Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1J9Q172

Protein Details
Accession A0A1J9Q172    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
227-248AYIKGKEEKARREKARKEKAFVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
230-246KGKEEKARREKARKEKA
258-301PRGGRGGGRGGGGRGGGDRGRGGNGGRGGRGGEFRAGVGLRGAP
Subcellular Location(s) cyto_nucl 8.5, cyto 8, nucl 7, mito 6, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039764  HABP4/SERBP1  
IPR006861  HABP4_PAIRBP1-bd  
IPR019084  Stm1-like_N  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF09598  Stm1_N  
Amino Acid Sequences NLYELLGNDPEEDSDREPSPPTSAITKAAPRYGKREGPSEPPRSANPANARAPRTGRAGGNRSGNEQAFRDRDASARANRSKPVDAPVPDIPTGVVKNRDVRGNLLREDRTNRSDRTDTNKQIEQGWGATDGEAAWDDERAAAAAAKRERKEGPGGEAADAEATAAAAAAAEAEDKAKSYAEYLAEQAEQRREDLGVKEARKPNEGVKADKKWATAREFKRDEDDEAYIKGKEEKARREKARKEKAFVEVDMRFVEQPRGGRGGGRGGGGRGGGDRGRGGNGGRGGRGGEFRAGVGLRGAPRGGPAAGSSVNVDETNFPALGGK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.21
3 0.22
4 0.24
5 0.24
6 0.25
7 0.24
8 0.24
9 0.24
10 0.24
11 0.26
12 0.29
13 0.34
14 0.34
15 0.39
16 0.43
17 0.43
18 0.48
19 0.52
20 0.54
21 0.51
22 0.53
23 0.5
24 0.54
25 0.6
26 0.6
27 0.55
28 0.52
29 0.51
30 0.53
31 0.5
32 0.48
33 0.47
34 0.48
35 0.52
36 0.55
37 0.56
38 0.53
39 0.55
40 0.5
41 0.48
42 0.44
43 0.41
44 0.43
45 0.45
46 0.45
47 0.49
48 0.46
49 0.44
50 0.45
51 0.42
52 0.36
53 0.32
54 0.33
55 0.28
56 0.29
57 0.27
58 0.22
59 0.23
60 0.26
61 0.3
62 0.3
63 0.37
64 0.42
65 0.43
66 0.46
67 0.49
68 0.47
69 0.43
70 0.42
71 0.4
72 0.35
73 0.38
74 0.37
75 0.36
76 0.33
77 0.31
78 0.26
79 0.21
80 0.21
81 0.19
82 0.19
83 0.18
84 0.24
85 0.26
86 0.3
87 0.28
88 0.32
89 0.35
90 0.35
91 0.37
92 0.36
93 0.35
94 0.35
95 0.39
96 0.39
97 0.38
98 0.39
99 0.36
100 0.37
101 0.38
102 0.39
103 0.42
104 0.47
105 0.47
106 0.47
107 0.49
108 0.44
109 0.42
110 0.39
111 0.32
112 0.23
113 0.18
114 0.14
115 0.11
116 0.1
117 0.08
118 0.07
119 0.06
120 0.06
121 0.06
122 0.04
123 0.04
124 0.04
125 0.04
126 0.05
127 0.04
128 0.04
129 0.05
130 0.05
131 0.1
132 0.14
133 0.19
134 0.2
135 0.23
136 0.24
137 0.25
138 0.3
139 0.26
140 0.26
141 0.26
142 0.26
143 0.23
144 0.22
145 0.2
146 0.14
147 0.13
148 0.09
149 0.04
150 0.03
151 0.02
152 0.02
153 0.02
154 0.02
155 0.02
156 0.02
157 0.02
158 0.02
159 0.02
160 0.03
161 0.03
162 0.03
163 0.04
164 0.04
165 0.05
166 0.06
167 0.08
168 0.09
169 0.1
170 0.1
171 0.11
172 0.11
173 0.12
174 0.13
175 0.15
176 0.13
177 0.13
178 0.13
179 0.13
180 0.14
181 0.15
182 0.18
183 0.21
184 0.23
185 0.3
186 0.34
187 0.35
188 0.35
189 0.36
190 0.34
191 0.38
192 0.39
193 0.38
194 0.4
195 0.44
196 0.46
197 0.46
198 0.44
199 0.39
200 0.42
201 0.42
202 0.44
203 0.45
204 0.5
205 0.51
206 0.5
207 0.52
208 0.48
209 0.45
210 0.39
211 0.36
212 0.28
213 0.26
214 0.27
215 0.2
216 0.19
217 0.19
218 0.19
219 0.23
220 0.29
221 0.38
222 0.46
223 0.56
224 0.65
225 0.72
226 0.78
227 0.82
228 0.87
229 0.83
230 0.79
231 0.74
232 0.72
233 0.66
234 0.57
235 0.53
236 0.42
237 0.38
238 0.33
239 0.29
240 0.22
241 0.2
242 0.21
243 0.17
244 0.18
245 0.19
246 0.22
247 0.2
248 0.21
249 0.22
250 0.25
251 0.24
252 0.23
253 0.21
254 0.18
255 0.19
256 0.17
257 0.16
258 0.11
259 0.12
260 0.11
261 0.12
262 0.13
263 0.13
264 0.14
265 0.16
266 0.16
267 0.18
268 0.23
269 0.24
270 0.23
271 0.22
272 0.22
273 0.22
274 0.24
275 0.2
276 0.17
277 0.16
278 0.15
279 0.18
280 0.17
281 0.16
282 0.15
283 0.16
284 0.16
285 0.17
286 0.17
287 0.14
288 0.15
289 0.17
290 0.16
291 0.13
292 0.12
293 0.14
294 0.15
295 0.15
296 0.15
297 0.14
298 0.15
299 0.15
300 0.15
301 0.13
302 0.14
303 0.16
304 0.15