Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1J9QFD3

Protein Details
Accession A0A1J9QFD3    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
36-63ENRQLQQALNQERRRRKRGRVMGLLDPSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
48-54RRRRKRG
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 11, cyto 6.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027806  HARBI1_dom  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0046872  F:metal ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF13359  DDE_Tnp_4  
Amino Acid Sequences MIKQVKQRQHQISSDLHQLIRAGENLALDKEILLIENRQLQQALNQERRRRKRGRVMGLLDPSNPSLAQFFSPAKVQRAREQIAADEAIKKSEQARKEDAKLQRAILKEQKEADIMKQRMQRDAARQTAKEQKEMDKAARAAQQQVEKELRDARKAQEQKEKEERAAARLQSRLDKNKIEESKNHLPNRESRPSISQRVAKSRFQSPARVPTDPPPEGYDDITISTNLMAACSLNLPPPKISRSGRVIKPTKHLQDYLYIFISAAATAAVNTVLLAASAAGNNIQMIVSKHRCEEIEEDRSYQYRYRPPVPIMSQFEFESDALADEFIVAKFRFTKDEIRIILPYMRLEMIEWLARYQPSSEMALCIVLARLAYPHRYQDLTSIFGRSASFLASIFNDTVQHLTDRFRDLLLWDCDRLTLEKLKFYCHYIEQRGGGDSIWGYIDGTLQPITRPNVDQRMFYSGHKHRHGIKFQGNVTPDGLLS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.63
2 0.56
3 0.47
4 0.4
5 0.37
6 0.33
7 0.29
8 0.25
9 0.18
10 0.16
11 0.17
12 0.18
13 0.17
14 0.16
15 0.13
16 0.12
17 0.11
18 0.1
19 0.1
20 0.1
21 0.11
22 0.13
23 0.21
24 0.22
25 0.23
26 0.23
27 0.22
28 0.26
29 0.33
30 0.4
31 0.42
32 0.49
33 0.57
34 0.68
35 0.77
36 0.82
37 0.82
38 0.83
39 0.84
40 0.87
41 0.88
42 0.87
43 0.83
44 0.82
45 0.79
46 0.71
47 0.6
48 0.52
49 0.42
50 0.33
51 0.27
52 0.19
53 0.13
54 0.13
55 0.13
56 0.14
57 0.15
58 0.16
59 0.21
60 0.24
61 0.3
62 0.35
63 0.37
64 0.41
65 0.48
66 0.5
67 0.48
68 0.46
69 0.41
70 0.38
71 0.36
72 0.3
73 0.26
74 0.23
75 0.21
76 0.2
77 0.19
78 0.22
79 0.27
80 0.31
81 0.32
82 0.4
83 0.45
84 0.5
85 0.57
86 0.58
87 0.59
88 0.56
89 0.53
90 0.49
91 0.45
92 0.47
93 0.46
94 0.43
95 0.39
96 0.39
97 0.38
98 0.36
99 0.35
100 0.35
101 0.37
102 0.35
103 0.37
104 0.41
105 0.4
106 0.42
107 0.45
108 0.43
109 0.42
110 0.48
111 0.5
112 0.5
113 0.49
114 0.5
115 0.56
116 0.53
117 0.49
118 0.44
119 0.42
120 0.44
121 0.46
122 0.43
123 0.39
124 0.39
125 0.38
126 0.4
127 0.36
128 0.32
129 0.33
130 0.36
131 0.3
132 0.35
133 0.33
134 0.28
135 0.3
136 0.33
137 0.31
138 0.3
139 0.33
140 0.3
141 0.37
142 0.42
143 0.46
144 0.49
145 0.5
146 0.53
147 0.6
148 0.6
149 0.51
150 0.53
151 0.47
152 0.42
153 0.44
154 0.38
155 0.32
156 0.32
157 0.33
158 0.33
159 0.38
160 0.41
161 0.4
162 0.41
163 0.4
164 0.46
165 0.5
166 0.46
167 0.45
168 0.47
169 0.53
170 0.58
171 0.58
172 0.52
173 0.48
174 0.53
175 0.57
176 0.55
177 0.47
