FuNGI

A0A2G5B0S8

Protein Details

Accession

A0A2G5B0S8

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
824-843	TNPLEIKKYIQKQNKKETTI	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 18, cyto 4, mito 3, cyto_pero 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR015712 DNA-dir_RNA_pol_su2 IPR007120 DNA-dir_RNAP_su2_dom IPR037033 DNA-dir_RNAP_su2_hyb_sf IPR000722 RNA_pol_asu IPR007121 RNA_pol_bsu_CS IPR006592 RNA_pol_N IPR007645 RNA_pol_Rpb2_3 IPR007641 RNA_pol_Rpb2_7
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0003899 F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity GO:0032549 F:ribonucleoside binding GO:0006351 P:DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF00623 RNA_pol_Rpb1_2 PF04565 RNA_pol_Rpb2_3 PF00562 RNA_pol_Rpb2_6 PF04560 RNA_pol_Rpb2_7
PROSITE	View protein in PROSITE PS01166 RNA_POL_BETA

Amino Acid Sequences

MMEDITNFGQIDIYNRLLSRAKVPADVNSPTDCIYGQHSYYALIDDVQIPIMIGSLLHLNTHPEDNPLKINGYFIIDGICKSVSNMYMLDKTPFTKDRAYLSTGERVSIEKMGGYTITDKNNTKKWILPINYKEIAKYSINIKKEKLETHLNLVADQHKNLKTPLSPPIKDKGDIIALCRMFEIWIEIREEIETKWRLVTPGELIHDMVNRKEHVIDCFRIHTWSVKNIQNVHSVSEDIKNYSMVGNIEAIRRITTPTQRENMRMKDRMVKLYNKNKICPVQTSDGDLCGTIMYLAQGAKLCDSVINMLSKLPVKKDEPKRYIFIDGKYNCLLNIDIDRIKKIGADIYYDEQIAIIWTRAGRVIPGNSEKSYTVSLIPYYNHNPAVRSMFASSMLKQAITQNPIIKNGIYNDTSFLIKGEQPKIGKNFPHPAGHNLTIAIIPWFGFNIEDAIVISESAAELYTSEKFTVFRKKLQKYDKIINKYVEIGDNVKELDPLFRIYCPSEIVTLEEIRSTTKGKVSIIVEGKDSYIVKISQKRKLEVGDKMTSRHGQKGVISLIVPDDLMPQYFDNKDKKWRKIDLLMNPHAFPSRMTMGQIREINQFQNNTLVLPLEEQHNVIRREARITDIDEPLEYKIRIPTEATKIYSNSSYPIDIIQDKKGNWINVKNTIIVGSCYYLALRHQVAGKVQHRNLGLIDQISKQAISGKSKKGGLRFGQMERDILIAVGAWKILKELWSIDTTSIYVCYNCGLISSLSLCCLCSKTTFLTKCNQYLLICTGLLRGRGRDIRWFVDKKEYSIIEIEDKQIELFEEIKDKKDLCFGETNPLEIKKYIQKQNKKETTILILPMCLRSDYIKTLYSRIFHTKINKDIIIKECQKILSGKDGAYHTLVEGHRINHCLRSVIIPNPLLPIDTIEIPLGSDIGTSYGLFNRQPSLNINSIMTVKLKQGKNKTISFNPLLCGGFNADFDGDEMCVFGLKSESAIIEGKEKLPPKTTPTQDYIIDDLLSLTLHGLTANKSGIKFMIASKSKGKNFNFDHIFEKIGNVIVDNTVVGEISSCYWKGLSSEEWYLQAMAAREAAASIGVNTPFIGALQSRTNLAII

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.2
2	0.2
3	0.24
4	0.26
5	0.27
6	0.29
7	0.32
8	0.32
9	0.35
10	0.36
11	0.39
12	0.41
13	0.43
14	0.4
15	0.35
16	0.34
17	0.3
18	0.29
19	0.23
20	0.19
21	0.21
22	0.22
23	0.21
24	0.21
25	0.2
26	0.21
27	0.21
28	0.22
29	0.17
30	0.12
31	0.13
32	0.12
33	0.12
34	0.11
35	0.11
36	0.09
37	0.08
38	0.08
39	0.06
40	0.05
41	0.05
42	0.08
43	0.09
44	0.09
45	0.1
46	0.13
47	0.16
48	0.19
49	0.19
50	0.2
51	0.23
52	0.25
53	0.28
54	0.27
55	0.28
56	0.25
57	0.26
58	0.22
59	0.24
60	0.21
61	0.17
62	0.18
63	0.16
64	0.16
65	0.17
66	0.16
67	0.12
68	0.12
69	0.16
70	0.14
71	0.15
72	0.16
73	0.18
74	0.22
75	0.23
76	0.25
77	0.24
78	0.24
79	0.29
80	0.32
81	0.32
82	0.33
83	0.35
84	0.38
85	0.41
86	0.43
87	0.4
88	0.4
89	0.45
90	0.39
91	0.37
92	0.31
93	0.29
94	0.27
95	0.25
96	0.21
97	0.14
98	0.14
99	0.14
100	0.13
101	0.13
102	0.16
103	0.18
104	0.23
105	0.27
106	0.31
107	0.37
108	0.44
109	0.46
110	0.44
111	0.45
112	0.48
113	0.52
114	0.54
115	0.58
116	0.57
117	0.61
118	0.64
119	0.59
120	0.53
121	0.46
122	0.44
123	0.35
124	0.31
125	0.32
126	0.33
127	0.38
128	0.41
129	0.41
130	0.44
131	0.48
132	0.49
133	0.45
134	0.49
135	0.46
136	0.49
137	0.51
138	0.44
139	0.39
140	0.38
141	0.4
142	0.32
143	0.31
144	0.31
145	0.29
146	0.31
147	0.31
148	0.33
149	0.28
150	0.3
151	0.38
152	0.41
153	0.41
154	0.43
155	0.5
156	0.5
157	0.48
158	0.45
159	0.39
160	0.37
161	0.36
162	0.35
163	0.34
164	0.3
165	0.29
166	0.28
167	0.24
168	0.16
169	0.16
170	0.18
171	0.13
172	0.15
173	0.17
174	0.17
175	0.17
176	0.18
177	0.19
178	0.14
179	0.2
180	0.2
181	0.18
182	0.21
183	0.21
184	0.22
185	0.21
186	0.24
187	0.2
188	0.22
189	0.24
190	0.23
191	0.22
192	0.23
193	0.26
194	0.24
195	0.22
196	0.22
197	0.2
198	0.2
199	0.22
200	0.23
201	0.25
202	0.3
203	0.31
204	0.3
205	0.32
206	0.32
207	0.31
208	0.3
209	0.3
210	0.27
211	0.31
212	0.35
213	0.36
214	0.4
215	0.43
216	0.44
217	0.46
218	0.43
219	0.38
220	0.33
221	0.29
222	0.26
223	0.27
224	0.25
225	0.19
226	0.19
227	0.17
228	0.17
229	0.16
230	0.16
231	0.12
232	0.11
233	0.12
234	0.13
235	0.14
236	0.16
237	0.16
238	0.15
239	0.15
240	0.17
241	0.2
242	0.26
243	0.31
244	0.36
245	0.42
246	0.43
247	0.49
248	0.54
249	0.58
250	0.59
251	0.56
252	0.53
253	0.56
254	0.57
255	0.59
256	0.57
257	0.56
258	0.58
259	0.64
260	0.7
261	0.65
262	0.64
263	0.62
264	0.62
265	0.57
266	0.52
267	0.47
268	0.45
269	0.42
270	0.45
271	0.38
272	0.34
273	0.31
274	0.25
275	0.2
276	0.13
277	0.12
278	0.06
279	0.05
