Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

F5HCY3

Protein Details
Accession F5HCY3    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
413-438IEEQWQKHLKSKKHQKAVKWARRQAEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
422-435KSKKHQKAVKWARR
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 12.5, cyto 5, pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039657  Dimethylallyltransferase  
IPR030666  IPP_transferase_euk  
IPR018022  IPT  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR022755  Znf_C2H2_jaz  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
IPR013087  Znf_C2H2_type  
Gene Ontology GO:0005739  C:mitochondrion  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0052381  F:tRNA dimethylallyltransferase activity  
GO:0006400  P:tRNA modification  
KEGG ncr:NCU10185  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01715  IPPT  
PF12171  zf-C2H2_jaz  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00028  ZINC_FINGER_C2H2_1  
PS50157  ZINC_FINGER_C2H2_2  
Amino Acid Sequences MADPLVVIYGSTGTGKSDLAVELATRFNGEIINVDAMQMYRGLPIITNQLTPEEQRGIPHYLLGNIGLDEEPWSVTSWKREATRIISDIRSRGKLPIVVGGTSYYLDGLLFDEKLVESDPATTEESETAAAKATRDELASQHPILRESAEVMLAKLQEVDPVMAERWHPKDIRKIRNSLEIYLSTGRRASDIYAEQRARKEAKRAEQPPSPWNLLLFWLYAKPDVLNERLDKRVDKMVANGLLDETSSVYDYLQRRLAAGDTVDRTKGIWQSIGFRQFESYLSAVKSTETDTPQAALEKLKQQGIEDTKTATRQYAKYQIRWIARKTIAALQEENLLSNFYLLDSSNISHWHSEVAEKGSSLLAKHLAHQPLPRPEDLSDTAREVLAEQLERSNRPETICNKTCEVCGKEFRIEEQWQKHLKSKKHQKAVKWARRQAEGWPTRGVAKGDKVEEGTDDDVDADDSDGQVPKP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.1
3 0.1
4 0.11
5 0.1
6 0.1
7 0.11
8 0.1
9 0.11
10 0.13
11 0.12
12 0.11
13 0.11
14 0.11
15 0.11
16 0.1
17 0.1
18 0.12
19 0.14
20 0.13
21 0.14
22 0.14
23 0.13
24 0.13
25 0.12
26 0.1
27 0.08
28 0.09
29 0.09
30 0.08
31 0.1
32 0.17
33 0.18
34 0.19
35 0.19
36 0.21
37 0.22
38 0.24
39 0.26
40 0.23
41 0.22
42 0.23
43 0.27
44 0.29
45 0.27
46 0.28
47 0.25
48 0.22
49 0.22
50 0.2
51 0.17
52 0.12
53 0.13
54 0.1
55 0.09
56 0.09
57 0.09
58 0.09
59 0.08
60 0.1
61 0.11
62 0.13
63 0.19
64 0.21
65 0.26
66 0.28
67 0.31
68 0.34
69 0.39
70 0.43
71 0.41
72 0.42
73 0.42
74 0.42
75 0.44
76 0.44
77 0.41
78 0.36
79 0.35
80 0.35
81 0.32
82 0.3
83 0.31
84 0.27
85 0.25
86 0.24
87 0.22
88 0.19
89 0.16
90 0.15
91 0.08
92 0.06
93 0.06
94 0.06
95 0.06
96 0.07
97 0.07
98 0.07
99 0.07
100 0.07
101 0.08
102 0.09
103 0.08
104 0.07
105 0.08
106 0.09
107 0.11
108 0.13
109 0.12
110 0.12
111 0.12
112 0.12
113 0.12
114 0.11
115 0.09
116 0.1
117 0.1
118 0.1
119 0.1
120 0.11
121 0.11
122 0.12
123 0.12
124 0.12
125 0.17
126 0.21
127 0.2
128 0.22
129 0.21
130 0.22
131 0.21
132 0.2
133 0.14
134 0.13
135 0.13
136 0.12
137 0.11
138 0.1
139 0.12
140 0.11
141 0.1
142 0.09
143 0.09
144 0.08
145 0.08
146 0.08
147 0.07
148 0.08
149 0.08
150 0.08
151 0.1
152 0.13
153 0.16
154 0.2
155 0.22
156 0.24
157 0.34
158 0.43
159 0.53
160 0.53
161 0.56
162 0.54
163 0.62
164 0.61
165 0.52
166 0.46
167 0.36
168 0.34
169 0.32
170 0.29
171 0.2
172 0.2
173 0.17
174 0.14
175 0.14
176 0.12
177 0.12
178 0.16
179 0.18
180 0.25
181 0.26
182 0.28
183 0.29
184 0.32
185 0.32
186 0.31
187 0.36
188 0.35
189 0.41
190 0.49
191 0.52
192 0.54
193 0.54
194 0.55
195 0.51
196 0.5
197 0.43
198 0.34
199 0.29
200 0.24
201 0.2
202 0.18
203 0.13
204 0.09
205 0.08
206 0.09
207 0.09
208 0.08
209 0.07
210 0.08
211 0.1
212 0.11
213 0.13
214 0.15
215 0.17
216 0.2
217 0.21
218 0.2
219 0.2
220 0.23
221 0.22
222 0.2
223 0.19
224 0.2
225 0.21
226 0.2
227 0.18
228 0.13
229 0.11
230 0.11
231 0.09
232 0.06
233 0.04
234 0.04
235 0.04
236 0.04
237 0.09
238 0.11
239 0.13
240 0.16
241 0.15
242 0.15
243 0.16
244 0.16
245 0.12
246 0.11
247 0.12
248 0.11
249 0.12
250 0.12
251 0.12
252 0.12
253 0.13
254 0.15
255 0.13
256 0.13
257 0.13
258 0.18
259 0.22
260 0.28
261 0.26
262 0.23
263 0.24
264 0.22
265 0.22
266 0.2
267 0.16
268 0.12
269 0.12
270 0.13
271 0.12
272 0.11
273 0.11
274 0.1
275 0.14
276 0.13
277 0.14
278 0.14
279 0.15
280 0.15
281 0.16
282 0.14
283 0.12
284 0.13
285 0.17
286 0.19
287 0.2
288 0.19
289 0.19
290 0.25
291 0.28
292 0.28
293 0.23
294 0.24
295 0.23
296 0.25
297 0.25
298 0.21
299 0.21
300 0.21
301 0.26
302 0.34
303 0.37
304 0.38
305 0.44
306 0.49
307 0.51
308 0.55
309 0.52
310 0.5
311 0.47
312 0.45
313 0.42
314 0.4
315 0.37
316 0.34
317 0.32
318 0.24
319 0.27
320 0.26
321 0.23
322 0.18
323 0.14
324 0.12
325 0.11
326 0.1
327 0.05
328 0.06
329 0.06
330 0.07
331 0.07
332 0.08
333 0.09
334 0.11
335 0.12
336 0.12
337 0.12
338 0.12
339 0.12
340 0.12
341 0.14
342 0.16
343 0.15
344 0.15
345 0.15
346 0.15
347 0.15
348 0.14
349 0.13
350 0.15
351 0.15
352 0.18
353 0.24
354 0.26
355 0.28
356 0.32
357 0.38
358 0.42
359 0.45
360 0.43
361 0.39
362 0.36
363 0.39
364 0.39
365 0.35
366 0.28
367 0.27
368 0.27
369 0.24
370 0.23
371 0.18
372 0.16
373 0.15
374 0.14
375 0.13
376 0.17
377 0.2
378 0.22
379 0.25
380 0.25
381 0.25
382 0.26
383 0.33
384 0.33
385 0.41
386 0.45
387 0.45
388 0.46
389 0.45
390 0.46
391 0.46
392 0.46
393 0.42
394 0.43
395 0.44
396 0.46
397 0.45
398 0.46
399 0.44
400 0.46
401 0.48
402 0.47
403 0.52
404 0.53
405 0.55
406 0.6
407 0.61
408 0.64
409 0.66
410 0.72
411 0.73
412 0.77
413 0.8
414 0.81
415 0.84
416 0.87
417 0.86
418 0.85
419 0.83
420 0.78
421 0.78
422 0.71
423 0.68
424 0.67
425 0.62
426 0.55
427 0.51
428 0.46
429 0.42
430 0.45
431 0.4
432 0.34
433 0.35
434 0.38
435 0.37
436 0.38
437 0.37
438 0.34
439 0.33
440 0.31
441 0.26
442 0.2
443 0.18
444 0.15
445 0.14
446 0.14
447 0.13
448 0.1
449 0.08
450 0.08
451 0.11