FuNGI

A0A2A9NXR1

Protein Details

Accession

A0A2A9NXR1

Localization Confidence

High

Confidence Score

21.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
10-42	LLFHPKKNTKSDGNKTPPRKPTAPRPKLSPEKS	Hydrophilic
151-173	KATVTNGKKRFQKKTKQVFYVPD	Hydrophilic
575-599	TNNNGSAAPKPKKRKAQNVVPITVS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
22-36	GNKTPPRKPTAPRPK
584-589	KPKKRK

Subcellular Location(s)

nucl 23.5, cyto_nucl 13

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MPPKQHSLSLLFHPKKNTKSDGNKTPPRKPTAPRPKLSPEKSDDEELKLPDGPYQEFKLMSSALNGWKYDVMKFDSRKVIDISKWTAPIKLNRKELRKDTEPNAPPAAVAPMLGPDGKPVIGADGKIVMVDAEGRPIQQTDGSNGKDGKGKATVTNGKKRFQKKTKQVFYVPDEVRQLRKEERYPWVMEDSSPAHDEMWVGQLEDVSRSDTHAFFMPAANDVFKFVPAHRWYKFQKKLKHDLPTSTAEVESLYNLSQKRDPQTWLASRNGRGPSAATAAMFKAEAEGRPVSSASLVYSSGSSLGPGGRRLKTVDSGMSGLFDDDDDPESRRRREREYGGEGDLDEQVYEEEFADDEEKVEADENDEEAKELEERLKREYKSANRQRDTGTVESDEEEIPSMSKQAKAMQRLIRNREGNEAYESDDEKNPYASSEEEEEEEEVSIPPHDAAAQPPASQSSTQTDNRADSQTPKPGAVVRPGSSAGSRATSPVPLAPSPNHGGHSVVAKRATSDKTPKANVSRANSPIGSRATSPVANSRATSPAGLGLGISMDGQKVSNKRKAEDMPNGAPSPTATNNNGSAAPKPKKRKAQNVVPITVSAAELKNLLVEWLKNTINATTRDCIQHFTPYLTDQEKKTEFSTLVKEVAQLKNGVLVLRGKVG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.62
2	0.63
3	0.66
4	0.64
5	0.63
6	0.69
7	0.75
8	0.77
9	0.8
10	0.83
11	0.84
12	0.86
13	0.84
14	0.82
15	0.8
16	0.77
17	0.78
18	0.79
19	0.81
20	0.77
21	0.77
22	0.79
23	0.81
24	0.8
25	0.77
26	0.72
27	0.7
28	0.68
29	0.67
30	0.59
31	0.54
32	0.53
33	0.45
34	0.41
35	0.36
36	0.32
37	0.29
38	0.29
39	0.26
40	0.26
41	0.28
42	0.28
43	0.26
44	0.26
45	0.26
46	0.24
47	0.21
48	0.19
49	0.2
50	0.23
51	0.26
52	0.25
53	0.24
54	0.27
55	0.28
56	0.27
57	0.27
58	0.26
59	0.31
60	0.34
61	0.39
62	0.44
63	0.43
64	0.45
65	0.44
66	0.44
67	0.39
68	0.43
69	0.42
70	0.38
71	0.42
72	0.39
73	0.4
74	0.4
75	0.46
76	0.5
77	0.53
78	0.59
79	0.62
80	0.69
81	0.74
82	0.77
83	0.76
84	0.74
85	0.72
86	0.66
87	0.69
88	0.65
89	0.61
90	0.56
91	0.47
92	0.39
93	0.33
94	0.3
95	0.19
96	0.16
97	0.11
98	0.09
99	0.1
100	0.11
101	0.09
102	0.08
103	0.1
104	0.09
105	0.09
106	0.08
107	0.11
108	0.12
109	0.12
110	0.11
111	0.12
112	0.11
113	0.11
114	0.11
115	0.07
116	0.06
117	0.08
118	0.07
119	0.09
120	0.1
121	0.1
122	0.11
123	0.12
124	0.12
125	0.14
126	0.15
127	0.16
128	0.23
129	0.24
130	0.27
131	0.27
132	0.28
133	0.3
134	0.29
135	0.28
136	0.26
137	0.26
138	0.24
139	0.32
140	0.4
141	0.42
142	0.52
143	0.53
144	0.56
145	0.62
146	0.68
147	0.71
148	0.72
149	0.75
150	0.76
151	0.83
152	0.86
153	0.85
154	0.82
155	0.78
156	0.74
157	0.73
158	0.62
159	0.55
160	0.51
161	0.46
162	0.44
163	0.38
164	0.37
165	0.34
166	0.39
167	0.4
168	0.4
169	0.45
170	0.46
171	0.46
172	0.45
173	0.42
174	0.36
175	0.32
176	0.29
177	0.25
178	0.22
179	0.21
180	0.18
181	0.14
182	0.14
183	0.14
184	0.11
185	0.12
186	0.1
187	0.09
188	0.09
189	0.09
190	0.1
191	0.11
192	0.1
193	0.09
194	0.09
195	0.11
196	0.13
197	0.12
198	0.13
199	0.14
200	0.14
201	0.12
202	0.14
203	0.13
204	0.12
205	0.12
206	0.12
207	0.1
208	0.11
209	0.11
210	0.1
211	0.11
212	0.1
213	0.18
214	0.22
215	0.28
216	0.27
217	0.34
218	0.39
219	0.48
220	0.58
221	0.57
222	0.62
223	0.65
224	0.74
225	0.74
226	0.78
227	0.71
228	0.65
229	0.61
230	0.57
231	0.5
232	0.41
233	0.33
234	0.24
235	0.21
236	0.17
237	0.12
238	0.09
239	0.07
240	0.09
241	0.1
242	0.12
243	0.14
244	0.18
245	0.22
246	0.24
247	0.26
248	0.27
249	0.34
250	0.37
251	0.38
252	0.4
253	0.39
254	0.38
255	0.42
256	0.4
257	0.32
258	0.28
259	0.24
260	0.21
261	0.19
262	0.18
263	0.12
264	0.11
265	0.1
266	0.1
267	0.09
268	0.07
269	0.06
270	0.07
271	0.07
272	0.09
273	0.09
274	0.09
275	0.1
276	0.1
277	0.09
278	0.09
279	0.08
280	0.06
281	0.06
282	0.06
283	0.06
284	0.06
285	0.06
286	0.07
287	0.06
288	0.06
289	0.05
290	0.07
291	0.07
292	0.11
293	0.15
294	0.15
295	0.16
296	0.18
297	0.19
298	0.2
299	0.21
300	0.18
301	0.15
302	0.15
303	0.14
304	0.13
305	0.11
306	0.09
307	0.07
308	0.06
309	0.05
310	0.04
311	0.06
312	0.06
313	0.08
314	0.13
315	0.17
316	0.2
317	0.25
318	0.28
319	0.32
320	0.39
321	0.44
322	0.47
323	0.5
324	0.5
325	0.45
326	0.42
327	0.36
328	0.3
329	0.24
330	0.15
331	0.09
332	0.06
333	0.05
334	0.04
335	0.05
336	0.04
337	0.04
338	0.04
339	0.04
340	0.05
341	0.05
342	0.05
343	0.05
344	0.05
345	0.05
346	0.06
347	0.05
348	0.06
349	0.06
350	0.06
351	0.07
352	0.07
353	0.07
354	0.07
355	0.07
356	0.06
357	0.06
358	0.1
359	0.13
360	0.14
361	0.19
362	0.25
363	0.25
364	0.29
365	0.37
366	0.41
367	0.49
368	0.58
369	0.63
370	0.59
371	0.61
372	0.59
373	0.56
374	0.52
375	0.42
376	0.35
377	0.26
378	0.24
379	0.23
380	0.22
381	0.17
382	0.12
383	0.1
384	0.08
385	0.07
386	0.07
387	0.08
388	0.08
389	0.09
390	0.1
391	0.16
392	0.21