280	0.04
281	0.05
282	0.05
283	0.06
284	0.08
285	0.08
286	0.09
287	0.09
288	0.09
289	0.08
290	0.09
291	0.09
292	0.1
293	0.11
294	0.11
295	0.11
296	0.13
297	0.17
298	0.18
299	0.18
300	0.21
301	0.24
302	0.34
303	0.45
304	0.54
305	0.56
306	0.59
307	0.6
308	0.58
309	0.61
310	0.55
311	0.47
312	0.46
313	0.41
314	0.4
315	0.38
316	0.35
317	0.27
318	0.24
319	0.22
320	0.13
321	0.15
322	0.14
323	0.17
324	0.18
325	0.19
326	0.18
327	0.17
328	0.16
329	0.15
330	0.15
331	0.12
332	0.14
333	0.16
334	0.18
335	0.19
336	0.18
337	0.17
338	0.13
339	0.12
340	0.1
341	0.08
342	0.06
343	0.06
344	0.06
345	0.06
346	0.07
347	0.07
348	0.08
349	0.1
350	0.12
351	0.15
352	0.2
353	0.23
354	0.23
355	0.25
356	0.24
357	0.23
358	0.23
359	0.19
360	0.15
361	0.13
362	0.14
363	0.14
364	0.14
365	0.17
366	0.19
367	0.21
368	0.23
369	0.23
370	0.23
371	0.23
372	0.26
373	0.22
374	0.2
375	0.18
376	0.15
377	0.17
378	0.18
379	0.16
380	0.16
381	0.15
382	0.14
383	0.14
384	0.18
385	0.2
386	0.21
387	0.23
388	0.24
389	0.25
390	0.28
391	0.28
392	0.23
393	0.2
394	0.2
395	0.21
396	0.17
397	0.16
398	0.15
399	0.16
400	0.16
401	0.14
402	0.12
403	0.1
404	0.11
405	0.16
406	0.17
407	0.2
408	0.21
409	0.26
410	0.29
411	0.32
412	0.32
413	0.33
414	0.38
415	0.37
416	0.41
417	0.38
418	0.38
419	0.4
420	0.39
421	0.33
422	0.26
423	0.23
424	0.18
425	0.17
426	0.12
427	0.07
428	0.05
429	0.05
430	0.05
431	0.04
432	0.04
433	0.04
434	0.05
435	0.05
436	0.05
437	0.05
438	0.05
439	0.05
440	0.05
441	0.05
442	0.04
443	0.03
444	0.03
445	0.03
446	0.03
447	0.03
448	0.04
449	0.06
450	0.06
451	0.07
452	0.07
453	0.08
454	0.12
455	0.22
456	0.23
457	0.3
458	0.39
459	0.44
460	0.53
461	0.6
462	0.66
463	0.62
464	0.69
465	0.7
466	0.67
467	0.66
468	0.59
469	0.51
470	0.44
471	0.38
472	0.3
473	0.23
474	0.18
475	0.14
476	0.13
477	0.12
478	0.11
479	0.1
480	0.09
481	0.09
482	0.08
483	0.09
484	0.09
485	0.09
486	0.1
487	0.11
488	0.12
489	0.12
490	0.11
491	0.11
492	0.1
493	0.12
494	0.12
495	0.11
496	0.11
497	0.1
498	0.09
499	0.09
500	0.1
501	0.1
502	0.1
503	0.11
504	0.13
505	0.13
506	0.17
507	0.17
508	0.22
509	0.22
510	0.22
511	0.2
512	0.19
513	0.19
514	0.16
515	0.16
516	0.1
517	0.09
518	0.1
519	0.13
520	0.21
521	0.26
522	0.31
523	0.34
524	0.35
525	0.36
526	0.39
527	0.4
528	0.37
529	0.38
530	0.37
531	0.34
532	0.35
533	0.35
534	0.34
535	0.3
536	0.29
537	0.24
538	0.2
539	0.2
540	0.22
541	0.2
542	0.17
543	0.16
544	0.12
545	0.11
546	0.09
547	0.08
548	0.05
549	0.06
550	0.05
551	0.05
552	0.06
553	0.06
