Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q7SDE4

Protein Details
Accession Q7SDE4    Localization Confidence High Confidence Score 16.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
552-575GLGSSKGKRKRGGGKKGGDKNNFABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
281-301AAKAKQESSLGSRFKKIGPKK
553-570LGSSKGKRKRGGGKKGGD
Subcellular Location(s) nucl 19, mito 4, cyto 4, cyto_mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039896  Red-like  
IPR012916  RED_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG ncr:NCU02054  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF07808  RED_N  
Amino Acid Sequences MNNEQFRRLLLANSQKNNHQNGSSPSPPSSNTSKSPVAPAPAGNSTPRTLALGSKARSSIPMTPRSVAGFNPRNEFARQLAERNQTLSSSSSSSQHQHPNKKIRTSAPKGSRLAEGYVDRAKQRQAQEEADERERKLKELEERYKKEEIDKDEYERLRVEIIGGGGGLETAHLVKGLDFKLLERVRRGEVDVFGEKKDASESESPEVEENQEETEENEQRADGEEDGDADDVLEQLEAAQVKAKEKEKVQKKGEFATTTLLAGAKKTRNQILAELKAARAAAKAKQESSLGSRFKKIGPKKQAETRIERDDRGNEIMIIVDEDGNERRKVRRVDPNKTQEEYEKEREALAQGKVLGMDVPEYYKKLEEEKKAAEAAEEDKEPNIFDDVESDYDPLAGLESGSDDESDKEDGEVEDTQKKEKKSLSDMPPPPKPEPAAAGPRNYFKDSKTGLTSQEEYKKPSLDDPSFRAALAKAKAISAAEKSEEERLAAEREARLRKKLLESSRDDEDLDMGFGSSRMEDDADLDESSKVKLSEWGEDEDDDGYEGGGKAGLGSSKGKRKRGGGKKGGDKNNFADVMKVIEKNKAKE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.53
2 0.56
3 0.62
4 0.65
5 0.6
6 0.52
7 0.49
8 0.49
9 0.54
10 0.51
11 0.47
12 0.44
13 0.42
14 0.42
15 0.41
16 0.41
17 0.39
18 0.38
19 0.41
20 0.44
21 0.43
22 0.47
23 0.45
24 0.43
25 0.39
26 0.37
27 0.35
28 0.34
29 0.35
30 0.31
31 0.31
32 0.27
33 0.26
34 0.25
35 0.22
36 0.19
37 0.2
38 0.25
39 0.31
40 0.31
41 0.33
42 0.34
43 0.32
44 0.34
45 0.35
46 0.36
47 0.36
48 0.42
49 0.42
50 0.42
51 0.43
52 0.44
53 0.41
54 0.34
55 0.37
56 0.37
57 0.37
58 0.41
59 0.41
60 0.41
61 0.41
62 0.41
63 0.34
64 0.35
65 0.34
66 0.34
67 0.4
68 0.43
69 0.43
70 0.42
71 0.41
72 0.32
73 0.31
74 0.28
75 0.22
76 0.19
77 0.19
78 0.2
79 0.22
80 0.26
81 0.3
82 0.38
83 0.45
84 0.51
85 0.6
86 0.68
87 0.72
88 0.75
89 0.75
90 0.74
91 0.76
92 0.74
93 0.75
94 0.73
95 0.74
96 0.7
97 0.66
98 0.6
99 0.52
100 0.45
101 0.4
102 0.32
103 0.28
104 0.3
105 0.3
106 0.27
107 0.28
108 0.3
109 0.31
110 0.35
111 0.39
112 0.4
113 0.41
114 0.45
115 0.5
116 0.51
117 0.53
118 0.51
119 0.43
120 0.45
121 0.42
122 0.39
123 0.34
124 0.34
125 0.36
126 0.44
127 0.53
128 0.57
129 0.61
130 0.65
131 0.67
132 0.62
133 0.59
134 0.55
135 0.52
136 0.49
137 0.47
138 0.46
139 0.49
140 0.49
141 0.44
142 0.38
143 0.32
144 0.25
145 0.22
146 0.17
147 0.11
148 0.11
149 0.09
150 0.08
151 0.07
152 0.06
153 0.06
154 0.05
155 0.03
156 0.03
157 0.03
158 0.03
159 0.04
160 0.04
161 0.05
162 0.09
163 0.1
164 0.11
165 0.11
166 0.12
167 0.21
168 0.24
169 0.26
170 0.25
171 0.27
172 0.28
173 0.29
174 0.31
175 0.25
176 0.23
177 0.25
178 0.27
179 0.25
180 0.23
181 0.23
182 0.2
183 0.18
184 0.17
185 0.13
186 0.13
187 0.15
188 0.18
189 0.2
190 0.2
191 0.21
192 0.2
193 0.2
194 0.17
195 0.13
196 0.11
197 0.09
198 0.09
199 0.08
200 0.09
201 0.13
202 0.14
203 0.14
204 0.13
205 0.12
206 0.12
207 0.14
208 0.14
209 0.09
210 0.08
211 0.08
212 0.08
213 0.09
214 0.09
215 0.06
216 0.05
217 0.05
218 0.04
