 0.2
749 0.15
750 0.14
751 0.1
752 0.08
753 0.08
754 0.08
755 0.07
756 0.09
757 0.12
758 0.15
759 0.16
760 0.15
761 0.15
762 0.18
763 0.17
764 0.16
765 0.14
766 0.11
767 0.11
768 0.12
769 0.12
770 0.1
771 0.12
772 0.13
773 0.14
774 0.19
775 0.23
776 0.24
777 0.24
778 0.23
779 0.21
780 0.2
781 0.19
782 0.14
783 0.12
784 0.08
785 0.11
786 0.11
787 0.12
788 0.13
789 0.11
790 0.1
791 0.1
792 0.1
793 0.07
794 0.07
795 0.07
796 0.07
797 0.1
798 0.12
799 0.14
800 0.17
801 0.18
802 0.19
803 0.2
804 0.19
805 0.21
806 0.26
807 0.31
808 0.32
809 0.31
810 0.3
811 0.29
812 0.29
813 0.25
814 0.18
815 0.11
816 0.08
817 0.09
818 0.11
819 0.11
820 0.1
821 0.09
822 0.08
823 0.08
824 0.08
825 0.07
826 0.04
827 0.04
828 0.05
829 0.05
830 0.05
831 0.05
832 0.05
833 0.06
834 0.06
835 0.06
836 0.06
837 0.06
838 0.06
839 0.06
840 0.06
841 0.06
842 0.05
843 0.07
844 0.07
845 0.07
846 0.06
847 0.07
848 0.09
849 0.09
850 0.1
851 0.08
852 0.14
853 0.15
854 0.2
855 0.23
856 0.23
857 0.25
858 0.27
859 0.26
860 0.22
861 0.21
862 0.16
863 0.13
864 0.13
865 0.11
866 0.08
867 0.08
868 0.07
869 0.07
870 0.07
871 0.08
872 0.08
873 0.1
874 0.14
875 0.18
876 0.21
877 0.23
878 0.23
879 0.23
880 0.24
881 0.23
882 0.2
883 0.2
884 0.19
885 0.16
886 0.16
887 0.13
888 0.11
889 0.11
890 0.1
891 0.06
892 0.05
893 0.05
894 0.06
895 0.07
896 0.07
897 0.1
898 0.1
899 0.15
900 0.17
901 0.23
902 0.33
903 0.37
904 0.39
905 0.44
906 0.47
907 0.45
908 0.49
909 0.49
910 0.4
911 0.36
912 0.34
913 0.3
914 0.3
915 0.29
916 0.32
917 0.26
918 0.26
919 0.3
920 0.34
921 0.36
922 0.42
923 0.49
924 0.45
925 0.48
926 0.51
927 0.49
928 0.47
929 0.44
930 0.35
931 0.26
932 0.27
933 0.23
934 0.19
935 0.17
936 0.15
937 0.13
938 0.14
939 0.14
940 0.12
941 0.13
942 0.12
943 0.16
944 0.25
945 0.28
946 0.33
947 0.35
948 0.35
949 0.37
950 0.43
951 0.46
952 0.45
953 0.48
954 0.46
955 0.46
956 0.49
957 0.46
958 0.41
959 0.34
960 0.26
961 0.19
962 0.16
963 0.13
964 0.1
965 0.1
966 0.09
967 0.1
968 0.11
969 0.11
970 0.11
971 0.11
972 0.11
973 0.12
974 0.13
975 0.12
976 0.12
977 0.14
978 0.15
979 0.18
980 0.24
981 0.26
982 0.28
983 0.29
984 0.29
985 0.27
986 0.29
987 0.27
988 0.21
989 0.18
990 0.14
991 0.13
992 0.12
993 0.1
994 0.07
995 0.07
996 0.06
997 0.07
998 0.12
999 0.13
1000 0.22
1001 0.26
1002 0.28
1003 0.3
1004 0.36
1005 0.39
1006 0.39
1007 0.38
1008 0.31
1009 0.37
1010 0.38
1011 0.38
1012 0.34
1013 0.31
1014 0.28
1015 0.34
1016 0.38
1017 0.35
1018 0.37
1019 0.35
1020 0.35
1021 0.39
1022 0.41
1023 0.37
1024 0.38
1025 0.35
1026 0.32
1027 0.33
1028 0.3
1029 0.28
1030 0.3
1031 0.28
1032 0.25
1033 0.26
1034 0.28
1035 0.28
1036 0.31
1037 0.3
1038 0.27
1039 0.28
1040 0.24
1041 0.2
1042 0.17
1043 0.13
1044 0.09
1045 0.08
1046 0.07
1047 0.06
1048 0.08
1049 0.08
1050 0.08
1051 0.09
1052 0.09
1053 0.1
1054 0.14
1055 0.21
1056 0.24
1057 0.3
1058 0.33
1059 0.41
1060 0.42
1061 0.43
1062 0.45
1063 0.45
1064 0.51
1065 0.54
1066 0.59
1067 0.51
1068 0.55
1069 0.6
1070 0.59
1071 0.55
1072 0.49
1073 0.46
1074 0.46
1075 0.5
1076 0.47
1077 0.45
1078 0.41
1079 0.39
1080 0.38
1081 0.33
1082 0.3
1083 0.33
1084 0.36