FuNGI

Q7SDG9

Protein Details

Accession

Q7SDG9

Localization Confidence

High

Confidence Score

16.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
15-60	GSSRDYPSSRRDRDDRRDRGDRSDRGSGRRRSRSPADYRSSRPRRE	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
25-58	RDRDDRRDRGDRSDRGSGRRRSRSPADYRSSRPR
84-176	GRDRRGPDRGDREWDRDRGADRGADRGADRGADRGADRGAERGGRSRRDDDEGGRRRDRDRDVMGDDRRGGGRRDREADRERRRSVSPPPKKR

Subcellular Location(s)

nucl 23.5, cyto_nucl 13

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR000504 RRM_dom IPR003954 RRM_dom_euk IPR006529 U2AF_lg
Gene Ontology	GO:0000243 C:commitment complex GO:0016607 C:nuclear speck GO:0071004 C:U2-type prespliceosome GO:0089701 C:U2AF complex GO:0008187 F:poly-pyrimidine tract binding GO:0030628 F:pre-mRNA 3'-splice site binding GO:0006397 P:mRNA processing GO:0008380 P:RNA splicing
KEGG	ncr:NCU03039 -
Pfam	View protein in Pfam PF00076 RRM_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM
CDD	cd12231 RRM2_U2AF65 cd12232 RRM3_U2AF65

Amino Acid Sequences

MNGDTYSSRDSGRHGSSRDYPSSRRDRDDRRDRGDRSDRGSGRRRSRSPADYRSSRPRREDGDFDAYSSSRSHRDREREDRYSGRDRRGPDRGDREWDRDRGADRGADRGADRGADRGADRGAERGGRSRRDDDEGGRRRDRDRDVMGDDRRGGGRRDREADRERRRSVSPPPKKREPTPDLTDVVPVIERKRRMTQWDIKPPGYGNVTAEQAKLSGMFPLPGAPRQQAMDPTKLQAFMTQPGGAVNSAALKPTNSRQSKRLIVSNIPPSATDESLLGFFNLQLNGLNVIDSADPCVQCQISPDHSFAMLEFRNSPDATVALALDGITMEAEDANGAAGAGGLKIRRPKDYIVPAIVEDPNYDPDSEVPSSIVIDSPNKISVTNIPAYLSEEQIMELLVAFGKLKSFVLVKDKHTEESRGIAFCEYHDSSVTSVAIDGLNNMMLGDRALKVQKASYGIQQVAGELSVNAMSMLAGTTSLDGDVSRVVQLLNMVTADELMDNDDYEEIRDDVQEECEKFGTIVSLKIPRPTGGSRQSAGVGKIFIKYENSDQATKALKALAGRKFADRTVVATYFPEENFDVNAW

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.37
2	0.42
3	0.5
4	0.56
5	0.6
6	0.58
7	0.55
8	0.58
9	0.67
10	0.67
11	0.66
12	0.68
13	0.71
14	0.76
15	0.82
16	0.82
17	0.81
18	0.84
19	0.79
20	0.81
21	0.8
22	0.75
23	0.71
24	0.72
25	0.67
26	0.67
27	0.73
28	0.72
29	0.73
30	0.77
31	0.74
32	0.73
33	0.77
34	0.78
35	0.78
36	0.78
37	0.77
38	0.74
39	0.77
40	0.8
41	0.81
42	0.79
43	0.75
44	0.72
45	0.69
46	0.69
47	0.67
48	0.63
49	0.62
50	0.54
51	0.49
52	0.44
53	0.38
54	0.33
55	0.28
56	0.23
57	0.22
58	0.25
59	0.3
60	0.37
61	0.47
62	0.55
63	0.64
64	0.71
65	0.69
66	0.72
67	0.72
68	0.7
69	0.71
70	0.68
71	0.66
72	0.61
73	0.6
74	0.62
75	0.64
76	0.62
77	0.61
78	0.63
79	0.6
80	0.64
81	0.64
82	0.63
83	0.61
84	0.6
85	0.53
86	0.48
87	0.45
88	0.39
89	0.37
90	0.34
91	0.27
92	0.29
93	0.26
94	0.25
95	0.23
96	0.22
97	0.2
98	0.17
99	0.17
100	0.14
101	0.14
102	0.14
103	0.14
104	0.14
105	0.14
106	0.14
107	0.14
108	0.14
109	0.15
110	0.16
111	0.17
112	0.24
113	0.29
114	0.34
115	0.38
116	0.41
117	0.42
118	0.46
119	0.47
120	0.45
121	0.5
122	0.53
123	0.56
124	0.56
125	0.55
126	0.52
127	0.56
128	0.55
129	0.52
130	0.48
131	0.46
132	0.47
133	0.52
134	0.52
135	0.48
136	0.44
137	0.38
138	0.35
139	0.32
140	0.29
141	0.28
142	0.33
143	0.35
144	0.4
145	0.41
146	0.48
147	0.55
148	0.63
149	0.66
150	0.68
151	0.65
152	0.63
153	0.63
154	0.59
155	0.61
156	0.62
157	0.62
158	0.64
159	0.69
160	0.75
161	0.78
162	0.8
163	0.79
164	0.75
165	0.73
166	0.68
167	0.65
168	0.57
169	0.51
170	0.45
171	0.35
172	0.28
173	0.21
174	0.15
175	0.14
176	0.18
177	0.2
178	0.23
179	0.29
180	0.33
181	0.37
182	0.45
183	0.52
184	0.57
185	0.65
186	0.66
187	0.61
188	0.58
189	0.53
190	0.47
191	0.39
192	0.3
193	0.21
194	0.18
195	0.19
196	0.18
197	0.18
198	0.14
199	0.12
200	0.11
201	0.1
202	0.08
203	0.07
204	0.07
205	0.07
206	0.07
207	0.1
208	0.12
209	0.13
210	0.15
211	0.14
212	0.15
213	0.16
214	0.17
215	0.21
216	0.23
217	0.26
218	0.24
219	0.26
220	0.25
221	0.25
222	0.24
223	0.19
224	0.17
225	0.15
226	0.16
227	0.15
228	0.14
229	0.13
230	0.14
231	0.11
232	0.09
233	0.07
234	0.06
235	0.06
236	0.07
237	0.07
238	0.06
239	0.08
240	0.13
241	0.22
242	0.26
243	0.28
244	0.31
245	0.38
246	0.43
247	0.44
248	0.45
249	0.39
250	0.37
251	0.4
252	0.43
253	0.38
254	0.32
255	0.29
256	0.27
257	0.26
258	0.22
259	0.17
260	0.1
261	0.1
262	0.1
263	0.1
264	0.07
265	0.05
266	0.05
267	0.06
268	0.06
269	0.06
270	0.05
271	0.06
272	0.07
273	0.07
274	0.06
275	0.05
276	0.06
277	0.06
278	0.05
279	0.07
280	0.08
281	0.08
282	0.08
283	0.09
284	0.08
285	0.08
286	0.1
287	0.11
288	0.14
289	0.16
290	0.17
291	0.16
292	0.16
293	0.16
294	0.14
295	0.16
296	0.12
297	0.11
298	0.11
299	0.11
300	0.13
301	0.13
302	0.13
303	0.09
304	0.09
305	0.08
306	0.08
307	0.07
308	0.04
309	0.04
310	0.04
311	0.04
312	0.03
313	0.03
314	0.02
315	0.02
316	0.02
317	0.02
318	0.02
319	0.02
320	0.02
321	0.02
322	0.02
323	0.02
324	0.02
325	0.02
326	0.02
327	0.03
328	0.04
329	0.04
330	0.06
331	0.11
332	0.13
333	0.16
334	0.18
335	0.21
336	0.28
337	0.35
338	0.37
339	0.34
340	0.33
341	0.31
342	0.31
343	0.29
344	0.21
345	0.15
346	0.13
347	0.13
348	0.13
349	0.13
350	0.1
351	0.1
352	0.15
353	0.14
354	0.13
355	0.11
356	0.1
357	0.1
358	0.1
359	0.1
360	0.07
361	0.08
362	0.09
363	0.1
364	0.13
365	0.12
366	0.12
367	0.12
368	0.15
369	0.18
370	0.19
371	0.18
372	0.16
373	0.17
374	0.2
375	0.2
376	0.16
377	0.12
378	0.11
379	0.1
380	0.1
381	0.1
382	0.06
383	0.05
384	0.04
385	0.04
386	0.04
387	0.04
388	0.04
389	0.04
390	0.05
391	0.05
392	0.07
393	0.08
394	0.1
395	0.18
396	0.22
397	0.25
398	0.32
399	0.34
400	0.36
401	0.37
402	0.38
403	0.31
404	0.32
405	0.31
406	0.24
407	0.23
408	0.2
409	0.18
410	0.16
411	0.21
412	0.17
413	0.15
414	0.16
415	0.16
416	0.15
417	0.17
418	0.17
419	0.1
420	0.09
421	0.09
422	0.08
423	0.08
424	0.07
425	0.06
426	0.06
427	0.06
428	0.05
429	0.05
430	0.04
431	0.05
432	0.06
433	0.06
434	0.09
435	0.1
436	0.11
437	0.12
438	0.14
439	0.16
440	0.19
441	0.2
442	0.23
443	0.27
444	0.26
445	0.27
446	0.26
447	0.23
448	0.2
449	0.18
450	0.13
451	0.07
452	0.08
453	0.05
454	0.05
455	0.05
456	0.04
457	0.04
458	0.04
459	0.04
460	0.03
461	0.03
462	0.04
463	0.04
464	0.04
465	0.05
466	0.05
467	0.05
468	0.05
469	0.06
470	0.07
471	0.07
472	0.07
473	0.07
474	0.07
475	0.08
476	0.08
477	0.08
478	0.08
479	0.07
480	0.07
481	0.07
482	0.07
483	0.06
484	0.05
485	0.06
486	0.07
487	0.07
488	0.07
489	0.08
490	0.08
491	0.09
492	0.11
493	0.09
494	0.1
495	0.1
496	0.1
497	0.11
498	0.16
499	0.2
500	0.19
501	0.2
502	0.21
503	0.21
504	0.2
505	0.19
506	0.19
507	0.14
508	0.16
509	0.18
510	0.25
511	0.26
512	0.31
513	0.32
514	0.29
515	0.33
516	0.36
517	0.4
518	0.42
519	0.46
520	0.42
521	0.42
522	0.45
523	0.43
524	0.4
525	0.33
526	0.27
527	0.23
528	0.25
529	0.23
530	0.21
531	0.22
532	0.23
533	0.27
534	0.33
535	0.36
536	0.35
537	0.35
538	0.39
539	0.4
540	0.37
541	0.33
542	0.26
543	0.24
544	0.27
545	0.34
546	0.35
547	0.37
548	0.38
549	0.42
550	0.43
551	0.42
552	0.43
553	0.36
554	0.33
555	0.33
556	0.33
557	0.28
558	0.27
559	0.29
560	0.26
561	0.25
562	0.26
563	0.2
564	0.19

Q7SDG9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer