Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1J9RK45

Protein Details
Accession A0A1J9RK45    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1039-1067GYGISSSPPKGKRKRKKFRSTDADFAEKDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
747-747R
1046-1057PPKGKRKRKKFR
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 13, cyto 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012310  DNA_ligase_ATP-dep_cent  
IPR012308  DNA_ligase_ATP-dep_N  
IPR036599  DNA_ligase_N_sf  
IPR029710  LIG4  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003910  F:DNA ligase (ATP) activity  
GO:0051103  P:DNA ligation involved in DNA repair  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006260  P:DNA replication  
Pfam View protein in Pfam  
PF01068  DNA_ligase_A_M  
PF04675  DNA_ligase_A_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50160  DNA_LIGASE_A3  
CDD cd08039  Adenylation_DNA_ligase_Fungal  
Amino Acid Sequences MGFKFSYVCDLFTSLEANLTLKTSTASSVRNPDVATIINWFNQHGKQIHGGETDRLALLSCLFPERRPERVFGLKEPSLVKVIGRCLLLGTSRRLALDSYKICGNGDLGQCVENVMRQAENDDLEQPGVTVEEVDAVWNAIASRCRFSSLDVRRQRSATSVDEALGPILRRLTSRDAKWFTRITLKDLSPLTLPASLVLRNFHFLFPDLLLLQDSLIAAVDLLSRDPIKQFPWRPDPAYAKLLAAFASSHISLTIGVKVGRSMFYKARSIKHCCEMVGKRTMSVERKYDGEYCQIHIDISKDSGCIRIFSKSGKDSTSDRSGIHSTVKECLKIGKPGCKMSKNCILEGELLVWSDMESKLLPFHKLRKHVKRSGSFIGTENDSPAYFYEHLYIMLFDVLLIDDQVCLPKSYRERRALLRRISHPIDGRAGIAEQEYIDFSLSNSQEILRNSFATAISQRWEGLVLKSSEEPYFNIGQHECTSLGHWIKMKQDYIPGIGDTADFAVIGARYDAREAAQLRAIEGVKWTSFFVGCRDSSSKYPYDARPMFRVVDLLNRHNVNAEFIRTLNQSGQFCSCDADDDGAPFTIKKDQVQLPKVQVLFKNPFVVEMVGSGFEKPAGVNYFTLRFPRVLKIHMDRDAEDATTLKELQELAEAANSVPTDELSQEAALMAGRLGEVDGKSGYIIDPPDHSSMSPASIIPLSNMDNEQSNISLRPLAMNELDLVPSVRNRTDIDASQKGTRAVSRKRPKITKLRSPCIAIHSDNTQTSADTPPSHPQDNSLNRHLSDLTNLSQPTPVPTYINTNDRENVNDARIHDNEVKWSTTHEERDEDKLHYFPQPRQRNGPVPYPPHDQQCSPEPNFGLVVSNLTVGTDTFDNKPMPSVPVSPSFLSETPVLLGTGVSHDKVGSILLGTAQLLTSTTDFLGRVFDAKFPDTSMLHSSSLGRTQAFPRCSGIVLVESNTANAPQAASDIARIGNALVTTQRAGDMPSQKGKIIFLRYGALLQHGFFENNQTGPLENIQERRKRLGKRLFAGCLKWGYGISSSPPKGKRKRKKFRSTDADFAEKDGAGRALANDSPSLRTMDVDVQLTWDWREVLSLG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.16
3 0.16
4 0.15
5 0.13
6 0.13
7 0.12
8 0.11
9 0.12
10 0.11
11 0.13
12 0.16
13 0.19
14 0.23
15 0.31
16 0.34
17 0.36
18 0.35
19 0.33
20 0.32
21 0.3
22 0.25
23 0.22
24 0.21
25 0.21
26 0.22
27 0.22
28 0.24
29 0.24
30 0.3
31 0.27
32 0.29
33 0.33
34 0.36
35 0.38
36 0.39
37 0.39
38 0.34
39 0.34
40 0.32
41 0.25
42 0.22
43 0.18
44 0.14
45 0.14
46 0.12
47 0.12
48 0.16
49 0.17
50 0.19
51 0.28
52 0.32
53 0.39
54 0.4
55 0.43
56 0.44
57 0.53
58 0.55
59 0.51
60 0.56
61 0.48
62 0.49
63 0.48
64 0.43
65 0.36
66 0.32
67 0.28
68 0.23
69 0.25
70 0.25
71 0.24
72 0.22
73 0.2
74 0.21
75 0.24
76 0.24
77 0.26
78 0.25
79 0.26
80 0.27
81 0.27
82 0.26
83 0.26
84 0.31
85 0.28
86 0.28
87 0.29
88 0.29
89 0.29
90 0.28
91 0.25
92 0.23
93 0.23
94 0.22
95 0.2
96 0.2
97 0.19
98 0.2
99 0.18
100 0.13
101 0.13
102 0.12
103 0.12
104 0.12
105 0.14
106 0.16
107 0.17
108 0.17
109 0.16
110 0.15
111 0.15
112 0.15
113 0.12
114 0.1
115 0.09
116 0.07
117 0.06
118 0.05
119 0.06
120 0.06
121 0.07
122 0.07
123 0.07
124 0.07
125 0.07
126 0.07
127 0.08
128 0.13
129 0.15
130 0.18
131 0.19
132 0.23
133 0.23
134 0.27
135 0.35
136 0.39
137 0.48
138 0.53
139 0.58
140 0.59
141 0.6
142 0.57
143 0.51
144 0.46
145 0.39
146 0.35
147 0.3
148 0.27
149 0.26
150 0.25
151 0.22
152 0.19
153 0.15
154 0.12
155 0.12
156 0.12
157 0.12
158 0.17
159 0.25
160 0.3
161 0.34
162 0.43
163 0.47
164 0.5
165 0.55
166 0.53
167 0.47
168 0.49
169 0.46
170 0.41
171 0.43
172 0.4
173 0.4
174 0.39
175 0.38
176 0.29
177 0.29
178 0.25
179 0.19
180 0.19
181 0.14
182 0.15
183 0.15
184 0.15
185 0.17
186 0.16
187 0.18
188 0.19
189 0.18
190 0.18
191 0.18
192 0.18
193 0.16
194 0.17
195 0.13
196 0.12
197 0.13
198 0.11
199 0.1
200 0.08
201 0.08
202 0.06
203 0.06
204 0.05
205 0.04
206 0.04
207 0.05
208 0.05
209 0.05
210 0.07
211 0.07
212 0.09
213 0.1
214 0.12
215 0.15
216 0.24
217 0.3
218 0.37
219 0.45
220 0.5
221 0.51
222 0.57
223 0.59
224 0.55
225 0.54
226 0.46
227 0.38
228 0.34
229 0.31
230 0.23
231 0.17
232 0.12
233 0.09
234 0.11
235 0.1
236 0.09
237 0.09
238 0.09
239 0.09
240 0.1
241 0.11
242 0.1
243 0.1
244 0.1
245 0.11
246 0.12
247 0.14
248 0.15
249 0.17
250 0.2
251 0.24
252 0.31
253 0.35
254 0.41
255 0.46
256 0.52
257 0.53
258 0.55
259 0.53
260 0.47
261 0.51
262 0.49
263 0.48
264 0.48
265 0.43
266 0.37
267 0.39
268 0.44
269 0.41
270 0.4
271 0.38
272 0.31
273 0.33
274 0.34
275 0.35
276 0.3
277 0.31
278 0.28
279 0.26
280 0.27
281 0.25
282 0.22
283 0.2
284 0.2
285 0.14
286 0.14
287 0.13
288 0.11
289 0.11
290 0.15
291 0.15
292 0.15
293 0.15
294 0.16
295 0.17
296 0.19
297 0.25
298 0.25
299 0.26
300 0.26
301 0.28
