Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

Q7SCM7

Protein Details
Accession Q7SCM7    Localization Confidence High Confidence Score 22.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
12-32AAEPPHPKRRRLPDDDANSMPHydrophilic
131-157SRSITRSRSPRSRSRTRSRSRSSSIRDHydrophilic
517-547GQDCTIKVYKNVRRKKHDRRLKFDKPNGISAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
55-91RAHRPLARRDRLPTSPNRTRDASASRSRSRSGRSRTR
115-174RESRSRTSSRSRSRSYSRSITRSRSPRSRSRTRSRSRSSSIRDRSRSVSPSRFQGRRPSK
529-537RRKKHDRRL
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 12.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020472  G-protein_beta_WD-40_rep  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR019775  WD40_repeat_CS  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0048188  C:Set1C/COMPASS complex  
GO:0042393  F:histone binding  
GO:0051568  P:histone H3-K4 methylation  
KEGG ncr:NCU03244  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00678  WD_REPEATS_1  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
CDD cd00200  WD40  
Amino Acid Sequences MPKARASPAGTAAEPPHPKRRRLPDDDANSMPRYSSPAEDMNRDEDTTEYPGRSRAHRPLARRDRLPTSPNRTRDASASRSRSRSGRSRTRSTSPRSDEDEQQRRYRSRSSTSSRESRSRTSSRSRSRSYSRSITRSRSPRSRSRTRSRSRSSSIRDRSRSVSPSRFQGRRPSKSHAEQLRPNYRPRLELSGHTAAISQVRISPDGKWIASASADGSVKIWDATTGNNLDTLIGHMAGVSCLAWAPDSNTLATGSDDKAIRLWDRVTASPAHACGDESNRGQGPREYIRGGSQLARTARGGRTGMGPLLGHHNYVYCLAFSPKGNILASGSYDEAVFLWDVRAGRLMRSLPAHSDPVSGIGFCCDGTLVVSCSTDGLIRIWDTSTGQCLRTLVHEDNPAVTNVCFSPNGRFVLAFNLDNSIRLWDYVSGTVKKTYQGHKNSGFSIGGGFGVVTDNKDTQDDYRHGNIGKPFVVSASEDGDIVMWDVVTKQIVQRIEKAHEGVCFWVDVNGDTMVSSGQDCTIKVYKNVRRKKHDRRLKFDKPNGISAIDGTNGHGNGRGIEINEAMGDDDL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.44
3 0.49
4 0.51
5 0.57
6 0.64
7 0.72
8 0.74
9 0.76
10 0.8
11 0.79
12 0.81
13 0.81
14 0.76
15 0.7
16 0.61
17 0.52
18 0.43
19 0.33
20 0.29
21 0.25
22 0.23
23 0.23
24 0.28
25 0.31
26 0.35
27 0.37
28 0.37
29 0.36
30 0.34
31 0.3
32 0.24
33 0.24
34 0.25
35 0.25
36 0.22
37 0.21
38 0.27
39 0.29
40 0.33
41 0.38
42 0.41
43 0.49
44 0.54
45 0.6
46 0.66
47 0.74
48 0.77
49 0.75
50 0.72
51 0.68
52 0.7
53 0.7
54 0.69
55 0.68
56 0.69
57 0.68
58 0.67
59 0.62
60 0.57
61 0.57
62 0.54
63 0.52
64 0.52
65 0.56
66 0.58
67 0.58
68 0.6
69 0.58
70 0.58
71 0.6
72 0.6
73 0.63
74 0.64
75 0.7
76 0.73
77 0.77
78 0.78
79 0.76
80 0.77
81 0.73
82 0.71
83 0.69
84 0.67
85 0.66
86 0.68
87 0.7
88 0.65
89 0.65
90 0.66
91 0.62
92 0.62
93 0.6
94 0.56
95 0.54
96 0.58
97 0.6
98 0.62
99 0.66
100 0.71
101 0.7
102 0.71
103 0.68
104 0.65
105 0.65
106 0.62
107 0.61
108 0.62
109 0.67
110 0.69
111 0.73
112 0.73
113 0.72
114 0.74
115 0.74
116 0.71
117 0.7
118 0.68
119 0.68
120 0.69
121 0.67
122 0.68
123 0.71
124 0.72
125 0.71
126 0.71
127 0.72
128 0.74
129 0.79
130 0.79
131 0.81
132 0.83
133 0.84
134 0.87
135 0.86
136 0.86
137 0.82
138 0.81
139 0.79
140 0.79
141 0.79
142 0.78
143 0.73
144 0.68
145 0.66
146 0.63
147 0.6
148 0.57
149 0.55
150 0.47
151 0.52
152 0.57
153 0.56
154 0.52
155 0.57
156 0.6
157 0.61
158 0.64
159 0.63
160 0.62
161 0.65
162 0.71
163 0.69
164 0.66
165 0.64
166 0.68
167 0.71
168 0.66
169 0.64
170 0.63
171 0.56
172 0.51
173 0.47
174 0.45
175 0.37
176 0.36
177 0.39
178 0.36
179 0.34
180 0.31
181 0.28
182 0.21
183 0.21
184 0.18
185 0.11
186 0.09
187 0.1
188 0.12
189 0.12
190 0.13
191 0.16
192 0.18
193 0.18
194 0.16
195 0.16
196 0.14
197 0.14
198 0.13
199 0.09
200 0.1
201 0.1
202 0.09
203 0.09
204 0.09
205 0.09
206 0.09
207 0.08
208 0.05
209 0.06
210 0.06
211 0.09
212 0.1
213 0.1
214 0.1
215 0.1
216 0.09
217 0.09
218 0.09
219 0.07
220 0.06
221 0.05
222 0.05
223 0.05
224 0.05
225 0.05
226 0.04
227 0.03
228 0.03
229 0.03
230 0.03
231 0.03
232 0.05
233 0.08
234 0.09
235 0.09
236 0.09
237 0.1
238 0.1
239 0.1
240 0.1
241 0.08
242 0.1
243 0.1
244 0.1
245 0.11
246 0.12
247 0.12
248 0.12
249 0.11
250 0.12
251 0.14
252 0.15
253 0.16
254 0.15
255 0.16
256 0.15
257 0.15
258 0.13
259 0.11
260 0.1
261 0.1
262 0.12
263 0.14
264 0.13
265 0.15
266 0.15
267 0.15
268 0.16
269 0.16
270 0.17
271 0.17
272 0.19
273 0.17
274 0.17
275 0.18
276 0.19
277 0.18
278 0.17
279 0.15
280 0.17
281 0.17
282 0.18
283 0.17
284 0.19
285 0.18
286 0.19
287 0.18
288 0.14
289 0.15
290 0.15
291 0.14
292 0.12
293 0.11
294 0.09
295 0.14
296 0.14
297 0.12
298 0.11
299 0.11
300 0.11
301 0.13
302 0.12
303 0.07
304 0.07
305 0.08
306 0.1
307 0.1
308 0.12
309 0.13
310 0.15
311 0.15
312 0.14
313 0.14
314 0.12
315 0.13
316 0.11
317 0.1
318 0.07
319 0.07
320 0.07
321 0.06
322 0.06
323 0.05
324 0.04
325 0.04
326 0.06
327 0.06
328 0.06
329 0.11
330 0.1
331 0.11
332 0.14
333 0.14
334 0.15
335 0.17
336 0.18
337 0.17
338 0.19
339 0.21
340 0.18
341 0.18
342 0.16
343 0.16
344 0.16
345 0.12
346 0.1
347 0.09
348 0.09
349 0.07
350 0.07
351 0.05
352 0.04
353 0.05
354 0.06
355 0.07
356 0.07
357 0.07
358 0.07
359 0.07
360 0.07
361 0.07
362 0.07
363 0.06
364 0.07
365 0.07
366 0.08
367 0.08
368 0.08
369 0.09
370 0.09
371 0.14
372 0.15
373 0.15
374 0.15
375 0.15
376 0.15
377 0.17
378 0.21
379 0.18
380 0.2
381 0.23
382 0.23
383 0.24
384 0.25
385 0.22
386 0.18
387 0.16
388 0.14
389 0.11
390 0.13
391 0.12
392 0.12
393 0.16
394 0.19
395 0.21
396 0.2
397 0.2
398 0.18
399 0.23
400 0.25
401 0.21
402 0.17
403 0.19
404 0.18
405 0.18
406 0.18
407 0.15
408 0.12
409 0.12
410 0.12
411 0.11
412 0.13
413 0.16
414 0.21
415 0.2
416 0.22
417 0.24
418 0.24
419 0.27
420 0.31
421 0.34
422 0.39
423 0.44
424 0.51
425 0.55
426 0.57
427 0.54
428 0.51
429 0.44
430 0.34
431 0.28
432 0.2
433 0.13
434 0.1
435 0.09
436 0.05
437 0.07
438 0.07
439 0.07
440 0.09
441 0.1
442 0.11
443 0.12
444 0.13
445 0.13
446 0.2
447 0.22
448 0.25
449 0.27
450 0.31
451 0.31
452 0.34
453 0.35
454 0.32
455 0.31
456 0.27
457 0.23
458 0.2
459 0.21
460 0.17
461 0.15
462 0.14
463 0.13
464 0.12
465 0.12
466 0.12
467 0.1
468 0.1
469 0.08
470 0.05
471 0.05
472 0.05
473 0.06
474 0.07
475 0.07
476 0.09
477 0.14
478 0.18
479 0.21
480 0.27
481 0.31
482 0.34
483 0.37
484 0.37
485 0.35
486 0.32
487 0.31
488 0.27
489 0.22
490 0.19
491 0.15
492 0.15
493 0.13
494 0.12
495 0.13
496 0.12
497 0.11
498 0.1
499 0.1
500 0.08
501 0.08
502 0.08
503 0.06
504 0.09
505 0.1
506 0.11
507 0.17
508 0.22
509 0.24
510 0.3
511 0.4
512 0.46
513 0.55
514 0.65
515 0.7
516 0.75
517 0.84
518 0.89
519 0.9
520 0.92
521 0.92
522 0.92
523 0.93
524 0.93
525 0.93
526 0.9
527 0.9
528 0.83
529 0.79
530 0.72
531 0.62
532 0.51
533 0.42
534 0.35
535 0.27
536 0.22
537 0.17
538 0.19
539 0.18
540 0.18
541 0.19
542 0.17
543 0.16
544 0.19
545 0.19
546 0.15
547 0.17
548 0.17
549 0.15
550 0.14
551 0.14