Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1J9QBU6

Protein Details
Accession A0A1J9QBU6    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
6-34LNNKENCLRKGSKRTARARPKYVGRCVVWHydrophilic
294-321NKALRAENAKQKRKRERRRTYRFASRSYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
300-313ENAKQKRKRERRRT
Subcellular Location(s) nucl 11, cyto_nucl 10.5, mito 8, cyto 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004875  DDE_SF_endonuclease_dom  
IPR036397  RNaseH_sf  
IPR003782  SCO1/SenC  
IPR036249  Thioredoxin-like_sf  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF03184  DDE_1  
PF02630  SCO1-SenC  
CDD cd02968  SCO  
Amino Acid Sequences LSYVRLNNKENCLRKGSKRTARARPKYVGRCVVWSEQRRFRLSEPGRGFVRNPIGRSIGRIRRTSEDPSVRVPTPNKRKWHQASWYETGLLYDWRIETRENGWTTDKLGLIWLKEVFNKHTQARTKGQYRLLILDGHGSHNGPEFDQFCMQNLIIPLYMPAHSSHLLQPLDVACFSPLKQAYRKEVEKRIGLGINHINKNEFLTIYPSVHQVLSHLNTQMRTPTPPGTSHSSQASWATATPHNVRQLELQSEKVKKYLKRRTQSPPSPTNRALEQLVKGCQMAMHSAAILGAENKALRAENAKQKRKRERRRTYRFASRSYSSSRRLLQAPGTRITSPSFLLLIRSNPQTASFSTTSPCPKSKTIQQLKARASTGPFSWKAAALFVVTGVGMIFYFRYEKARLERKRIAEMSKGVGKPKVGGPFVLKDLDGNEFTEENLKGKYSFVYFGFTHCPDICPDELDKMAEIIDIVKAKSNNKTVLRPVFITCDPARDSADVLRKYLAEFHKGIIGLTGTYEQVKNVCKQYRVYFSTPRNITPGEDYLVDHSIYFYLMDPEGDFVECIGRQDTAETAATTILAHINDWKREGKPINTEEG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.69
2 0.74
3 0.75
4 0.75
5 0.78
6 0.83
7 0.86
8 0.89
9 0.9
10 0.87
11 0.86
12 0.86
13 0.86
14 0.85
15 0.83
16 0.74
17 0.69
18 0.66
19 0.66
20 0.65
21 0.65
22 0.64
23 0.64
24 0.68
25 0.66
26 0.65
27 0.58
28 0.6
29 0.56
30 0.57
31 0.54
32 0.53
33 0.52
34 0.51
35 0.49
36 0.46
37 0.51
38 0.45
39 0.42
40 0.4
41 0.42
42 0.4
43 0.45
44 0.47
45 0.46
46 0.48
47 0.5
48 0.5
49 0.52
50 0.56
51 0.56
52 0.56
53 0.55
54 0.51
55 0.54
56 0.55
57 0.5
58 0.52
59 0.51
60 0.52
61 0.55
62 0.6
63 0.63
64 0.62
65 0.72
66 0.73
67 0.77
68 0.76
69 0.74
70 0.75
71 0.71
72 0.69
73 0.59
74 0.51
75 0.41
76 0.33
77 0.25
78 0.17
79 0.13
80 0.12
81 0.12
82 0.14
83 0.14
84 0.15
85 0.17
86 0.25
87 0.24
88 0.26
89 0.28
90 0.28
91 0.29
92 0.3
93 0.27
94 0.19
95 0.22
96 0.21
97 0.18
98 0.2
99 0.2
100 0.18
101 0.21
102 0.24
103 0.24
104 0.28
105 0.33
106 0.34
107 0.4
108 0.44
109 0.48
110 0.53
111 0.57
112 0.58
113 0.6
114 0.61
115 0.58
116 0.54
117 0.51
118 0.45
119 0.37
120 0.3
121 0.29
122 0.24
123 0.21
124 0.2
125 0.17
126 0.16
127 0.18
128 0.18
129 0.13
130 0.15
131 0.14
132 0.16
133 0.19
134 0.19
135 0.17
136 0.19
137 0.19
138 0.18
139 0.18
140 0.16
141 0.13
142 0.13
143 0.12
144 0.11
145 0.11
146 0.1
147 0.1
148 0.12
149 0.13
150 0.15
151 0.17
152 0.22
153 0.22
154 0.2
155 0.21
156 0.19
157 0.2
158 0.18
159 0.15
160 0.1
161 0.11
162 0.11
163 0.16
164 0.17
165 0.2
166 0.25
167 0.3
168 0.36
169 0.43
170 0.5
171 0.51
172 0.57
173 0.58
174 0.55
175 0.52
176 0.49
177 0.45
178 0.38
179 0.36
180 0.35
181 0.37
182 0.36
183 0.35
184 0.31
185 0.28
186 0.3
187 0.25
188 0.18
189 0.12
190 0.14
191 0.15
192 0.15
193 0.16
194 0.15
195 0.15
196 0.15
197 0.14
198 0.11
199 0.14
200 0.15
201 0.16
202 0.17
203 0.17
204 0.18
205 0.18
206 0.21
207 0.18
208 0.18
209 0.19
210 0.2
211 0.21
212 0.22
213 0.25
214 0.29
215 0.29
216 0.3
217 0.29
218 0.26
219 0.25
220 0.24
221 0.21
222 0.14
223 0.13
224 0.14
225 0.13
226 0.17
227 0.19
228 0.22
229 0.26
230 0.26
231 0.26
232 0.26
233 0.27
234 0.28
235 0.26
236 0.26
237 0.27
238 0.3
239 0.29
240 0.3
241 0.34
242 0.34
243 0.43
244 0.5
245 0.54
246 0.58
247 0.65
248 0.71
249 0.76
250 0.79
251 0.77
252 0.76
253 0.72
254 0.71
255 0.65
256 0.57
257 0.47
258 0.41
259 0.35
260 0.28
261 0.24
262 0.2
263 0.19
264 0.18
265 0.17
266 0.14
267 0.13
268 0.11
269 0.1
270 0.08
271 0.07
272 0.06
273 0.06
274 0.06
275 0.05
276 0.05
277 0.04
278 0.03
279 0.04
280 0.04
281 0.04
282 0.05
283 0.05
284 0.05
285 0.08
286 0.13
287 0.22
288 0.32
289 0.41
290 0.47
291 0.56
292 0.67
293 0.75
294 0.81
295 0.83
296 0.85
297 0.87
298 0.92
299 0.92
300 0.88
301 0.88
302 0.82
303 0.75
304 0.69
305 0.6
306 0.53
307 0.5
308 0.48
309 0.41
310 0.41
311 0.37
312 0.35
313 0.35
314 0.33
315 0.33
316 0.33
317 0.33
318 0.31
319 0.32
320 0.29
321 0.28
322 0.27
323 0.22
324 0.16
325 0.14
326 0.12
327 0.1
328 0.11
329 0.11
330 0.12
331 0.14
332 0.15
333 0.14
334 0.14
335 0.15
336 0.15
337 0.15
338 0.19
339 0.17
340 0.16
341 0.17
342 0.2
343 0.23
344 0.25
345 0.27
346 0.24
347 0.26
348 0.3
349 0.37
350 0.44
351 0.5
352 0.55
353 0.6
354 0.65
355 0.66
356 0.66
357 0.59
358 0.49
359 0.41
360 0.34
361 0.28
362 0.26
363 0.23
364 0.21
365 0.21
366 0.2
367 0.19
368 0.17
369 0.16
370 0.1
371 0.09
372 0.07
373 0.06
374 0.05
375 0.05
376 0.04
377 0.03
378 0.03
379 0.03
380 0.03
381 0.03
382 0.05
383 0.06
384 0.09
385 0.11
386 0.15
387 0.23
388 0.33
389 0.38
390 0.46
391 0.53
392 0.53
393 0.6
394 0.6
395 0.55
396 0.51
397 0.48
398 0.44
399 0.44
400 0.42
401 0.36
402 0.34
403 0.31
404 0.28
405 0.29
406 0.31
407 0.24
408 0.24
409 0.25
410 0.26
411 0.28
412 0.27
413 0.22
414 0.16
415 0.17
416 0.18
417 0.15
418 0.13
419 0.13
420 0.12
421 0.12
422 0.16
423 0.15
424 0.13
425 0.13
426 0.13
427 0.12
428 0.13
429 0.15
430 0.12
431 0.15
432 0.14
433 0.18
434 0.18
435 0.2
436 0.24
437 0.23
438 0.26
439 0.23
440 0.24
441 0.2
442 0.24
443 0.22
444 0.19
445 0.19
446 0.18
447 0.18
448 0.18
449 0.17
450 0.13
451 0.13
452 0.1
453 0.09
454 0.07
455 0.09
456 0.09
457 0.09
458 0.13
459 0.16
460 0.19
461 0.26
462 0.31
463 0.36
464 0.39
465 0.44
466 0.48
467 0.53
468 0.54
469 0.49
470 0.45
471 0.43
472 0.39
473 0.4
474 0.32
475 0.3
476 0.28
477 0.28
478 0.28
479 0.23
480 0.25
481 0.25
482 0.33
483 0.29
484 0.29
485 0.28
486 0.27
487 0.27
488 0.33
489 0.29
490 0.26
491 0.26
492 0.26
493 0.28
494 0.28
495 0.27
496 0.21
497 0.18
498 0.13
499 0.13
500 0.13
501 0.1
502 0.12
503 0.12
504 0.12
505 0.15
506 0.19
507 0.23
508 0.31
509 0.36
510 0.37
511 0.42
512 0.49
513 0.54
514 0.57
515 0.58
516 0.59
517 0.6
518 0.66
519 0.63
520 0.58
521 0.53
522 0.47
523 0.43
524 0.39
525 0.36
526 0.28
527 0.26
528 0.25
529 0.24
530 0.25
531 0.23
532 0.17
533 0.15
534 0.13
535 0.12
536 0.12
537 0.09
538 0.1
539 0.1
540 0.11
541 0.11
542 0.12
543 0.13
544 0.12
545 0.11
546 0.09
547 0.12
548 0.12
549 0.13
550 0.13
551 0.12
552 0.12
553 0.14
554 0.14
555 0.15
556 0.16
557 0.14
558 0.14
559 0.13
560 0.13
561 0.12
562 0.12
563 0.11
564 0.1
565 0.1
566 0.18
567 0.24
568 0.27
569 0.3
570 0.34
571 0.33
572 0.41
573 0.48
574 0.47
575 0.51