178 0.4
179 0.45
180 0.48
181 0.51
182 0.48
183 0.45
184 0.42
185 0.5
186 0.52
187 0.48
188 0.46
189 0.46
190 0.48
191 0.45
192 0.47
193 0.41
194 0.47
195 0.47
196 0.45
197 0.41
198 0.41
199 0.47
200 0.4
201 0.38
202 0.29
203 0.28
204 0.27
205 0.26
206 0.2
207 0.13
208 0.13
209 0.12
210 0.1
211 0.08
212 0.07
213 0.07
214 0.06
215 0.06
216 0.05
217 0.04
218 0.05
219 0.05
220 0.06
221 0.08
222 0.09
223 0.1
224 0.11
225 0.14
226 0.15
227 0.2
228 0.21
229 0.23
230 0.29
231 0.36
232 0.38
233 0.46
234 0.5
235 0.47
236 0.52
237 0.55
238 0.52
239 0.48
240 0.45
241 0.37
242 0.38
243 0.37
244 0.33
245 0.26
246 0.21
247 0.18
248 0.17
249 0.16
250 0.08
251 0.06
252 0.04
253 0.03
254 0.03
255 0.03
256 0.03
257 0.03
258 0.03
259 0.03
260 0.03
261 0.03
262 0.03
263 0.03
264 0.03
265 0.03
266 0.03
267 0.03
268 0.03
269 0.03
270 0.04
271 0.03
272 0.04
273 0.06
274 0.13
275 0.16
276 0.17
277 0.18
278 0.19
279 0.2
280 0.21
281 0.25
282 0.26
283 0.3
284 0.3
285 0.31
286 0.3
287 0.31
288 0.31
289 0.28
290 0.27
291 0.26
292 0.3
293 0.34
294 0.37
295 0.38
296 0.44
297 0.45
298 0.47
299 0.47
300 0.44
301 0.4
302 0.36
303 0.34
304 0.28
305 0.24
306 0.17
307 0.11
308 0.09
309 0.08
310 0.07
311 0.06
312 0.05
313 0.06
314 0.05
315 0.08
316 0.07
317 0.08
318 0.11
319 0.12
320 0.15
321 0.17
322 0.25
323 0.26
324 0.33
325 0.35
326 0.35
327 0.35
328 0.33
329 0.33
330 0.27
331 0.23
332 0.17
333 0.15
334 0.12
335 0.12
336 0.12
337 0.11
338 0.12
339 0.12
340 0.11
341 0.13
342 0.14
343 0.14
344 0.13
345 0.13
346 0.13
347 0.16
348 0.15
349 0.14
350 0.14
351 0.13
352 0.12
353 0.11
354 0.08
355 0.06
356 0.06
357 0.05
358 0.07
359 0.09
360 0.13
361 0.14
362 0.18
363 0.2
364 0.22
365 0.22
366 0.27
367 0.27
368 0.27
369 0.27
370 0.25
371 0.22
372 0.22
373 0.22
374 0.16
375 0.14
376 0.11
377 0.1
378 0.09
379 0.1
380 0.1
381 0.12
382 0.11
383 0.11
384 0.11
385 0.12
386 0.13
387 0.12
388 0.13
389 0.12
390 0.15
391 0.18
392 0.21
393 0.21
394 0.2
395 0.2
396 0.2
397 0.27
398 0.29
399 0.29
400 0.26
401 0.25
402 0.25
403 0.26
404 0.26
405 0.22
406 0.25
407 0.24
408 0.3
409 0.3
410 0.35
411 0.35
412 0.36
413 0.37
414 0.36
415 0.43
416 0.43
417 0.47
418 0.45
419 0.45
420 0.43
421 0.39
422 0.31
423 0.25
424 0.19
425 0.14
426 0.12
427 0.1
428 0.09
429 0.08
430 0.1
431 0.08
432 0.1
433 0.11
434 0.11
435 0.12
436 0.17
437 0.2
438 0.22
439 0.26
440 0.31
441 0.4
442 0.41
443 0.43
444 0.4
445 0.44
446 0.43
447 0.41
448 0.44
449 0.42
450 0.5
451 0.53
452 0.55
453 0.58
454 0.65
455 0.71
456 0.71
457 0.7
458 0.69
459 0.67
460 0.69
461 0.62
462 0.54
463 0.48