Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1J9RI07

Protein Details
Accession A0A1J9RI07    Localization Confidence High Confidence Score 16.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
135-158LIVSPKTRKKKGATAKRTRKQDGVHydrophilic
313-333SMSSKQQRMRVKRPQKTKLTTHydrophilic
659-684FVNTRSPKIRRTKTVKKSQEPKGLSLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
140-155KTRKKKGATAKRTRKQ
Subcellular Location(s) nucl 12.5, mito 10, cyto_nucl 8.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027784  Slx4_ascomycetes  
IPR018574  Structure-sp_endonuc_su_Slx4  
Gene Ontology GO:0033557  C:Slx1-Slx4 complex  
GO:0017108  F:5'-flap endonuclease activity  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0006260  P:DNA replication  
GO:0006996  P:organelle organization  
Pfam View protein in Pfam  
PF09494  Slx4  
CDD cd22999  SAP_SLX4  
Amino Acid Sequences MMDNSTIASQSNTPPTNGRSSARFVTPIIVHSSPITAEVIEPSSPFTPPSPSTLLTSLSKSPSHKISNLQMDGAKTTCLEVLQKSRLVGDSPKRQDKSITGSRAKPASTVRHGQKITSPKIATQTEIQIVDGDRLIVSPKTRKKKGATAKRTRKQDGVAERRLHGHVSKAQFPVDLTLDAKVPPSKACDDKTPSVGGNTDNELERQTSGLQLEQATKRRLDWTPTKDGTIPNVDLTEAHSSPCGKSVTGTHSAGMQLSKYGFSGVVNTSLASKPEAFYNAPTTKRLMELQNFYSASGIQTPTESRPATNDPHSMSSKQQRMRVKRPQKTKLTTITSYVTAKYSVADQTADLDRIETVNSRKNKTKGVTRRTSGTERANAARRKSDIFKNGSGPPVFKVVPPLEAFKSFDGQELLFGTLSQLEHGHSEDQDEEIQHTADSVNKSNDVPSPVVSKGLGSSLFRLSSSKNLWSASARDLTGAVLQVDEIDLSEPSIEVSTPAAKSERQTGIWDLSGQNVVDVEEDTRTLAAIDTHELDNMNERSLEEDDIVYIENLEPTNAKLNSQTPANILEAMLERASPDKPVFGRFTTSELAKKVAAYGFKPIKSRDKMISLLEKCWETQSMSAKPEPKPNQCNYKTQGHDLAERQLLGLKPRSDSIPFVNTRSPKIRRTKTVKKSQEPKGLSLSSEGSTITPKLPMKRFVSPCAILIEDDQSSDSVGEALPESPSHSCDGNGALPHPRPGELHAPTIQMAIRSTKPSTSASSSMDLPSLSSQITKAVQSQPRIRAIKGLKQPTWYEKILMYDPIQLEDLSAWLNTDGFGRIGEDREVGAGVVREWCESKGICCVWRKQTSAKSH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.36
3 0.41
4 0.43
5 0.41
6 0.37
7 0.41
8 0.44
9 0.43
10 0.41
11 0.34
12 0.36
13 0.34
14 0.33
15 0.33
16 0.29
17 0.26
18 0.25
19 0.25
20 0.19
21 0.19
22 0.17
23 0.11
24 0.11
25 0.12
26 0.14
27 0.13
28 0.13
29 0.15
30 0.16
31 0.16
32 0.17
33 0.16
34 0.2
35 0.21
36 0.27
37 0.28
38 0.28
39 0.31
40 0.32
41 0.34
42 0.31
43 0.33
44 0.31
45 0.31
46 0.34
47 0.33
48 0.36
49 0.4
50 0.43
51 0.43
52 0.46
53 0.51
54 0.56
55 0.55
56 0.53
57 0.48
58 0.43
59 0.42
60 0.36
61 0.27
62 0.18
63 0.17
64 0.15
65 0.13
66 0.15
67 0.17
68 0.24
69 0.28
70 0.3
71 0.3
72 0.31
73 0.31
74 0.31
75 0.34
76 0.37
77 0.42
78 0.49
79 0.59
80 0.59
81 0.58
82 0.6
83 0.56
84 0.56
85 0.55
86 0.55
87 0.52
88 0.55
89 0.59
90 0.59
91 0.54
92 0.49
93 0.46
94 0.45
95 0.46
96 0.51
97 0.5
98 0.56
99 0.56
100 0.53
101 0.54
102 0.55
103 0.54
104 0.53
105 0.48
106 0.42
107 0.49
108 0.49
109 0.44
110 0.38
111 0.37
112 0.33
113 0.32
114 0.3
115 0.24
116 0.23
117 0.22
118 0.19
119 0.14
120 0.09
121 0.09
122 0.11
123 0.11
124 0.15
125 0.23
126 0.32
127 0.42
128 0.48
129 0.56
130 0.6
131 0.69
132 0.76
133 0.78
134 0.8
135 0.81
136 0.86
137 0.87
138 0.9
139 0.84
140 0.78
141 0.72
142 0.7
143 0.69
144 0.68
145 0.68
146 0.62
147 0.58
148 0.57
149 0.53
150 0.47
151 0.37
152 0.33
153 0.31
154 0.32
155 0.37
156 0.35
157 0.35
158 0.33
159 0.32
160 0.29
161 0.24
162 0.21
163 0.15
164 0.14
165 0.15
166 0.14
167 0.16
168 0.15
169 0.14
170 0.14
171 0.18
172 0.22
173 0.27
174 0.29
175 0.35
176 0.4
177 0.43
178 0.44
179 0.42
180 0.38
181 0.34
182 0.33
183 0.26
184 0.21
185 0.2
186 0.19
187 0.17
188 0.16
189 0.16
190 0.16
191 0.14
192 0.13
193 0.11
194 0.12
195 0.12
196 0.12
197 0.12
198 0.13
199 0.19
200 0.23
201 0.29
202 0.3
203 0.3
204 0.3
205 0.34
206 0.35
207 0.37
208 0.41
209 0.41
210 0.48
211 0.49
212 0.5
213 0.47
214 0.46
215 0.43
216 0.38
217 0.32
218 0.23
219 0.22
220 0.2
221 0.18
222 0.19
223 0.2
224 0.15
225 0.14
226 0.15
227 0.16
228 0.16
229 0.2
230 0.18
231 0.13
232 0.14
233 0.17
234 0.22
235 0.26
236 0.26
237 0.22
238 0.23
239 0.23
240 0.23
241 0.19
242 0.14
243 0.09
244 0.09
245 0.09
246 0.08
247 0.09
248 0.08
249 0.07
250 0.1
251 0.09
252 0.11
253 0.11
254 0.11
255 0.12
256 0.13
257 0.13
258 0.12
259 0.12
260 0.1
261 0.12
262 0.15
263 0.13
264 0.15
265 0.22
266 0.25
267 0.26
268 0.27
269 0.27
270 0.25
271 0.26
272 0.28
273 0.26
274 0.26
275 0.29
276 0.3
277 0.34
278 0.33
279 0.31
280 0.28
281 0.22
282 0.18
283 0.15
284 0.14
285 0.09
286 0.1
287 0.11
288 0.13
289 0.17
290 0.17
291 0.15
292 0.18
293 0.22
294 0.25
295 0.27
296 0.28
297 0.26
298 0.3
299 0.32
300 0.3
301 0.32
302 0.36
303 0.4
304 0.42
305 0.46
306 0.5
307 0.56
308 0.64
309 0.7
310 0.72
311 0.73
312 0.78
313 0.81
314 0.82
315 0.79
316 0.76
317 0.74
318 0.7
319 0.63
320 0.56
321 0.48
322 0.41
323 0.36
324 0.3
325 0.22
326 0.16
327 0.14
328 0.12
329 0.11
330 0.1
331 0.1
332 0.09
333 0.08
334 0.11
335 0.12
336 0.12
337 0.1
338 0.1
339 0.09
340 0.09
341 0.09
342 0.09
343 0.1
344 0.17
345 0.21
346 0.25
347 0.31
348 0.33
349 0.39
350 0.41
351 0.48
352 0.52
353 0.57
354 0.61
355 0.57
356 0.58
357 0.57
358 0.57
359 0.52
360 0.47
361 0.41
362 0.36
363 0.39
364 0.42
365 0.41
366 0.39
367 0.37
368 0.34
369 0.33
370 0.35
371 0.37
372 0.37
373 0.38
374 0.38
375 0.38
376 0.39
377 0.39
378 0.35
379 0.3
380 0.23
381 0.22
382 0.2
383 0.16
384 0.19
385 0.16
386 0.18
387 0.18
388 0.2
389 0.17
390 0.18
391 0.2
392 0.15
393 0.17
394 0.14
395 0.14
396 0.12
397 0.11
398 0.1
399 0.1
400 0.1
401 0.08
402 0.07
403 0.06
404 0.06
405 0.06
406 0.06
407 0.06
408 0.05
409 0.06
410 0.07
411 0.08
412 0.06
413 0.08
414 0.07
415 0.08
416 0.08
417 0.08
418 0.08
419 0.07
420 0.07
421 0.06
422 0.06
423 0.06
424 0.08
425 0.1
426 0.11
427 0.11
428 0.12
429 0.13
430 0.14
431 0.15
432 0.15
433 0.14
434 0.13
435 0.15
436 0.14
437 0.15
438 0.13
439 0.12
440 0.09
441 0.1
442 0.1
443 0.07
444 0.09
445 0.1
446 0.1
447 0.1
448 0.11
449 0.11
450 0.15
451 0.17
452 0.17
453 0.18
454 0.18
455 0.19
456 0.19
457 0.2
458 0.18
459 0.18
460 0.16
461 0.14
462 0.14
463 0.13
464 0.12
465 0.1
466 0.08
467 0.05
468 0.05
469 0.05
470 0.04
471 0.04
472 0.03
473 0.03
474 0.03
475 0.03
476 0.03
477 0.03
478 0.04
479 0.04
480 0.04
481 0.04
482 0.05
483 0.07
484 0.07
485 0.08
486 0.09
487 0.1
488 0.11
489 0.18
490 0.19
491 0.18
492 0.2
493 0.21
494 0.22
495 0.21
496 0.22
497 0.15
498 0.14
499 0.14
500 0.12
501 0.1
502 0.08
503 0.08
504 0.07
505 0.07
506 0.06
507 0.05
508 0.05
509 0.06
510 0.05
511 0.05
512 0.05
513 0.05
514 0.05
515 0.05
516 0.06
517 0.08
518 0.09
519 0.09
520 0.09
521 0.09
522 0.14
523 0.14
524 0.13
525 0.12
526 0.12
527 0.14
528 0.14
529 0.15
530 0.1
531 0.09
532 0.09
533 0.09
534 0.09
535 0.06
536 0.06
537 0.05
538 0.06
539 0.06
540 0.06
541 0.06
542 0.07
543 0.14
544 0.13
545 0.14
546 0.15
547 0.17
548 0.19
549 0.2
550 0.2
551 0.14
552 0.16
553 0.17
554 0.14
555 0.12
556 0.12
557 0.11
558 0.11
559 0.1
560 0.08
561 0.07
562 0.09
563 0.09
564 0.1
565 0.09
566 0.12
567 0.13
568 0.17
569 0.2
570 0.2
571 0.23
572 0.22
573 0.25
574 0.24
575 0.25
576 0.24
577 0.22
578 0.23
579 0.2
580 0.19
581 0.17
582 0.18
583 0.18
584 0.15
585 0.23
586 0.27
587 0.29
588 0.33
589 0.34
590 0.41
591 0.43
592 0.47
593 0.43
594 0.42
595 0.42
596 0.44
597 0.49
598 0.42
599 0.4
600 0.38
601 0.34
602 0.3
603 0.28
604 0.25
605 0.17
606 0.19
607 0.24
608 0.26
609 0.29
610 0.32
611 0.37
612 0.38
613 0.47
614 0.51
615 0.53
616 0.56
617 0.6
618 0.66
619 0.64
620 0.7
621 0.64
622 0.66
623 0.6
624 0.56
625 0.57
626 0.48
627 0.5
628 0.43
629 0.44
630 0.36
631 0.32
632 0.28
633 0.24
634 0.23
635 0.22
636 0.26
637 0.23
638 0.23
639 0.24
640 0.27
641 0.25
642 0.26
643 0.27
644 0.29
645 0.29
646 0.31
647 0.37
648 0.36
649 0.4
650 0.46
651 0.47
652 0.47
653 0.56
654 0.61
655 0.65
656 0.73
657 0.78
658 0.8
659 0.85
660 0.87
661 0.87
662 0.88
663 0.88
664 0.88
665 0.8
666 0.73
667 0.69
668 0.6
669 0.5
670 0.43
671 0.36
672 0.26
673 0.23
674 0.2
675 0.13
676 0.14
677 0.15
678 0.13
679 0.16
680 0.19
681 0.27
682 0.31
683 0.38
684 0.41
685 0.5
686 0.53
687 0.53
688 0.57
689 0.51
690 0.47
691 0.43
692 0.38
693 0.29
694 0.26
695 0.23
696 0.16
697 0.15
698 0.14
699 0.11
700 0.11
701 0.1
702 0.09
703 0.06
704 0.06
705 0.06
706 0.07
707 0.07
708 0.07
709 0.08
710 0.1
711 0.11
712 0.12
713 0.14
714 0.13
715 0.13
716 0.14
717 0.16
718 0.18
719 0.18
720 0.19
721 0.23
722 0.23
723 0.27
724 0.27
725 0.26
726 0.23
727 0.26
728 0.33
729 0.3
730 0.34
731 0.32
732 0.32
733 0.31
734 0.32
735 0.28
736 0.21
737 0.19
738 0.19
739 0.2
740 0.23
741 0.24
742 0.24
743 0.26
744 0.28
745 0.31
746 0.32
747 0.33
748 0.32
749 0.33
750 0.33
751 0.31
752 0.29
753 0.24
754 0.19
755 0.17
756 0.15
757 0.13
758 0.12
759 0.11
760 0.14
761 0.16
762 0.16
763 0.2
764 0.28
765 0.33
766 0.41
767 0.48
768 0.51
769 0.59
770 0.6
771 0.55
772 0.56
773 0.56
774 0.58
775 0.59
776 0.62
777 0.55
778 0.58
779 0.63
780 0.62
781 0.62
782 0.54
783 0.46
784 0.39
785 0.41
786 0.38
787 0.36
788 0.3
789 0.3
790 0.29
791 0.29
792 0.28
793 0.23
794 0.21
795 0.17
796 0.16
797 0.11
798 0.1
799 0.09
800 0.08
801 0.08
802 0.08
803 0.09
804 0.1
805 0.09
806 0.09
807 0.11
808 0.12
809 0.15
810 0.16
811 0.15
812 0.14
813 0.15
814 0.15
815 0.12
816 0.12
817 0.11
818 0.1
819 0.14
820 0.14
821 0.15
822 0.16
823 0.17
824 0.2
825 0.2
826 0.21
827 0.25
828 0.28
829 0.32
830 0.38
831 0.45
832 0.51
833 0.58
834 0.61
835 0.62