FuNGI

A0A2A9NF97

Protein Details

Accession

A0A2A9NF97

Localization Confidence

Low

Confidence Score

7.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
5-29	QMADTEPNDKQKRRRLNVMVARFID	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 13, cyto_nucl 11.333, cyto 8.5, mito_nucl 8.333, pero 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR005100 NGN-domain IPR036735 NGN_dom_sf IPR039659 SPT5
Gene Ontology	GO:0032784 P:regulation of DNA-templated transcription elongation GO:0006357 P:regulation of transcription by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF03439 Spt5-NGN

Amino Acid Sequences

MTAGQMADTEPNDKQKRRRLNVMVARFIDAEAIENNEGEHNESDSDSLFDDGFIDDAEIKEGLHPVTLPTKIVHNESSSQEPQKTALESVVARWEQAATAVRDGAPYGTLSEGKVHENVEPLDMSRLCMEPTIHDIPLWRVHVQTSQEYYTLQVIHDRLLKHSHLAVAAVVSPHVQGSILVESPNLANVRDLCRDISSVIHSRDISLVPLDERVHWLETTRMRQVNEPRIPDWRRLRSTLFLKSTNAICGLDRFGGSLALVCGWDKLQPEDGLVLNVKILPRVYQPPPWAVYDSNIIPPKQSRKRMERLVTPFAWPGHPRQSEYEPEFFWRPNKNITLEDNGEGNYIIDHIPYAIPFVHFSDVPEAYFEDSPPTPTYHELLLFHKGVLHDFTPIPRPPYPRDLVPFLEDSWDRYLSTPLDTGHIVRICEGQQQTALGMIISVEFECCDVQLLDTNVTIKLPHSHLRRHWKLGDGARVVAKMSPHYTQVGWVIGIDHRRVTLIDRDTKAHFEVHTWQIEPSEIVETIRPITPPCDNWKVGDWVQTDQSLSGQVLQQGRITNIDSGFIALFDPDSQTSCEVYPWQIEPIERLQQSDVSLSQEQENPGRFPGGDPYRHWVGQRVLILGRNEDKGLRGRVKQTATRGLVDVELDLGARIVRKHISQLDTHYGRHLFSGSPLTTPWIWSDIDNVYASESRTPLPTPDQQGESNHTRDLSSHTTGSSGPENEGQAKEVNPIEKILIRYGDQELPHDWPLDPALENKRIWVYVHNSSPNPVLNEAGYQRGAYDKDRGMIMETQGIHSIKVHISRRRWVIDIPARFLFPEQPTSAKQTVVVMEGEHKGCVFNTRKSDVPDHFVLVPMRGHRLYYTHALIN

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.51
2	0.58
3	0.68
4	0.72
5	0.8
6	0.79
7	0.81
8	0.85
9	0.84
10	0.82
11	0.73
12	0.68
13	0.57
14	0.48
15	0.39
16	0.28
17	0.21
18	0.14
19	0.16
20	0.14
21	0.13
22	0.14
23	0.15
24	0.15
25	0.16
26	0.16
27	0.14
28	0.14
29	0.15
30	0.15
31	0.14
32	0.14
33	0.12
34	0.12
35	0.1
36	0.09
37	0.1
38	0.09
39	0.09
40	0.08
41	0.08
42	0.08
43	0.08
44	0.1
45	0.09
46	0.09
47	0.1
48	0.12
49	0.11
50	0.11
51	0.11
52	0.12
53	0.18
54	0.18
55	0.18
56	0.18
57	0.23
58	0.26
59	0.3
60	0.3
61	0.28
62	0.31
63	0.34
64	0.4
65	0.4
66	0.42
67	0.4
68	0.38
69	0.36
70	0.36
71	0.34
72	0.27
73	0.23
74	0.22
75	0.2
76	0.21
77	0.27
78	0.23
79	0.21
80	0.2
81	0.19
82	0.16
83	0.19
84	0.22
85	0.16
86	0.18
87	0.19
88	0.19
89	0.19
90	0.19
91	0.16
92	0.12
93	0.1
94	0.09
95	0.1
96	0.11
97	0.11
98	0.15
99	0.16
100	0.17
101	0.19
102	0.19
103	0.18
104	0.21
105	0.21
106	0.19
107	0.18
108	0.17
109	0.21
110	0.2
111	0.2
112	0.18
113	0.18
114	0.16
115	0.18
116	0.18
117	0.14
118	0.21
119	0.23
120	0.21
121	0.21
122	0.22
123	0.24
124	0.29
125	0.31
126	0.24
127	0.21
128	0.23
129	0.28
130	0.3
131	0.32
132	0.3
133	0.28
134	0.28
135	0.27
136	0.27
137	0.25
138	0.22
139	0.17
140	0.17
141	0.16
142	0.19
143	0.23
144	0.22
145	0.22
146	0.26
147	0.26
148	0.24
149	0.25
150	0.24
151	0.2
152	0.2
153	0.17
154	0.13
155	0.13
156	0.11
157	0.09
158	0.08
159	0.08
160	0.07
161	0.07
162	0.06
163	0.05
164	0.07
165	0.09
166	0.1
167	0.1
168	0.1
169	0.1
170	0.1
171	0.14
172	0.12
173	0.1
174	0.11
175	0.14
176	0.18
177	0.2
178	0.22
179	0.19
180	0.2
181	0.21
182	0.2
183	0.19
184	0.2
185	0.23
186	0.24
187	0.26
188	0.25
189	0.25
190	0.26
191	0.25
192	0.2
193	0.15
194	0.14
195	0.11
196	0.14
197	0.14
198	0.13
199	0.15
200	0.16
201	0.17
202	0.16
203	0.17
204	0.19
205	0.24
206	0.29
207	0.33
208	0.34
209	0.33
210	0.4
211	0.48
212	0.53
213	0.53
214	0.52
215	0.47
216	0.53
217	0.54
218	0.56
219	0.57
220	0.56
221	0.54
222	0.54
223	0.56
224	0.54
225	0.58
226	0.58
227	0.53
228	0.46
229	0.43
230	0.43
231	0.4
232	0.34
233	0.29
234	0.21
235	0.17
236	0.16
237	0.16
238	0.14
239	0.12
240	0.11
241	0.1
242	0.1
243	0.09
244	0.08
245	0.07
246	0.06
247	0.06
248	0.06
249	0.06
250	0.06
251	0.08
252	0.09
253	0.1
254	0.13
255	0.13
256	0.14
257	0.15
258	0.15
259	0.14
260	0.14
261	0.12
262	0.09
263	0.1
264	0.1
265	0.09
266	0.09
267	0.09
268	0.12
269	0.18
270	0.21
271	0.25
272	0.27
273	0.3
274	0.32
275	0.32
276	0.31
277	0.25
278	0.24
279	0.22
280	0.21
281	0.24
282	0.25
283	0.23
284	0.22
285	0.26
286	0.35
287	0.4
288	0.48
289	0.5
290	0.55
291	0.64
292	0.72
293	0.73
294	0.72
295	0.7
296	0.68
297	0.61
298	0.54
299	0.48
300	0.39
301	0.37
302	0.29
303	0.26
304	0.29
305	0.29
306	0.29
307	0.31
308	0.34
309	0.37
310	0.4
311	0.38
312	0.3
313	0.31
314	0.31
315	0.29
316	0.3
317	0.29
318	0.27
319	0.29
320	0.32
321	0.31
322	0.32
323	0.34
324	0.35
325	0.31
326	0.3
327	0.25
328	0.22
329	0.2
330	0.16
331	0.13
332	0.07
333	0.06
334	0.05
335	0.04
336	0.04
337	0.04
338	0.05
339	0.04
340	0.06
341	0.05
342	0.06
343	0.07
344	0.08
345	0.09
346	0.09
347	0.1
348	0.12
349	0.12
350	0.12
351	0.12
352	0.11
353	0.12
354	0.12
355	0.11
356	0.1
357	0.1
358	0.12
359	0.13
360	0.14
361	0.13
362	0.14
363	0.15
364	0.13
365	0.15
366	0.14
367	0.15
368	0.18
369	0.17
370	0.15
371	0.16
372	0.15
373	0.14
374	0.14
375	0.12
376	0.1
377	0.11
378	0.12
379	0.16
380	0.17
381	0.2
382	0.22
383	0.25
384	0.27
385	0.33
386	0.34
387	0.32
388	0.34
389	0.33
390	0.31
391	0.3
392	0.27
393	0.2
394	0.21
395	0.18
396	0.17
397	0.16
398	0.15
399	0.13
400	0.13
401	0.15
402	0.12
403	0.13
404	0.12
405	0.1
406	0.11
407	0.11
408	0.11
409	0.13
410	0.14
411	0.13
412	0.12
413	0.13
414	0.12
415	0.16
416	0.16
417	0.13
418	0.11
419	0.12
420	0.11
421	0.1
422	0.09
423	0.04
424	0.04
425	0.04
426	0.03
427	0.03
428	0.03
429	0.03
430	0.03
431	0.03
432	0.03
433	0.03
434	0.04
435	0.04
436	0.04
437	0.07
438	0.07
439	0.08
440	0.08
441	0.09
442	0.08
443	0.08
444	0.08
445	0.06
446	0.09
447	0.11
448	0.17
449	0.2
450	0.25
451	0.33
452	0.43
453	0.47
454	0.5
455	0.49
456	0.46
457	0.49
458	0.48
459	0.48
460	0.38
461	0.35
462	0.3
463	0.28
464	0.25
465	0.2
466	0.16
467	0.1
468	0.12
469	0.12
470	0.12
471	0.13
472	0.13
473	0.13
474	0.14
475	0.13
476	0.1
477	0.09
478	0.09
479	0.09
480	0.11
481	0.11
482	0.09
483	0.09
484	0.09
485	0.1
486	0.11
487	0.16
488	0.19
489	0.25
490	0.26
491	0.28
492	0.29
493	0.31
494	0.3
495	0.25
496	0.2
497	0.15
498	0.2
499	0.21
500	0.21
501	0.2
502	0.19
503	0.18
504	0.18
505	0.16
506	0.12
507	0.09
508	0.08
509	0.08
510	0.08
511	0.08
512	0.09
513	0.1
514	0.1
515	0.09
516	0.11
517	0.13
518	0.15
519	0.21
520	0.26
521	0.25
522	0.26
523	0.29
524	0.31
525	0.3
526	0.33
527	0.28
528	0.24
529	0.24
530	0.23
531	0.21
532	0.16
533	0.15
534	0.1
535	0.09
536	0.08
537	0.08
538	0.11
539	0.12
540	0.13
541	0.15
542	0.15
543	0.15
544	0.16
545	0.16
546	0.14
547	0.13
548	0.13
549	0.11
550	0.11
551	0.1
552	0.08
553	0.07
554	0.05
555	0.05
556	0.05
557	0.06
558	0.06
559	0.07
560	0.08
561	0.09
562	0.1
563	0.1
564	0.1
565	0.1
566	0.11
567	0.12
568	0.12
569	0.13
570	0.13
571	0.13
572	0.15
573	0.18
574	0.24
575	0.22
576	0.22
577	0.21
578	0.21
579	0.22
580	0.21
581	0.18
582	0.15
583	0.16
584	0.16
585	0.17
586	0.18
587	0.19
588	0.22
589	0.23
590	0.19
591	0.19
592	0.19
593	0.17
594	0.15
595	0.22
596	0.24
597	0.25
598	0.26
599	0.31
600	0.34
601	0.36
602	0.35
603	0.32
604	0.29
605	0.31
606	0.31
607	0.27
608	0.25
609	0.28
610	0.28
611	0.25
612	0.25
613	0.21
614	0.2
615	0.18
616	0.19
617	0.2
618	0.26
619	0.29
620	0.3
621	0.33
622	0.39
623	0.44
624	0.46
625	0.46
626	0.49
627	0.46
628	0.44
629	0.4
630	0.34
631	0.3
632	0.26
633	0.2
634	0.11
635	0.08
636	0.07
637	0.06
638	0.05
639	0.05
640	0.06
641	0.06
642	0.08
643	0.1
644	0.11
645	0.17
646	0.22
647	0.25
648	0.26
649	0.31
650	0.39
651	0.39
652	0.39
653	0.38
654	0.33
655	0.31
656	0.29
657	0.25
658	0.15
659	0.15
660	0.21
661	0.18
662	0.17
663	0.17
664	0.2
665	0.19
666	0.19
667	0.18
668	0.14
669	0.14
670	0.13
671	0.17
672	0.14
673	0.16
674	0.16
675	0.14
676	0.14
677	0.15
678	0.16
679	0.15
680	0.15
681	0.13
682	0.15
683	0.16
684	0.16
685	0.21
686	0.26
687	0.3
688	0.33
689	0.35
690	0.36
691	0.38
692	0.42
693	0.42
694	0.38
695	0.34
696	0.3
697	0.27
698	0.25
699	0.28
700	0.28
701	0.25
702	0.24
703	0.23
704	0.24
705	0.24
706	0.26
707	0.24
708	0.19
709	0.18
710	0.19
711	0.21
712	0.24
713	0.24
714	0.22
715	0.2
716	0.19
717	0.21
718	0.22
719	0.21
720	0.19
721	0.19
722	0.19
723	0.21
724	0.22
725	0.21
726	0.21
727	0.2
728	0.22
729	0.25
730	0.27
731	0.25
732	0.25
733	0.24
734	0.27
735	0.27
736	0.26
737	0.22
738	0.19
739	0.2
740	0.19
741	0.18
742	0.2
743	0.25
744	0.29
745	0.29
746	0.3
747	0.31
748	0.3
749	0.3
750	0.31
751	0.3
752	0.32
753	0.4
754	0.43
755	0.41
756	0.43
757	0.45
758	0.42
759	0.39
760	0.32
761	0.26
762	0.2
763	0.24
764	0.23
765	0.23
766	0.2
767	0.17
768	0.17
769	0.19
770	0.21
771	0.19
772	0.25
773	0.23
774	0.24
775	0.25
776	0.25
777	0.25
778	0.26
779	0.25
780	0.24
781	0.23
782	0.22
783	0.26
784	0.26
785	0.23
786	0.2
787	0.22
788	0.2
789	0.28
790	0.35
791	0.38
792	0.43
793	0.51
794	0.58
795	0.59
796	0.58
797	0.52
798	0.55
799	0.56
800	0.56
801	0.53
802	0.48
803	0.44
804	0.42
805	0.41
806	0.37
807	0.31
808	0.31
809	0.28
810	0.3
811	0.33
812	0.4
813	0.4
814	0.34
815	0.31
816	0.29
817	0.28
818	0.26
819	0.24
820	0.17
821	0.19
822	0.24
823	0.23
824	0.2
825	0.19
826	0.17
827	0.17
828	0.25
829	0.27
830	0.3
831	0.36
832	0.4
833	0.45
834	0.5
835	0.57
836	0.53
837	0.54
838	0.49
839	0.45
840	0.42
841	0.42
842	0.37
843	0.32
844	0.31
845	0.27
846	0.3
847	0.27
848	0.28
849	0.26
850	0.27
851	0.3
852	0.33

A0A2A9NF97

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer