Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

V5IN45

Protein Details
Accession V5IN45    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
293-321TTDMPPPSFKRQVKKKKDHSALLGIKKKQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
303-313RQVKKKKDHSA
318-319KK
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 11, mito 6, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007590  Saf4/Yju2  
IPR043701  Yju2  
Gene Ontology GO:0071006  C:U2-type catalytic step 1 spliceosome  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0000349  P:generation of catalytic spliceosome for first transesterification step  
GO:0008380  P:RNA splicing  
KEGG ncr:NCU01390  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04502  Saf4_Yju2  
Amino Acid Sequences MSERKVLTKYYPPDFDPSLVGRSRQPKQTGPKVQTVRLMAPFSLRCSTCGEYMYKGRKFNARKETPVDERYLGIQIYRFYIRCTRCSAEIVFRTDPKNQDYAVEKGAKRNTEPWRRGLEGELEETDEQRLDRIEREMADENGEIAQAEERNAMAELEQKTADAKREMAVADALDEIRSRNARLERAQREGGVDIESVLGGRGLSEEEERRRREEEEDAEAARKAFEFARLQQKLEETPAEEEVLGLPSIPGAAANGEGSSGSSPSAGIGPSSASSTAATATAATASNPASAATTDMPPPSFKRQVKKKKDHSALLGIKKKQPLV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.51
2 0.46
3 0.41
4 0.37
5 0.35
6 0.32
7 0.32
8 0.33
9 0.39
10 0.44
11 0.48
12 0.51
13 0.53
14 0.61
15 0.7
16 0.73
17 0.7
18 0.74
19 0.71
20 0.69
21 0.67
22 0.61
23 0.55
24 0.5
25 0.47
26 0.37
27 0.38
28 0.35
29 0.33
30 0.35
31 0.3
32 0.27
33 0.3
34 0.33
35 0.29
36 0.3
37 0.28
38 0.27
39 0.35
40 0.43
41 0.42
42 0.43
43 0.44
44 0.51
45 0.55
46 0.6
47 0.62
48 0.6
49 0.6
50 0.63
51 0.67
52 0.66
53 0.63
54 0.57
55 0.47
56 0.41
57 0.37
58 0.32
59 0.25
60 0.18
61 0.17
62 0.14
63 0.16
64 0.18
65 0.17
66 0.18
67 0.26
68 0.28
69 0.29
70 0.34
71 0.34
72 0.33
73 0.36
74 0.36
75 0.36
76 0.38
77 0.41
78 0.37
79 0.37
80 0.38
81 0.39
82 0.4
83 0.34
84 0.32
85 0.26
86 0.27
87 0.28
88 0.28
89 0.28
90 0.32
91 0.29
92 0.33
93 0.37
94 0.35
95 0.33
96 0.39
97 0.44
98 0.47
99 0.5
100 0.49
101 0.51
102 0.51
103 0.5
104 0.44
105 0.39
106 0.3
107 0.29
108 0.24
109 0.2
110 0.18
111 0.17
112 0.16
113 0.11
114 0.09
115 0.07
116 0.08
117 0.07
118 0.09
119 0.1
120 0.12
121 0.11
122 0.16
123 0.17
124 0.17
125 0.17
126 0.16
127 0.14
128 0.12
129 0.12
130 0.08
131 0.06
132 0.06
133 0.05
134 0.05
135 0.05
136 0.05
137 0.06
138 0.06
139 0.06
140 0.05
141 0.1
142 0.1
143 0.11
144 0.11
145 0.11
146 0.12
147 0.13
148 0.15
149 0.11
150 0.1
151 0.09
152 0.11
153 0.11
154 0.1
155 0.1
156 0.07
157 0.07
158 0.07
159 0.06
160 0.05
161 0.05
162 0.05
163 0.07
164 0.08
165 0.08
166 0.12
167 0.15
168 0.19
169 0.24
170 0.34
171 0.35
172 0.4
173 0.41
174 0.36
175 0.35
176 0.32
177 0.27
178 0.18
179 0.14
180 0.09
181 0.08
182 0.07
183 0.06
184 0.05
185 0.04
186 0.03
187 0.03
188 0.03
189 0.03
190 0.05
191 0.07
192 0.11
193 0.18
194 0.25
195 0.27
196 0.3
197 0.31
198 0.32
199 0.34
200 0.36
201 0.33
202 0.32
203 0.33
204 0.31
205 0.3
206 0.29
207 0.26
208 0.19
209 0.15
210 0.11
211 0.09
212 0.13
213 0.15
214 0.2
215 0.3
216 0.32
217 0.32
218 0.33
219 0.34
220 0.31
221 0.31
222 0.27
223 0.18
224 0.19
225 0.19
226 0.18
227 0.15
228 0.14
229 0.12
230 0.12
231 0.09
232 0.07
233 0.06
234 0.05
235 0.05
236 0.05
237 0.04
238 0.03
239 0.04
240 0.04
241 0.05
242 0.05
243 0.05
244 0.05
245 0.06
246 0.06
247 0.06
248 0.06
249 0.05
250 0.05
251 0.06
252 0.07
253 0.07
254 0.06
255 0.06
256 0.07
257 0.08
258 0.09
259 0.09
260 0.09
261 0.09
262 0.09
263 0.1
264 0.09
265 0.08
266 0.07
267 0.07
268 0.07
269 0.07
270 0.07
271 0.08
272 0.09
273 0.09
274 0.09
275 0.09
276 0.09
277 0.09
278 0.11
279 0.12
280 0.13
281 0.15
282 0.17
283 0.18
284 0.2
285 0.25
286 0.31
287 0.39
288 0.43
289 0.52
290 0.61
291 0.71
292 0.79
293 0.86
294 0.88
295 0.89
296 0.92
297 0.9
298 0.86
299 0.85
300 0.83
301 0.83
302 0.8
303 0.74
304 0.71