Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

V5INT4

Protein Details
Accession V5INT4    Localization Confidence High Confidence Score 15.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
149-172SSEPTAKRPKTKGNKKKTEKLIVEHydrophilic
209-231FSFKTAPKERQRPPKLTQKRSLTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
131-166KEKAKAEAKEEKKRAADSSSEPTAKRPKTKGNKKKT
Subcellular Location(s) nucl 18.5, mito_nucl 10, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011082  Exosome-assoc_fac/DNA_repair  
IPR007146  Sas10/Utp3/C1D  
Gene Ontology GO:0000178  C:exosome (RNase complex)  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000460  P:maturation of 5.8S rRNA  
GO:0010468  P:regulation of gene expression  
KEGG ncr:NCU16328  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04000  Sas10_Utp3  
Amino Acid Sequences MDVPDITPSLEKLNVDLDQLEAALKPVLGDVGDVSSKLPLLDKAKLYVMVTYAIESILFSSLRLNGVDAKEHAIFTELTRVRQYFEKIQNIENPPQEREQTVNKEAAARFIRSDLADDEAIKQKLTELIAKEKAKAEAKEEKKRAADSSSEPTAKRPKTKGNKKKTEKLIVEAPKDEICGYNPNPLTGGHAPYKPQQHDALSPSIGFQFSFKTAPKERQRPPKLTQKRSLTGENRGPSSELSSRLSGPRPAREA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.19
3 0.18
4 0.16
5 0.13
6 0.13
7 0.13
8 0.08
9 0.09
10 0.08
11 0.07
12 0.07
13 0.06
14 0.07
15 0.06
16 0.06
17 0.06
18 0.08
19 0.08
20 0.08
21 0.09
22 0.09
23 0.09
24 0.09
25 0.1
26 0.12
27 0.16
28 0.21
29 0.23
30 0.24
31 0.26
32 0.28
33 0.27
34 0.23
35 0.2
36 0.16
37 0.15
38 0.13
39 0.12
40 0.1
41 0.09
42 0.08
43 0.08
44 0.07
45 0.07
46 0.06
47 0.07
48 0.09
49 0.1
50 0.1
51 0.1
52 0.13
53 0.14
54 0.16
55 0.15
56 0.18
57 0.17
58 0.17
59 0.16
60 0.14
61 0.13
62 0.11
63 0.2
64 0.18
65 0.19
66 0.22
67 0.22
68 0.22
69 0.25
70 0.29
71 0.28
72 0.34
73 0.4
74 0.39
75 0.42
76 0.47
77 0.48
78 0.49
79 0.45
80 0.4
81 0.35
82 0.35
83 0.33
84 0.27
85 0.26
86 0.28
87 0.29
88 0.28
89 0.28
90 0.26
91 0.29
92 0.28
93 0.31
94 0.27
95 0.22
96 0.2
97 0.19
98 0.2
99 0.16
100 0.17
101 0.11
102 0.12
103 0.11
104 0.11
105 0.12
106 0.16
107 0.16
108 0.15
109 0.14
110 0.12
111 0.13
112 0.14
113 0.15
114 0.12
115 0.16
116 0.23
117 0.24
118 0.25
119 0.25
120 0.28
121 0.29
122 0.28
123 0.28
124 0.31
125 0.38
126 0.46
127 0.47
128 0.47
129 0.45
130 0.46
131 0.43
132 0.35
133 0.31
134 0.25
135 0.29
136 0.29
137 0.29
138 0.28
139 0.31
140 0.37
141 0.38
142 0.4
143 0.39
144 0.45
145 0.54
146 0.65
147 0.71
148 0.74
149 0.81
150 0.83
151 0.88
152 0.87
153 0.86
154 0.76
155 0.71
156 0.69
157 0.64
158 0.59
159 0.5
160 0.43
161 0.33
162 0.32
163 0.28
164 0.19
165 0.14
166 0.18
167 0.18
168 0.24
169 0.23
170 0.23
171 0.24
172 0.23
173 0.27
174 0.23
175 0.26
176 0.22
177 0.23
178 0.25
179 0.3
180 0.38
181 0.34
182 0.35
183 0.34
184 0.34
185 0.37
186 0.38
187 0.37
188 0.3
189 0.27
190 0.25
191 0.22
192 0.2
193 0.15
194 0.12
195 0.11
196 0.12
197 0.16
198 0.17
199 0.23
200 0.28
201 0.38
202 0.48
203 0.55
204 0.62
205 0.7
206 0.77
207 0.77
208 0.79
209 0.8
210 0.81
211 0.81
212 0.81
213 0.79
214 0.78
215 0.76
216 0.79
217 0.73
218 0.71
219 0.7
220 0.65
221 0.58
222 0.52
223 0.48
224 0.39
225 0.4
226 0.35
227 0.3
228 0.29
229 0.29
230 0.31
231 0.34
232 0.37
233 0.39
234 0.41