Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q7SHR3

Protein Details
Accession Q7SHR3    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
128-152QINLEAMPRPHRRRREKKLMTIDEVHydrophilic
383-406VSSNDQRGSRRRHGERRRDNNGASHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
136-145RPHRRRREKK
394-394R
Subcellular Location(s) extr 12, mito 3, pero 3, cyto 2.5, cyto_nucl 2.5, plas 2, vacu 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001841  Znf_RING  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0016020  C:membrane  
GO:0061630  F:ubiquitin protein ligase activity  
GO:0006511  P:ubiquitin-dependent protein catabolic process  
KEGG ncr:NCU02552  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF13639  zf-RING_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50089  ZF_RING_2  
CDD cd16473  RING-H2_RNF103  
Amino Acid Sequences MVVFVNPAILEGARAVARQVAETGTSILTSTVASATASAISTSGSSSVITASLTSISPTVTPPSATSNSASGDTDSKDEKGGSSPLLFFVALGFGVVFTNLWIIVGVKYCFRYNARTRQMRLAEEGDQINLEAMPRPHRRRREKKLMTIDEVNEKFPMLKYKTWVASRARDGLPTSGGVSAPSRPNSIHDADAISRELPNKERMSTEGRPTTSQVERADRDPKTPQHEAKESTSSTVPLTHAVSEATTPPKEARVSHDEGEEEEDPIDAALPPECEGTSGDTCAICIDTLEDDDDVRGLTCGHAFHAACLDPWLTSRRACCPLCKADYYTPKPRAAGEPVDGQPGVIHVTLSNDPRSNRMNLPNRPRRALFGLGRPARTVYVVSSNDQRGSRRRHGERRRDNNGASSQPGSSPQASSDRAEGGSVFANLRAAFPHFRRSNGGQIADANSNPTMTPSNLEAGVRPGAS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.1
3 0.12
4 0.13
5 0.13
6 0.14
7 0.12
8 0.13
9 0.14
10 0.15
11 0.12
12 0.12
13 0.11
14 0.1
15 0.09
16 0.08
17 0.08
18 0.07
19 0.07
20 0.07
21 0.07
22 0.07
23 0.08
24 0.08
25 0.07
26 0.07
27 0.07
28 0.07
29 0.07
30 0.08
31 0.07
32 0.07
33 0.07
34 0.08
35 0.08
36 0.07
37 0.07
38 0.07
39 0.08
40 0.08
41 0.09
42 0.09
43 0.09
44 0.09
45 0.11
46 0.14
47 0.13
48 0.14
49 0.15
50 0.21
51 0.23
52 0.24
53 0.24
54 0.23
55 0.23
56 0.24
57 0.23
58 0.18
59 0.18
60 0.18
61 0.19
62 0.19
63 0.18
64 0.18
65 0.18
66 0.17
67 0.17
68 0.18
69 0.17
70 0.17
71 0.17
72 0.17
73 0.18
74 0.16
75 0.13
76 0.11
77 0.1
78 0.07
79 0.07
80 0.06
81 0.04
82 0.05
83 0.05
84 0.04
85 0.04
86 0.04
87 0.04
88 0.04
89 0.04
90 0.05
91 0.06
92 0.1
93 0.1
94 0.12
95 0.14
96 0.15
97 0.19
98 0.2
99 0.28
100 0.33
101 0.43
102 0.51
103 0.57
104 0.6
105 0.65
106 0.68
107 0.61
108 0.57
109 0.49
110 0.42
111 0.38
112 0.35
113 0.26
114 0.21
115 0.19
116 0.15
117 0.11
118 0.09
119 0.09
120 0.1
121 0.18
122 0.27
123 0.35
124 0.44
125 0.54
126 0.65
127 0.73
128 0.82
129 0.85
130 0.86
131 0.87
132 0.9
133 0.86
134 0.8
135 0.74
136 0.65
137 0.62
138 0.54
139 0.45
140 0.34
141 0.28
142 0.23
143 0.19
144 0.25
145 0.2
146 0.21
147 0.23
148 0.28
149 0.34
150 0.35
151 0.4
152 0.37
153 0.4
154 0.41
155 0.44
156 0.39
157 0.35
158 0.35
159 0.3
160 0.26
161 0.2
162 0.17
163 0.12
164 0.12
165 0.1
166 0.1
167 0.12
168 0.15
169 0.15
170 0.16
171 0.15
172 0.18
173 0.21
174 0.22
175 0.2
176 0.17
177 0.18
178 0.17
179 0.18
180 0.16
181 0.12
182 0.11
183 0.12
184 0.13
185 0.14
186 0.19
187 0.19
188 0.2
189 0.2
190 0.22
191 0.28
192 0.3
193 0.34
194 0.32
195 0.32
196 0.32
197 0.33
198 0.35
199 0.28
200 0.3
201 0.26
202 0.26
203 0.27
204 0.29
205 0.34
206 0.3
207 0.32
208 0.32
209 0.34
210 0.35
211 0.4
212 0.4
213 0.39
214 0.42
215 0.42
216 0.4
217 0.4
218 0.34
219 0.3
220 0.26
221 0.21
222 0.18
223 0.16
224 0.13
225 0.11
226 0.11
227 0.09
228 0.09
229 0.09
230 0.08
231 0.07
232 0.09
233 0.1
234 0.1
235 0.1
236 0.1
237 0.13
238 0.14
239 0.14
240 0.18
241 0.22
242 0.26
243 0.27
244 0.27
245 0.25
246 0.24
247 0.27
248 0.22
249 0.15
250 0.11
251 0.1
252 0.09
253 0.08
254 0.08
255 0.04
256 0.04
257 0.04
258 0.05
259 0.05
260 0.06
261 0.06
262 0.06
263 0.07
264 0.1
265 0.1
266 0.11
267 0.11
268 0.1
269 0.1
270 0.1
271 0.1
272 0.06
273 0.05
274 0.05
275 0.05
276 0.05
277 0.06
278 0.06
279 0.06
280 0.06
281 0.06
282 0.05
283 0.05
284 0.05
285 0.04
286 0.04
287 0.06
288 0.06
289 0.07
290 0.11
291 0.11
292 0.11
293 0.13
294 0.13
295 0.12
296 0.13
297 0.13
298 0.08
299 0.1
300 0.13
301 0.13
302 0.14
303 0.17
304 0.21
305 0.29
306 0.3
307 0.33
308 0.37
309 0.42
310 0.44
311 0.45
312 0.44
313 0.44
314 0.53
315 0.57
316 0.59
317 0.58
318 0.56
319 0.54
320 0.51
321 0.47
322 0.42
323 0.39
324 0.32
325 0.32
326 0.31
327 0.33
328 0.3
329 0.25
330 0.2
331 0.17
332 0.16
333 0.09
334 0.09
335 0.06
336 0.1
337 0.13
338 0.16
339 0.19
340 0.21
341 0.21
342 0.25
343 0.29
344 0.3
345 0.32
346 0.4
347 0.46
348 0.52
349 0.62
350 0.68
351 0.7
352 0.71
353 0.67
354 0.62
355 0.57
356 0.57
357 0.5
358 0.49
359 0.54
360 0.52
361 0.52
362 0.48
363 0.44
364 0.36
365 0.32
366 0.25
367 0.17
368 0.21
369 0.22
370 0.24
371 0.29
372 0.3
373 0.34
374 0.35
375 0.37
376 0.37
377 0.45
378 0.52
379 0.56
380 0.64
381 0.7
382 0.79
383 0.86
384 0.88
385 0.9
386 0.89
387 0.86
388 0.79
389 0.75
390 0.7
391 0.63
392 0.55
393 0.46
394 0.38
395 0.32
396 0.33
397 0.29
398 0.24
399 0.22
400 0.21
401 0.26
402 0.27
403 0.28
404 0.27
405 0.25
406 0.24
407 0.24
408 0.21
409 0.16
410 0.16
411 0.15
412 0.14
413 0.12
414 0.14
415 0.13
416 0.14
417 0.13
418 0.16
419 0.21
420 0.23
421 0.34
422 0.34
423 0.36
424 0.43
425 0.46
426 0.52
427 0.52
428 0.51
429 0.42
430 0.43
431 0.44
432 0.4
433 0.36
434 0.29
435 0.22
436 0.21
437 0.19
438 0.18
439 0.17
440 0.15
441 0.18
442 0.17
443 0.2
444 0.21
445 0.22
446 0.21
447 0.21