Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q7SHF0

Protein Details
Accession Q7SHF0    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
80-106STPAPETEKKPVKKRKSWGQVLPEPKTHydrophilic
548-567QQYKLKVIPKRKLKAGPCGFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
88-143KKPVKKRKSWGQVLPEPKTNLPPRKRAKTEDEKEQRRVERVLRNRRAAQSSRERKR
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 10, mito 7, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004827  bZIP  
IPR046347  bZIP_sf  
IPR044280  Hac1/HY5  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0000981  F:DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific  
GO:0045944  P:positive regulation of transcription by RNA polymerase II  
GO:0006986  P:response to unfolded protein  
KEGG ncr:NCU01856  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF07716  bZIP_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50217  BZIP  
CDD cd14710  bZIP_HAC1-like  
Amino Acid Sequences MDSWAAHSPSPANLKFENPAESLLATPGEIFPEVFGSDRATSATPSLDVMSPVSLADDVDLTALATLTVPQIPPRSTPASTPAPETEKKPVKKRKSWGQVLPEPKTNLPPRKRAKTEDEKEQRRVERVLRNRRAAQSSRERKRLEVEGLERRNKELETLLMQAQQINQTLLQALRENGVAPTIATRPASFDGLNPTPVTFSQELFSSQDGHNLSKHDSSLEQLFPTIKTEETVNPASLSPVLNPLPEMEEDGEKEQSTAAQPVADATSTATVDTSPDATQHPAVVLCDDLQCRSAEVPRSKCLAVSQQSQPPSLDPLSLLLLSASAISWMISFSQRPLMLIATSMKRNFSLPPAPAILMSIVWLVTTPKPSTSRQTPRTSSTNSSTPTSQMPQTATSSSRSNNPDSAQPRTRQSTTLRIRTLRKILTSSPILARPLMDATMEVLRWVVSEGRTVPQVLGEDGSAAATANGKEQRAQPRTGLLAFWPKGAMLPSKEVLLTLMWVLRVEERKMRVRAELRGSSSKLCGSTGVPSLTIHTPTTTDNNKLQQQYKLKVIPKRKLKAGPCGFLKPHLDTERRRMS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.38
3 0.4
4 0.38
5 0.31
6 0.31
7 0.27
8 0.26
9 0.23
10 0.2
11 0.17
12 0.12
13 0.12
14 0.11
15 0.11
16 0.11
17 0.1
18 0.09
19 0.1
20 0.11
21 0.11
22 0.11
23 0.13
24 0.14
25 0.14
26 0.16
27 0.15
28 0.15
29 0.16
30 0.16
31 0.13
32 0.13
33 0.15
34 0.14
35 0.14
36 0.14
37 0.13
38 0.12
39 0.11
40 0.11
41 0.09
42 0.08
43 0.07
44 0.07
45 0.06
46 0.06
47 0.06
48 0.05
49 0.05
50 0.05
51 0.05
52 0.04
53 0.05
54 0.06
55 0.08
56 0.08
57 0.12
58 0.17
59 0.18
60 0.2
61 0.26
62 0.3
63 0.29
64 0.31
65 0.35
66 0.38
67 0.38
68 0.4
69 0.38
70 0.39
71 0.41
72 0.42
73 0.46
74 0.48
75 0.54
76 0.61
77 0.67
78 0.71
79 0.78
80 0.84
81 0.85
82 0.86
83 0.88
84 0.86
85 0.85
86 0.82
87 0.82
88 0.77
89 0.72
90 0.65
91 0.57
92 0.57
93 0.56
94 0.58
95 0.56
96 0.62
97 0.65
98 0.72
99 0.77
100 0.75
101 0.76
102 0.78
103 0.77
104 0.78
105 0.79
106 0.76
107 0.76
108 0.77
109 0.71
110 0.64
111 0.62
112 0.59
113 0.58
114 0.61
115 0.66
116 0.66
117 0.7
118 0.72
119 0.73
120 0.73
121 0.67
122 0.65
123 0.65
124 0.67
125 0.69
126 0.71
127 0.67
128 0.61
129 0.62
130 0.6
131 0.54
132 0.5
133 0.48
134 0.5
135 0.56
136 0.6
137 0.55
138 0.5
139 0.47
140 0.4
141 0.34
142 0.26
143 0.21
144 0.18
145 0.2
146 0.2
147 0.2
148 0.2
149 0.19
150 0.19
151 0.18
152 0.16
153 0.14
154 0.13
155 0.11
156 0.12
157 0.11
158 0.12
159 0.11
160 0.1
161 0.1
162 0.1
163 0.11
164 0.09
165 0.09
166 0.08
167 0.06
168 0.08
169 0.08
170 0.1
171 0.1
172 0.1
173 0.12
174 0.14
175 0.16
176 0.14
177 0.14
178 0.2
179 0.2
180 0.22
181 0.19
182 0.17
183 0.16
184 0.16
185 0.2
186 0.14
187 0.13
188 0.13
189 0.13
190 0.15
191 0.15
192 0.16
193 0.14
194 0.13
195 0.17
196 0.18
197 0.18
