Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q1K5X0

Protein Details
Accession Q1K5X0    Localization Confidence High Confidence Score 20.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
5-33VAGSPPPTKSEKKHKDKKRSREEAEEVPABasic
50-78ETETTDKKAKRSKKSKKSKLEAEPEQPEEHydrophilic
91-131SESEAEEKKKRKSKDKKEKKEKKDKKDKKKRQASATPEPEPBasic
383-407LQKEERELERKRRSRQNPGGLLRPMHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
12-28TKSEKKHKDKKRSREEA
36-47DAPKKHKKSKSE
55-68DKKAKRSKKSKKSK
98-122KKKRKSKDKKEKKEKKDKKDKKKRQ
393-395KRR
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 12.333, mito_nucl 12.333, mito 3.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036898  RNA_pol_Rpb7-like_N_sf  
IPR041901  RNAP_I_Rpa43_N  
IPR041178  RPA43_OB  
IPR045113  Rpb7-like  
IPR005576  Rpb7-like_N  
Gene Ontology GO:0005736  C:RNA polymerase I complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
GO:0006360  P:transcription by RNA polymerase I  
KEGG ncr:NCU07166  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF17875  RPA43_OB  
PF03876  SHS2_Rpb7-N  
CDD cd04328  RNAP_I_Rpa43_N  
Amino Acid Sequences MSQSVAGSPPPTKSEKKHKDKKRSREEAEEVPAVEDAPKKHKKSKSESLETETTDKKAKRSKKSKKSKLEAEPEQPEEEEEKPEQEAAVASESEAEEKKKRKSKDKKEKKEKKDKKDKKKRQASATPEPEPETTTDAMDVDTTTTFPTDDDADFPFYTQVHSLYVPFYPCGFDKPITNVAAQHLEPLLNHYSPVLRGVLLRYTNLNLSERPVQASVINPPTDKTPALLRSVDEYAVGFAYLTFDAHIFKPARGKWMEGVVQLQSEGHIGVQCWGRFNASIEAKRLPKGWKWVDLKGDHKSYNQQEEEQQEEEEQQEEEDQLDGEELQVVEQVHTTGYWVDASGKKVSGKVRFRIKNFDVGLAGDYGYLSLEGTFLNDQDERALQKEERELERKRRSRQNPGGLLRPMSRRVPEFSMTKFGKEEEEEDAGQRTVFAKVTGKEGDVTPDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.51
2 0.6
3 0.69
4 0.76
5 0.82
6 0.88
7 0.92
8 0.94
9 0.94
10 0.94
11 0.9
12 0.89
13 0.85
14 0.82
15 0.78
16 0.69
17 0.59
18 0.49
19 0.41
20 0.31
21 0.28
22 0.23
23 0.2
24 0.27
25 0.35
26 0.4
27 0.49
28 0.56
29 0.63
30 0.69
31 0.76
32 0.77
33 0.78
34 0.78
35 0.76
36 0.74
37 0.67
38 0.63
39 0.55
40 0.46
41 0.44
42 0.41
43 0.41
44 0.45
45 0.52
46 0.58
47 0.67
48 0.76
49 0.79
50 0.88
51 0.91
52 0.93
53 0.94
54 0.93
55 0.92
56 0.91
57 0.88
58 0.85
59 0.81
60 0.73
61 0.64
62 0.54
63 0.45
64 0.38
65 0.31
66 0.27
67 0.21
68 0.19
69 0.18
70 0.18
71 0.16
72 0.14
73 0.13
74 0.1
75 0.11
76 0.1
77 0.09
78 0.1
79 0.1
80 0.12
81 0.13
82 0.15
83 0.2
84 0.26
85 0.36
86 0.42
87 0.5
88 0.59
89 0.69
90 0.77
91 0.82
92 0.87
93 0.89
94 0.93
95 0.96
96 0.96
97 0.97
98 0.95
99 0.95
100 0.95
101 0.95
102 0.95
103 0.95
104 0.95
105 0.95
106 0.96
107 0.93
108 0.91
109 0.9
110 0.87
111 0.87
112 0.84
113 0.77
114 0.68
115 0.62
116 0.52
117 0.43
118 0.35
119 0.28
120 0.2
121 0.16
122 0.15
123 0.12
124 0.12
125 0.11
126 0.09
127 0.07
128 0.06
129 0.06
130 0.06
131 0.06
132 0.06
133 0.06
134 0.07
135 0.08
136 0.08
137 0.1
138 0.11
139 0.14
140 0.14
141 0.14
142 0.14
143 0.12
144 0.13
145 0.12
146 0.11
147 0.09
148 0.09
149 0.1
150 0.1
151 0.11
152 0.11
153 0.11
154 0.11
155 0.11
156 0.11
157 0.14
158 0.15
159 0.14
160 0.15
161 0.19
162 0.24
163 0.24
164 0.24
165 0.21
166 0.2
167 0.22
168 0.2
169 0.17
170 0.13
171 0.11
172 0.11
173 0.13
174 0.14
175 0.11
176 0.11
177 0.1
178 0.11
179 0.11
180 0.12
181 0.09
182 0.07
183 0.07
184 0.09
185 0.12
186 0.12
187 0.12
188 0.12
189 0.12
190 0.13
191 0.14
192 0.14
193 0.11
194 0.13
195 0.17
196 0.17
197 0.17
198 0.17
199 0.16
200 0.15
201 0.16
202 0.17
203 0.16
204 0.16
205 0.15
206 0.15
207 0.16
208 0.17
209 0.16
210 0.13
211 0.13
212 0.15
213 0.17
214 0.18
215 0.16
216 0.18
217 0.18
218 0.17
219 0.13
220 0.11
221 0.09
222 0.08
223 0.07
224 0.04
225 0.03
226 0.05
227 0.05
228 0.04
229 0.04
230 0.05
231 0.06
232 0.07
233 0.12
234 0.12
235 0.13
236 0.18
237 0.19
238 0.25
239 0.24
240 0.25
241 0.22
242 0.26
243 0.26
244 0.21
245 0.22
246 0.16
247 0.16
248 0.14
249 0.13
250 0.08
251 0.07
252 0.06
253 0.05
254 0.05
255 0.05
256 0.08
257 0.12
258 0.12
259 0.13
260 0.13
261 0.14
262 0.14
263 0.16
264 0.2
265 0.22
266 0.24
267 0.25
268 0.3
269 0.3
270 0.31
271 0.33
272 0.29
273 0.28
274 0.35
275 0.37
276 0.41
277 0.44
278 0.47
279 0.5
280 0.51
281 0.52
282 0.49
283 0.5
284 0.42
285 0.4
286 0.43
287 0.42
288 0.45
289 0.42
290 0.37
291 0.37
292 0.39
293 0.41
294 0.34
295 0.29
296 0.21
297 0.21
298 0.19
299 0.16
300 0.12
301 0.09
302 0.08
303 0.08
304 0.08
305 0.07
306 0.06
307 0.06
308 0.06
309 0.05
310 0.05
311 0.06
312 0.05
313 0.05
314 0.07
315 0.08
316 0.08
317 0.08
318 0.08
319 0.07
320 0.07
321 0.08
322 0.06
323 0.06
324 0.06
325 0.06
326 0.1
327 0.13
328 0.16
329 0.18
330 0.2
331 0.2
332 0.24
333 0.3
334 0.36
335 0.4
336 0.45
337 0.54
338 0.59
339 0.62
340 0.67
341 0.63
342 0.63
343 0.57
344 0.52
345 0.42
346 0.35
347 0.33
348 0.23
349 0.21
350 0.12
351 0.1
352 0.07
353 0.07
354 0.06
355 0.05
356 0.04
357 0.04
358 0.04
359 0.07
360 0.07
361 0.07
362 0.1
363 0.1
364 0.11
365 0.12
366 0.15
367 0.14
368 0.16
369 0.2
370 0.18
371 0.22
372 0.28
373 0.32
374 0.37
375 0.43
376 0.49
377 0.55
378 0.65
379 0.7
380 0.73
381 0.78
382 0.8
383 0.84
384 0.87
385 0.87
386 0.86
387 0.83
388 0.82
389 0.75
390 0.7
391 0.64
392 0.59
393 0.53
394 0.48
395 0.47
396 0.42
397 0.44
398 0.45
399 0.45
400 0.44
401 0.42
402 0.47
403 0.44
404 0.43
405 0.39
406 0.35
407 0.34
408 0.32
409 0.31
410 0.26
411 0.29
412 0.27
413 0.28
414 0.29
415 0.25
416 0.22
417 0.21
418 0.17
419 0.15
420 0.15
421 0.16
422 0.19
423 0.2
424 0.26
425 0.27
426 0.27
427 0.27
428 0.27