FuNGI

A0A1J9Q6V8

Protein Details

Accession

A0A1J9Q6V8

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
370-391	LLSHAHRKKYRRRARIPPPVTL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
375-394	HRKKYRRRARIPPPVTLKRR

Subcellular Location(s)

nucl 18, cyto_nucl 11.5, mito 5, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR019313 Mediator_Med17
Gene Ontology	GO:0016592 C:mediator complex GO:0003712 F:transcription coregulator activity GO:0006357 P:regulation of transcription by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF10156 Med17

Amino Acid Sequences

MKESLSLPLRPFVQRSVTEPDSLPIRIAQINSQRGSFRNVTEQSLQAEIDAQQATAAAGLEAEETEEAESQEAKSTDRLEQLFKSRAEIVDFVAQAHAEANYALDLVSLLISKYTPRQAEISMSPYLKQKAPLGSLGIDIIKTQEKTETTQKDIVDLSRGWKLETFDFAANKLLQAAFRLEQEVAAETKYWADVLSIKEKGWKICRLPRERQTLGVQCGFLEATPTLRDRGLAALRRGHGGDLILDRGLQPSQPRSLRVRVQQHNQIVGSSKLISLELVPGDNSIEHCIRLARDVLYEEELFHELNREARTLLQHGIESKGNLIQFQASDNQQILIDMVSLDEYNISDFDKQEHAEDALAEAVAQSLRLLLSHAHRKKYRRRARIPPPVTLKRRPNPEYSLLQPVVSYLQHKSALQWLKSVLGTITRTLQLAGLKCKHDVSPLIFVRLPPVNKTIPYPSEPDTLPFVERLVDTFLTPLESIVTGTLLTPTSSFKIRIITNISPNGYGTEFEIATNMTSGSRTKSSSSRFGLRDDLQQLLLHLYTTDLVYLIPALTLGTSTESSPLPTSSQQKQEQGQERLQPEQTHFNTPVQPHTSHPTPWTPTSPENGELVASFPTQRRSKKLNIDLRPERLTILCQWLGAGLADLGEDLESVAGEGNVIYSWSDDGGNERKTLQSIMCLLSQWETKPEL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.36
2	0.39
3	0.43
4	0.42
5	0.41
6	0.39
7	0.37
8	0.34
9	0.32
10	0.28
11	0.2
12	0.22
13	0.22
14	0.22
15	0.27
16	0.32
17	0.39
18	0.39
19	0.41
20	0.4
21	0.39
22	0.45
23	0.41
24	0.35
25	0.37
26	0.38
27	0.41
28	0.41
29	0.42
30	0.37
31	0.36
32	0.32
33	0.23
34	0.22
35	0.18
36	0.19
37	0.16
38	0.13
39	0.11
40	0.12
41	0.11
42	0.1
43	0.1
44	0.05
45	0.05
46	0.05
47	0.05
48	0.05
49	0.06
50	0.05
51	0.05
52	0.06
53	0.07
54	0.07
55	0.08
56	0.09
57	0.09
58	0.14
59	0.14
60	0.15
61	0.17
62	0.19
63	0.22
64	0.28
65	0.29
66	0.28
67	0.32
68	0.38
69	0.42
70	0.4
71	0.39
72	0.36
73	0.36
74	0.35
75	0.31
76	0.27
77	0.26
78	0.26
79	0.23
80	0.2
81	0.19
82	0.15
83	0.15
84	0.12
85	0.07
86	0.06
87	0.06
88	0.06
89	0.06
90	0.05
91	0.05
92	0.05
93	0.04
94	0.05
95	0.05
96	0.05
97	0.05
98	0.06
99	0.07
100	0.12
101	0.18
102	0.19
103	0.21
104	0.23
105	0.24
106	0.29
107	0.31
108	0.3
109	0.29
110	0.28
111	0.28
112	0.31
113	0.32
114	0.29
115	0.3
116	0.3
117	0.3
118	0.32
119	0.33
120	0.3
121	0.27
122	0.26
123	0.24
124	0.2
125	0.15
126	0.12
127	0.12
128	0.14
129	0.13
130	0.13
131	0.16
132	0.17
133	0.22
134	0.31
135	0.34