302 0.27
303 0.32
304 0.36
305 0.32
306 0.29
307 0.3
308 0.31
309 0.29
310 0.3
311 0.27
312 0.21
313 0.26
314 0.27
315 0.24
316 0.22
317 0.27
318 0.26
319 0.31
320 0.34
321 0.36
322 0.39
323 0.46
324 0.53
325 0.55
326 0.54
327 0.53
328 0.59
329 0.53
330 0.49
331 0.43
332 0.38
333 0.31
334 0.29
335 0.24
336 0.15
337 0.12
338 0.11
339 0.09
340 0.08
341 0.08
342 0.07
343 0.06
344 0.06
345 0.06
346 0.11
347 0.12
348 0.16
349 0.17
350 0.26
351 0.31
352 0.41
353 0.51
354 0.58
355 0.66
356 0.71
357 0.77
358 0.75
359 0.75
360 0.72
361 0.64
362 0.55
363 0.47
364 0.42
365 0.35
366 0.29
367 0.23
368 0.17
369 0.14
370 0.13
371 0.11
372 0.13
373 0.11
374 0.12
375 0.12
376 0.12
377 0.12
378 0.12
379 0.12
380 0.08
381 0.07
382 0.07
383 0.04
384 0.04
385 0.04
386 0.04
387 0.04
388 0.03
389 0.03
390 0.04
391 0.05
392 0.06
393 0.06
394 0.07
395 0.12
396 0.21
397 0.29
398 0.38
399 0.43
400 0.47
401 0.55
402 0.65
403 0.68
404 0.67
405 0.65
406 0.61
407 0.62
408 0.6
409 0.55
410 0.47
411 0.41
412 0.36
413 0.3
414 0.26
415 0.19
416 0.16
417 0.12
418 0.1
419 0.08
420 0.05
421 0.05
422 0.05
423 0.05
424 0.05
425 0.05
426 0.05
427 0.1
428 0.1
429 0.1
430 0.1
431 0.11
432 0.14
433 0.15
434 0.18
435 0.13
436 0.14
437 0.14
438 0.15
439 0.14
440 0.12
441 0.13
442 0.11
443 0.11
444 0.11
445 0.11
446 0.1
447 0.11
448 0.1
449 0.1
450 0.13
451 0.12
452 0.13
453 0.14
454 0.15
455 0.15
456 0.15
457 0.14
458 0.13
459 0.15
460 0.14
461 0.15
462 0.14
463 0.15
464 0.15
465 0.16
466 0.13
467 0.11
468 0.11
469 0.14
470 0.14
471 0.14
472 0.15
473 0.16
474 0.2
475 0.23
476 0.23
477 0.19
478 0.22
479 0.21
480 0.21
481 0.2
482 0.16
483 0.13
484 0.12
485 0.11
486 0.08
487 0.07
488 0.05
489 0.04
490 0.03
491 0.04
492 0.04
493 0.04
494 0.04
495 0.04
496 0.04
497 0.05
498 0.05
499 0.05
500 0.08
501 0.1
502 0.1
503 0.13
504 0.13
505 0.13
506 0.16
507 0.16
508 0.12
509 0.12
510 0.12
511 0.09
512 0.09
513 0.09
514 0.07
515 0.07
516 0.08
517 0.09
518 0.11
519 0.11
520 0.13
521 0.16
522 0.17
523 0.19
524 0.22
525 0.21
526 0.2
527 0.25
528 0.23
529 0.3
530 0.32
531 0.32
532 0.31
533 0.32
534 0.3
535 0.26
536 0.25
537 0.16
538 0.19
539 0.2
540 0.19
541 0.21
542 0.2
543 0.2
544 0.21
545 0.2
546 0.16
547 0.14
548 0.14
549 0.11
550 0.11
551 0.13
552 0.11
553 0.12
554 0.12
555 0.15
556 0.14
557 0.15
558 0.16
559 0.15
560 0.14
561 0.14
562 0.12
563 0.1
564 0.1
565 0.1
566 0.09
567 0.08
568 0.09
569 0.08
570 0.08
571 0.07
572 0.07
573 0.1
574 0.11
575 0.11
576 0.15
577 0.21
578 0.28
579 0.31
580 0.34
581 0.32
582 0.35
583 0.35
584 0.33
585 0.29
586 0.28
587 0.28
588 0.26
589 0.27
590 0.23
591 0.22
592 0.2
593 0.19
594 0.13
595 0.1
596 0.09
597 0.07
598 0.07
599 0.06
600 0.05
601 0.05
602 0.05
603 0.04
604 0.07
605 0.08
606 0.09
607 0.09
608 0.11
609 0.13
610 0.14
611 0.15
612 0.14
613 0.14
614 0.14
615 0.2
616 0.2
617 0.2
618 0.25
619 0.29
620 0.33
621 0.37
622 0.36
623 0.31
624 0.32
625 0.31
626 0.26
627 0.2
628 0.16
629 0.11
630 0.1
631 0.1
632 0.07
633 0.07
634 0.07
635 0.07
636 0.07
637 0.07
638 0.06
639 0.07
640 0.07
641 0.06
642 0.07
643 0.07
644 0.06
645 0.05
646 0.05
647 0.05
648 0.05
649 0.06
650 0.06
651 0.06
652 0.06
653 0.06
654 0.06
655 0.05
656 0.05
657 0.04
658 0.03
659 0.03
660 0.03
661 0.03
662 0.04
663 0.04
664 0.05
665 0.06
666 0.06
667 0.06
668 0.06
669 0.06
670 0.06
671 0.07
672 0.07
673 0.09
674 0.12
675 0.13
676 0.13
677 0.13
678 0.13
679 0.13
680 0.13
681 0.12
682 0.09
683 0.09
684 0.09
685 0.09
686 0.08
687 0.1
688 0.1
689 0.1
690 0.1
691 0.1
692 0.1
693 0.11
694 0.11
695 0.1
696 0.1
697 0.09
698 0.1
699 0.1
700 0.09
701 0.09
702 0.09
703 0.11
704 0.1
705 0.1
706 0.1
707 0.09
708 0.1
709 0.08
710 0.09
711 0.07
712 0.08
713 0.1
714 0.1
715 0.11
716 0.12
717 0.16
718 0.18
719 0.21
720 0.26
721 0.29
722 0.31
723 0.31
724 0.32
725 0.29
726 0.27
727 0.28
728 0.28
729 0.32
730 0.41
731 0.49
732 0.56
733 0.64
734 0.7
735 0.74
736 0.78
737 0.79
738 0.79
739 0.79
740 0.77
741 0.72
742 0.69
743 0.63
744 0.56
745 0.51
746 0.42
747 0.34
748 0.3
749 0.29
750 0.26
751 0.26
752 0.21
753 0.17
754 0.17
755 0.18
756 0.16
757 0.15
758 0.18
759 0.23
760 0.27
761 0.29
762 0.27
763 0.28
764 0.36
765 0.42
766 0.46
767 0.44
768 0.43
769 0.4
770 0.42
771 0.4
772 0.31
773 0.26
774 0.23
775 0.19
776 0.2
777 0.2
778 0.19
779 0.19
780 0.19
781 0.19
782 0.19
783 0.18
784 0.15
785 0.16
786 0.22
787 0.25
788 0.31
789 0.3
790 0.3
791 0.32
792 0.32
793 0.33
794 0.29
795 0.28
796 0.24
797 0.24
798 0.24
799 0.26
800 0.26
801 0.28
802 0.28
803 0.27
804 0.3
805 0.29
806 0.28
807 0.23
808 0.25
809 0.24
810 0.26
811 0.3
812 0.27
813 0.29
814 0.3
815 0.37
816 0.38
817 0.35
818 0.31
819 0.29
820 0.28
821 0.31
822 0.32
823 0.32
824 0.4
825 0.47
826 0.5
