Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1J9QGB1

Protein Details
Accession A0A1J9QGB1    Localization Confidence High Confidence Score 18.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
53-72GPPPYGKRSGWRPRNPEDFAHydrophilic
387-415DEEAARERERRRRQQRQKDERQLRQSRMGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
227-242KFKHKKIPRGPPSPPP
393-402ERERRRRQQR
576-582KKRGSKR
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 13.5, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017862  SKI-int_prot_SKIP  
IPR004015  SKI-int_prot_SKIP_SNW-dom  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF02731  SKIP_SNW  
Amino Acid Sequences MATSIAQGLFKSLPKPKYTGEEEELPIHAQPKGPRIVGASAINESQVVLKTAGPPPYGKRSGWRPRNPEDFADGGAFPEIPVAQYPLDMGRKGTSSTSNALAVQVDAEGKVKYDAIAKQGHGENRIVHASFKDLIPLRQRVDMGEISLARPSQEEVAEQMEKTKAALAKLVTGAVAAQKPKNVKGGKRSEPTFVRYTPANQMGDTSQKNDRIMKIVERQVDPMEPPKFKHKKIPRGPPSPPPPVIHSPPRKLTAEDQEAWRIPPPVSNWKNPRGYTVPLDKRLAADGRGLQDVSINDKFAQFAEALFTADRHAREEVKQRAQMQQKLAEKEKAQKEEHLRQLAQKAREARSGGTSRQESRARTRSRSASGSRSPSPYSSRSATPSEDEEAARERERRRRQQRQKDERQLRQSRMGTERRIQMMAREQNRDISEKVALGLAKPTQSKETMYDSRLFNQSSGFDSGFNEDQPYDKPLFAAQDAINSIYRPRAQADDLDDEEAAGAEMSRIERNSRFEVLGRAKQGFRGAADAEARDGPVQFEKDTSDPFGIDGMIAEVTGGSGSGQKRYGIQEAEGAKKRGSKRARVDDDDDNDDHDRGR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.42
3 0.43
4 0.49
5 0.53
6 0.54
7 0.51
8 0.52
9 0.51
10 0.49
11 0.47
12 0.4
13 0.34
14 0.28
15 0.24
16 0.22
17 0.24
18 0.28
19 0.33
20 0.32
21 0.32
22 0.34
23 0.35
24 0.35
25 0.35
26 0.3
27 0.26
28 0.26
29 0.24
30 0.2
31 0.18
32 0.15
33 0.13
34 0.13
35 0.12
36 0.13
37 0.18
38 0.23
39 0.27
40 0.26
41 0.28
42 0.32
43 0.4
44 0.44
45 0.4
46 0.43
47 0.49
48 0.59
49 0.66
50 0.71
51 0.69
52 0.74
53 0.82
54 0.78
55 0.7
56 0.65
57 0.55
58 0.47
59 0.41
60 0.32
61 0.24
62 0.2
63 0.17
64 0.11
65 0.11
66 0.09
67 0.07
68 0.08
69 0.09
70 0.09
71 0.09
72 0.1
73 0.14
74 0.17
75 0.17
76 0.18
77 0.18
78 0.19
79 0.21
80 0.22
81 0.21
82 0.22
83 0.24
84 0.25
85 0.24
86 0.23
87 0.23
88 0.2
89 0.16
90 0.13
91 0.1
92 0.08
93 0.07
94 0.08
95 0.08
96 0.08
97 0.09
98 0.09
99 0.09
100 0.13
101 0.15
102 0.19
103 0.23
104 0.22
105 0.27
106 0.32
107 0.34
108 0.32
109 0.32
110 0.28
111 0.28
112 0.31
113 0.26
114 0.22
115 0.2
116 0.2
117 0.2
118 0.18
119 0.21
120 0.19
121 0.23
122 0.29
123 0.34
124 0.32
125 0.34
126 0.35
127 0.29
128 0.32
129 0.28
130 0.22
131 0.21
132 0.19
133 0.16
134 0.18
135 0.17
136 0.12
137 0.12
138 0.12
139 0.11
140 0.11
141 0.11
142 0.11
143 0.16
144 0.16
145 0.16
146 0.17
147 0.16
148 0.15
149 0.15
150 0.17
151 0.14
152 0.14
153 0.17
154 0.15
155 0.17
156 0.17
157 0.17
158 0.13
159 0.11
160 0.11
161 0.11
162 0.13
163 0.13
164 0.13
165 0.16
166 0.19
167 0.21
168 0.29
169 0.32
170 0.34
171 0.42
172 0.51
173 0.56
174 0.61
175 0.61
176 0.59
177 0.58
178 0.57
179 0.52
180 0.43
181 0.37
182 0.31
183 0.32
184 0.32
185 0.34
186 0.29
187 0.25
188 0.25
189 0.24
190 0.29
191 0.27
192 0.24
193 0.22
194 0.25
195 0.27
196 0.29
197 0.28
198 0.27
199 0.28
200 0.3
201 0.32
202 0.34
203 0.37
204 0.35
205 0.35
206 0.32
207 0.31
208 0.27
209 0.27
210 0.27
211 0.24
212 0.25
213 0.34
214 0.4
215 0.4
216 0.5
217 0.52
218 0.58
219 0.67
220 0.76
221 0.75
222 0.77
223 0.79
224 0.78
225 0.76
226 0.72
227 0.66
228 0.56
229 0.52
230 0.49
231 0.5
232 0.5
233 0.5
234 0.48
235 0.49
236 0.51
237 0.46
238 0.43
239 0.43
240 0.42
241 0.4
242 0.37
243 0.35
244 0.34
245 0.33
246 0.32
247 0.28
248 0.21
249 0.15
250 0.16
251 0.18
252 0.26
253 0.29
254 0.36
255 0.4
256 0.46
257 0.52
258 0.49
259 0.51
260 0.43
261 0.42
262 0.39
263 0.43
264 0.42
265 0.4
266 0.41
267 0.36
268 0.33
269 0.33
270 0.29
271 0.2
272 0.16
273 0.14
274 0.14
275 0.15
276 0.14
277 0.11
278 0.13
279 0.12
280 0.15
281 0.13
282 0.12
283 0.12
284 0.12
285 0.13
286 0.11
287 0.11
288 0.06
289 0.06
290 0.07
291 0.07
292 0.07
293 0.07
294 0.07
295 0.07
296 0.09
297 0.09
298 0.1
299 0.11
300 0.12
301 0.16
302 0.25
303 0.31
304 0.34
305 0.38
306 0.38
307 0.44
308 0.49
309 0.5
310 0.44
311 0.44
312 0.43
313 0.44
314 0.45
315 0.41
316 0.36
317 0.41
318 0.43
319 0.42
320 0.38
321 0.4
322 0.45
323 0.5
324 0.54
325 0.5
326 0.45
327 0.42
328 0.48
329 0.48
330 0.42
331 0.37
332 0.36
333 0.34
334 0.37
335 0.36
336 0.3
337 0.31
338 0.32
339 0.29
340 0.3
341 0.3
342 0.28
343 0.34
344 0.37
345 0.33
346 0.39
347 0.47
348 0.46
349 0.47
350 0.51
351 0.5
352 0.5
353 0.53
354 0.49
355 0.47
356 0.48
357 0.5
358 0.47
359 0.45
360 0.42
361 0.38
362 0.39
363 0.34
364 0.32
365 0.29
366 0.28
367 0.29
368 0.3
369 0.29
370 0.26
371 0.26
372 0.24
373 0.23
374 0.21
375 0.18
376 0.19
377 0.2
378 0.2
379 0.23
380 0.26
381 0.34
382 0.45
383 0.54
384 0.62
385 0.71
386 0.8
387 0.86
388 0.92
389 0.94
390 0.95
391 0.95
392 0.94
393 0.92
394 0.91
395 0.88
396 0.81
397 0.79
398 0.7
399 0.65
400 0.63
401 0.6
402 0.54
403 0.52
404 0.53
405 0.47
406 0.46
407 0.4
408 0.36
409 0.39
410 0.42
411 0.41
412 0.4
413 0.38
414 0.42
415 0.43
416 0.42
417 0.33
418 0.27
419 0.23
420 0.19
421 0.19
422 0.16
423 0.14
424 0.12
425 0.14
426 0.13
427 0.15
428 0.16
429 0.17
430 0.18
431 0.2
432 0.21
433 0.22
434 0.28
435 0.29
436 0.31
437 0.35
438 0.34
439 0.36
440 0.39
441 0.36
442 0.29
443 0.26
444 0.24
445 0.22
446 0.24
447 0.2
448 0.16
449 0.16
450 0.2
451 0.19
452 0.18
453 0.16
454 0.13
455 0.14
456 0.15
457 0.19
458 0.16
459 0.15
460 0.16
461 0.16
462 0.18
463 0.17
464 0.2
465 0.16
466 0.18
467 0.19
468 0.2
469 0.19
470 0.17
471 0.17
472 0.18
473 0.19
474 0.17
475 0.19
476 0.2
477 0.21
478 0.24
479 0.29
480 0.3
481 0.3
482 0.3
483 0.27
484 0.24
485 0.22
486 0.18
487 0.13
488 0.06
489 0.05
490 0.04
491 0.05
492 0.07
493 0.09
494 0.1
495 0.14
496 0.18
497 0.24
498 0.29
499 0.3
500 0.3
501 0.3
502 0.38
503 0.42
504 0.44
505 0.42
506 0.42
507 0.39
508 0.4
509 0.43
510 0.36
511 0.29
512 0.27
513 0.23
514 0.23
515 0.25
516 0.23
517 0.21
518 0.2
519 0.19
520 0.17
521 0.16
522 0.14
523 0.17
524 0.19
525 0.17
526 0.17
527 0.2
528 0.22
529 0.24
530 0.26
531 0.22
532 0.2
533 0.2
534 0.19
535 0.16
536 0.13
537 0.11
538 0.08
539 0.07
540 0.06
541 0.06
542 0.05
543 0.05
544 0.05
545 0.04
546 0.04
547 0.09
548 0.1
549 0.14
550 0.16
551 0.17
552 0.2
553 0.25
554 0.3
555 0.28
556 0.28
557 0.31
558 0.35
559 0.43
560 0.46
561 0.44
562 0.41
563 0.46
564 0.49
565 0.53
566 0.56
567 0.57
568 0.61
569 0.7
570 0.77
571 0.77
572 0.78
573 0.77
574 0.75
575 0.7
576 0.6
577 0.53
578 0.46