Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

Q7SH89

Protein Details
Accession Q7SH89    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
91-118NAPSTTFPKGLRRKDKKRTGTFDQNGNNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
100-107GLRRKDKK
Subcellular Location(s) nucl 14, mito 9.5, cyto_mito 6.5, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG ncr:NCU01917  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MADIKRMMPRPSSMARNAVSKMLEKGRHNMVNSSIQSVDSEDHEGHGGVSLLDDDSQEDFPVQPVQSPNAVMAQDIDATPKASVVQKKNGNAPSTTFPKGLRRKDKKRTGTFDQNGNNGNHGREQNGSTQSHTQSCQQGTSTTAGVAPFDHQASMVYMVQYPQATQSFQQGQPSPALSNDISLNPTNEVMTGGQPVWPSSNNHGINNQQAGIIYQHMGISQLQNGQGFVPNRPGGHPGISSPAGQTGYAPMGLPYPQHQMAPITDPNGLTPLSHPSYIPTNGSDGPLAFAQSPNAQPVAGVTRLAPGQLYYAYGPMFGGPGSNMQPQGSQQTGDASRTEHNQTVNDPQTELGQSQATKTPSHTKEIFNQTEPRNFAPRAGSLPSQPPPPFMIDTAHALNTHGTQAGIVTGSGIDPFSSAGNDERAIVRVPNHHSGYETPNENYAVMSHMPISEPPPPEVRAVRSEQLNRLTVLGPYGLPTAEVALHPDNFPFIESCSQASASDAGVVKITNLPYTTTHQEIKALLGRNAKLLTEESVHVIMERINGKTQDAYIEFCSQDDAIRAVQRLNQAAVRTNRPSRIADRPVDVELSGQASMMKDLFPLASGVTWRGAEPIIESPVEGKPWKTFKGFIMIEEMAMLVKLVEMPQRAQYTKSCPQRPYECMISTIRKLPWQKSDCITIHQRWAVYSATIRLIELLRNTIQRRDHDSHIALNQLLLKRLVNTAMLCPGFSVLQKDNIAFTAGMDEMKQREFNQPRFPNLWTHQLSICPRPGVPLDVLEWYIAIIREETTRFVNLKPVSERSEILSKATRMNSNSYFGFLWHEIGFPTGDEYDHMTLKQAMGMELEAIEKCLKRALGYGYQHADHGRVKKLMAA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.51
2 0.49
3 0.51
4 0.49
5 0.46
6 0.41
7 0.36
8 0.38
9 0.39
10 0.44
11 0.41
12 0.46
13 0.51
14 0.54
15 0.54
16 0.51
17 0.47
18 0.49
19 0.48
20 0.45
21 0.37
22 0.31
23 0.3
24 0.28
25 0.24
26 0.17
27 0.19
28 0.16
29 0.16
30 0.17
31 0.16
32 0.14
33 0.14
34 0.12
35 0.08
36 0.08
37 0.08
38 0.07
39 0.08
40 0.08
41 0.08
42 0.1
43 0.11
44 0.11
45 0.11
46 0.11
47 0.12
48 0.17
49 0.16
50 0.18
51 0.2
52 0.22
53 0.24
54 0.24
55 0.24
56 0.23
57 0.22
58 0.18
59 0.17
60 0.15
61 0.14
62 0.14
63 0.15
64 0.12
65 0.13
66 0.13
67 0.12
68 0.13
69 0.18
70 0.27
71 0.31
72 0.4
73 0.46
74 0.5
75 0.58
76 0.62
77 0.58
78 0.52
79 0.49
80 0.47
81 0.46
82 0.46
83 0.39
84 0.36
85 0.44
86 0.52
87 0.58
88 0.62
89 0.67
90 0.74
91 0.83
92 0.91
93 0.91
94 0.92
95 0.9
96 0.88
97 0.89
98 0.84
99 0.82
100 0.76
101 0.71
102 0.65
103 0.58
104 0.52
105 0.43
106 0.38
107 0.35
108 0.31
109 0.28
110 0.25
111 0.27
112 0.29
113 0.34
114 0.33
115 0.31
116 0.36
117 0.38
118 0.38
119 0.38
120 0.36
121 0.37
122 0.37
123 0.36
124 0.31
125 0.28
126 0.27
127 0.28
128 0.23
129 0.16
130 0.16
131 0.14
132 0.13
133 0.13
134 0.12
135 0.12
136 0.12
137 0.11
138 0.1
139 0.1
140 0.12
141 0.14
142 0.14
143 0.12
144 0.12
145 0.13
146 0.15
147 0.14
148 0.13
149 0.14
150 0.15
151 0.15
152 0.15
153 0.22
154 0.27
155 0.28
156 0.34
157 0.33
158 0.33
159 0.34
160 0.35
161 0.28
162 0.22
163 0.25
164 0.18
165 0.17
166 0.17
167 0.16
168 0.17
169 0.18
170 0.18
171 0.15
172 0.16
173 0.14
174 0.12
175 0.13
176 0.1
177 0.1
178 0.11
179 0.1
180 0.12
181 0.12
182 0.12
183 0.13
184 0.15
185 0.17
186 0.2
187 0.29
188 0.3
189 0.31
190 0.33
191 0.34
192 0.36
193 0.35
194 0.31
195 0.21
196 0.19
197 0.18
198 0.16
199 0.15
200 0.11
201 0.09
202 0.09
203 0.09
204 0.1
205 0.1
206 0.1
207 0.1
208 0.12
209 0.13
210 0.13
211 0.14
212 0.13
213 0.18
214 0.18
215 0.17
216 0.21
217 0.21
218 0.22
219 0.23
220 0.25
221 0.22
222 0.23
223 0.22
224 0.16
225 0.2
226 0.2
227 0.2
228 0.17
229 0.18
230 0.16
231 0.15
232 0.15
233 0.11
234 0.11
235 0.11
236 0.11
237 0.08
238 0.08
239 0.09
240 0.1
241 0.1
242 0.15
243 0.15
244 0.15
245 0.16
246 0.16
247 0.17
248 0.22
249 0.21
250 0.17
251 0.18
252 0.18
253 0.17
254 0.17
255 0.16
256 0.11
257 0.1
258 0.15
259 0.15
260 0.16
261 0.15
262 0.16
263 0.21
264 0.22
265 0.22
266 0.17
267 0.18
268 0.18
269 0.19
270 0.17
271 0.13
272 0.13
273 0.12
274 0.12
275 0.09
276 0.08
277 0.09
278 0.11
279 0.12
280 0.12
281 0.12
282 0.1
283 0.1
284 0.11
285 0.13
286 0.11
287 0.1
288 0.09
289 0.11
290 0.11
291 0.11
292 0.1
293 0.06
294 0.07
295 0.07
296 0.08
297 0.07
298 0.08
299 0.08
300 0.08
301 0.08
302 0.07
303 0.07
304 0.05
305 0.05
306 0.04
307 0.07
308 0.09
309 0.11
310 0.12
311 0.12
312 0.12
313 0.13
314 0.16
315 0.15
316 0.12
317 0.11
318 0.15
319 0.15
320 0.16
321 0.16
322 0.14
323 0.15
324 0.18
325 0.2
326 0.18
327 0.18
328 0.18
329 0.2
330 0.25
331 0.28
332 0.25
333 0.23
334 0.2
335 0.21
336 0.2
337 0.18
338 0.12
339 0.1
340 0.1
341 0.11
342 0.15
343 0.15
344 0.15
345 0.17
346 0.26
347 0.26
348 0.32
349 0.33
350 0.31
351 0.38
352 0.47
353 0.47
354 0.4
355 0.45
356 0.42
357 0.44
358 0.44
359 0.38
360 0.34
361 0.32
362 0.3
363 0.26
364 0.24
365 0.22
366 0.23
367 0.21
368 0.18
369 0.22
370 0.22
371 0.25
372 0.24
373 0.23
374 0.22
375 0.23
376 0.22
377 0.18
378 0.18
379 0.14
380 0.16
381 0.16
382 0.15
383 0.12
384 0.12
385 0.11
386 0.1
387 0.1
388 0.07
389 0.06
390 0.05
391 0.05
392 0.05
393 0.05
394 0.04
395 0.03
396 0.03
397 0.03
398 0.03
399 0.03
400 0.03
401 0.03
402 0.04
403 0.04
404 0.04
405 0.04
406 0.05
407 0.06
408 0.07
409 0.07
410 0.07
411 0.08
412 0.09
413 0.09
414 0.09
415 0.13
416 0.17
417 0.23
418 0.23
419 0.23
420 0.23
421 0.25
422 0.27
423 0.25
424 0.23
425 0.17
426 0.17
427 0.18
428 0.17
429 0.14
430 0.11
431 0.09
432 0.08
433 0.08
434 0.07
435 0.07
436 0.07
437 0.07
438 0.1
439 0.13
440 0.14
441 0.15
442 0.17
443 0.18
444 0.2
445 0.21
446 0.21
447 0.2
448 0.22
449 0.23
450 0.25
451 0.26
452 0.28
453 0.3
454 0.28
455 0.25
456 0.23
457 0.21
458 0.17
459 0.15
460 0.11
461 0.08
462 0.07
463 0.08
464 0.06
465 0.05
466 0.05
467 0.05
468 0.05
469 0.05
470 0.07
471 0.08
472 0.09
473 0.09
474 0.09
475 0.09
476 0.08
477 0.09
478 0.07
479 0.07
480 0.08
481 0.09
482 0.1
483 0.1
484 0.11
485 0.1
486 0.1
487 0.1
488 0.08
489 0.1
490 0.09
491 0.09
492 0.09
493 0.08
494 0.08
495 0.1
496 0.1
497 0.08
498 0.08
499 0.09
500 0.11
501 0.15
502 0.18
503 0.19
504 0.2
505 0.19
506 0.2
507 0.19
508 0.2
509 0.21
510 0.2
511 0.2
512 0.23
513 0.23
514 0.23
515 0.23
516 0.21
517 0.17
518 0.16
519 0.14
520 0.12
521 0.12
522 0.11
523 0.12
524 0.11
525 0.1
526 0.1
527 0.09
528 0.1
529 0.12
530 0.11
531 0.13
532 0.14
533 0.14
534 0.14
535 0.14
536 0.14
537 0.13
538 0.14
539 0.14
540 0.17
541 0.16
542 0.15
543 0.16
544 0.13
545 0.13
546 0.11
547 0.1
548 0.09
549 0.11
550 0.12
551 0.11
552 0.14
553 0.17
554 0.17
555 0.17
556 0.18
557 0.17
558 0.23
559 0.26
560 0.28
561 0.31
562 0.33
563 0.35
564 0.36
565 0.38
566 0.37
567 0.42
568 0.44
569 0.41
570 0.4
571 0.39
572 0.37
573 0.34
574 0.29
575 0.21
576 0.15
577 0.14
578 0.1
579 0.08
580 0.08
581 0.07
582 0.08
583 0.08
584 0.07
585 0.05
586 0.06
587 0.06
588 0.06
589 0.06
590 0.05
591 0.06
592 0.06
593 0.07
594 0.08
595 0.09
596 0.08
597 0.09
598 0.09
599 0.08
600 0.1
601 0.11
602 0.11
603 0.11
604 0.11
605 0.12
606 0.13
607 0.15
608 0.14
609 0.13
610 0.17
611 0.22
612 0.26
613 0.26
614 0.27
615 0.26
616 0.35
617 0.34
618 0.29
619 0.31
620 0.28
621 0.25
622 0.23
623 0.21
624 0.11
625 0.11
626 0.1
627 0.03
628 0.03
629 0.03
630 0.04
631 0.07
632 0.09
633 0.1
634 0.16
635 0.2
636 0.21
637 0.23
638 0.26
639 0.31
640 0.39
641 0.48
642 0.49
643 0.48
644 0.55
645 0.59
646 0.6
647 0.58
648 0.56
649 0.47
650 0.44
651 0.46
652 0.44
653 0.39
654 0.41
655 0.36
656 0.36
657 0.4
658 0.42
659 0.47
660 0.46
661 0.48
662 0.45
663 0.52
664 0.47
665 0.48
666 0.5
667 0.43
668 0.46
669 0.44
670 0.41
671 0.33
672 0.34
673 0.28
674 0.23
675 0.21
676 0.17
677 0.17
678 0.17
679 0.17
680 0.16
681 0.16
682 0.17
683 0.16
684 0.17
685 0.17
686 0.23
687 0.25
688 0.29
689 0.33
690 0.35
691 0.43
692 0.44
693 0.46
694 0.47
695 0.47
696 0.46
697 0.43
698 0.41
699 0.32
700 0.28
701 0.28
702 0.23
703 0.23
704 0.19
705 0.18
706 0.17
707 0.18
708 0.18
709 0.16
710 0.16
711 0.16
712 0.21
713 0.2
714 0.19
715 0.18
716 0.17
717 0.16
718 0.15
719 0.19
720 0.14
721 0.21
722 0.22
723 0.22
724 0.22
725 0.22
726 0.23
727 0.17
728 0.16
729 0.12
730 0.11
731 0.11
732 0.11
733 0.13
734 0.13
735 0.15
736 0.17
737 0.17
738 0.27
739 0.35
740 0.41
741 0.5
742 0.52
743 0.56
744 0.57
745 0.57
746 0.55
747 0.51
748 0.55
749 0.47
750 0.45
751 0.4
752 0.44
753 0.47
754 0.44
755 0.45
756 0.37
757 0.33
758 0.34
759 0.34
760 0.31
761 0.28
762 0.24
763 0.21
764 0.21
765 0.22
766 0.18
767 0.16
768 0.12
769 0.13
770 0.11
771 0.1
772 0.08
773 0.09
774 0.12
775 0.14
776 0.16
777 0.16
778 0.2
779 0.21
780 0.21
781 0.29
782 0.28
783 0.33
784 0.36
785 0.38
786 0.4
787 0.41
788 0.41
789 0.38
790 0.43
791 0.37
792 0.36
793 0.38
794 0.34
795 0.38
796 0.42
797 0.43
798 0.38
799 0.45
800 0.44
801 0.42
802 0.4
803 0.37
804 0.32
805 0.27
806 0.3
807 0.24
808 0.24
809 0.19
810 0.19
811 0.16
812 0.18
813 0.17
814 0.12
815 0.14
816 0.11
817 0.11
818 0.11
819 0.16
820 0.18
821 0.19
822 0.19
823 0.18
824 0.19
825 0.19
826 0.2
827 0.16
828 0.14
829 0.14
830 0.14
831 0.12
832 0.11
833 0.12
834 0.1
835 0.11
836 0.14
837 0.14
838 0.14
839 0.18
840 0.18
841 0.18
842 0.23
843 0.27
844 0.33
845 0.37
846 0.44
847 0.44
848 0.44
849 0.45
850 0.41
851 0.39
852 0.36
853 0.37
854 0.36
855 0.34