Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1J9QXC0

Protein Details
Accession A0A1J9QXC0    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
9-37HGGGGDKPSKKSKKSKLWFNKSNTRQWSYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
6-24KRAHGGGGDKPSKKSKKSK
Subcellular Location(s) nucl 13, mito 4.5, cyto_mito 4.5, cyto 3.5, plas 2, pero 1, E.R. 1, cysk 1, vacu 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004114  THUMP_dom  
IPR040183  THUMPD1-like  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006400  P:tRNA modification  
Pfam View protein in Pfam  
PF02926  THUMP  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51165  THUMP  
CDD cd11717  THUMP_THUMPD1_like  
Amino Acid Sequences MSGPAKRAHGGGGDKPSKKSKKSKLWFNKSNTRQWSYRRVIERGDAGMFVTSNRGKEAKCVSEMIDILYQDLESQRLLAGTPNDETATSDTGSKQEEEKDGDDIEAQIHKEVDDMKPNKDKKITSPFQAVKLDIPCLSFIKIDKTLDPVQIANRLFTEARENPTKKRSRWIQRITPITLTQKVLGGGIEQLSREVLKPHFHAGGPSKKYAIRTSIRNNTEWTRDTLIPLVAKAVGPGHSVDLKNYDLLILVDIVQNICGMSVVGPDYDELKRYNLSEIYDPTPKPGPKPSSAPVPPAAAPVEKGIAPANTADATAPTPAIPAAVEERNE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.48
2 0.53
3 0.61
4 0.63
5 0.67
6 0.71
7 0.71
8 0.74
9 0.81
10 0.87
11 0.88
12 0.91
13 0.91
14 0.9
15 0.9
16 0.86
17 0.86
18 0.82
19 0.77
20 0.73
21 0.7
22 0.72
23 0.68
24 0.69
25 0.66
26 0.61
27 0.58
28 0.57
29 0.54
30 0.46
31 0.39
32 0.31
33 0.25
34 0.22
35 0.18
36 0.14
37 0.16
38 0.15
39 0.15
40 0.17
41 0.19
42 0.19
43 0.25
44 0.32
45 0.3
46 0.31
47 0.31
48 0.3
49 0.32
50 0.32
51 0.28
52 0.24
53 0.19
54 0.17
55 0.16
56 0.14
57 0.11
58 0.11
59 0.09
60 0.07
61 0.07
62 0.07
63 0.07
64 0.07
65 0.09
66 0.11
67 0.12
68 0.13
69 0.13
70 0.13
71 0.13
72 0.15
73 0.14
74 0.14
75 0.12
76 0.13
77 0.12
78 0.14
79 0.15
80 0.15
81 0.14
82 0.15
83 0.18
84 0.2
85 0.21
86 0.21
87 0.19
88 0.19
89 0.17
90 0.14
91 0.13
92 0.11
93 0.11
94 0.1
95 0.09
96 0.09
97 0.09
98 0.11
99 0.12
100 0.19
101 0.21
102 0.25
103 0.34
104 0.36
105 0.39
106 0.42
107 0.41
108 0.4
109 0.49
110 0.47
111 0.43
112 0.5
113 0.49
114 0.49
115 0.49
116 0.42
117 0.35
118 0.32
119 0.3
120 0.21
121 0.19
122 0.15
123 0.14
124 0.14
125 0.12
126 0.11
127 0.14
128 0.16
129 0.16
130 0.16
131 0.2
132 0.21
133 0.21
134 0.22
135 0.18
136 0.16
137 0.21
138 0.21
139 0.16
140 0.14
141 0.15
142 0.14
143 0.14
144 0.19
145 0.16
146 0.19
147 0.27
148 0.28
149 0.3
150 0.39
151 0.45
152 0.4
153 0.46
154 0.52
155 0.55
156 0.64
157 0.68
158 0.68
159 0.69
160 0.73
161 0.66
162 0.59
163 0.52
164 0.44
165 0.39
166 0.31
167 0.24
168 0.2
169 0.18
170 0.16
171 0.12
172 0.09
173 0.07
174 0.07
175 0.07
176 0.06
177 0.06
178 0.06
179 0.07
180 0.07
181 0.09
182 0.1
183 0.13
184 0.14
185 0.17
186 0.18
187 0.18
188 0.22
189 0.25
190 0.33
191 0.32
192 0.32
193 0.31
194 0.31
195 0.34
196 0.33
197 0.33
198 0.29
199 0.33
200 0.41
201 0.49
202 0.49
203 0.48
204 0.49
205 0.45
206 0.46
207 0.4
208 0.36
209 0.31
210 0.29
211 0.29
212 0.27
213 0.26
214 0.21
215 0.19
216 0.16
217 0.12
218 0.11
219 0.1
220 0.1
221 0.08
222 0.09
223 0.09
224 0.11
225 0.14
226 0.15
227 0.15
228 0.17
229 0.17
230 0.16
231 0.16
232 0.13
233 0.1
234 0.1
235 0.09
236 0.07
237 0.07
238 0.07
239 0.08
240 0.08
241 0.07
242 0.07
243 0.06
244 0.06
245 0.05
246 0.04
247 0.04
248 0.05
249 0.06
250 0.06
251 0.06
252 0.07
253 0.1
254 0.1
255 0.12
256 0.13
257 0.14
258 0.16
259 0.17
260 0.21
261 0.2
262 0.22
263 0.24
264 0.27
265 0.29
266 0.34
267 0.33
268 0.33
269 0.38
270 0.37
271 0.37
272 0.42
273 0.44
274 0.43
275 0.5
276 0.5
277 0.53
278 0.54
279 0.55
280 0.48
281 0.46
282 0.41
283 0.37
284 0.35
285 0.26
286 0.24
287 0.21
288 0.2
289 0.16
290 0.17
291 0.17
292 0.15
293 0.15
294 0.14
295 0.14
296 0.13
297 0.13
298 0.12
299 0.11
300 0.12
301 0.12
302 0.12
303 0.09
304 0.1
305 0.09
306 0.09
307 0.08
308 0.09
309 0.14