198 0.18
199 0.18
200 0.2
201 0.18
202 0.18
203 0.15
204 0.13
205 0.14
206 0.16
207 0.16
208 0.13
209 0.13
210 0.14
211 0.13
212 0.15
213 0.14
214 0.1
215 0.1
216 0.11
217 0.12
218 0.16
219 0.17
220 0.16
221 0.16
222 0.15
223 0.15
224 0.14
225 0.13
226 0.09
227 0.11
228 0.11
229 0.11
230 0.11
231 0.11
232 0.11
233 0.11
234 0.12
235 0.08
236 0.09
237 0.1
238 0.11
239 0.12
240 0.1
241 0.1
242 0.09
243 0.08
244 0.08
245 0.09
246 0.07
247 0.07
248 0.06
249 0.07
250 0.08
251 0.07
252 0.06
253 0.05
254 0.06
255 0.06
256 0.06
257 0.05
258 0.05
259 0.05
260 0.06
261 0.07
262 0.05
263 0.06
264 0.07
265 0.08
266 0.09
267 0.08
268 0.09
269 0.07
270 0.07
271 0.07
272 0.06
273 0.06
274 0.07
275 0.07
276 0.07
277 0.08
278 0.08
279 0.08
280 0.09
281 0.11
282 0.16
283 0.22
284 0.25
285 0.27
286 0.3
287 0.29
288 0.29
289 0.27
290 0.27
291 0.25
292 0.27
293 0.28
294 0.3
295 0.31
296 0.32
297 0.31
298 0.24
299 0.23
300 0.19
301 0.15
302 0.11
303 0.1
304 0.1
305 0.1
306 0.09
307 0.06
308 0.05
309 0.05
310 0.05
311 0.04
312 0.03
313 0.03
314 0.03
315 0.03
316 0.03
317 0.04
318 0.05
319 0.06
320 0.06
321 0.11
322 0.11
323 0.11
324 0.12
325 0.11
326 0.1
327 0.12
328 0.14
329 0.12
330 0.15
331 0.16
332 0.15
333 0.15
334 0.16
335 0.16
336 0.18
337 0.21
338 0.19
339 0.21
340 0.22
341 0.21
342 0.2
343 0.2
344 0.15
345 0.09
346 0.09
347 0.06
348 0.05
349 0.04
350 0.05
351 0.06
352 0.07
353 0.1
354 0.1
355 0.14
356 0.17
357 0.2
358 0.26
359 0.35
360 0.44
361 0.48
362 0.56
363 0.56
364 0.58
365 0.62
366 0.59
367 0.54
368 0.49
369 0.47
370 0.41
371 0.4
372 0.35
373 0.31
374 0.29
375 0.27
376 0.24
377 0.21
378 0.2
379 0.2
380 0.21
381 0.22
382 0.2
383 0.2
384 0.22
385 0.2
386 0.26
387 0.27
388 0.28
389 0.29
390 0.29
391 0.34
392 0.35
393 0.42
394 0.41
395 0.41
396 0.43
397 0.46
398 0.46
399 0.43
400 0.44
401 0.47
402 0.49
403 0.54
404 0.54
405 0.54
406 0.57
407 0.59
408 0.62
409 0.55
410 0.5
411 0.45
412 0.42
413 0.42
414 0.4
415 0.36
416 0.32
417 0.31
418 0.29
419 0.26
420 0.24
421 0.19
422 0.18
423 0.15
424 0.12
425 0.09
426 0.1
427 0.11
428 0.11
429 0.09
430 0.08
431 0.08
432 0.08
433 0.09
434 0.09
435 0.08
436 0.11
437 0.12
438 0.14
439 0.15
440 0.16
441 0.15
442 0.14
443 0.15
444 0.13
445 0.12
446 0.1
447 0.09
448 0.09
449 0.09
450 0.07
451 0.06
452 0.05
453 0.06
454 0.07
455 0.11
456 0.14
457 0.15
458 0.18
459 0.24
460 0.35
461 0.37
462 0.4
463 0.36
464 0.38
465 0.41
466 0.39
467 0.33
468 0.26
469 0.31
470 0.29
471 0.28
472 0.24
473 0.21
474 0.21
475 0.23
476 0.24
477 0.17
478 0.22
479 0.22
480 0.22
481 0.22
482 0.21
483 0.2
484 0.15
485 0.13
486 0.1
487 0.1
488 0.09
489 0.1
490 0.1
491 0.15
492 0.19
493 0.21
494 0.26
495 0.31
496 0.39
497 0.43
498 0.45
499 0.48
500 0.49
501 0.53
502 0.56
503 0.57
504 0.55
505 0.57
506 0.58
507 0.52
508 0.49
509 0.44
510 0.36
511 0.3
512 0.26
513 0.2
514 0.22
515 0.25
516 0.23
517 0.21
518 0.2
519 0.23
520 0.25
521 0.26
522 0.22
523 0.18
524 0.18
525 0.21
526 0.29
527 0.29
528 0.32
529 0.35
530 0.42
531 0.48
532 0.53
533 0.55
534 0.56
535 0.6
536 0.61
537 0.63
538 0.64
539 0.64
540 0.66
541 0.72
542 0.73
543 0.74
544 0.77
545 0.77
546 0.79
547 0.78
548 0.8
549 0.79
550 0.78
551 0.73
552 0.74
553 0.67
554 0.64
555 0.62
556 0.56
557 0.56
558 0.56
559 0.57
560 0.55