827 0.56
828 0.61
829 0.63
830 0.63
831 0.65
832 0.62
833 0.58
834 0.59
835 0.59
836 0.56
837 0.54
838 0.53
839 0.45
840 0.41
841 0.44
842 0.47
843 0.42
844 0.42
845 0.36
846 0.34
847 0.34
848 0.3
849 0.23
850 0.15
851 0.15
852 0.11
853 0.11
854 0.1
855 0.09
856 0.09
857 0.07
858 0.09
859 0.08
860 0.1
861 0.11
862 0.15
863 0.16
864 0.16
865 0.18
866 0.18
867 0.19
868 0.2
869 0.21
870 0.21
871 0.26
872 0.29
873 0.28
874 0.28
875 0.29
876 0.27
877 0.26
878 0.23
879 0.18
880 0.15
881 0.16
882 0.14
883 0.1
884 0.09
885 0.07
886 0.1
887 0.11
888 0.1
889 0.1
890 0.1
891 0.1
892 0.1
893 0.1
894 0.06
895 0.06
896 0.05
897 0.06
898 0.06
899 0.06
900 0.06
901 0.06
902 0.05
903 0.06
904 0.07
905 0.07
906 0.08
907 0.08
908 0.09
909 0.09
910 0.09
911 0.11
912 0.1
913 0.12
914 0.12
915 0.15
916 0.17
917 0.19
918 0.19
919 0.18
920 0.21
921 0.19
922 0.21
923 0.23
924 0.23
925 0.22
926 0.22
927 0.23
928 0.22
929 0.25
930 0.24
931 0.21
932 0.2
933 0.26
934 0.33
935 0.33
936 0.32
937 0.32
938 0.31
939 0.31
940 0.29
941 0.24
942 0.2
943 0.19
944 0.19
945 0.18
946 0.17
947 0.17
948 0.16
949 0.15
950 0.12
951 0.11
952 0.1
953 0.07
954 0.08
955 0.08
956 0.08
957 0.08
958 0.09
959 0.09
960 0.09
961 0.09
962 0.08
963 0.09
964 0.09
965 0.09
966 0.08
967 0.1
968 0.11
969 0.11
970 0.11
971 0.1
972 0.12
973 0.18
974 0.24
975 0.28
976 0.35
977 0.36
978 0.37
979 0.38
980 0.39
981 0.39
982 0.38
983 0.34
984 0.29
985 0.3
986 0.29
987 0.3
988 0.27
989 0.24
990 0.19
991 0.17
992 0.18
993 0.17
994 0.17
995 0.16
996 0.21
997 0.19
998 0.19
999 0.2
1000 0.18
1001 0.17
1002 0.18
1003 0.2
1004 0.2
1005 0.22
1006 0.29
1007 0.36
1008 0.43
1009 0.46
1010 0.53
1011 0.58
1012 0.61
1013 0.67
1014 0.7
1015 0.72
1016 0.73
1017 0.77
1018 0.77
1019 0.74
1020 0.69
1021 0.63
1022 0.56
1023 0.47
1024 0.4
1025 0.32
1026 0.26
1027 0.23
1028 0.21
1029 0.22
1030 0.28
1031 0.3
1032 0.37
1033 0.44
1034 0.53
1035 0.61
1036 0.71
1037 0.77
1038 0.79
1039 0.87
1040 0.91
1041 0.95
1042 0.95
1043 0.96
1044 0.95
1045 0.92
1046 0.9
1047 0.85
1048 0.81
1049 0.7
1050 0.62
1051 0.53
1052 0.42
1053 0.35
1054 0.27
1055 0.21
1056 0.14
1057 0.14
1058 0.13
1059 0.14
1060 0.15
1061 0.17
1062 0.17
1063 0.18
1064 0.2
1065 0.21
1066 0.22
1067 0.19
1068 0.18
1069 0.2
1070 0.23
1071 0.25
1072 0.25
1073 0.23
1074 0.23
1075 0.24
1076 0.25
1077 0.23
1078 0.19
1079 0.16
1080 0.14