Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1J9R5X0

Protein Details
Accession A0A1J9R5X0    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
101-122QMLYKLKHPPRESKQKSPAPTPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
110-126PRESKQKSPAPTPAKPK
Subcellular Location(s) nucl 11, cyto 8, mito_nucl 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039900  Pat1-like  
IPR019167  PAT1_dom  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000290  P:deadenylation-dependent decapping of nuclear-transcribed mRNA  
Pfam View protein in Pfam  
PF09770  PAT1  
Amino Acid Sequences MSFFGFDTTLPRDRPSGRQTRGIFENPDPFAQVAHATTQDDDDAIDFEDTYDGLGDQLDEDQDAFNEDTFGGTEDEKQPVGKDFDFYGKTAQMTNVLDEEQMLYKLKHPPRESKQKSPAPTPAKPKRTGYELYQDPGYIPEIQAKSTVWGTGVGQKSKAEDSTKPSKTAVPAKKIMSLEEVEAQMRAQSKKPLTTEPPSAPPQLPQTTPQFPGVMPQVTVPLTMPLHDRPSPPPDGMLPLSLQEFPPVDQQRQYAQLGKDALAAQAFQRQQSFSPMEAMLPRPGMPPPPMRHQNRPSRSAASQRPMRQVQHHHLKSQTPISLPGQLPATSGVPPNLAPLTEEQKKASLIEDAKRAKRNHKIFLLSKGNGLMTPQDKNFITRIQLQQLVAATGNMTDPESETSLSEDFYYQVYSQIRGAPRQHPRQPLGHFAQTYLFQTGGRSAGGMGRRQFYTGDNHMQRMQQQVQRAVEAAKLRPKNKQLIIEGSLGKISFSNAKTPKPMLNIKRPDSSDGQKASNIKKGNHTTMSASDRKSILRNIENVYGTLMQMEDHERSMPPPPDENDPGSVERHMEWRQKMQNLNQKLWSDMKVLEPIVPGSSTPHPFIAFLSYPKGKKAIPRIFRQIDQEQRVTILTMIIVHLDSLDVVQRAQLQPGESQPPLAVREEIDLFSHAVMPSLLGYVNEAPINIITGLLGLVIGQTHVQTIAKTRVGLGVLTMLLSRAELVKEGGTVEDELLKSWTELYNTFFDRLEPVFGDIFPGTINSGDDMYVWQFLAAVGIGASPEQQQRLVIAVKERVMETVAQSKTLPADMASQRLGNVNLFMRAIGLDVELLG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.44
2 0.49
3 0.54
4 0.53
5 0.61
6 0.61
7 0.63
8 0.66
9 0.63
10 0.58
11 0.53
12 0.56
13 0.49
14 0.47
15 0.42
16 0.35
17 0.3
18 0.26
19 0.22
20 0.16
21 0.16
22 0.17
23 0.16
24 0.16
25 0.17
26 0.16
27 0.14
28 0.13
29 0.11
30 0.1
31 0.1
32 0.1
33 0.08
34 0.09
35 0.09
36 0.08
37 0.08
38 0.08
39 0.06
40 0.06
41 0.06
42 0.06
43 0.06
44 0.07
45 0.07
46 0.07
47 0.07
48 0.08
49 0.08
50 0.11
51 0.11
52 0.1
53 0.1
54 0.1
55 0.1
56 0.1
57 0.11
58 0.1
59 0.1
60 0.14
61 0.16
62 0.19
63 0.19
64 0.19
65 0.19
66 0.23
67 0.27
68 0.24
69 0.23
70 0.23
71 0.3
72 0.31
73 0.3
74 0.29
75 0.26
76 0.26
77 0.26
78 0.24
79 0.23
80 0.22
81 0.23
82 0.2
83 0.19
84 0.18
85 0.16
86 0.17
87 0.13
88 0.13
89 0.14
90 0.13
91 0.17
92 0.27
93 0.32
94 0.39
95 0.43
96 0.52
97 0.61
98 0.72
99 0.75
100 0.76
101 0.81
102 0.8
103 0.81
104 0.77
105 0.77
106 0.74
107 0.73
108 0.74
109 0.74
110 0.74
111 0.74
112 0.73
113 0.67
114 0.65
115 0.62
116 0.56
117 0.56
118 0.51
119 0.48
120 0.43
121 0.38
122 0.32
123 0.29
124 0.26
125 0.17
126 0.14
127 0.19
128 0.18
129 0.19
130 0.2
131 0.19
132 0.19
133 0.19
134 0.19
135 0.12
136 0.12
137 0.13
138 0.19
139 0.24
140 0.23
141 0.24
142 0.25
143 0.27
144 0.28
145 0.3
146 0.26
147 0.25
148 0.31
149 0.39
150 0.42
151 0.42
152 0.41
153 0.4
154 0.43
155 0.49
156 0.51
157 0.48
158 0.5
159 0.5
160 0.55
161 0.52
162 0.47
163 0.41
164 0.33
165 0.27
166 0.25
167 0.24
168 0.18
169 0.17
170 0.16
171 0.14
172 0.18
173 0.18
174 0.17
175 0.24
176 0.27
177 0.33
178 0.36
179 0.41
180 0.43
181 0.47
182 0.51
183 0.47
184 0.5
185 0.48
186 0.48
187 0.42
188 0.38
189 0.39
190 0.36
191 0.34
192 0.32
193 0.35
194 0.36
195 0.37
196 0.36
197 0.3
198 0.26
199 0.28
200 0.28
201 0.22
202 0.18
203 0.16
204 0.17
205 0.16
206 0.17
207 0.13
208 0.12
209 0.11
210 0.12
211 0.15
212 0.15
213 0.2
214 0.22
215 0.24
216 0.25
217 0.31
218 0.33
219 0.3
220 0.29
221 0.25
222 0.27
223 0.25
224 0.22
225 0.17
226 0.15
227 0.16
228 0.15
229 0.14
230 0.12
231 0.11
232 0.11
233 0.2
234 0.22
235 0.22
236 0.23
237 0.25
238 0.26
239 0.3
240 0.31
241 0.28
242 0.26
243 0.28
244 0.28
245 0.26
246 0.26
247 0.22
248 0.2
249 0.14
250 0.14
251 0.1
252 0.15
253 0.15
254 0.14
255 0.15
256 0.15
257 0.16
258 0.21
259 0.23
260 0.18
261 0.2
262 0.19
263 0.19
264 0.2
265 0.21
266 0.16
267 0.15
268 0.15
269 0.13
270 0.14
271 0.15
272 0.17
273 0.23
274 0.26
275 0.34
276 0.43
277 0.47
278 0.56
279 0.63
280 0.7
281 0.68
282 0.7
283 0.64
284 0.6
285 0.58
286 0.57
287 0.55
288 0.52
289 0.53
290 0.53
291 0.56
292 0.55
293 0.55
294 0.53
295 0.53
296 0.55
297 0.58
298 0.55
299 0.51
300 0.5
301 0.49
302 0.46
303 0.43
304 0.36
305 0.26
306 0.27
307 0.25
308 0.29
309 0.26
310 0.25
311 0.22
312 0.2
313 0.19
314 0.17
315 0.17
316 0.11
317 0.12
318 0.11
319 0.1
320 0.09
321 0.11
322 0.09
323 0.08
324 0.08
325 0.1
326 0.15
327 0.19
328 0.2
329 0.19
330 0.2
331 0.21
332 0.21
333 0.19
334 0.18
335 0.17
336 0.19
337 0.26
338 0.3
339 0.35
340 0.42
341 0.43
342 0.46
343 0.52
344 0.55
345 0.54
346 0.55
347 0.57
348 0.52
349 0.59
350 0.59
351 0.5
352 0.44
353 0.38
354 0.32
355 0.25
356 0.23
357 0.17
358 0.12
359 0.13
360 0.13
361 0.15
362 0.15
363 0.17
364 0.18
365 0.16
366 0.17
367 0.2
368 0.22
369 0.22
370 0.24
371 0.23
372 0.23
373 0.21
374 0.19
375 0.14
376 0.11
377 0.08
378 0.06
379 0.06
380 0.04
381 0.04
382 0.04
383 0.04
384 0.06
385 0.06
386 0.06
387 0.07
388 0.08
389 0.08
390 0.08
391 0.08
392 0.07
393 0.07
394 0.07
395 0.08
396 0.06
397 0.1
398 0.1
399 0.11
400 0.12
401 0.15
402 0.16
403 0.19
404 0.22
405 0.26
406 0.34
407 0.41
408 0.46
409 0.49
410 0.5
411 0.53
412 0.52
413 0.51
414 0.47
415 0.42
416 0.36
417 0.31
418 0.29
419 0.24
420 0.23
421 0.16
422 0.12
423 0.09
424 0.09
425 0.09
426 0.08
427 0.07
428 0.06
429 0.06
430 0.08
431 0.1
432 0.13
433 0.14
434 0.15
435 0.16
436 0.16
437 0.17
438 0.16
439 0.19
440 0.2
441 0.27
442 0.26
443 0.28
444 0.29
445 0.29
446 0.29
447 0.29
448 0.31
449 0.25
450 0.28
451 0.31
452 0.29
453 0.29
454 0.28
455 0.23
456 0.2
457 0.2
458 0.19
459 0.21
460 0.26
461 0.27
462 0.33
463 0.37
464 0.42
465 0.44
466 0.47
467 0.43
468 0.42
469 0.44
470 0.42
471 0.37
472 0.3
473 0.26
474 0.2
475 0.17
476 0.12
477 0.1
478 0.11
479 0.12
480 0.2
481 0.22
482 0.24
483 0.26
484 0.29
485 0.31
486 0.31
487 0.39
488 0.38
489 0.45
490 0.52
491 0.53
492 0.56
493 0.54
494 0.52
495 0.49
496 0.46
497 0.42
498 0.37
499 0.35
500 0.32
501 0.36
502 0.35
503 0.36
504 0.36
505 0.31
506 0.36
507 0.4
508 0.42
509 0.4
510 0.38
511 0.34
512 0.35
513 0.4
514 0.35
515 0.31
516 0.29
517 0.28
518 0.28
519 0.29
520 0.27
521 0.27
522 0.27
523 0.3
524 0.3
525 0.33
526 0.32
527 0.29
528 0.28
529 0.22
530 0.18
531 0.14
532 0.11
533 0.07
534 0.07
535 0.1
536 0.09
537 0.09
538 0.1
539 0.1
540 0.11
541 0.17
542 0.2
543 0.2
544 0.23
545 0.24
546 0.29
547 0.32
548 0.33
549 0.3
550 0.29
551 0.28
552 0.25
553 0.24
554 0.19
555 0.17
556 0.2
557 0.23
558 0.27
559 0.28
560 0.35
561 0.41
562 0.45
563 0.49
564 0.52
565 0.56
566 0.55
567 0.56
568 0.53
569 0.48
570 0.45
571 0.43
572 0.37
573 0.3
574 0.25
575 0.24
576 0.21
577 0.21
578 0.19
579 0.17
580 0.16
581 0.14
582 0.13
583 0.11
584 0.12
585 0.16
586 0.17
587 0.18
588 0.19
589 0.18
590 0.19
591 0.19
592 0.21
593 0.17
594 0.16
595 0.21
596 0.25
597 0.25
598 0.26
599 0.28
600 0.25
601 0.3
602 0.4
603 0.43
604 0.46
605 0.52
606 0.61
607 0.62
608 0.64
609 0.64
610 0.61
611 0.61
612 0.59
613 0.53
614 0.43
615 0.4
616 0.37
617 0.31
618 0.23
619 0.14
620 0.09
621 0.07
622 0.07
623 0.07
624 0.06
625 0.05
626 0.05
627 0.05
628 0.04
629 0.04
630 0.06
631 0.06
632 0.06
633 0.07
634 0.12
635 0.12
636 0.14
637 0.16
638 0.15
639 0.17
640 0.21
641 0.25
642 0.21
643 0.21
644 0.2
645 0.2
646 0.21
647 0.21
648 0.17
649 0.13
650 0.16
651 0.17
652 0.17
653 0.16
654 0.15
655 0.14
656 0.13
657 0.15
658 0.12
659 0.1
660 0.1
661 0.09
662 0.08
663 0.08
664 0.08
665 0.06
666 0.08
667 0.08
668 0.1
669 0.1
670 0.09
671 0.09
672 0.09
673 0.11
674 0.09
675 0.07
676 0.06
677 0.06
678 0.06
679 0.05
680 0.05
681 0.03
682 0.03
683 0.03
684 0.04
685 0.04
686 0.04
687 0.04
688 0.06
689 0.07
690 0.07
691 0.12
692 0.18
693 0.2
694 0.2
695 0.2
696 0.22
697 0.22
698 0.22
699 0.17
700 0.13
701 0.11
702 0.11
703 0.1
704 0.08
705 0.07
706 0.07
707 0.07
708 0.06
709 0.07
710 0.08
711 0.09
712 0.09
713 0.1
714 0.1
715 0.1
716 0.1
717 0.1
718 0.1
719 0.13
720 0.12
721 0.12
722 0.13
723 0.13
724 0.12
725 0.13
726 0.14
727 0.13
728 0.14
729 0.17
730 0.22
731 0.24
732 0.26
733 0.24
734 0.22
735 0.24
736 0.24
737 0.23
738 0.18
739 0.18
740 0.18
741 0.17
742 0.2
743 0.16
744 0.15
745 0.12
746 0.12
747 0.1
748 0.1
749 0.1
750 0.08
751 0.09
752 0.09
753 0.09
754 0.1
755 0.11
756 0.11
757 0.11
758 0.09
759 0.09
760 0.09
761 0.09
762 0.07
763 0.06
764 0.05
765 0.05
766 0.05
767 0.05
768 0.06
769 0.09
770 0.12
771 0.13
772 0.14
773 0.14
774 0.15
775 0.19
776 0.22
777 0.21
778 0.24
779 0.27
780 0.28
781 0.3
782 0.3
783 0.26
784 0.25
785 0.23
786 0.21
787 0.26
788 0.24
789 0.23
790 0.23
791 0.24
792 0.24
793 0.24
794 0.21
795 0.13
796 0.21
797 0.22
798 0.26
799 0.27
800 0.26
801 0.25
802 0.28
803 0.29
804 0.21
805 0.23
806 0.2
807 0.2
808 0.2
809 0.19
810 0.16
811 0.14
812 0.14
813 0.11
814 0.09