Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1J9Q6Q4

Protein Details
Accession A0A1J9Q6Q4    Localization Confidence High Confidence Score 16.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
425-451ASWKPNKRGMYYRKRRRWSRVRSVVDEHydrophilic
610-635GKVEARGNQARKKRKTSTRDVTPAASHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
437-441RKRRR
620-624RKKRK
Subcellular Location(s) nucl 12, mito 11, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017423  TRM6  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0031515  C:tRNA (m1A) methyltransferase complex  
GO:0030488  P:tRNA methylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF04189  Gcd10p  
Amino Acid Sequences MPTLKITLTKISCSTRFDLNIQDSITSVQRRMHSRILPHAYIALRLPSDTVKVQQIVPNTIISLGKYGSFQANQILGRPYHLTFEILDQPTTEDNHALRIVSAAELHAESLIADGSIPGEVEDRECYRDLDDMDASPMRTNRDTVDDSSSQLMTMDEIEALKKGTTGAGRDIINKLLESHSGLDKKTEFSLAKYTLRKQKKYLKRFSVLPLDVPLLTQWMLEQKDATKIMELRDEIVGLIGCWANVHNGGDAFTIQGSVEMHPASRWLVVDDTGGLVVAAMAERMGILYPHETSIGDVQDKAASQPQPERDDEHQPNNSEPSSQYGPAQATNGLSWQASNASSSARNRRPSPGMTSNNTTLTMIHPNAQPNLALLKYFSFDVSDPSPSHPLHTNLKTLSWLQLLDPSSDPVYSKEPTVASDEALASWKPNKRGMYYRKRRRWSRVRSVVDETRAGGFNGLIVASLMDPTSILKHTIPLLSGSAPVVVYAPHIEPLVRLADFYSTARRTAYINFMRAARQQEQTAATARAVNGMCNQTELEQDAEDAESPSAAVNESDFPVDPTLLLAPTIQTSRVRPWQVLPGRTHPLMTGRGGAEGYVFHALRAFPALGKVEARGNQARKKRKTSTRDVTPAASIISAPQTVN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.45
2 0.43
3 0.44
4 0.43
5 0.45
6 0.43
7 0.43
8 0.38
9 0.35
10 0.29
11 0.28
12 0.32
13 0.26
14 0.24
15 0.25
16 0.31
17 0.37
18 0.42
19 0.48
20 0.47
21 0.51
22 0.59
23 0.62
24 0.56
25 0.51
26 0.51
27 0.43
28 0.4
29 0.35
30 0.29
31 0.21
32 0.2
33 0.21
34 0.17
35 0.2
36 0.2
37 0.22
38 0.23
39 0.24
40 0.27
41 0.28
42 0.31
43 0.31
44 0.31
45 0.28
46 0.23
47 0.23
48 0.21
49 0.19
50 0.17
51 0.13
52 0.13
53 0.13
54 0.14
55 0.17
56 0.17
57 0.17
58 0.19
59 0.23
60 0.22
61 0.25
62 0.27
63 0.23
64 0.25
65 0.27
66 0.23
67 0.22
68 0.23
69 0.21
70 0.17
71 0.22
72 0.27
73 0.26
74 0.25
75 0.22
76 0.24
77 0.24
78 0.26
79 0.22
80 0.17
81 0.16
82 0.19
83 0.2
84 0.18
85 0.16
86 0.15
87 0.14
88 0.11
89 0.11
90 0.08
91 0.08
92 0.08
93 0.08
94 0.07
95 0.07
96 0.06
97 0.06
98 0.06
99 0.04
100 0.04
101 0.04
102 0.04
103 0.04
104 0.04
105 0.04
106 0.05
107 0.06
108 0.07
109 0.11
110 0.12
111 0.15
112 0.16
113 0.17
114 0.17
115 0.2
116 0.19
117 0.19
118 0.19
119 0.16
120 0.19
121 0.2
122 0.19
123 0.19
124 0.2
125 0.2
126 0.2
127 0.21
128 0.19
129 0.24
130 0.26
131 0.26
132 0.31
133 0.28
134 0.28
135 0.29
136 0.27
137 0.21
138 0.18
139 0.15
140 0.09
141 0.09
142 0.08
143 0.06
144 0.07
145 0.07
146 0.07
147 0.08
148 0.07
149 0.07
150 0.07
151 0.09
152 0.11
153 0.12
154 0.15
155 0.18
156 0.19
157 0.22
158 0.23
159 0.23
160 0.21
161 0.19
162 0.18
163 0.15
164 0.15
165 0.14
166 0.15
167 0.18
168 0.2
169 0.2
170 0.22
171 0.21
172 0.22
173 0.21
174 0.24
175 0.19
176 0.19
177 0.26
178 0.27
179 0.32
180 0.34
181 0.4
182 0.45
183 0.54
184 0.56
185 0.57
186 0.64
187 0.68
188 0.74
189 0.78
190 0.77
191 0.73
192 0.74
193 0.72
194 0.71
195 0.61
196 0.52
197 0.43
198 0.35
199 0.3
200 0.26
201 0.19
202 0.11
203 0.1
204 0.08
205 0.07
206 0.11
207 0.12
208 0.12
209 0.13
210 0.12
211 0.17
212 0.18
213 0.18
214 0.16
215 0.16
216 0.18
217 0.21
218 0.2
219 0.17
220 0.16
221 0.16
222 0.13
223 0.12
224 0.1
225 0.06
226 0.07
227 0.05
228 0.05
229 0.05
230 0.05
231 0.05
232 0.06
233 0.07
234 0.06
235 0.07
236 0.08
237 0.08
238 0.08
239 0.07
240 0.06
241 0.06
242 0.05
243 0.06
244 0.06
245 0.06
246 0.07
247 0.07
248 0.07
249 0.07
250 0.08
251 0.08
252 0.08
253 0.07
254 0.07
255 0.08
256 0.08
257 0.08
258 0.07
259 0.07
260 0.06
261 0.05
262 0.04
263 0.03
264 0.03
265 0.03
266 0.02
267 0.02
268 0.02
269 0.02
270 0.02
271 0.02
272 0.02
273 0.02
274 0.03
275 0.04
276 0.05
277 0.06
278 0.06
279 0.06
280 0.07
281 0.09
282 0.1
283 0.09
284 0.09
285 0.09
286 0.09
287 0.09
288 0.09
289 0.12
290 0.11
291 0.12
292 0.16
293 0.21
294 0.23
295 0.24
296 0.28
297 0.27
298 0.35
299 0.37
300 0.39
301 0.38
302 0.35
303 0.35
304 0.33
305 0.3
306 0.22
307 0.18
308 0.17
309 0.16
310 0.15
311 0.15
312 0.15
313 0.15
314 0.15
315 0.15
316 0.11
317 0.1
318 0.09
319 0.09
320 0.08
321 0.07
322 0.06
323 0.06
324 0.06
325 0.06
326 0.06
327 0.06
328 0.07
329 0.1
330 0.14
331 0.23
332 0.27
333 0.32
334 0.33
335 0.38
336 0.4
337 0.4
338 0.44
339 0.45
340 0.44
341 0.43
342 0.45
343 0.42
344 0.39
345 0.37
346 0.29
347 0.2
348 0.17
349 0.18
350 0.15
351 0.16
352 0.16
353 0.18
354 0.18
355 0.18
356 0.16
357 0.12
358 0.14
359 0.11
360 0.09
361 0.08
362 0.08
363 0.08
364 0.08
365 0.08
366 0.07
367 0.07
368 0.1
369 0.11
370 0.13
371 0.13
372 0.16
373 0.2
374 0.19
375 0.21
376 0.21
377 0.23
378 0.28
379 0.3
380 0.31
381 0.27
382 0.28
383 0.28
384 0.25
385 0.24
386 0.17
387 0.15
388 0.12
389 0.16
390 0.16
391 0.17
392 0.16
393 0.15
394 0.15
395 0.15
396 0.15
397 0.12
398 0.15
399 0.13
400 0.13
401 0.14
402 0.14
403 0.15
404 0.19
405 0.18
406 0.14
407 0.15
408 0.15
409 0.12
410 0.14
411 0.12
412 0.09
413 0.14
414 0.18
415 0.2
416 0.25
417 0.27
418 0.3
419 0.4
420 0.5
421 0.56
422 0.63
423 0.71
424 0.76
425 0.83
426 0.87
427 0.88
428 0.88
429 0.88
430 0.88
431 0.87
432 0.84
433 0.8
434 0.79
435 0.73
436 0.66
437 0.56
438 0.45
439 0.37
440 0.31
441 0.25
442 0.18
443 0.12
444 0.1
445 0.09
446 0.07
447 0.05
448 0.04
449 0.04
450 0.04
451 0.04
452 0.04
453 0.04
454 0.04
455 0.04
456 0.07
457 0.07
458 0.09
459 0.09
460 0.11
461 0.13
462 0.14
463 0.14
464 0.13
465 0.14
466 0.13
467 0.13
468 0.12
469 0.11
470 0.09
471 0.09
472 0.08
473 0.06
474 0.06
475 0.08
476 0.08
477 0.08
478 0.09
479 0.09
480 0.09
481 0.11
482 0.13
483 0.1
484 0.1
485 0.1
486 0.11
487 0.12
488 0.14
489 0.19
490 0.18
491 0.19
492 0.19
493 0.19
494 0.2
495 0.22
496 0.3
497 0.28
498 0.3
499 0.31
500 0.32
501 0.34
502 0.36
503 0.39
504 0.34
505 0.31
506 0.3
507 0.32
508 0.33
509 0.32
510 0.31
511 0.26
512 0.23
513 0.22
514 0.21
515 0.22
516 0.2
517 0.2
518 0.21
519 0.22
520 0.21
521 0.2
522 0.21
523 0.16
524 0.17
525 0.17
526 0.14
527 0.11
528 0.11
529 0.11
530 0.11
531 0.11
532 0.1
533 0.09
534 0.07
535 0.07
536 0.07
537 0.07
538 0.07
539 0.06
540 0.06
541 0.09
542 0.1
543 0.11
544 0.11
545 0.12
546 0.13
547 0.13
548 0.12
549 0.11
550 0.11
551 0.1
552 0.1
553 0.09
554 0.08
555 0.11
556 0.12
557 0.13
558 0.15
559 0.18
560 0.25
561 0.34
562 0.36
563 0.36
564 0.38
565 0.46
566 0.51
567 0.54
568 0.53
569 0.51
570 0.55
571 0.54
572 0.51
573 0.42
574 0.39
575 0.36
576 0.32
577 0.3
578 0.23
579 0.24
580 0.24
581 0.22
582 0.17
583 0.14
584 0.14
585 0.15
586 0.15
587 0.13
588 0.15
589 0.15
590 0.16
591 0.19
592 0.17
593 0.12
594 0.16
595 0.18
596 0.18
597 0.19
598 0.2
599 0.23
600 0.26
601 0.32
602 0.37
603 0.42
604 0.49
605 0.58
606 0.67
607 0.7
608 0.76
609 0.8
610 0.82
611 0.84
612 0.86
613 0.87
614 0.88
615 0.87
616 0.81
617 0.74
618 0.65
619 0.57
620 0.46
621 0.36
622 0.25
623 0.19
624 0.18