Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1J9QCN5

Protein Details
Accession A0A1J9QCN5    Localization Confidence High Confidence Score 16.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
462-483QAKEQPKEPKEPIRQQPPSKANHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
237-241RPRSK
374-389KREAEEKAKAEKADKL
467-506PKEPKEPIRQQPPSKANGNWRNGAPRSRGPSHGHAPPRGP
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 13, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MSVGAFLSDETFGSWADEMDDIPLPAVPEPRSSYGGERRMMGGYGNDMGGFERDHRGYAIREELPMPTQPPYTAHIGNLSFEATQGDIADLFAECQVTNVRVVEDKITRAPKGFGYVEFATVEGLKKALSFQGTTLQGRNIRVSVAEPPKERQDTRDYSDWSRKGPLPDLPSQRRVSDRPGFGPRGQDSMSDAGGDRPGRRAYEPADGKSRDYGNWERKGPLSPSLAPASLAREGGRPRSKDGPQFRRASPAWGEARSQDGSRPPRREFQERPPPERAPTAPELDNQWRARMRPDPPAPKPAAVPEAAPAAAPPAPAQRPKLNLQKRTVEAEPGSPTAPTGDAKSSPFGGARPIDTSAREREVEERRQLALRQKREAEEKAKAEKADKLKAAKEQEQQAKEQASKTESVDTTVANGAKEDDSGAAQAGNNIEILRRAEETPTAEGSTEAGTADGKSEAPKEQAKEQPKEPKEPIRQQPPSKANGNWRNGAPRSRGPSHGHAPPRGPQGQAKGQQPKTPAPEPAASPSATEPEEEGWSTVSSKPRNSRRGNHRG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.09
3 0.1
4 0.1
5 0.09
6 0.11
7 0.12
8 0.11
9 0.11
10 0.12
11 0.11
12 0.13
13 0.17
14 0.16
15 0.19
16 0.24
17 0.28
18 0.3
19 0.31
20 0.37
21 0.42
22 0.48
23 0.45
24 0.42
25 0.4
26 0.38
27 0.37
28 0.3
29 0.22
30 0.18
31 0.17
32 0.16
33 0.13
34 0.12
35 0.12
36 0.12
37 0.12
38 0.11
39 0.16
40 0.16
41 0.18
42 0.19
43 0.21
44 0.22
45 0.25
46 0.3
47 0.25
48 0.26
49 0.26
50 0.27
51 0.27
52 0.27
53 0.24
54 0.2
55 0.2
56 0.19
57 0.21
58 0.22
59 0.25
60 0.24
61 0.23
62 0.26
63 0.25
64 0.25
65 0.23
66 0.21
67 0.15
68 0.14
69 0.14
70 0.09
71 0.09
72 0.08
73 0.08
74 0.06
75 0.06
76 0.07
77 0.06
78 0.06
79 0.06
80 0.07
81 0.06
82 0.07
83 0.09
84 0.09
85 0.11
86 0.11
87 0.12
88 0.13
89 0.15
90 0.19
91 0.2
92 0.21
93 0.26
94 0.3
95 0.3
96 0.3
97 0.31
98 0.27
99 0.3
100 0.29
101 0.23
102 0.26
103 0.25
104 0.25
105 0.23
106 0.22
107 0.17
108 0.16
109 0.16
110 0.09
111 0.09
112 0.07
113 0.07
114 0.08
115 0.1
116 0.11
117 0.11
118 0.12
119 0.19
120 0.22
121 0.24
122 0.25
123 0.27
124 0.28
125 0.3
126 0.3
127 0.24
128 0.2
129 0.19
130 0.19
131 0.23
132 0.27
133 0.31
134 0.31
135 0.34
136 0.41
137 0.46
138 0.45
139 0.4
140 0.42
141 0.42
142 0.46
143 0.5
144 0.47
145 0.48
146 0.56
147 0.53
148 0.47
149 0.46
150 0.44
151 0.4
152 0.39
153 0.39
154 0.35
155 0.41
156 0.49
157 0.49
158 0.53
159 0.51
160 0.5
161 0.49
162 0.46
163 0.46
164 0.44
165 0.42
166 0.41
167 0.46
168 0.47
169 0.44
170 0.48
171 0.41
172 0.37
173 0.34
174 0.29
175 0.25
176 0.22
177 0.21
178 0.15
179 0.14
180 0.11
181 0.14
182 0.15
183 0.13
184 0.14
185 0.16
186 0.17
187 0.18
188 0.2
189 0.2
190 0.28
191 0.31
192 0.3
193 0.36
194 0.35
195 0.35
196 0.36
197 0.34
198 0.25
199 0.28
200 0.34
201 0.35
202 0.4
203 0.4
204 0.38
205 0.39
206 0.42
207 0.37
208 0.34
209 0.3
210 0.25
211 0.27
212 0.27
