Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

O13493

Protein Details
Accession O13493    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
41-60TRTPKQCRERWHQNLKPGLNHydrophilic
102-123WNGLNNRKKNQLRRQSAPRRVSHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009057  Homeobox-like_sf  
IPR017930  Myb_dom  
IPR001005  SANT/Myb  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0000981  F:DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific  
GO:0000978  F:RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding  
GO:0000278  P:mitotic cell cycle  
GO:0045944  P:positive regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG ncr:NCU01312  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00249  Myb_DNA-binding  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51294  HTH_MYB  
CDD cd00167  SANT  
Amino Acid Sequences MSNMPDQRRGPWSAGEDQRLIKLVKDLGPGNWVNVARILGTRTPKQCRERWHQNLKPGLNHGPMTQEEAAIIVREVDLKGPRWADIARKLQGRSDNAVKNYWNGLNNRKKNQLRRQSAPRRVSASDVLRSSPGQLPRAHMQRPIRYPQDIYTGSRRPSSPSSFNDSLHHRVHESIEWFPSRPQQQQQQQQQQARCTTPFTSFYPPSHAFPTTDGYQDGSDGPTGSTLRLLTPPTSRRLAPFSTLPSPTTSSIGDLDEFDRRQLAAFAPPAAYRRPSLPFPQQSSMGYLPSATEYLPTAPSSPIALIQRDEKNHARIPVTSLLCS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.5
2 0.49
3 0.47
4 0.44
5 0.44
6 0.42
7 0.37
8 0.29
9 0.27
10 0.27
11 0.27
12 0.3
13 0.3
14 0.27
15 0.33
16 0.32
17 0.29
18 0.3
19 0.26
20 0.22
21 0.22
22 0.21
23 0.16
24 0.17
25 0.19
26 0.19
27 0.24
28 0.31
29 0.37
30 0.45
31 0.53
32 0.59
33 0.61
34 0.65
35 0.7
36 0.74
37 0.77
38 0.8
39 0.77
40 0.78
41 0.81
42 0.76
43 0.7
44 0.64
45 0.6
46 0.52
47 0.48
48 0.4
49 0.34
50 0.31
51 0.32
52 0.27
53 0.21
54 0.16
55 0.16
56 0.16
57 0.12
58 0.11
59 0.06
60 0.05
61 0.07
62 0.07
63 0.1
64 0.12
65 0.14
66 0.18
67 0.18
68 0.18
69 0.2
70 0.21
71 0.24
72 0.29
73 0.34
74 0.36
75 0.4
76 0.4
77 0.42
78 0.47
79 0.45
80 0.41
81 0.42
82 0.43
83 0.4
84 0.42
85 0.38
86 0.34
87 0.34
88 0.32
89 0.28
90 0.27
91 0.35
92 0.43
93 0.49
94 0.53
95 0.59
96 0.63
97 0.69
98 0.76
99 0.76
100 0.74
101 0.75
102 0.81
103 0.81
104 0.84
105 0.79
106 0.73
107 0.67
108 0.59
109 0.54
110 0.49
111 0.43
112 0.37
113 0.33
114 0.29
115 0.26
116 0.25
117 0.24
118 0.23
119 0.22
120 0.21
121 0.21
122 0.25
123 0.3
124 0.35
125 0.33
126 0.35
127 0.37
128 0.4
129 0.44
130 0.46
131 0.43
132 0.39
133 0.39
134 0.35
135 0.36
136 0.31
137 0.29
138 0.3
139 0.31
140 0.31
141 0.32
142 0.31
143 0.27
144 0.3
145 0.33
146 0.32
147 0.31
148 0.38
149 0.38
150 0.38
151 0.37
152 0.37
153 0.37
154 0.33
155 0.3
156 0.22
157 0.21
158 0.21
159 0.21
160 0.19
161 0.15
162 0.16
163 0.16
164 0.16
165 0.16
166 0.21
167 0.22
168 0.24
169 0.27
170 0.33
171 0.41
172 0.5
173 0.59
174 0.63
175 0.67
176 0.68
177 0.67
178 0.63
179 0.58
180 0.51
181 0.42
182 0.35
183 0.29
184 0.26
185 0.26
186 0.25
187 0.28
188 0.28
189 0.28
190 0.33
191 0.34
192 0.33
193 0.32
194 0.3
195 0.24
196 0.23
197 0.27
198 0.21
199 0.2
200 0.18
201 0.16
202 0.15
203 0.15
204 0.14
205 0.1
206 0.09
207 0.08
208 0.08
209 0.08
210 0.09
211 0.08
212 0.09
213 0.08
214 0.09
215 0.11
216 0.13
217 0.14
218 0.2
219 0.23
220 0.27
221 0.29
222 0.29
223 0.29
224 0.33
225 0.32
226 0.29
227 0.3
228 0.31
229 0.33
230 0.34
231 0.32
232 0.3
233 0.31
234 0.28
235 0.27
236 0.21
237 0.18
238 0.18
239 0.18
240 0.16
241 0.14
242 0.14
243 0.17
244 0.17
245 0.16
246 0.16
247 0.15
248 0.15
249 0.15
250 0.15
251 0.15
252 0.16
253 0.17
254 0.17
255 0.19
256 0.2
257 0.22
258 0.22
259 0.19
260 0.21
261 0.25
262 0.28
263 0.34
264 0.42
265 0.48
266 0.52
267 0.55
268 0.53
269 0.5
270 0.51
271 0.45
272 0.36
273 0.28
274 0.21
275 0.18
276 0.17
277 0.16
278 0.1
279 0.1
280 0.1
281 0.12
282 0.14
283 0.14
284 0.14
285 0.14
286 0.15
287 0.15
288 0.15
289 0.18
290 0.2
291 0.21
292 0.22
293 0.28
294 0.34
295 0.36
296 0.42
297 0.43
298 0.46
299 0.49
300 0.52
301 0.48
302 0.43
303 0.45
304 0.47