136	0.35
137	0.4
138	0.39
139	0.37
140	0.37
141	0.33
142	0.28
143	0.24
144	0.22
145	0.22
146	0.22
147	0.2
148	0.22
149	0.23
150	0.21
151	0.23
152	0.24
153	0.22
154	0.23
155	0.23
156	0.23
157	0.21
158	0.19
159	0.17
160	0.14
161	0.11
162	0.12
163	0.15
164	0.12
165	0.13
166	0.15
167	0.13
168	0.13
169	0.13
170	0.13
171	0.11
172	0.1
173	0.1
174	0.08
175	0.09
176	0.08
177	0.08
178	0.06
179	0.06
180	0.1
181	0.13
182	0.18
183	0.19
184	0.19
185	0.25
186	0.27
187	0.32
188	0.35
189	0.38
190	0.39
191	0.45
192	0.55
193	0.57
194	0.64
195	0.67
196	0.7
197	0.65
198	0.63
199	0.63
200	0.6
201	0.56
202	0.49
203	0.4
204	0.31
205	0.3
206	0.25
207	0.17
208	0.13
209	0.09
210	0.08
211	0.1
212	0.11
213	0.11
214	0.11
215	0.12
216	0.1
217	0.15
218	0.19
219	0.23
220	0.25
221	0.28
222	0.29
223	0.3
224	0.3
225	0.25
226	0.2
227	0.15
228	0.14
229	0.11
230	0.11
231	0.09
232	0.09
233	0.09
234	0.09
235	0.09
236	0.08
237	0.1
238	0.12
239	0.19
240	0.2
241	0.24
242	0.27
243	0.33
244	0.38
245	0.44
246	0.51
247	0.51
248	0.56
249	0.6
250	0.59
251	0.56
252	0.5
253	0.43
254	0.35
255	0.28
256	0.23
257	0.16
258	0.13
259	0.09
260	0.09
261	0.09
262	0.07
263	0.08
264	0.07
265	0.07
266	0.06
267	0.06
268	0.06
269	0.07
270	0.07
271	0.08
272	0.09
273	0.08
274	0.09
275	0.1
276	0.1
277	0.11
278	0.12
279	0.09
280	0.1
281	0.11
282	0.12
283	0.13
284	0.13
285	0.12
286	0.11
287	0.12
288	0.11
289	0.09
290	0.1
291	0.08
292	0.11
293	0.12
294	0.11
295	0.11
296	0.12
297	0.14
298	0.14
299	0.15
300	0.12
301	0.12
302	0.13
303	0.15
304	0.14
305	0.13
306	0.11
307	0.12
308	0.11
309	0.1
310	0.1
311	0.08
312	0.08
313	0.09
314	0.11
315	0.09
316	0.1
317	0.1
318	0.1
319	0.09
320	0.09
321	0.08
322	0.06
323	0.05
324	0.04
325	0.04
326	0.03
327	0.03
328	0.03
329	0.03
330	0.03
331	0.03
332	0.04
333	0.04
334	0.05
335	0.05
336	0.07
337	0.09
338	0.09
339	0.1
340	0.1
341	0.1
342	0.09
343	0.09
344	0.08
345	0.06
346	0.06
347	0.05
348	0.04
349	0.04
350	0.03
351	0.03
352	0.03
353	0.03
354	0.03
355	0.03
356	0.04
357	0.05
358	0.1
359	0.2
360	0.24
361	0.31
362	0.36
363	0.44
364	0.53
365	0.63
366	0.69
367	0.69
368	0.75
369	0.79
370	0.85
371	0.89
372	0.82
373	0.78
374	0.77
375	0.76
376	0.73
377	0.71
378	0.69
379	0.64
380	0.7
381	0.66
382	0.62
383	0.58
384	0.57
385	0.52
386	0.45
387	0.46
388	0.37
389	0.34
390	0.28
391	0.24
392	0.2
393	0.17
394	0.15
395	0.09
396	0.12
397	0.13
398	0.14
399	0.14
400	0.2
401	0.26
402	0.24
403	0.25
404	0.22
405	0.22
406	0.22
407	0.22