393	0.25
394	0.32
395	0.36
396	0.43
397	0.5
398	0.55
399	0.57
400	0.55
401	0.52
402	0.52
403	0.47
404	0.41
405	0.36
406	0.3
407	0.25
408	0.23
409	0.23
410	0.19
411	0.2
412	0.19
413	0.17
414	0.17
415	0.14
416	0.13
417	0.13
418	0.11
419	0.11
420	0.13
421	0.13
422	0.13
423	0.14
424	0.13
425	0.12
426	0.12
427	0.11
428	0.08
429	0.07
430	0.07
431	0.06
432	0.06
433	0.06
434	0.06
435	0.06
436	0.07
437	0.12
438	0.13
439	0.12
440	0.13
441	0.15
442	0.15
443	0.15
444	0.16
445	0.15
446	0.2
447	0.22
448	0.25
449	0.25
450	0.26
451	0.28
452	0.29
453	0.27
454	0.26
455	0.29
456	0.34
457	0.33
458	0.31
459	0.29
460	0.31
461	0.32
462	0.34
463	0.33
464	0.27
465	0.28
466	0.28
467	0.28
468	0.24
469	0.24
470	0.18
471	0.15
472	0.14
473	0.13
474	0.13
475	0.13
476	0.14
477	0.14
478	0.16
479	0.15
480	0.18
481	0.17
482	0.21
483	0.25
484	0.26
485	0.25
486	0.22
487	0.22
488	0.21
489	0.27
490	0.24
491	0.23
492	0.23
493	0.22
494	0.23
495	0.27
496	0.29
497	0.29
498	0.36
499	0.4
500	0.46
501	0.5
502	0.55
503	0.56
504	0.59
505	0.59
506	0.56
507	0.55
508	0.51
509	0.51
510	0.46
511	0.4
512	0.39
513	0.34
514	0.3
515	0.24
516	0.24
517	0.23
518	0.23
519	0.24
520	0.25
521	0.26
522	0.26
523	0.26
524	0.25
525	0.25
526	0.25
527	0.24
528	0.17
529	0.16
530	0.15
531	0.14
532	0.11
533	0.08
534	0.07
535	0.07
536	0.07
537	0.05
538	0.05
539	0.05
540	0.06
541	0.11
542	0.18
543	0.26
544	0.33
545	0.36
546	0.37
547	0.45
548	0.52
549	0.56
550	0.58
551	0.59
552	0.57
553	0.59
554	0.59
555	0.51
556	0.43
557	0.35
558	0.31
559	0.27
560	0.26
561	0.23
562	0.26
563	0.27
564	0.29
565	0.31
566	0.27
567	0.28
568	0.33
569	0.4
570	0.45
571	0.54
572	0.61
573	0.69
574	0.78
575	0.84
576	0.84
577	0.87
578	0.88
579	0.87
580	0.81
581	0.72
582	0.62
583	0.52
584	0.43
585	0.32
586	0.25
587	0.17
588	0.13
589	0.12
590	0.12
591	0.11
592	0.1
593	0.11
594	0.1
595	0.11
596	0.13
597	0.18
598	0.18
599	0.19
600	0.2
601	0.22
602	0.26
603	0.29
604	0.31
605	0.29
606	0.32
607	0.37
608	0.37
609	0.37
610	0.33
611	0.38
612	0.35
613	0.35
614	0.34
615	0.3
616	0.36
617	0.37
618	0.39
619	0.33
620	0.4
621	0.39
622	0.4
623	0.39
624	0.38
625	0.34
626	0.35
627	0.39
628	0.34
629	0.34
630	0.31
631	0.34
632	0.36
633	0.38
634	0.36
635	0.31
636	0.27
637	0.3
638	0.3
639	0.27
640	0.23
641	0.22

A0A2A9NXR1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer