Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

V5IM08

Protein Details
Accession V5IM08    Localization Confidence High Confidence Score 22.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-27MPVELRKRKAPPPPPAPVKKRATKATKHydrophilic
379-402TTNGEKKDEKKKTEEKKSDDDKAEAcidic
410-486AEEEKKDEKKDEKKDEKKDEKKDEKKDEKKDEKKDEKKDEKKDEKKDEKKDEKKDEKKDEKKDEKKDEKTEEKEKEDAcidic
NLS Segment(s)
PositionSequence
6-33RKRKAPPPPPAPVKKRATKATKAAAKAK
276-300EKKEDKAETKEREEKAEAKESEEKK
311-316KKDEKK
370-478EEKKKEKEDTTNGEKKDEKKKTEEKKSDDDKAEDKKEDKEAEEEKKDEKKDEKKDEKKDEKKDEKKDEKKDEKKDEKKDEKKDEKKDEKKDEKKDEKKDEKKDEKKDEK
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000866  AhpC/TSA  
IPR036249  Thioredoxin-like_sf  
IPR013766  Thioredoxin_domain  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0008379  F:thioredoxin peroxidase activity  
GO:0045454  P:cell redox homeostasis  
GO:0034599  P:cellular response to oxidative stress  
Pfam View protein in Pfam  
PF00578  AhpC-TSA  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51352  THIOREDOXIN_2  
CDD cd03017  PRX_BCP  
Amino Acid Sequences MPVELRKRKAPPPPPAPVKKRATKATKAAAKAKEQVEDVASKAAETASKAAEVATETATAAAQTAAEAVANGAAKVATALAGNPKVGDLIDLDNFGGEVETNDGTKTSLKKLVEESKAGVVLFTYPKASTPGCTRQVCLFRDSYTALSSATGLSIYGLSSDSPKANTTFKEKQKLPYPLLCDPSYALIGAIGLKKAPKGTTRGVFVVDKQGKVLAAEAGGPEATVKVVERVVSEMGEEGKTEKKKEEEEAEEKGEKKEGEEEEKAEKDEAKEEGEEKKEDKAETKEREEKAEAKESEEKKDEKDETEAAGKKDEKKNEKDETEAAEKKDEKKDEKDETEAEEKKEEQDKDSETKDDDEKKAEKKDAATEEEKKKEKEDTTNGEKKDEKKKTEEKKSDDDKAEDKKEDKEAEEEKKDEKKDEKKDEKKDEKKDEKKDEKKDEKKDEKKDEKKDEKKDEKKDEKKDEKKDEKKDEKKDEKTEEKEKEDTEMKDA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.82
2 0.86
3 0.86
4 0.85
5 0.85
6 0.83
7 0.82
8 0.82
9 0.8
10 0.78
11 0.8
12 0.8
13 0.78
14 0.76
15 0.76
16 0.72
17 0.69
18 0.67
19 0.62
20 0.55
21 0.49
22 0.44
23 0.39
24 0.34
25 0.29
26 0.26
27 0.22
28 0.18
29 0.17
30 0.16
31 0.14
32 0.14
33 0.15
34 0.12
35 0.13
36 0.13
37 0.13
38 0.13
39 0.13
40 0.13
41 0.11
42 0.1
43 0.1
44 0.1
45 0.1
46 0.09
47 0.08
48 0.06
49 0.05
50 0.05
51 0.05
52 0.05
53 0.05
54 0.05
55 0.04
56 0.07
57 0.07
58 0.07
59 0.06
60 0.06
61 0.06
62 0.06
63 0.06
64 0.04
65 0.04
66 0.06
67 0.11
68 0.13
69 0.13
70 0.13
71 0.13
72 0.13
73 0.12
74 0.12
75 0.08
76 0.1
77 0.11
78 0.11
79 0.11
80 0.11
81 0.11
82 0.1
83 0.08
84 0.05
85 0.05
86 0.06
87 0.07
88 0.08
89 0.08
90 0.08
91 0.09
92 0.13
93 0.15
94 0.17
95 0.23
96 0.23
97 0.26
98 0.33
99 0.41
100 0.41
101 0.41
102 0.38
103 0.35
104 0.35
105 0.32
106 0.25
107 0.16
108 0.15
109 0.14
110 0.13
111 0.12
112 0.11
113 0.12
114 0.15
115 0.15
116 0.15
117 0.21
118 0.29
119 0.36
120 0.37
121 0.38
122 0.42
123 0.49
124 0.48
125 0.44
126 0.37
127 0.3
128 0.32
129 0.31
130 0.26
131 0.19
132 0.18
133 0.14
134 0.13
135 0.12
136 0.09
137 0.08
138 0.06
139 0.05
140 0.05
141 0.05
142 0.04
143 0.04
144 0.05
145 0.05
146 0.07
147 0.08
148 0.09
149 0.1
150 0.12
151 0.13
152 0.16
153 0.18
154 0.25
155 0.32
156 0.38
157 0.46
158 0.48
159 0.52
160 0.59
161 0.63
162 0.59
163 0.55
164 0.54
165 0.5
166 0.52
167 0.46
168 0.37
169 0.31
170 0.27
171 0.23
172 0.16
173 0.11
174 0.07
175 0.06
176 0.08
177 0.08
178 0.06
179 0.06
180 0.07
181 0.08
182 0.09
183 0.11
184 0.13
185 0.17
186 0.23
187 0.26
188 0.28
189 0.28
190 0.3
191 0.28
192 0.26
193 0.31
194 0.28
195 0.25
196 0.22
197 0.21
198 0.19
199 0.18
200 0.18
201 0.08
202 0.06
203 0.06
204 0.06
205 0.05
206 0.05
207 0.05
208 0.04
209 0.04
210 0.03
211 0.03
212 0.03
213 0.04
214 0.05
215 0.06
216 0.06
217 0.07
218 0.08
219 0.07
220 0.07
221 0.07
222 0.07
223 0.07
224 0.07
225 0.07
226 0.12
227 0.14
228 0.15
229 0.16
230 0.17
231 0.19
232 0.22
233 0.26
234 0.27
235 0.29
236 0.31
237 0.32
238 0.32
239 0.31
240 0.28
241 0.25
242 0.19
243 0.16
244 0.19
245 0.17
246 0.2
247 0.21
248 0.22
249 0.24
250 0.25
251 0.25
252 0.2
253 0.19
254 0.14
255 0.16
256 0.14
257 0.12
258 0.12
259 0.13
260 0.17
261 0.18
262 0.19
263 0.17
264 0.19
265 0.21
266 0.21
267 0.23
268 0.25
269 0.32
270 0.35
271 0.41
272 0.46
273 0.45
274 0.48
275 0.47
276 0.45
277 0.41
278 0.44
279 0.38
280 0.34
281 0.42
282 0.39
283 0.42
284 0.42
285 0.38
286 0.31
287 0.37
288 0.35
289 0.28
290 0.3
291 0.26
292 0.23
293 0.29
294 0.3
295 0.25
296 0.28
297 0.29
298 0.33
299 0.38
300 0.44
301 0.45
302 0.48
303 0.55
304 0.58
305 0.57
306 0.53
307 0.49
308 0.46
309 0.47
310 0.44
311 0.37
312 0.35
313 0.36
314 0.38
315 0.42
316 0.43
317 0.4
318 0.43
319 0.5
320 0.52
321 0.53
322 0.51
323 0.46
324 0.45
325 0.48
326 0.44
327 0.38
328 0.32
329 0.3
330 0.3
331 0.36
332 0.32
333 0.26
334 0.28
335 0.3
336 0.33
337 0.34
338 0.32
339 0.26
340 0.28
341 0.32
342 0.34
343 0.32
344 0.34
345 0.37
346 0.41
347 0.45
348 0.46
349 0.42
350 0.38
351 0.44
352 0.43
353 0.45
354 0.45
355 0.48
356 0.52
357 0.58
358 0.6
359 0.53
360 0.51
361 0.51
362 0.5
363 0.5
364 0.51
365 0.51
366 0.56
367 0.62
368 0.61
369 0.59
370 0.59
371 0.56
372 0.59
373 0.59
374 0.55
375 0.57
376 0.66
377 0.72
378 0.78
379 0.81
380 0.77
381 0.78
382 0.81
383 0.8
384 0.75
385 0.68
386 0.64
387 0.64
388 0.63
389 0.57
390 0.51
391 0.47
392 0.49
393 0.48
394 0.42
395 0.41
396 0.42
397 0.46
398 0.49
399 0.47
400 0.47
401 0.51
402 0.52
403 0.51
404 0.53
405 0.55
406 0.6
407 0.69
408 0.74
409 0.76
410 0.84
411 0.89
412 0.91
413 0.91
414 0.91
415 0.91
416 0.91
417 0.91
418 0.91
419 0.91
420 0.91
421 0.91
422 0.91
423 0.91
424 0.91
425 0.91
426 0.91
427 0.91
428 0.91
429 0.91
430 0.91
431 0.91
432 0.91
433 0.91
434 0.91
435 0.91
436 0.91
437 0.91
438 0.91
439 0.91
440 0.91
441 0.91
442 0.91
443 0.91
444 0.91
445 0.91
446 0.91
447 0.91
448 0.91
449 0.91
450 0.91
451 0.91
452 0.91
453 0.91
454 0.91
455 0.91
456 0.91
457 0.91
458 0.91
459 0.91
460 0.9
461 0.9
462 0.89
463 0.88
464 0.87
465 0.85
466 0.85
467 0.82
468 0.77
469 0.73
470 0.64
471 0.61
472 0.58