408	0.14
409	0.12
410	0.12
411	0.12
412	0.13
413	0.12
414	0.12
415	0.12
416	0.14
417	0.13
418	0.15
419	0.2
420	0.22
421	0.23
422	0.23
423	0.24
424	0.23
425	0.23
426	0.24
427	0.21
428	0.26
429	0.26
430	0.29
431	0.28
432	0.27
433	0.28
434	0.29
435	0.27
436	0.2
437	0.23
438	0.22
439	0.22
440	0.25
441	0.26
442	0.25
443	0.27
444	0.28
445	0.27
446	0.28
447	0.28
448	0.27
449	0.25
450	0.23
451	0.21
452	0.18
453	0.15
454	0.13
455	0.13
456	0.12
457	0.12
458	0.11
459	0.1
460	0.1
461	0.1
462	0.1
463	0.1
464	0.09
465	0.07
466	0.06
467	0.07
468	0.06
469	0.06
470	0.05
471	0.05
472	0.06
473	0.06
474	0.06
475	0.06
476	0.08
477	0.1
478	0.12
479	0.13
480	0.13
481	0.18
482	0.18
483	0.22
484	0.27
485	0.29
486	0.33
487	0.37
488	0.37
489	0.32
490	0.32
491	0.29
492	0.23
493	0.19
494	0.14
495	0.12
496	0.11
497	0.1
498	0.11
499	0.09
500	0.09
501	0.09
502	0.08
503	0.06
504	0.07
505	0.08
506	0.11
507	0.13
508	0.15
509	0.17
510	0.24
511	0.29
512	0.36
513	0.4
514	0.44
515	0.44
516	0.45
517	0.48
518	0.43
519	0.45
520	0.39
521	0.36
522	0.29
523	0.27
524	0.25
525	0.2
526	0.18
527	0.11
528	0.09
529	0.08
530	0.08
531	0.07
532	0.07
533	0.05
534	0.05
535	0.05
536	0.06
537	0.05
538	0.04
539	0.04
540	0.04
541	0.04
542	0.04
543	0.04
544	0.06
545	0.07
546	0.08
547	0.1
548	0.1
549	0.12
550	0.13
551	0.14
552	0.14
553	0.19
554	0.25
555	0.3
556	0.39
557	0.42
558	0.47
559	0.51
560	0.57
561	0.61
562	0.61
563	0.6
564	0.58
565	0.55
566	0.54
567	0.53
568	0.47
569	0.41
570	0.45
571	0.42
572	0.41
573	0.41
574	0.4
575	0.42
576	0.4
577	0.45
578	0.39
579	0.38
580	0.35
581	0.4
582	0.4
583	0.37
584	0.39
585	0.39
586	0.4
587	0.43
588	0.44
589	0.42
590	0.42
591	0.45
592	0.45
593	0.39
594	0.35
595	0.31
596	0.27
597	0.22
598	0.2
599	0.15
600	0.12
601	0.13
602	0.14
603	0.22
604	0.29
605	0.34
606	0.41
607	0.46
608	0.54
609	0.63
610	0.7
611	0.73
612	0.74
613	0.79
614	0.8
615	0.8
616	0.74
617	0.64
618	0.55
619	0.46
620	0.41
621	0.35
622	0.34
623	0.28
624	0.24
625	0.24
626	0.22
627	0.21
628	0.18
629	0.14
630	0.06
631	0.06
632	0.06
633	0.06
634	0.05
635	0.05
636	0.04
637	0.04
638	0.04
639	0.04
640	0.04
641	0.05
642	0.04
643	0.04
644	0.04
645	0.05
646	0.05
647	0.05
648	0.05
649	0.05
650	0.06
651	0.07
652	0.08
653	0.08
654	0.14
655	0.21
656	0.23
657	0.23
658	0.24
659	0.25
660	0.27
661	0.3
662	0.25
663	0.23
664	0.25
665	0.26
666	0.26
667	0.25
668	0.24
669	0.25
670	0.27
671	0.23

A0A1J9Q6V8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer