Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2A9P1C7

Protein Details
Accession A0A2A9P1C7    Localization Confidence High Confidence Score 16.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
15-35EDTSRPSSPPPPKKQSSQSAPHydrophilic
249-268GKAKTAPKTRSKKEEKVFIEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
80-106PRKFEGGRGRGRGRGGDRPPPRGGRRP
254-262APKTRSKKE
273-302FDRPDRGGRGRGRGERGRGGRGRGGARGGR
Subcellular Location(s) cyto 12, cyto_nucl 12, nucl 10, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039764  HABP4/SERBP1  
IPR006861  HABP4_PAIRBP1-bd  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF04774  HABP4_PAI-RBP1  
Amino Acid Sequences MSVATKNPFAILDAEDTSRPSSPPPPKKQSSQSAPARASQKPRGGPASRVGGYYPRGGARQSPRDTNQTQNGVDDPAPEPRKFEGGRGRGRGRGGDRPPPRGGRRPFDRHSQTGKTDSDKKIHQAWGGDDGKQELKAEEAANVDAAAEGANWGTEGAQADWGAGDTAPTDIAGATAEDDKTENKPRREKEEEEDNTLTLEQYLAKQRGMEPIVPKLDNTRKANEGADANIWKDVVQITKNDTTDNYFVGKAKTAPKTRSKKEEKVFIEIDARFDRPDRGGRGRGRGERGRGGRGRGGARGGRQNGSPTQTINVDDQTAFPSLS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.19
3 0.2
4 0.21
5 0.2
6 0.19
7 0.19
8 0.27
9 0.35
10 0.46
11 0.54
12 0.62
13 0.67
14 0.75
15 0.81
16 0.81
17 0.79
18 0.79
19 0.78
20 0.77
21 0.72
22 0.7
23 0.66
24 0.61
25 0.6
26 0.58
27 0.57
28 0.52
29 0.56
30 0.58
31 0.57
32 0.55
33 0.53
34 0.53
35 0.46
36 0.43
37 0.38
38 0.34
39 0.33
40 0.32
41 0.28
42 0.22
43 0.22
44 0.22
45 0.29
46 0.33
47 0.41
48 0.42
49 0.47
50 0.49
51 0.56
52 0.58
53 0.58
54 0.56
55 0.52
56 0.48
57 0.42
58 0.4
59 0.34
60 0.31
61 0.26
62 0.2
63 0.23
64 0.26
65 0.25
66 0.26
67 0.25
68 0.32
69 0.3
70 0.35
71 0.36
72 0.4
73 0.48
74 0.53
75 0.55
76 0.51
77 0.52
78 0.51
79 0.46
80 0.47
81 0.44
82 0.47
83 0.48
84 0.51
85 0.55
86 0.57
87 0.58
88 0.58
89 0.6
90 0.59
91 0.64
92 0.66
93 0.65
94 0.67
95 0.67
96 0.64
97 0.65
98 0.61
99 0.55
100 0.51
101 0.5
102 0.45
103 0.47
104 0.44
105 0.42
106 0.39
107 0.39
108 0.39
109 0.39
110 0.36
111 0.29
112 0.28
113 0.32
114 0.31
115 0.28
116 0.23
117 0.22
118 0.21
119 0.19
120 0.18
121 0.09
122 0.09
123 0.1
124 0.1
125 0.1
126 0.1
127 0.09
128 0.09
129 0.09
130 0.08
131 0.06
132 0.05
133 0.04
134 0.03
135 0.03
136 0.03
137 0.03
138 0.02
139 0.03
140 0.03
141 0.03
142 0.04
143 0.04
144 0.05
145 0.05
146 0.05
147 0.05
148 0.05
149 0.05
150 0.04
151 0.03
152 0.03
153 0.03
154 0.03
155 0.03
156 0.03
157 0.03
158 0.03
159 0.03
160 0.03
161 0.04
162 0.05
163 0.05
164 0.05
165 0.06
166 0.07
167 0.11
168 0.2
169 0.26
170 0.31
171 0.39
172 0.42
173 0.51
174 0.56
175 0.56
176 0.53
177 0.58
178 0.54
179 0.53
180 0.51
181 0.42
182 0.36
183 0.32
184 0.25
185 0.14
186 0.12
187 0.06
188 0.08
189 0.14
190 0.15
191 0.15
192 0.16
193 0.17
194 0.23
195 0.24
196 0.25
197 0.21
198 0.25
199 0.29
200 0.28
201 0.27
202 0.29
203 0.34
204 0.39
205 0.4
206 0.39
207 0.37
208 0.39
209 0.4
210 0.35
211 0.29
212 0.22
213 0.23
214 0.2
215 0.18
216 0.17
217 0.16
218 0.13
219 0.12
220 0.12
221 0.11
222 0.12
223 0.13
224 0.18
225 0.23
226 0.23
227 0.23
228 0.23
229 0.24
230 0.24
231 0.24
232 0.21
233 0.17
234 0.18
235 0.19
236 0.2
237 0.19
238 0.25
239 0.32
240 0.37
241 0.43
242 0.52
243 0.61
244 0.67
245 0.74
246 0.76
247 0.77
248 0.78
249 0.81
250 0.74
251 0.72
252 0.65
253 0.57
254 0.54
255 0.45
256 0.42
257 0.35
258 0.32
259 0.26
260 0.26
261 0.26
262 0.23
263 0.29
264 0.32
265 0.36
266 0.43
267 0.48
268 0.56
269 0.61
270 0.64
271 0.66
272 0.66
273 0.65
274 0.66
275 0.64
276 0.65
277 0.61
278 0.59
279 0.55
280 0.54
281 0.51
282 0.45
283 0.47
284 0.42
285 0.44
286 0.48
287 0.47
288 0.43
289 0.42
290 0.44
291 0.43
292 0.43
293 0.39
294 0.31
295 0.31
296 0.31
297 0.31
298 0.29
299 0.26
300 0.24
301 0.22
302 0.22
303 0.21