Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1J9RFP3

Protein Details
Accession A0A1J9RFP3    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
130-154WCLAAQPRWKPTKKDKDGKFLPPTEHydrophilic
309-334IYKLTSGKKSDKSRRWKEVTHRRYHTHydrophilic
764-786PGAAKQGTNKRKRNNEDGKMPKSHydrophilic
970-997PLQAKETPKKSPQQRRWWHTHKYRDVLGHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 11, cyto 10.5, cyto_mito 7.5, mito 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR046351  UTP4  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0030686  C:90S preribosome  
GO:0000462  P:maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50082  WD_REPEATS_2  
Amino Acid Sequences MDIHRCRFVAYNPQAINALAFSHPPSAEVSGRGVPTLRLAIGRANGDVEIWNPLRGAWLQESILRGGKDRTIEGLAWTQDPSENEVDSSGFKVPGKLRLFSIGSSSVVTEWNLEEGRPARHSSGSFGEIWCLAAQPRWKPTKKDKDGKFLPPTEGEYTGQHLAVGCADGSIVILSTEDGDLRYLRTMRPSTKKARVLSLTFQDRNTAVAGYADSTIRIFDIRNGKILRTVSMGKGPVKGSKDLLVWSVKCLPDGTIISGDSAGEIRFWDARNYSLIQRIQGHQADVLDIAVSADGESVISGGVDQRTTIYKLTSGKKSDKSRRWKEVTHRRYHTHDVKAFAVYETKDISIVVSGGLDTIPVVLPLREYGAEHHRKLSNLPQVPQVTSSPSSRLLMSWWDREVCLWYISKRSGPGEQLLDGTSHKLVGKVLFQGDESLTSAALSSDGKLLIAATVAEVKMFSLKWRKGGSKPALRVQKIDLPPTVARHGAKSVTFSPDRLWICLVRPNNDINLARIVSNSYPKENPWVLSELIDLDRIPRQIRYKEIYGTLGQYERSVRCLVFSEDSRMLACGDLGGFIDTWILEDVQESEKAGKGVKLNGMALTSSDDESSDDDDDAPVVLEGQRWIRTPSESPIPRLKAGILLLSFRPSNLSHVKSLTNGTTDSHVSLPILPGTDRLMVLTAEHQLSEFEVMKGILSDWSRRNPKAYLPNEFTILKDRAMGAIWDVNQSRERLWLYGPTWMWMFDLSQDFPSPDDAVENKDVPGAAKQGTNKRKRNNEDGKMPKSNTGAGDRIAVSKSDVGLGRKMRKIVGSEEANAQWIDLKREKARDDVIEEDEYDQYNESSAANDSLLARLRRERGLAELETKEEGEDEDHGRDKEINHHSQHQPNGTSTSSPSSSITSSRKLQVAFAVVIDNRLQVNGHNKTLAKGKQERSQKSQAAIPEKPERKEQATVGTQNPTDLDFVPDLPLQAKETPKKSPQQRRWWHTHKYRDVLGIVPLDHPGSVSDADQGLREGDFNLEVAVVERPMWEVELPGRYVRDYE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.4
3 0.36
4 0.25
5 0.21
6 0.12
7 0.13
8 0.14
9 0.17
10 0.16
11 0.16
12 0.19
13 0.2
14 0.22
15 0.22
16 0.24
17 0.24
18 0.25
19 0.25
20 0.23
21 0.2
22 0.21
23 0.21
24 0.19
25 0.15
26 0.16
27 0.19
28 0.22
29 0.23
30 0.21
31 0.2
32 0.19
33 0.18
34 0.18
35 0.14
36 0.18
37 0.17
38 0.17
39 0.16
40 0.16
41 0.18
42 0.18
43 0.22
44 0.18
45 0.2
46 0.21
47 0.23
48 0.25
49 0.25
50 0.29
51 0.25
52 0.24
53 0.23
54 0.25
55 0.26
56 0.25
57 0.25
58 0.24
59 0.24
60 0.25
61 0.28
62 0.26
63 0.24
64 0.24
65 0.21
66 0.21
67 0.22
68 0.23
69 0.2
70 0.19
71 0.18
72 0.18
73 0.19
74 0.17
75 0.18
76 0.15
77 0.15
78 0.15
79 0.21
80 0.23
81 0.31
82 0.34
83 0.33
84 0.33
85 0.37
86 0.38
87 0.33
88 0.35
89 0.28
90 0.25
91 0.23
92 0.22
93 0.16
94 0.16
95 0.16
96 0.13
97 0.11
98 0.14
99 0.13
100 0.13
101 0.17
102 0.18
103 0.22
104 0.24
105 0.26
106 0.25
107 0.29
108 0.3
109 0.29
110 0.31
111 0.3
112 0.29
113 0.26
114 0.25
115 0.21
116 0.22
117 0.17
118 0.14
119 0.11
120 0.14
121 0.19
122 0.24
123 0.32
124 0.41
125 0.47
126 0.54
127 0.65
128 0.72
129 0.77
130 0.82
131 0.81
132 0.82
133 0.84
134 0.85
135 0.83
136 0.75
137 0.68
138 0.6
139 0.57
140 0.5
141 0.45
142 0.37
143 0.29
144 0.3
145 0.27
146 0.24
147 0.2
148 0.17
149 0.14
150 0.13
151 0.12
152 0.08
153 0.06
154 0.06
155 0.05
156 0.05
157 0.05
158 0.04
159 0.03
160 0.04
161 0.04
162 0.05
163 0.05
164 0.05
165 0.06
166 0.07
167 0.08
168 0.09
169 0.13
170 0.13
171 0.15
172 0.22
173 0.27
174 0.35
175 0.44
176 0.51
177 0.56
178 0.64
179 0.7
180 0.66
181 0.68
182 0.66
183 0.61
184 0.6
185 0.6
186 0.59
187 0.53
188 0.51
189 0.45
190 0.39
191 0.36
192 0.3
193 0.21
194 0.13
195 0.11
196 0.11
197 0.09
198 0.1
199 0.09
200 0.09
201 0.08
202 0.08
203 0.08
204 0.08
205 0.07
206 0.12
207 0.21
208 0.22
209 0.29
210 0.3
211 0.3
212 0.34
213 0.35
214 0.3
215 0.26
216 0.28
217 0.23
218 0.26
219 0.3
220 0.26
221 0.3
222 0.3
223 0.31
224 0.31
225 0.31
226 0.28
227 0.28
228 0.28
229 0.25
230 0.26
231 0.27
232 0.24
233 0.25
234 0.29
235 0.25
236 0.25
237 0.24
238 0.21
239 0.21
240 0.22
241 0.2
242 0.17
243 0.17
244 0.16
245 0.16
246 0.15
247 0.1
248 0.1
249 0.07
250 0.05
251 0.06
252 0.07
253 0.09
254 0.1
255 0.13
256 0.13
257 0.14
258 0.17
259 0.2
260 0.2
261 0.25
262 0.25
263 0.26
264 0.28
265 0.29
266 0.33
267 0.32
268 0.3
269 0.24
270 0.23
271 0.2
272 0.17
273 0.15
274 0.08
275 0.07
276 0.06
277 0.04
278 0.04
279 0.03
280 0.03
281 0.03
282 0.03
283 0.03
284 0.03
285 0.03
286 0.03
287 0.03
288 0.04
289 0.05
290 0.05
291 0.06
292 0.07
293 0.09
294 0.11
295 0.12
296 0.11
297 0.14
298 0.21
299 0.27
300 0.32
301 0.36
302 0.41
303 0.49
304 0.58
305 0.65
306 0.68
307 0.73
308 0.77
309 0.81
310 0.8
311 0.79
312 0.8
313 0.81
314 0.82
315 0.81
316 0.77
317 0.72
318 0.72
319 0.74
320 0.71
321 0.69
322 0.62
323 0.55
324 0.5
325 0.47
326 0.41
327 0.32
328 0.27
329 0.18
330 0.16
331 0.14
332 0.13
333 0.11
334 0.11
335 0.1
336 0.08
337 0.07
338 0.06
339 0.04
340 0.04
341 0.04
342 0.04
343 0.04
344 0.03
345 0.04
346 0.03
347 0.04
348 0.04
349 0.04
350 0.05
351 0.05
352 0.06
353 0.06
354 0.07
355 0.1
356 0.19
357 0.26
358 0.26
359 0.31
360 0.32
361 0.32
362 0.34
363 0.39
364 0.38
365 0.36
366 0.37
367 0.39
368 0.38
369 0.38
370 0.38
371 0.3
372 0.25
373 0.23
374 0.23
375 0.18
376 0.18
377 0.19
378 0.17
379 0.16
380 0.14
381 0.18
382 0.21
383 0.21
384 0.21
385 0.2
386 0.2
387 0.2
388 0.22
389 0.17
390 0.15
391 0.14
392 0.14
393 0.17
394 0.18
395 0.2
396 0.19
397 0.2
398 0.21
399 0.21
400 0.23
401 0.21
402 0.2
403 0.2
404 0.18
405 0.16
406 0.14
407 0.13
408 0.1
409 0.09
410 0.09
411 0.09
412 0.09
413 0.09
414 0.11
415 0.11
416 0.12
417 0.11
418 0.11
419 0.12
420 0.11
421 0.1
422 0.1
423 0.08
424 0.07
425 0.06
426 0.06
427 0.05
428 0.06
429 0.05
430 0.04
431 0.05
432 0.05
433 0.05
434 0.05
435 0.05
436 0.04
437 0.04
438 0.04
439 0.03
440 0.04
441 0.04
442 0.04
443 0.04
444 0.04
445 0.05
446 0.05
447 0.09
448 0.16
449 0.17
450 0.23
451 0.27
452 0.31
453 0.33
454 0.43
455 0.48
456 0.48
457 0.51
458 0.52
459 0.57
460 0.53
461 0.51
462 0.45
463 0.44
464 0.38
465 0.37
466 0.3
467 0.26
468 0.26
469 0.27
470 0.26
471 0.2
472 0.19
473 0.17
474 0.18
475 0.16
476 0.15
477 0.16
478 0.16
479 0.18
480 0.18
481 0.18
482 0.17
483 0.23
484 0.23
485 0.2
486 0.2
487 0.16
488 0.17
489 0.22
490 0.23
491 0.19
492 0.2
493 0.21
494 0.2
495 0.24
496 0.23
497 0.19
498 0.19
499 0.16
500 0.14
501 0.13
502 0.14
503 0.11
504 0.16
505 0.15
506 0.15
507 0.16
508 0.16
509 0.21
510 0.21
511 0.2
512 0.17
513 0.19
514 0.16
515 0.16
516 0.16
517 0.12
518 0.11
519 0.11
520 0.08
521 0.07
522 0.09
523 0.1
524 0.1
525 0.12
526 0.17
527 0.18
528 0.23
529 0.26
530 0.27
531 0.27
532 0.28
533 0.27
534 0.23
535 0.22
536 0.19
537 0.15
538 0.13
539 0.12
540 0.14
541 0.12
542 0.13
543 0.13
544 0.12
545 0.12
546 0.14
547 0.15
548 0.15
549 0.15
550 0.18
551 0.17
552 0.18
553 0.17
554 0.15
555 0.14
556 0.11
557 0.1
558 0.05
559 0.04
560 0.04
561 0.04
562 0.04
563 0.04
564 0.04
565 0.04
566 0.04
567 0.04
568 0.04
569 0.04
570 0.04
571 0.04
572 0.06
573 0.07
574 0.07
575 0.07
576 0.07
577 0.09
578 0.09
579 0.09
580 0.1
581 0.1
582 0.13
583 0.15
584 0.16
585 0.15
586 0.15
587 0.15
588 0.13
589 0.11
590 0.11
591 0.09
592 0.08
593 0.08
594 0.08
595 0.08
596 0.09
597 0.1
598 0.09
599 0.08
600 0.08
601 0.08
602 0.07
603 0.07
604 0.06
605 0.04
606 0.04
607 0.04
608 0.04
609 0.06
610 0.08
611 0.1
612 0.1
613 0.12
614 0.13
615 0.15
616 0.17
617 0.19
618 0.26
619 0.26
620 0.3
621 0.36
622 0.37
623 0.36
624 0.34
625 0.31
626 0.24
627 0.23
628 0.21
629 0.14
630 0.13
631 0.13
632 0.14
633 0.14
634 0.11
635 0.13
636 0.11
637 0.16
638 0.2
639 0.22
640 0.22
641 0.24
642 0.25
643 0.24
644 0.25
645 0.21
646 0.17
647 0.15
648 0.14
649 0.14
650 0.14
651 0.14
652 0.12
653 0.11
654 0.1
655 0.1
656 0.1
657 0.09
658 0.09
659 0.08
660 0.08
661 0.1
662 0.1
663 0.1
664 0.09
665 0.09
666 0.08
667 0.09
668 0.09
669 0.1
670 0.09
671 0.09
672 0.09
673 0.08
674 0.08
675 0.1
676 0.1
677 0.08
678 0.08
679 0.08
680 0.08
681 0.08
682 0.08
683 0.09
684 0.09
685 0.14
686 0.17
687 0.25
688 0.31
689 0.32
690 0.35
691 0.34
692 0.4
693 0.46
694 0.47
695 0.47
696 0.47
697 0.47
698 0.47
699 0.45
700 0.38
701 0.34
702 0.31
703 0.23
704 0.19
705 0.18
706 0.15
707 0.15
708 0.14
709 0.09
710 0.11
711 0.11
712 0.14
713 0.14
714 0.15
715 0.17
716 0.18
717 0.17
718 0.18
719 0.19
720 0.16
721 0.17
722 0.21
723 0.19
724 0.25
725 0.24
726 0.22
727 0.21
728 0.2
729 0.19
730 0.14
731 0.13
732 0.1
733 0.13
734 0.13
735 0.14
736 0.14
737 0.14
738 0.14
739 0.16
740 0.13
741 0.1
742 0.11
743 0.11
744 0.14
745 0.17
746 0.17
747 0.15
748 0.16
749 0.16
750 0.14
751 0.15
752 0.14
753 0.12
754 0.14
755 0.2
756 0.29
757 0.39
758 0.48
759 0.55
760 0.61
761 0.7
762 0.74
763 0.8
764 0.81
765 0.79
766 0.79
767 0.81
768 0.79
769 0.76
770 0.71
771 0.64
772 0.55
773 0.5
774 0.42
775 0.37
776 0.31
777 0.25
778 0.26
779 0.23
780 0.23
781 0.2
782 0.17
783 0.14
784 0.14
785 0.13
786 0.14
787 0.16
788 0.16
789 0.21
790 0.28
791 0.34
792 0.36
793 0.37
794 0.35
795 0.36
796 0.37
797 0.35
798 0.36
799 0.32
800 0.31
801 0.33
802 0.32
803 0.3
804 0.27
805 0.23
806 0.2
807 0.18
808 0.22
809 0.23
810 0.28
811 0.31
812 0.37
813 0.39
814 0.39
815 0.42
816 0.4
817 0.39
818 0.38
819 0.37
820 0.32
821 0.31
822 0.28
823 0.25
824 0.22
825 0.18
826 0.15
827 0.11
828 0.1
829 0.1
830 0.08
831 0.08
832 0.09
833 0.09
834 0.08
835 0.1
836 0.1
837 0.12
838 0.17
839 0.17
840 0.19
841 0.23
842 0.27
843 0.28
844 0.3
845 0.28
846 0.27
847 0.32
848 0.32
849 0.32
850 0.3
851 0.29
852 0.28
853 0.27
854 0.22
855 0.17
856 0.15
857 0.11
858 0.12
859 0.13
860 0.15
861 0.19
862 0.19
863 0.2
864 0.22
865 0.21
866 0.28
867 0.34
868 0.38
869 0.39
870 0.47
871 0.53
872 0.58
873 0.62
874 0.58
875 0.53
876 0.48
877 0.47
878 0.4
879 0.35
880 0.3
881 0.29
882 0.25
883 0.24
884 0.23
885 0.21
886 0.22
887 0.27
888 0.29
889 0.29
890 0.33
891 0.36
892 0.38
893 0.36
894 0.36
895 0.33
896 0.33
897 0.28
898 0.24
899 0.23
900 0.19
901 0.21
902 0.2
903 0.17
904 0.13
905 0.13
906 0.13
907 0.13
908 0.22
909 0.25
910 0.27
911 0.3
912 0.3
913 0.33
914 0.41
915 0.42
916 0.42
917 0.46
918 0.5
919 0.53
920 0.63
921 0.68
922 0.67
923 0.73
924 0.68
925 0.62
926 0.6
927 0.6
928 0.58
929 0.54
930 0.52
931 0.53
932 0.55
933 0.54
934 0.58
935 0.56
936 0.53
937 0.55
938 0.51
939 0.5
940 0.51
941 0.54
942 0.5
943 0.49
944 0.44
945 0.4
946 0.38
947 0.3
948 0.24
949 0.2
950 0.2
951 0.15
952 0.16
953 0.18
954 0.18
955 0.18
956 0.17
957 0.18
958 0.17
959 0.21
960 0.29
961 0.34
962 0.37
963 0.45
964 0.51
965 0.59
966 0.67
967 0.73
968 0.76
969 0.79
970 0.86
971 0.86
972 0.89
973 0.89
974 0.89
975 0.87
976 0.88
977 0.86
978 0.82
979 0.78
980 0.72
981 0.65
982 0.56
983 0.5
984 0.42
985 0.34
986 0.28
987 0.24
988 0.2
989 0.18
990 0.16
991 0.12
992 0.12
993 0.12
994 0.12
995 0.13
996 0.14
997 0.15
998 0.15
999 0.15
1000 0.13
1001 0.12
1002 0.12
1003 0.1
1004 0.11
1005 0.11
1006 0.1
1007 0.1
1008 0.09
1009 0.09
1010 0.09
1011 0.1
1012 0.09
1013 0.08
1014 0.09
1015 0.1
1016 0.1
1017 0.12
1018 0.11
1019 0.12
1020 0.16
1021 0.2
1022 0.22
1023 0.24
1024 0.24