Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

Q1K5B7

Protein Details
Accession Q1K5B7    Localization Confidence High Confidence Score 23.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
72-92SYWPGKSSQHPSRPSRPSRAYHydrophilic
132-153ELSIHKKIPSDKKRVDNRQGTIHydrophilic
672-702EKEKAPEKGREREKRDDERRRGRGRGRGRDGBasic
786-814EKGEGEKKGENRSRRRRGGRGRGGGDKDKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
245-256KKRAREAKGEKT
435-445SGRTRGRRGRG
666-730EREKENEKEKAPEKGREREKRDDERRRGRGRGRGRDGGGGGGDKDKEKEKEKGEKGVDSRGGAKG
776-827GEKDKENDKGEKGEGEKKGENRSRRRRGGRGRGGGDKDKEKDKDGGGGAKKA
Subcellular Location(s) nucl 24.5, mito_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR039722  Upf3  
IPR005120  UPF3_dom  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0000184  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay  
GO:0045727  P:positive regulation of translation  
KEGG ncr:NCU03435  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PF03467  Smg4_UPF3  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12455  RRM_like_Smg4_UPF3  
cd00590  RRM_SF  
Amino Acid Sequences MMAAPQLLLRKPNGTAAGQATNDAQNAPKTKPQSEGEKVVVRRLPPLLTEEEFFKILGDEWKVGHGKVDWFSYWPGKSSQHPSRPSRPSRAYIHVIRKDDLLVLSQAVQNGVWEDAKESYNDPVLNLPPTVELSIHKKIPSDKKRVDNRQGTIDQEPEFMAFLESLANPDAHKTTDTAGEPNAEETSAKPEKVTTTPLVEYLKEKKAQRAKEAALARSAKQHARQESQGGKTKTATATITLEELKKRAREAKGEKTDKVSEKPRDNVKILTRRGASSAAAEAAKAANTVASQIQDNARSSSKADSQTKAAQSSSQSATQSTPSGDATSELPKSRRAGIAAAARILQRDLGLSPGNAHRKARQEAAKAEADAKASAAATASANASAAKETASREKKEKETTPAPASSERSSTPANAADSSAVASPSASARGRESASGRTRGRRGRGGTTEEGSKSKGTDAGKETKPAEVATPQPPIKPTMILKKRDSTQATPSALSTPSTPVNAQSPALSASQKPSSPKQPSTGGRQRGGGRGGEAKENVQPGNNTANTPSTPAPTGPTQAFIKHAHQTQGVTESTLREALQAFGAINSIDLRKKGLAYVDFADPEALKKAIASSPVTIARASVTILERKSDTDKKEDGGKDKDKETAAPGPAGASALVEKEKTVPEREKENEKEKAPEKGREREKRDDERRRGRGRGRGRDGGGGGGDKDKEKEKEKGEKGVDSRGGAKGDAPAGGAKEAVPQEGNGSDRPVSTPKAERGAAASASARPTSAQDKGEKDKENDKGEKGEGEKKGENRSRRRRGGRGRGGGDKDKEKDKDGGGGAKKAEGSGSAQAAPAS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.31
3 0.32
4 0.35
5 0.32
6 0.32
7 0.29
8 0.27
9 0.26
10 0.23
11 0.21
12 0.21
13 0.25
14 0.28
15 0.32
16 0.35
17 0.37
18 0.44
19 0.47
20 0.5
21 0.54
22 0.56
23 0.56
24 0.59
25 0.57
26 0.57
27 0.55
28 0.46
29 0.44
30 0.41
31 0.36
32 0.29
33 0.33
34 0.31
35 0.29
36 0.3
37 0.28
38 0.27
39 0.26
40 0.25
41 0.2
42 0.15
43 0.15
44 0.19
45 0.18
46 0.17
47 0.17
48 0.23
49 0.25
50 0.24
51 0.25
52 0.23
53 0.24
54 0.26
55 0.29
56 0.24
57 0.25
58 0.29
59 0.33
60 0.31
61 0.29
62 0.3
63 0.3
64 0.36
65 0.43
66 0.5
67 0.52
68 0.6
69 0.66
70 0.72
71 0.79
72 0.81
73 0.81
74 0.77
75 0.75
76 0.73
77 0.73
78 0.7
79 0.69
80 0.71
81 0.69
82 0.66
83 0.6
84 0.54
85 0.47
86 0.42
87 0.33
88 0.25
89 0.18
90 0.15
91 0.16
92 0.16
93 0.16
94 0.14
95 0.13
96 0.11
97 0.11
98 0.12
99 0.1
100 0.09
101 0.11
102 0.13
103 0.14
104 0.14
105 0.15
106 0.16
107 0.19
108 0.19
109 0.18
110 0.19
111 0.21
112 0.21
113 0.2
114 0.18
115 0.15
116 0.16
117 0.17
118 0.14
119 0.14
120 0.19
121 0.25
122 0.27
123 0.27
124 0.29
125 0.37
126 0.47
127 0.54
128 0.58
129 0.6
130 0.67
131 0.77
132 0.84
133 0.86
134 0.84
135 0.78
136 0.76
137 0.71
138 0.65
139 0.57
140 0.51
141 0.41
142 0.33
143 0.3
144 0.21
145 0.19
146 0.15
147 0.12
148 0.08
149 0.07
150 0.08
151 0.07
152 0.08
153 0.09
154 0.09
155 0.08
156 0.11
157 0.12
158 0.11
159 0.12
160 0.11
161 0.12
162 0.17
163 0.19
164 0.18
165 0.18
166 0.19
167 0.19
168 0.19
169 0.18
170 0.12
171 0.11
172 0.1
173 0.18
174 0.19
175 0.18
176 0.17
177 0.18
178 0.22
179 0.24
180 0.28
181 0.23
182 0.24
183 0.25
184 0.28
185 0.28
186 0.26
187 0.28
188 0.29
189 0.32
190 0.34
191 0.36
192 0.41
193 0.48
194 0.52
195 0.55
196 0.57
197 0.53
198 0.55
199 0.58
200 0.5
201 0.49
202 0.46
203 0.39
204 0.38
205 0.4
206 0.36
207 0.38
208 0.44
209 0.43
210 0.46
211 0.47
212 0.48
213 0.51
214 0.53
215 0.55
216 0.49
217 0.44
218 0.41
219 0.42
220 0.35
221 0.31
222 0.26
223 0.19
224 0.19
225 0.18
226 0.19
227 0.17
228 0.18
229 0.17
230 0.18
231 0.2
232 0.2
233 0.23
234 0.29
235 0.31
236 0.38
237 0.45
238 0.54
239 0.61
240 0.64
241 0.62
242 0.6
243 0.63
244 0.57
245 0.55
246 0.53
247 0.51
248 0.52
249 0.57
250 0.6
251 0.59
252 0.57
253 0.57
254 0.56
255 0.58
256 0.53
257 0.53
258 0.47
259 0.42
260 0.41
261 0.37
262 0.28
263 0.2
264 0.19
265 0.14
266 0.13
267 0.12
268 0.1
269 0.09
270 0.08
271 0.07
272 0.06
273 0.04
274 0.04
275 0.06
276 0.06
277 0.07
278 0.07
279 0.09
280 0.11
281 0.14
282 0.15
283 0.16
284 0.17
285 0.17
286 0.17
287 0.19
288 0.22
289 0.27
290 0.3
291 0.29
292 0.32
293 0.38
294 0.39
295 0.37
296 0.32
297 0.26
298 0.24
299 0.27
300 0.25
301 0.22
302 0.2
303 0.19
304 0.2
305 0.19
306 0.19
307 0.15
308 0.14
309 0.11
310 0.11
311 0.1
312 0.1
313 0.11
314 0.13
315 0.14
316 0.15
317 0.16
318 0.18
319 0.2
320 0.22
321 0.22
322 0.19
323 0.19
324 0.22
325 0.26
326 0.23
327 0.22
328 0.21
329 0.19
330 0.18
331 0.17
332 0.12
333 0.07
334 0.07
335 0.06
336 0.07
337 0.08
338 0.07
339 0.09
340 0.15
341 0.2
342 0.21
343 0.22
344 0.25
345 0.3
346 0.33
347 0.38
348 0.38
349 0.37
350 0.38
351 0.41
352 0.39
353 0.33
354 0.31
355 0.26
356 0.21
357 0.16
358 0.14
359 0.1
360 0.08
361 0.07
362 0.06
363 0.05
364 0.05
365 0.05
366 0.05
367 0.05
368 0.05
369 0.05
370 0.05
371 0.05
372 0.05
373 0.05
374 0.06
375 0.07
376 0.16
377 0.21
378 0.23
379 0.28
380 0.32
381 0.37
382 0.42
383 0.45
384 0.43
385 0.42
386 0.46
387 0.45
388 0.41
389 0.38
390 0.34
391 0.34
392 0.28
393 0.25
394 0.2
395 0.19
396 0.18
397 0.17
398 0.16
399 0.15
400 0.15
401 0.13
402 0.13
403 0.1
404 0.09
405 0.1
406 0.08
407 0.06
408 0.05
409 0.05
410 0.05
411 0.05
412 0.08
413 0.07
414 0.08
415 0.09
416 0.11
417 0.12
418 0.13
419 0.15
420 0.19
421 0.23
422 0.3
423 0.31
424 0.33
425 0.38
426 0.41
427 0.44
428 0.43
429 0.42
430 0.42
431 0.44
432 0.45
433 0.42
434 0.38
435 0.37
436 0.31
437 0.29
438 0.23
439 0.19
440 0.14
441 0.12
442 0.15
443 0.13
444 0.17
445 0.2
446 0.27
447 0.27
448 0.3
449 0.31
450 0.27
451 0.27
452 0.23
453 0.2
454 0.14
455 0.17
456 0.17
457 0.22
458 0.22
459 0.22
460 0.23
461 0.24
462 0.22
463 0.22
464 0.21
465 0.26
466 0.33
467 0.38
468 0.41
469 0.43
470 0.45
471 0.49
472 0.5
473 0.43
474 0.42
475 0.43
476 0.42
477 0.37
478 0.35
479 0.3
480 0.26
481 0.23
482 0.17
483 0.12
484 0.12
485 0.13
486 0.12
487 0.12
488 0.14
489 0.14
490 0.14
491 0.12
492 0.11
493 0.12
494 0.13
495 0.13
496 0.11
497 0.13
498 0.16
499 0.17
500 0.2
501 0.23
502 0.31
503 0.37
504 0.39
505 0.39
506 0.45
507 0.46
508 0.53
509 0.57
510 0.54
511 0.49
512 0.51
513 0.49
514 0.45
515 0.44
516 0.34
517 0.27
518 0.26
519 0.26
520 0.24
521 0.22
522 0.2
523 0.2
524 0.21
525 0.2
526 0.16
527 0.15
528 0.15
529 0.2
530 0.2
531 0.18
532 0.17
533 0.19
534 0.18
535 0.2
536 0.19
537 0.15
538 0.15
539 0.15
540 0.17
541 0.16
542 0.18
543 0.15
544 0.18
545 0.17
546 0.17
547 0.21
548 0.21
549 0.23
550 0.25
551 0.28
552 0.26
553 0.27
554 0.27
555 0.24
556 0.25
557 0.22
558 0.18
559 0.16
560 0.15
561 0.14
562 0.15
563 0.13
564 0.1
565 0.1
566 0.1
567 0.1
568 0.09
569 0.08
570 0.07
571 0.07
572 0.06
573 0.06
574 0.06
575 0.08
576 0.09
577 0.09
578 0.11
579 0.12
580 0.12
581 0.14
582 0.17
583 0.17
584 0.19
585 0.21
586 0.21
587 0.2
588 0.2
589 0.19
590 0.15
591 0.14
592 0.13
593 0.11
594 0.09
595 0.08
596 0.1
597 0.11
598 0.14
599 0.15
600 0.14
601 0.18
602 0.2
603 0.21
604 0.19
605 0.17
606 0.15
607 0.13
608 0.12
609 0.12
610 0.12
611 0.16
612 0.16
613 0.18
614 0.18
615 0.2
616 0.27
617 0.3
618 0.31
619 0.33
620 0.35
621 0.35
622 0.43
623 0.45
624 0.45
625 0.47
626 0.52
627 0.49
628 0.48
629 0.51
630 0.43
631 0.4
632 0.39
633 0.36
634 0.3
635 0.27
636 0.25
637 0.21
638 0.2
639 0.19
640 0.14
641 0.08
642 0.06
643 0.07
644 0.08
645 0.08
646 0.08
647 0.1
648 0.14
649 0.17
650 0.23
651 0.28
652 0.31
653 0.39
654 0.43
655 0.51
656 0.54
657 0.59
658 0.6
659 0.55
660 0.6
661 0.55
662 0.61
663 0.57
664 0.58
665 0.58
666 0.6
667 0.69
668 0.71
669 0.75
670 0.75
671 0.79
672 0.81
673 0.85
674 0.86
675 0.86
676 0.87
677 0.9
678 0.87
679 0.86
680 0.83
681 0.82
682 0.81
683 0.82
684 0.79
685 0.76
686 0.71
687 0.67
688 0.6
689 0.51
690 0.42
691 0.32
692 0.25
693 0.2
694 0.19
695 0.16
696 0.17
697 0.22
698 0.26
699 0.3
700 0.37
701 0.42
702 0.52
703 0.55
704 0.62
705 0.6
706 0.62
707 0.59
708 0.6
709 0.55
710 0.46
711 0.45
712 0.39
713 0.36
714 0.29
715 0.27
716 0.22
717 0.2
718 0.18
719 0.16
720 0.14
721 0.14
722 0.14
723 0.13
724 0.1
725 0.14
726 0.15
727 0.15
728 0.14
729 0.13
730 0.15
731 0.18
732 0.2
733 0.15
734 0.18
735 0.17
736 0.18
737 0.21
738 0.22
739 0.23
740 0.26
741 0.32
742 0.34
743 0.4
744 0.39
745 0.37
746 0.37
747 0.37
748 0.32
749 0.27
750 0.24
751 0.2
752 0.22
753 0.22
754 0.18
755 0.15
756 0.18
757 0.22
758 0.25
759 0.28
760 0.31
761 0.38
762 0.46
763 0.53
764 0.56
765 0.56
766 0.59
767 0.62
768 0.65
769 0.64
770 0.59
771 0.55
772 0.51
773 0.52
774 0.49
775 0.49
776 0.45
777 0.47
778 0.49
779 0.5
780 0.58
781 0.6
782 0.65
783 0.68
784 0.74
785 0.78
786 0.83
787 0.87
788 0.88
789 0.91
790 0.92
791 0.92
792 0.91
793 0.86
794 0.84
795 0.82
796 0.8
797 0.76
798 0.72
799 0.66
800 0.65
801 0.62
802 0.57
803 0.55
804 0.48
805 0.49
806 0.45
807 0.49
808 0.44
809 0.46
810 0.43
811 0.4
812 0.39
813 0.32
814 0.28
815 0.21
816 0.2
817 0.2
818 0.22
819 0.2