Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

V5IPN1

Protein Details
Accession V5IPN1    Localization Confidence Low Confidence Score 9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
56-75HPLVHRPRGQYKHNNVQHRNHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto_nucl 12.5, cyto 8, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
KEGG ncr:NCU16906  -  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
Amino Acid Sequences MDYRRGAPPLNDRVRSQDAQAAQRSQVTSNHQAGHEMDVDSFSNQDGVNSANSGAHPLVHRPRGQYKHNNVQHRNGHGHSRKRAYEPDYSYADVFLSADQREQRMGVRRLPFVGELLQQEPHDRVHVQYNGPQYKDQLELMGGDQSSINWFAPDRQSKSLYGHQFVAKVATDDESLMALVKTIQLEARRQGSPIVNLWMQCQDPNEQRKLSKTPPVVGHTYNDLAVSYNTSIQRCTACGKAGHRVRHCPTPDPVHFSTCIEPPQGDRDPNGRFKIEPTEAPASVAHAFGGVPARPPNPADAAVEEPPRDRSMPVIIKTEPDTEGSGITVPAELVKIPIEHVTVTERCLRILDEDEDADPAALAFELMPPTKPHNAVVQPTQMRPQALRAASLRVAGNNSLRQYGESSKADAPEPDV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.61
2 0.57
3 0.5
4 0.45
5 0.42
6 0.46
7 0.5
8 0.46
9 0.39
10 0.42
11 0.41
12 0.37
13 0.37
14 0.37
15 0.39
16 0.41
17 0.44
18 0.4
19 0.41
20 0.39
21 0.38
22 0.33
23 0.26
24 0.2
25 0.18
26 0.19
27 0.17
28 0.16
29 0.12
30 0.11
31 0.1
32 0.1
33 0.09
34 0.1
35 0.1
36 0.11
37 0.11
38 0.11
39 0.11
40 0.14
41 0.13
42 0.14
43 0.14
44 0.21
45 0.28
46 0.33
47 0.36
48 0.4
49 0.49
50 0.54
51 0.63
52 0.66
53 0.67
54 0.72
55 0.77
56 0.81
57 0.76
58 0.79
59 0.76
60 0.72
61 0.68
62 0.6
63 0.63
64 0.61
65 0.65
66 0.64
67 0.65
68 0.62
69 0.62
70 0.66
71 0.6
72 0.61
73 0.58
74 0.55
75 0.5
76 0.48
77 0.42
78 0.35
79 0.31
80 0.21
81 0.16
82 0.12
83 0.11
84 0.09
85 0.12
86 0.14
87 0.15
88 0.15
89 0.16
90 0.2
91 0.27
92 0.3
93 0.34
94 0.37
95 0.38
96 0.38
97 0.39
98 0.35
99 0.26
100 0.25
101 0.21
102 0.18
103 0.18
104 0.19
105 0.17
106 0.18
107 0.18
108 0.16
109 0.16
110 0.14
111 0.14
112 0.19
113 0.23
114 0.23
115 0.27
116 0.35
117 0.37
118 0.38
119 0.37
120 0.31
121 0.3
122 0.3
123 0.26
124 0.17
125 0.14
126 0.13
127 0.13
128 0.14
129 0.11
130 0.09
131 0.09
132 0.08
133 0.09
134 0.09
135 0.09
136 0.07
137 0.07
138 0.09
139 0.17
140 0.23
141 0.26
142 0.29
143 0.31
144 0.32
145 0.37
146 0.42
147 0.39
148 0.34
149 0.33
150 0.31
151 0.29
152 0.28
153 0.25
154 0.18
155 0.14
156 0.12
157 0.1
158 0.09
159 0.08
160 0.08
161 0.06
162 0.06
163 0.06
164 0.05
165 0.04
166 0.04
167 0.05
168 0.05
169 0.05
170 0.07
171 0.08
172 0.11
173 0.14
174 0.17
175 0.17
176 0.17
177 0.2
178 0.2
179 0.2
180 0.19
181 0.19
182 0.17
183 0.17
184 0.17
185 0.16
186 0.15
187 0.14
188 0.14
189 0.15
190 0.2
191 0.25
192 0.27
193 0.27
194 0.28
195 0.31
196 0.35
197 0.34
198 0.35
199 0.32
200 0.34
201 0.36
202 0.39
203 0.38
204 0.33
205 0.31
206 0.26
207 0.24
208 0.2
209 0.15
210 0.12
211 0.09
212 0.09
213 0.09
214 0.07
215 0.1
216 0.12
217 0.12
218 0.12
219 0.13
220 0.14
221 0.13
222 0.15
223 0.13
224 0.14
225 0.17
226 0.19
227 0.27
228 0.33
229 0.39
230 0.4
231 0.47
232 0.48
233 0.52
234 0.52
235 0.47
236 0.46
237 0.47
238 0.46
239 0.45
240 0.43
241 0.37
242 0.36
243 0.34
244 0.31
245 0.24
246 0.24
247 0.17
248 0.16
249 0.15
250 0.21
251 0.22
252 0.21
253 0.21
254 0.25
255 0.29
256 0.36
257 0.37
258 0.31
259 0.29
260 0.3
261 0.35
262 0.32
263 0.28
264 0.27
265 0.29
266 0.28
267 0.29
268 0.27
269 0.22
270 0.2
271 0.19
272 0.13
273 0.08
274 0.08
275 0.08
276 0.11
277 0.08
278 0.1
279 0.12
280 0.13
281 0.14
282 0.15
283 0.16
284 0.16
285 0.18
286 0.17
287 0.17
288 0.2
289 0.22
290 0.24
291 0.22
292 0.2
293 0.21
294 0.22
295 0.21
296 0.17
297 0.16
298 0.23
299 0.29
300 0.3
301 0.32
302 0.31
303 0.32
304 0.35
305 0.35
306 0.27
307 0.22
308 0.21
309 0.17
310 0.17
311 0.15
312 0.13
313 0.1
314 0.09
315 0.08
316 0.06
317 0.06
318 0.06
319 0.05
320 0.06
321 0.07
322 0.07
323 0.08
324 0.1
325 0.1
326 0.1
327 0.11
328 0.16
329 0.15
330 0.18
331 0.23
332 0.22
333 0.22
334 0.23
335 0.22
336 0.2
337 0.24
338 0.23
339 0.19
340 0.21
341 0.21
342 0.2
343 0.19
344 0.16
345 0.11
346 0.09
347 0.06
348 0.05
349 0.05
350 0.04
351 0.06
352 0.09
353 0.09
354 0.11
355 0.13
356 0.19
357 0.25
358 0.26
359 0.26
360 0.32
361 0.37
362 0.41
363 0.44
364 0.48
365 0.47
366 0.48
367 0.52
368 0.46
369 0.43
370 0.39
371 0.4
372 0.38
373 0.35
374 0.38
375 0.34
376 0.36
377 0.35
378 0.37
379 0.32
380 0.26
381 0.28
382 0.27
383 0.31
384 0.31
385 0.32
386 0.31
387 0.3
388 0.29
389 0.31
390 0.32
391 0.35
392 0.31
393 0.34
394 0.35
395 0.37
396 0.37