Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

V5IPZ0

Protein Details
Accession V5IPZ0    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
105-124MPHCSRCRKKLLPGEPGRNYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
313-322PERLRPRMSR
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 12, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002867  IBR_dom  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
KEGG ncr:NCU16775  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01485  IBR  
CDD cd20335  BRcat_RBR  
Amino Acid Sequences MDDHVRKPPMCCKRYISPQLVDNLFDPIFKKDWDRKFVHSSIFASGRPRSLVCPDPKCGTPIEDQDIHLDRDGREFGECRYCRTEVCVGCSGRWHKSLQCPPDAMPHCSRCRKKLLPGEPGRNYTTCQCNTRCCTVCGLRWKKCDCPFFNIEGNEPLDTLFTADPRSNPFTYAMQLESDAQSPRTYRSNGGHSRPVAAVHSRPQSYEERPVMDRLREKRSDDPLSRRFHVPGEFEEYDEREVDDDYRRGRDDRDRPLKPVNYVRRPEMAVPPPLVHRHTAPPPAHSVFERPTTNAWTDAIIPHDSDRRRSPSPERLRPRMSRHASLEKERLRAPSLPRHAYPSDRWADVPPELGGQFRPRSLERQRTSSRHRDASPDMRHAPSFERDAMRSASRRRTMTPSLEKRKLASRFDADTRQGPGYSTMAAPPMMAAPPPSHAATAPISSRFPVSAAPPPPPPPPGMKRHLTEDDFYTTSRSTRSSDRDRMATPARHHSYHESPQQPRYPAYYEGGIPARTPSGRRRSGQATKEHVKDDLPPSVLAGLGGPSKGMERVQEWNKDAGERIRHVRAPYTGRGRDVRDRDWE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.68
2 0.73
3 0.71
4 0.66
5 0.67
6 0.69
7 0.64
8 0.56
9 0.45
10 0.4
11 0.32
12 0.28
13 0.25
14 0.21
15 0.22
16 0.22
17 0.29
18 0.34
19 0.43
20 0.5
21 0.53
22 0.56
23 0.62
24 0.65
25 0.63
26 0.58
27 0.51
28 0.49
29 0.47
30 0.42
31 0.39
32 0.37
33 0.34
34 0.32
35 0.31
36 0.28
37 0.31
38 0.38
39 0.42
40 0.45
41 0.47
42 0.49
43 0.49
44 0.47
45 0.43
46 0.39
47 0.35
48 0.36
49 0.38
50 0.36
51 0.35
52 0.39
53 0.41
54 0.38
55 0.34
56 0.31
57 0.24
58 0.26
59 0.27
60 0.21
61 0.21
62 0.2
63 0.22
64 0.29
65 0.29
66 0.31
67 0.35
68 0.35
69 0.33
70 0.37
71 0.42
72 0.34
73 0.4
74 0.42
75 0.37
76 0.37
77 0.44
78 0.43
79 0.4
80 0.4
81 0.37
82 0.36
83 0.45
84 0.53
85 0.52
86 0.53
87 0.5
88 0.48
89 0.56
90 0.54
91 0.49
92 0.48
93 0.5
94 0.53
95 0.61
96 0.65
97 0.61
98 0.67
99 0.67
100 0.69
101 0.72
102 0.73
103 0.73
104 0.77
105 0.81
106 0.77
107 0.75
108 0.68
109 0.59
110 0.52
111 0.46
112 0.45
113 0.4
114 0.41
115 0.4
116 0.45
117 0.49
118 0.55
119 0.52
120 0.45
121 0.48
122 0.46
123 0.49
124 0.52
125 0.57
126 0.56
127 0.61
128 0.64
129 0.66
130 0.69
131 0.72
132 0.65
133 0.63
134 0.6
135 0.57
136 0.58
137 0.51
138 0.45
139 0.39
140 0.36
141 0.28
142 0.23
143 0.18
144 0.13
145 0.12
146 0.12
147 0.08
148 0.08
149 0.1
150 0.11
151 0.12
152 0.17
153 0.22
154 0.2
155 0.21
156 0.23
157 0.22
158 0.23
159 0.24
160 0.19
161 0.15
162 0.15
163 0.15
164 0.14
165 0.14
166 0.14
167 0.13
168 0.13
169 0.14
170 0.15
171 0.19
172 0.2
173 0.22
174 0.25
175 0.34
176 0.4
177 0.44
178 0.47
179 0.43
180 0.44
181 0.4
182 0.36
183 0.29
184 0.25
185 0.23
186 0.23
187 0.28
188 0.25
189 0.25
190 0.28
191 0.31
192 0.32
193 0.37
194 0.33
195 0.31
196 0.32
197 0.36
198 0.35
199 0.35
200 0.38
201 0.35
202 0.41
203 0.41
204 0.44
205 0.46
206 0.51
207 0.54
208 0.53
209 0.57
210 0.57
211 0.59
212 0.58
213 0.53
214 0.46
215 0.41
216 0.39
217 0.32
218 0.26
219 0.29
220 0.27
221 0.26
222 0.26
223 0.24
224 0.21
225 0.19
226 0.17
227 0.09
228 0.09
229 0.1
230 0.11
231 0.13
232 0.13
233 0.15
234 0.17
235 0.17
236 0.2
237 0.28
238 0.33
239 0.41
240 0.49
241 0.49
242 0.52
243 0.58
244 0.57
245 0.53
246 0.55
247 0.54
248 0.53
249 0.53
250 0.52
251 0.47
252 0.46
253 0.44
254 0.41
255 0.35
256 0.29
257 0.27
258 0.26
259 0.25
260 0.26
261 0.25
262 0.19
263 0.17
264 0.19
265 0.22
266 0.29
267 0.27
268 0.26
269 0.3
270 0.3
271 0.29
272 0.25
273 0.24
274 0.19
275 0.23
276 0.22
277 0.18
278 0.18
279 0.2
280 0.2
281 0.18
282 0.16
283 0.12
284 0.11
285 0.11
286 0.12
287 0.1
288 0.09
289 0.1
290 0.15
291 0.15
292 0.18
293 0.21
294 0.25
295 0.27
296 0.31
297 0.37
298 0.42
299 0.52
300 0.58
301 0.62
302 0.63
303 0.68
304 0.7
305 0.71
306 0.7
307 0.65
308 0.6
309 0.59
310 0.6
311 0.57
312 0.56
313 0.57
314 0.5
315 0.47
316 0.44
317 0.4
318 0.35
319 0.36
320 0.35
321 0.35
322 0.39
323 0.4
324 0.39
325 0.42
326 0.41
327 0.4
328 0.38
329 0.36
330 0.32
331 0.29
332 0.29
333 0.25
334 0.26
335 0.23
336 0.22
337 0.14
338 0.13
339 0.12
340 0.12
341 0.11
342 0.14
343 0.14
344 0.14
345 0.17
346 0.16
347 0.24
348 0.32
349 0.41
350 0.39
351 0.47
352 0.53
353 0.57
354 0.64
355 0.66
356 0.65
357 0.6
358 0.59
359 0.56
360 0.56
361 0.58
362 0.56
363 0.52
364 0.49
365 0.44
366 0.43
367 0.39
368 0.36
369 0.29
370 0.27
371 0.24
372 0.23
373 0.22
374 0.25
375 0.26
376 0.26
377 0.28
378 0.31
379 0.37
380 0.4
381 0.41
382 0.42
383 0.47
384 0.49
385 0.53
386 0.58
387 0.59
388 0.64
389 0.67
390 0.65
391 0.6
392 0.63
393 0.6
394 0.53
395 0.49
396 0.44
397 0.43
398 0.46
399 0.49
400 0.43
401 0.4
402 0.39
403 0.34
404 0.29
405 0.25
406 0.23
407 0.18
408 0.17
409 0.14
410 0.12
411 0.12
412 0.12
413 0.11
414 0.09
415 0.09
416 0.08
417 0.08
418 0.08
419 0.07
420 0.1
421 0.12
422 0.13
423 0.12
424 0.12
425 0.15
426 0.15
427 0.17
428 0.17
429 0.17
430 0.17
431 0.17
432 0.18
433 0.15
434 0.14
435 0.13
436 0.15
437 0.2
438 0.22
439 0.25
440 0.28
441 0.31
442 0.33
443 0.33
444 0.32
445 0.33
446 0.38
447 0.43
448 0.46
449 0.48
450 0.48
451 0.54
452 0.59
453 0.53
454 0.48
455 0.44
456 0.42
457 0.37
458 0.35
459 0.3
460 0.23
461 0.22
462 0.21
463 0.2
464 0.18
465 0.24
466 0.33
467 0.39
468 0.47
469 0.51
470 0.54
471 0.53
472 0.56
473 0.57
474 0.55
475 0.5
476 0.52
477 0.53
478 0.49
479 0.51
480 0.52
481 0.52
482 0.53
483 0.58
484 0.56
485 0.56
486 0.63
487 0.66
488 0.62
489 0.56
490 0.53
491 0.47
492 0.42
493 0.4
494 0.35
495 0.29
496 0.31
497 0.32
498 0.27
499 0.24
500 0.22
501 0.23
502 0.22
503 0.25
504 0.3
505 0.36
506 0.44
507 0.45
508 0.51
509 0.57
510 0.65
511 0.68
512 0.68
513 0.67
514 0.68
515 0.7
516 0.65
517 0.57
518 0.48
519 0.48
520 0.44
521 0.41
522 0.35
523 0.3
524 0.29
525 0.28
526 0.27
527 0.2
528 0.15
529 0.1
530 0.1
531 0.1
532 0.09
533 0.09
534 0.1
535 0.12
536 0.12
537 0.13
538 0.15
539 0.25
540 0.32
541 0.4
542 0.41
543 0.44
544 0.45
545 0.43
546 0.45
547 0.43
548 0.43
549 0.41
550 0.45
551 0.47
552 0.5
553 0.51
554 0.52
555 0.53
556 0.52
557 0.55
558 0.59
559 0.56
560 0.57
561 0.61
562 0.62
563 0.64
564 0.64