213 0.25
214 0.22
215 0.21
216 0.18
217 0.15
218 0.14
219 0.12
220 0.13
221 0.15
222 0.22
223 0.27
224 0.26
225 0.28
226 0.35
227 0.38
228 0.43
229 0.52
230 0.53
231 0.55
232 0.59
233 0.55
234 0.56
235 0.52
236 0.48
237 0.4
238 0.37
239 0.33
240 0.29
241 0.29
242 0.22
243 0.26
244 0.22
245 0.2
246 0.16
247 0.2
248 0.27
249 0.34
250 0.38
251 0.37
252 0.43
253 0.48
254 0.54
255 0.53
256 0.54
257 0.59
258 0.59
259 0.63
260 0.61
261 0.58
262 0.52
263 0.49
264 0.4
265 0.34
266 0.31
267 0.28
268 0.23
269 0.22
270 0.25
271 0.25
272 0.31
273 0.26
274 0.27
275 0.25
276 0.25
277 0.28
278 0.29
279 0.29
280 0.32
281 0.39
282 0.45
283 0.46
284 0.52
285 0.51
286 0.46
287 0.43
288 0.36
289 0.3
290 0.22
291 0.19
292 0.13
293 0.13
294 0.12
295 0.11
296 0.08
297 0.07
298 0.07
299 0.07
300 0.07
301 0.1
302 0.13
303 0.15
304 0.19
305 0.21
306 0.25
307 0.31
308 0.41
309 0.45
310 0.49
311 0.52
312 0.55
313 0.53
314 0.54
315 0.49
316 0.42
317 0.35
318 0.31
319 0.28
320 0.23
321 0.21
322 0.15
323 0.15
324 0.12
325 0.12
326 0.1
327 0.09
328 0.1
329 0.11
330 0.13
331 0.14
332 0.14
333 0.14
334 0.14
335 0.12
336 0.14
337 0.14
338 0.14
339 0.14
340 0.15
341 0.16
342 0.17
343 0.2
344 0.2
345 0.22
346 0.21
347 0.2
348 0.26
349 0.32
350 0.36
351 0.38
352 0.36
353 0.35
354 0.37
355 0.39
356 0.41
357 0.43
358 0.42
359 0.44
360 0.45
361 0.47
362 0.51
363 0.54
364 0.51
365 0.49
366 0.49
367 0.48
368 0.48
369 0.46
370 0.42
371 0.42
372 0.42
373 0.41
374 0.4
375 0.38
376 0.38
377 0.44
378 0.48
379 0.48
380 0.48
381 0.5
382 0.54
383 0.53
384 0.51
385 0.49
386 0.47
387 0.41
388 0.38
389 0.32
390 0.26
391 0.26
392 0.26
393 0.27
394 0.24
395 0.24
396 0.23
397 0.2
398 0.19
399 0.2
400 0.2
401 0.14
402 0.14
403 0.13
404 0.12
405 0.12
406 0.11
407 0.08
408 0.08
409 0.08
410 0.08
411 0.07
412 0.07
413 0.09
414 0.08
415 0.08
416 0.08
417 0.08
418 0.08
419 0.09
420 0.11
421 0.11
422 0.13
423 0.13
424 0.14
425 0.17
426 0.2
427 0.21
428 0.21
429 0.2
430 0.18
431 0.17
432 0.17
433 0.15
434 0.12
435 0.09
436 0.07
437 0.07
438 0.07
439 0.08
440 0.08
441 0.07
442 0.09
443 0.11
444 0.13
445 0.18
446 0.22
447 0.24
448 0.31
449 0.39
450 0.47
451 0.5
452 0.56
453 0.62
454 0.62
455 0.67
456 0.66
457 0.68
458 0.69
459 0.74
460 0.76
461 0.76
462 0.81
463 0.79
464 0.83
465 0.79
466 0.75
467 0.7
468 0.66
469 0.66
470 0.66
471 0.65
472 0.6
473 0.57
474 0.59
475 0.58
476 0.59
477 0.55
478 0.53
479 0.55
480 0.55
481 0.58
482 0.56
483 0.59
484 0.59
485 0.61
486 0.6
487 0.57
488 0.57
489 0.57
490 0.59
491 0.54
492 0.5
493 0.47
494 0.48
495 0.52
496 0.55
497 0.58
498 0.6
499 0.61
500 0.62
501 0.62
502 0.62
503 0.6
504 0.58
505 0.53
506 0.48
507 0.48
508 0.47
509 0.48
510 0.44
511 0.36
512 0.33
513 0.31
514 0.3
515 0.26
516 0.23
517 0.18
518 0.18
519 0.2
520 0.19
521 0.18
522 0.15
523 0.16
524 0.18
525 0.21
526 0.26
527 0.29
528 0.36
529 0.46
530 0.54
531 0.64
532 0.71
533 0.77