Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F5HH93

Protein Details
Accession F5HH93    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
378-397KKSAAERKRQEKEREKQQKABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
352-416RTKPAKGGTKKTAEERAKEREDKALEKKSAAERKRQEKEREKQQKAEEKQRAAARAEANKLKIRK
Subcellular Location(s) nucl 12cyto_nucl 12, cyto 10, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR042530  EME1/EME2_C  
IPR006166  ERCC4_domain  
IPR033310  Mms4/EME1/EME2  
IPR047521  XPF_nuclease_EME1_ascomycetes  
Gene Ontology GO:0048476  C:Holliday junction resolvase complex  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0004518  F:nuclease activity  
GO:0006302  P:double-strand break repair  
GO:0031573  P:mitotic intra-S DNA damage checkpoint signaling  
GO:0031297  P:replication fork processing  
GO:0000712  P:resolution of meiotic recombination intermediates  
KEGG ncr:NCU06826  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02732  ERCC4  
CDD cd22249  UDM1_RNF168_RNF169-like  
cd20085  XPF_nuclease_Mms4  
Amino Acid Sequences MPPEVISLLSSPEVEPRSTLVVNNMLSHVPPSAQKNVLDDDLDYDNFDLTADDVRPISTSKTPARKEQGLSTVDLTGDSQELKSIQGSARTMTQKKTPELDIDISSDGFLDIDSITRSTIRGERTSEPVRKRQRLSPVSESNSPKSRLAQTHTPAISQSLARLGPSRSSSSRVIEGFESSTSPDISGPNISKAAQPTYHDNDDNDDPFASPPPRFTREQKGKGPASTTPDVINIDDSDDDDPFADSPLKVNPNPRGPPRAATTAAAWDPISSSAPLPAKPSPHRSLGRSQSRFSPLEDSDEDIGADPLSNDEDDFPDISDLRFPANRLGNDLTGPTKRPFTKSASTTTGATRTKPAKGGTKKTAEERAKEREDKALEKKSAAERKRQEKEREKQQKAEEKQRAAARAEANKLKIRKEIATPEMIVDLPSSLPPATKIQMEEFLKKIDVKEINTWTSPVDNVVRWRRAVKSRYNEERHHYDPIPETIETEKIILVILPAAEFAKLAMGAEGHNLEAHVLKVQRHFPNHQTIYLIEGLKKLLSSNRNKRNNDFASVVRSRLAEDESASTSSSRRTNKKNDPPMTISESQIDAALLRLQLLYSMQIQETTCLQDTAHHLQLFTQNVAVAPYKRHQEDYLMKSAGFCMDSGQVRTAIGTEEAYVRMLQEVARITAPIAMGIANVYPRVGQLVRALEEGGPGTLEDIRRVINKEREVGEKRVGKAVSKRLWKIFTGRDEMSTEV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.19
3 0.19
4 0.23
5 0.23
6 0.24
7 0.22
8 0.26
9 0.27
10 0.28
11 0.27
12 0.23
13 0.22
14 0.22
15 0.19
16 0.14
17 0.18
18 0.21
19 0.26
20 0.29
21 0.31
22 0.33
23 0.36
24 0.36
25 0.32
26 0.27
27 0.25
28 0.25
29 0.23
30 0.2
31 0.17
32 0.15
33 0.14
34 0.13
35 0.1
36 0.07
37 0.11
38 0.11
39 0.12
40 0.12
41 0.12
42 0.13
43 0.14
44 0.18
45 0.19
46 0.25
47 0.32
48 0.42
49 0.46
50 0.54
51 0.61
52 0.63
53 0.63
54 0.63
55 0.62
56 0.54
57 0.53
58 0.46
59 0.39
60 0.32
61 0.28
62 0.21
63 0.14
64 0.13
65 0.11
66 0.09
67 0.1
68 0.1
69 0.11
70 0.11
71 0.13
72 0.14
73 0.18
74 0.19
75 0.19
76 0.26
77 0.33
78 0.36
79 0.37
80 0.42
81 0.44
82 0.47
83 0.5
84 0.45
85 0.42
86 0.44
87 0.43
88 0.38
89 0.34
90 0.31
91 0.26
92 0.23
93 0.19
94 0.13
95 0.1
96 0.08
97 0.06
98 0.05
99 0.06
100 0.07
101 0.07
102 0.08
103 0.09
104 0.09
105 0.12
106 0.16
107 0.2
108 0.23
109 0.28
110 0.3
111 0.38
112 0.46
113 0.51
114 0.53
115 0.58
116 0.65
117 0.69
118 0.7
119 0.69
120 0.72
121 0.71
122 0.73
123 0.72
124 0.71
125 0.68
126 0.71
127 0.69
128 0.64
129 0.63
130 0.58
131 0.5
132 0.46
133 0.47
134 0.45
135 0.46
136 0.49
137 0.46
138 0.52
139 0.51
140 0.46
141 0.4
142 0.36
143 0.31
144 0.22
145 0.2
146 0.15
147 0.14
148 0.15
149 0.17
150 0.17
151 0.19
152 0.22
153 0.26
154 0.24
155 0.28
156 0.31
157 0.31
158 0.35
159 0.31
160 0.3
161 0.25
162 0.25
163 0.22
164 0.19
165 0.17
166 0.13
167 0.13
168 0.12
169 0.11
170 0.1
171 0.1
172 0.11
173 0.14
174 0.15
175 0.16
176 0.17
177 0.17
178 0.19
179 0.21
180 0.23
181 0.21
182 0.22
183 0.27
184 0.32
185 0.36
186 0.35
187 0.32
188 0.33
189 0.35
190 0.33
191 0.27
192 0.21
193 0.17
194 0.17
195 0.2
196 0.18
197 0.15
198 0.19
199 0.24
200 0.29
201 0.32
202 0.37
203 0.44
204 0.52
205 0.6
206 0.62
207 0.65
208 0.63
209 0.61
210 0.59
211 0.51
212 0.48
213 0.41
214 0.35
215 0.27
216 0.25
217 0.24
218 0.22
219 0.19
220 0.12
221 0.11
222 0.1
223 0.11
224 0.1
225 0.09
226 0.08
227 0.08
228 0.08
229 0.07
230 0.08
231 0.08
232 0.07
233 0.08
234 0.13
235 0.17
236 0.18
237 0.24
238 0.29
239 0.36
240 0.42
241 0.45
242 0.46
243 0.44
244 0.46
245 0.44
246 0.43
247 0.36
248 0.32
249 0.28
250 0.26
251 0.25
252 0.22
253 0.18
254 0.13
255 0.12
256 0.11
257 0.11
258 0.08
259 0.08
260 0.11
261 0.13
262 0.14
263 0.17
264 0.18
265 0.23
266 0.27
267 0.35
268 0.34
269 0.4
270 0.43
271 0.43
272 0.49
273 0.53
274 0.59
275 0.55
276 0.53
277 0.51
278 0.53
279 0.5
280 0.43
281 0.39
282 0.29
283 0.3
284 0.29
285 0.26
286 0.21
287 0.2
288 0.19
289 0.13
290 0.13
291 0.08
292 0.07
293 0.05
294 0.04
295 0.05
296 0.05
297 0.04
298 0.05
299 0.06
300 0.07
301 0.07
302 0.07
303 0.07
304 0.07
305 0.07
306 0.08
307 0.07
308 0.08
309 0.09
310 0.09
311 0.14
312 0.19
313 0.19
314 0.21
315 0.23
316 0.21
317 0.21
318 0.21
319 0.18
320 0.15
321 0.18
322 0.15
323 0.18
324 0.19
325 0.22
326 0.25
327 0.28
328 0.34
329 0.34
330 0.38
331 0.37
332 0.37
333 0.35
334 0.33
335 0.34
336 0.28
337 0.26
338 0.26
339 0.24
340 0.24
341 0.26
342 0.28
343 0.31
344 0.37
345 0.43
346 0.45
347 0.48
348 0.48
349 0.49
350 0.56
351 0.49
352 0.47
353 0.45
354 0.45
355 0.44
356 0.45
357 0.42
358 0.38
359 0.37
360 0.39
361 0.4
362 0.4
363 0.36
364 0.34
365 0.36
366 0.38
367 0.44
368 0.41
369 0.43
370 0.44
371 0.53
372 0.61
373 0.66
374 0.68
375 0.7
376 0.76
377 0.78
378 0.82
379 0.76
380 0.74
381 0.73
382 0.73
383 0.68
384 0.71
385 0.66
386 0.57
387 0.58
388 0.55
389 0.5
390 0.41
391 0.4
392 0.33
393 0.31
394 0.34
395 0.31
396 0.32
397 0.33
398 0.34
399 0.31
400 0.31
401 0.29
402 0.27
403 0.28
404 0.31
405 0.29
406 0.29
407 0.28
408 0.25
409 0.23
410 0.2
411 0.16
412 0.1
413 0.08
414 0.06
415 0.05
416 0.06
417 0.05
418 0.05
419 0.07
420 0.09
421 0.1
422 0.11
423 0.13
424 0.13
425 0.2
426 0.22
427 0.23
428 0.22
429 0.22
430 0.22
431 0.21
432 0.2
433 0.2
434 0.21
435 0.21
436 0.26
437 0.28
438 0.3
439 0.29
440 0.29
441 0.23
442 0.21
443 0.18
444 0.14
445 0.13
446 0.12
447 0.19
448 0.25
449 0.27
450 0.28
451 0.3
452 0.34
453 0.4
454 0.45
455 0.47
456 0.49
457 0.56
458 0.65
459 0.7
460 0.68
461 0.67
462 0.67
463 0.61
464 0.57
465 0.48
466 0.41
467 0.37
468 0.36
469 0.32
470 0.26
471 0.24
472 0.19
473 0.2
474 0.17
475 0.14
476 0.12
477 0.09
478 0.09
479 0.07
480 0.06
481 0.05
482 0.05
483 0.04
484 0.04
485 0.04
486 0.04
487 0.04
488 0.04
489 0.04
490 0.04
491 0.04
492 0.04
493 0.04
494 0.04
495 0.06
496 0.06
497 0.06
498 0.06
499 0.06
500 0.06
501 0.06
502 0.07
503 0.09
504 0.1
505 0.13
506 0.17
507 0.24
508 0.29
509 0.34
510 0.38
511 0.39
512 0.48
513 0.48
514 0.45
515 0.39
516 0.34
517 0.32
518 0.32
519 0.28
520 0.18
521 0.17
522 0.16
523 0.15
524 0.15
525 0.13
526 0.15
527 0.23
528 0.33
529 0.42
530 0.52
531 0.62
532 0.65
533 0.69
534 0.73
535 0.68
536 0.62
537 0.54
538 0.46
539 0.45
540 0.43
541 0.39
542 0.3
543 0.27
544 0.23
545 0.22
546 0.21
547 0.14
548 0.14
549 0.15
550 0.16
551 0.16
552 0.16
553 0.15
554 0.14
555 0.17
556 0.23
557 0.28
558 0.33
559 0.41
560 0.51
561 0.62
562 0.72
563 0.79
564 0.78
565 0.78
566 0.74
567 0.71
568 0.68
569 0.59
570 0.49
571 0.41
572 0.35
573 0.28
574 0.24
575 0.19
576 0.11
577 0.1
578 0.11
579 0.08
580 0.08
581 0.08
582 0.07
583 0.08
584 0.08
585 0.09
586 0.09
587 0.1
588 0.1
589 0.13
590 0.13
591 0.14
592 0.15
593 0.17
594 0.16
595 0.15
596 0.15
597 0.17
598 0.23
599 0.28
600 0.32
601 0.29
602 0.28
603 0.3
604 0.36
605 0.34
606 0.29
607 0.23
608 0.17
609 0.17
610 0.19
611 0.2
612 0.16
613 0.18
614 0.22
615 0.28
616 0.3
617 0.33
618 0.32
619 0.37
620 0.45
621 0.48
622 0.51
623 0.45
624 0.43
625 0.4
626 0.4
627 0.33
628 0.24
629 0.17
630 0.12
631 0.16
632 0.18
633 0.2
634 0.21
635 0.19
636 0.18
637 0.19
638 0.17
639 0.13
640 0.12
641 0.1
642 0.1
643 0.11
644 0.12
645 0.12
646 0.12
647 0.11
648 0.1
649 0.11
650 0.1
651 0.12
652 0.13
653 0.14
654 0.15
655 0.14
656 0.14
657 0.16
658 0.15
659 0.12
660 0.1
661 0.08
662 0.07
663 0.08
664 0.09
665 0.07
666 0.07
667 0.08
668 0.07
669 0.08
670 0.12
671 0.12
672 0.13
673 0.18
674 0.23
675 0.24
676 0.25
677 0.26
678 0.21
679 0.22
680 0.21
681 0.15
682 0.1
683 0.09
684 0.09
685 0.12
686 0.12
687 0.12
688 0.13
689 0.16
690 0.2
691 0.24
692 0.32
693 0.37
694 0.41
695 0.46
696 0.48
697 0.55
698 0.57
699 0.58
700 0.58
701 0.56
702 0.54
703 0.54
704 0.52
705 0.49
706 0.52
707 0.57
708 0.56
709 0.59
710 0.64
711 0.64
712 0.67
713 0.64
714 0.64
715 0.62
716 0.61
717 0.59
718 0.54
719 0.49