554	0.08
555	0.09
556	0.14
557	0.17
558	0.19
559	0.29
560	0.36
561	0.43
562	0.48
563	0.52
564	0.52
565	0.56
566	0.61
567	0.6
568	0.6
569	0.59
570	0.53
571	0.49
572	0.45
573	0.37
574	0.3
575	0.21
576	0.16
577	0.13
578	0.12
579	0.13
580	0.15
581	0.16
582	0.21
583	0.23
584	0.21
585	0.22
586	0.22
587	0.23
588	0.22
589	0.22
590	0.17
591	0.18
592	0.16
593	0.13
594	0.12
595	0.1
596	0.08
597	0.08
598	0.08
599	0.07
600	0.08
601	0.08
602	0.1
603	0.16
604	0.17
605	0.17
606	0.2
607	0.18
608	0.21
609	0.21
610	0.22
611	0.17
612	0.2
613	0.22
614	0.2
615	0.2
616	0.17
617	0.17
618	0.15
619	0.16
620	0.13
621	0.11
622	0.12
623	0.13
624	0.13
625	0.15
626	0.18
627	0.22
628	0.25
629	0.26
630	0.25
631	0.25
632	0.26
633	0.25
634	0.21
635	0.16
636	0.14
637	0.13
638	0.11
639	0.11
640	0.12
641	0.13
642	0.15
643	0.17
644	0.2
645	0.19
646	0.25
647	0.28
648	0.28
649	0.29
650	0.33
651	0.32
652	0.35
653	0.37
654	0.32
655	0.28
656	0.26
657	0.23
658	0.18
659	0.15
660	0.09
661	0.08
662	0.08
663	0.07
664	0.07
665	0.07
666	0.1
667	0.09
668	0.1
669	0.12
670	0.13
671	0.16
672	0.23
673	0.28
674	0.33
675	0.33
676	0.36
677	0.34
678	0.34
679	0.32
680	0.25
681	0.21
682	0.14
683	0.15
684	0.12
685	0.12
686	0.12
687	0.11
688	0.1
689	0.14
690	0.16
691	0.22
692	0.27
693	0.3
694	0.34
695	0.39
696	0.41
697	0.4
698	0.44
699	0.4
700	0.41
701	0.42
702	0.4
703	0.41
704	0.39
705	0.36
706	0.29
707	0.26
708	0.19
709	0.14
710	0.11
711	0.06
712	0.05
713	0.05
714	0.05
715	0.04
716	0.04
717	0.05
718	0.05
719	0.06
720	0.06
721	0.08
722	0.1
723	0.11
724	0.12
725	0.12
726	0.12
727	0.12
728	0.11
729	0.11
730	0.09
731	0.08
732	0.07
733	0.07
734	0.07
735	0.06
736	0.07
737	0.07
738	0.06
739	0.07
740	0.09
741	0.08
742	0.09
743	0.1
744	0.1
745	0.09
746	0.11
747	0.1
748	0.1
749	0.13
750	0.15
751	0.24
752	0.28
753	0.29
754	0.36
755	0.39
756	0.4
757	0.4
758	0.39
759	0.3
760	0.29
761	0.29
762	0.23
763	0.19
764	0.16
765	0.17
766	0.16
767	0.19
768	0.18
769	0.16
770	0.2
771	0.24
772	0.26
773	0.31
774	0.33
775	0.34
776	0.41
777	0.43
778	0.39
779	0.46
780	0.45
781	0.4
782	0.42
783	0.38
784	0.31
785	0.31
786	0.3
787	0.24
788	0.24
789	0.23
790	0.18
791	0.18
792	0.16
793	0.14
794	0.13
795	0.1
796	0.1
797	0.09
798	0.16
799	0.17
800	0.19
801	0.22
802	0.22
803	0.21
804	0.26
805	0.26
806	0.23
807	0.28
808	0.26
809	0.34
810	0.33
811	0.34
812	0.31
813	0.32
814	0.29
815	0.23
816	0.26
817	0.25
818	0.33
819	0.41
820	0.48
821	0.56
822	0.65
823	0.75
824	0.8
825	0.76
826	0.69
827	0.63
828	0.6
829	0.54
830	0.48
831	0.37
832	0.3
833	0.27
834	0.26
835	0.24
836	0.17
837	0.14
838	0.13
839	0.15
840	0.17
841	0.19
842	0.22
843	0.23
844	0.27
845	0.29
846	0.29
847	0.31
848	0.34
849	0.34
850	0.34
851	0.42
852	0.44
853	0.48
854	0.51
855	0.49
856	0.45
857	0.48
858	0.48
859	0.48
860	0.45
861	0.41
862	0.38
863	0.36
864	0.36
865	0.32
866	0.3
867	0.29
868	0.27
869	0.26
870	0.28
871	0.28
872	0.28
873	0.26
874	0.24
875	0.16
876	0.21
877	0.2
878	0.2
879	0.21
880	0.21
881	0.23
882	0.26
883	0.27
884	0.25
885	0.26
886	0.23
887	0.22
888	0.25
889	0.26
890	0.27
891	0.32
892	0.28
893	0.28
894	0.29
895	0.28
896	0.23
897	0.18
898	0.17
899	0.13
900	0.13
901	0.13
902	0.11
903	0.11
904	0.11
905	0.1
906	0.08
907	0.06
908	0.05
909	0.04
910	0.05
911	0.06
912	0.06
913	0.08
914	0.1
915	0.12
916	0.13
917	0.14
918	0.17
919	0.17
920	0.19
921	0.22
922	0.26
923	0.27
924	0.28
925	0.27
926	0.25
927	0.25
928	0.25
929	0.22
930	0.18
931	0.19
932	0.27
933	0.3
934	0.37
935	0.45
936	0.53
937	0.58
938	0.63
939	0.66
940	0.63
941	0.67
942	0.65
943	0.57
944	0.49
945	0.46
946	0.4
947	0.33
948	0.28
949	0.23
950	0.19
951	0.17
952	0.17
953	0.13
954	0.12
955	0.13
956	0.12
957	0.09
958	0.07
959	0.07
960	0.06
961	0.06
962	0.06
963	0.06
964	0.07
965	0.06
966	0.07
967	0.08
968	0.08
969	0.1
970	0.12
971	0.12
972	0.15
973	0.17
974	0.18
975	0.23
976	0.27
977	0.28
978	0.31
979	0.34
980	0.37
981	0.45
982	0.5
983	0.5
984	0.51
985	0.52
986	0.5
987	0.5
988	0.46
989	0.37
990	0.31
991	0.25
992	0.2
993	0.16
994	0.13
995	0.09
996	0.07
997	0.05
998	0.05
999	0.06
1000	0.07
1001	0.09
1002	0.12
1003	0.14
1004	0.17
1005	0.17
1006	0.18
1007	0.18
1008	0.18
1009	0.18
1010	0.19
1011	0.27
1012	0.28
1013	0.31
1014	0.39
1015	0.47
1016	0.52
1017	0.6
1018	0.59
1019	0.58
1020	0.6
1021	0.66
1022	0.63
1023	0.56
1024	0.54
1025	0.47
1026	0.47
1027	0.37
1028	0.33
1029	0.24
1030	0.21
1031	0.19
1032	0.15
1033	0.14
1034	0.12
1035	0.12
1036	0.11
1037	0.1
1038	0.08
1039	0.07
1040	0.06
1041	0.06
1042	0.06
1043	0.08
1044	0.12
1045	0.11
1046	0.12
1047	0.12
1048	0.13
1049	0.14
1050	0.17
1051	0.19
1052	0.21
1053	0.26
1054	0.27
1055	0.29
1056	0.29
1057	0.28
1058	0.25
1059	0.24
1060	0.19
1061	0.15
1062	0.14
1063	0.13
1064	0.11
1065	0.11
1066	0.1
1067	0.08
1068	0.07
1069	0.07
1070	0.11
1071	0.11
1072	0.11
1073	0.11
1074	0.12
1075	0.11
1076	0.11
1077	0.12
1078	0.09
1079	0.12
1080	0.16
1081	0.18
1082	0.19

A0A2G5B0S8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer