Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q7S1H9

Protein Details
Accession Q7S1H9    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
37-70KIIPKPAPPKPKRASTPRVKREPVKKEAARPTRQBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
40-68PKPAPPKPKRASTPRVKREPVKKEAARPT
Subcellular Location(s) nucl 13, cyto_nucl 12.5, cyto 10, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0000785  C:chromatin  
GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0034399  C:nuclear periphery  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006974  P:DNA damage response  
GO:2000001  P:regulation of DNA damage checkpoint  
KEGG ncr:NCU09302  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00678  WD_REPEATS_1  
PS50082  WD_REPEATS_2  
Amino Acid Sequences MPPRKKETVMSEFERKRLENIAYNNAILSGISTTADKIIPKPAPPKPKRASTPRVKREPVKKEAARPTRQSSRLAGLEADSAVLKRKLDVEAEEEAAKAKAKRMRVSGDLNLGDITVEGRKWESSADGLALLKGLGVRGAQPGVRTFTEKDVKHTKDKGLKDLRLRMSGLKLYEKWAVNDIKIVPQRIYSMCFHPTEEKPIIFAGDKEGAMGVFDASQPTPKIEDDDEDAEYPDPIISAFKTHSRTISSFHFSPTDANAIYSASYDSSIRKLDLDKGISTEIFAPSSSSEDLPISAIDIPTTDPNMIIFSTLHGSLGRQDQRTKPSSAEIWGLTDHKIGGFSLHPRHPYLVATASLDRTLKIWDLRKITGKGDLRHPALLGEHESRLSVSHASWSSSGHIATSSYDDRIKIYSFPSAGEWKAGHDIPAKEMQPTVEIPHNNQTGRWVTILKPQWQRNPQDGWQKFAIGNMNRFVDVYAEDGEQLAQLGGDGITAVPAVAHFHPTKDWVAGGTASGKLCLWM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.64
2 0.55
3 0.49
4 0.48
5 0.46
6 0.43
7 0.45
8 0.49
9 0.46
10 0.45
11 0.42
12 0.36
13 0.3
14 0.22
15 0.17
16 0.09
17 0.07
18 0.08
19 0.08
20 0.08
21 0.1
22 0.12
23 0.13
24 0.14
25 0.22
26 0.25
27 0.3
28 0.38
29 0.45
30 0.54
31 0.58
32 0.68
33 0.67
34 0.73
35 0.77
36 0.79
37 0.81
38 0.81
39 0.87
40 0.86
41 0.89
42 0.86
43 0.86
44 0.86
45 0.85
46 0.82
47 0.82
48 0.77
49 0.77
50 0.8
51 0.81
52 0.79
53 0.76
54 0.77
55 0.76
56 0.73
57 0.68
58 0.61
59 0.58
60 0.51
61 0.46
62 0.38
63 0.29
64 0.26
65 0.22
66 0.19
67 0.12
68 0.1
69 0.13
70 0.15
71 0.14
72 0.13
73 0.16
74 0.18
75 0.2
76 0.21
77 0.21
78 0.22
79 0.24
80 0.23
81 0.21
82 0.19
83 0.18
84 0.19
85 0.15
86 0.19
87 0.21
88 0.27
89 0.33
90 0.37
91 0.42
92 0.45
93 0.5
94 0.48
95 0.51
96 0.45
97 0.4
98 0.34
99 0.29
100 0.23
101 0.16
102 0.13
103 0.07
104 0.07
105 0.07
106 0.08
107 0.08
108 0.09
109 0.1
110 0.1
111 0.1
112 0.11
113 0.11
114 0.11
115 0.11
116 0.1
117 0.1
118 0.08
119 0.07
120 0.06
121 0.05
122 0.05
123 0.05
124 0.06
125 0.07
126 0.09
127 0.09
128 0.11
129 0.13
130 0.16
131 0.17
132 0.19
133 0.19
134 0.25
135 0.33
136 0.32
137 0.37
138 0.43
139 0.46
140 0.51
141 0.53
142 0.53
143 0.54
144 0.56
145 0.6
146 0.59
147 0.6
148 0.6
149 0.64
150 0.6
151 0.55
152 0.54
153 0.46
154 0.41
155 0.38
156 0.33
157 0.29
158 0.25
159 0.26
160 0.3
161 0.29
162 0.26
163 0.29
164 0.28
165 0.24
166 0.27
167 0.24
168 0.25
169 0.27
170 0.27
171 0.22
172 0.21
173 0.24
174 0.22
175 0.24
176 0.19
177 0.2
178 0.22
179 0.22
180 0.23
181 0.25
182 0.25
183 0.29
184 0.29
185 0.26
186 0.23
187 0.23
188 0.23
189 0.18
190 0.16
191 0.13
192 0.12
193 0.12
194 0.11
195 0.11
196 0.09
197 0.09
198 0.09
199 0.06
200 0.04
201 0.04
202 0.05
203 0.05
204 0.07
205 0.07
206 0.08
207 0.09
208 0.09
209 0.11
210 0.11
211 0.12
212 0.14
213 0.15
214 0.16
215 0.14
216 0.15
217 0.13
218 0.12
219 0.11
220 0.08
221 0.05
222 0.04
223 0.05
224 0.04
225 0.05
226 0.07
227 0.11
228 0.14
229 0.15
230 0.17
231 0.2
232 0.2
233 0.22
234 0.26
235 0.26
236 0.23
237 0.24
238 0.23
239 0.2
240 0.2
241 0.18
242 0.16
243 0.11
244 0.11
245 0.1
246 0.09
247 0.09
248 0.08
249 0.07
250 0.05
251 0.05
252 0.06
253 0.06
254 0.08
255 0.09
256 0.09
257 0.1
258 0.11
259 0.15
260 0.18
261 0.19
262 0.17
263 0.18
264 0.19
265 0.17
266 0.17
267 0.14
268 0.1
269 0.09
270 0.08
271 0.07
272 0.07
273 0.09
274 0.09
275 0.08
276 0.08
277 0.08
278 0.08
279 0.08
280 0.08
281 0.07
282 0.07
283 0.06
284 0.05
285 0.06
286 0.06
287 0.07
288 0.08
289 0.07
290 0.06
291 0.06
292 0.07
293 0.07
294 0.07
295 0.06
296 0.06
297 0.08
298 0.08
299 0.08
300 0.07
301 0.07
302 0.09
303 0.16
304 0.2
305 0.21
306 0.25
307 0.29
308 0.36
309 0.39
310 0.39
311 0.32
312 0.31
313 0.31
314 0.29
315 0.27
316 0.21
317 0.18
318 0.18
319 0.18
320 0.15
321 0.14
322 0.12
323 0.09
324 0.09
325 0.08
326 0.08
327 0.09
328 0.13
329 0.19
330 0.22
331 0.24
332 0.25
333 0.26
334 0.26
335 0.25
336 0.23
337 0.19
338 0.17
339 0.17
340 0.17
341 0.16
342 0.17
343 0.16
344 0.14
345 0.12
346 0.12
347 0.13
348 0.17
349 0.21
350 0.25
351 0.3
352 0.33
353 0.39
354 0.4
355 0.39
356 0.42
357 0.43
358 0.4
359 0.44
360 0.47
361 0.43
362 0.41
363 0.4
364 0.32
365 0.27
366 0.26
367 0.22
368 0.18
369 0.16
370 0.15
371 0.16
372 0.15
373 0.15
374 0.14
375 0.11
376 0.09
377 0.14
378 0.15
379 0.17
380 0.17
381 0.17
382 0.18
383 0.19
384 0.18
385 0.13
386 0.12
387 0.11
388 0.12
389 0.15
390 0.14
391 0.15
392 0.16
393 0.16
394 0.17
395 0.19
396 0.19
397 0.17
398 0.17
399 0.19
400 0.18
401 0.19
402 0.21
403 0.23
404 0.22
405 0.23
406 0.22
407 0.19
408 0.23
409 0.22
410 0.21
411 0.24
412 0.24
413 0.25
414 0.31
415 0.29
416 0.26
417 0.27
418 0.25
419 0.21
420 0.22
421 0.21
422 0.22
423 0.23
424 0.25
425 0.33
426 0.37
427 0.34
428 0.33
429 0.35
430 0.32
431 0.33
432 0.31
433 0.25
434 0.22
435 0.31
436 0.38
437 0.41
438 0.46
439 0.52
440 0.6
441 0.66
442 0.7
443 0.68
444 0.68
445 0.67
446 0.69
447 0.63
448 0.59
449 0.52
450 0.49
451 0.42
452 0.39
453 0.4
454 0.34
455 0.37
456 0.36
457 0.36
458 0.33
459 0.33
460 0.29
461 0.22
462 0.18
463 0.16
464 0.14
465 0.12
466 0.12
467 0.12
468 0.12
469 0.1
470 0.1
471 0.07
472 0.05
473 0.05
474 0.05
475 0.05
476 0.04
477 0.05
478 0.04
479 0.04
480 0.04
481 0.04
482 0.03
483 0.04
484 0.08
485 0.08
486 0.15
487 0.15
488 0.17
489 0.19
490 0.23
491 0.25
492 0.23
493 0.23
494 0.18
495 0.2
496 0.18
497 0.18
498 0.17
499 0.18
500 0.17
501 0.17