219 0.04
220 0.03
221 0.03
222 0.03
223 0.04
224 0.04
225 0.04
226 0.08
227 0.09
228 0.11
229 0.16
230 0.19
231 0.21
232 0.25
233 0.35
234 0.41
235 0.5
236 0.54
237 0.55
238 0.55
239 0.57
240 0.57
241 0.49
242 0.4
243 0.34
244 0.28
245 0.22
246 0.2
247 0.15
248 0.11
249 0.1
250 0.14
251 0.14
252 0.17
253 0.19
254 0.22
255 0.24
256 0.25
257 0.31
258 0.33
259 0.32
260 0.31
261 0.29
262 0.26
263 0.24
264 0.23
265 0.17
266 0.11
267 0.11
268 0.12
269 0.17
270 0.19
271 0.18
272 0.2
273 0.2
274 0.2
275 0.23
276 0.26
277 0.24
278 0.24
279 0.25
280 0.25
281 0.28
282 0.35
283 0.38
284 0.41
285 0.46
286 0.51
287 0.54
288 0.6
289 0.66
290 0.63
291 0.63
292 0.59
293 0.59
294 0.54
295 0.51
296 0.46
297 0.39
298 0.36
299 0.31
300 0.25
301 0.16
302 0.14
303 0.13
304 0.1
305 0.08
306 0.06
307 0.04
308 0.04
309 0.05
310 0.07
311 0.1
312 0.11
313 0.12
314 0.14
315 0.21
316 0.25
317 0.31
318 0.4
319 0.47
320 0.55
321 0.64
322 0.71
323 0.69
324 0.66
325 0.6
326 0.54
327 0.51
328 0.49
329 0.44
330 0.36
331 0.31
332 0.3
333 0.29
334 0.27
335 0.24
336 0.18
337 0.14
338 0.13
339 0.13
340 0.12
341 0.12
342 0.1
343 0.06
344 0.06
345 0.05
346 0.07
347 0.08
348 0.08
349 0.09
350 0.1
351 0.11
352 0.17
353 0.24
354 0.27
355 0.31
356 0.33
357 0.34
358 0.34
359 0.33
360 0.26
361 0.21
362 0.19
363 0.16
364 0.14
365 0.13
366 0.12
367 0.12
368 0.12
369 0.11
370 0.1
371 0.08
372 0.07
373 0.08
374 0.1
375 0.11
376 0.11
377 0.11
378 0.1
379 0.09
380 0.09
381 0.07
382 0.06
383 0.04
384 0.04
385 0.03
386 0.04
387 0.05
388 0.05
389 0.06
390 0.06
391 0.06
392 0.08
393 0.09
394 0.08
395 0.08
396 0.08
397 0.08
398 0.1
399 0.11
400 0.12
401 0.17
402 0.17
403 0.23
404 0.26
405 0.27
406 0.3
407 0.32
408 0.35
409 0.39
410 0.48
411 0.5
412 0.57
413 0.63
414 0.65
415 0.68
416 0.67
417 0.61
418 0.55
419 0.49
420 0.4
421 0.37
422 0.36
423 0.4
424 0.38
425 0.41
426 0.39
427 0.43
428 0.45
429 0.44
430 0.39
431 0.3
432 0.36
433 0.33
434 0.35
435 0.35
436 0.33
437 0.33
438 0.37
439 0.39
440 0.36
441 0.42
442 0.41
443 0.4
444 0.41
445 0.4
446 0.36
447 0.38
448 0.41
449 0.38
450 0.41
451 0.4
452 0.43
453 0.41
454 0.4
455 0.36
456 0.28
457 0.29
458 0.26
459 0.25
460 0.2
461 0.2
462 0.21
463 0.2
464 0.22
465 0.18
466 0.18
467 0.17
468 0.17
469 0.19
470 0.22
471 0.21
472 0.19
473 0.18
474 0.18
475 0.18
476 0.18
477 0.2
478 0.19
479 0.26
480 0.35
481 0.37
482 0.4
483 0.41
484 0.45
485 0.5
486 0.56
487 0.57
488 0.57
489 0.6
490 0.6
491 0.61
492 0.57
493 0.5
494 0.41
495 0.34
496 0.25
497 0.19
498 0.14
499 0.09
500 0.08
501 0.08
502 0.08
503 0.06
504 0.06
505 0.07
506 0.07
507 0.07
508 0.09
509 0.11
510 0.13
511 0.13
512 0.13
513 0.14
514 0.14
515 0.14
516 0.15
517 0.13
518 0.12
519 0.18
520 0.19
521 0.26
522 0.28
523 0.31
524 0.31
525 0.31
526 0.31
527 0.25
528 0.23
529 0.16
530 0.13
531 0.09
532 0.08
533 0.08
534 0.07
535 0.07
536 0.07
537 0.06
538 0.08
539 0.09
540 0.1
541 0.15
542 0.23
543 0.33
544 0.41
545 0.48
546 0.52
547 0.6
548 0.69
549 0.74
550 0.78
551 0.78
552 0.81
553 0.84
554 0.88
555 0.89
556 0.84
557 0.79
558 0.72
559 0.69
560 0.62
561 0.52
562 0.44
563 0.34
564 0.34
565 0.33
566 0.34
567 0.27
568 0.33