Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

Q7SHW0

Protein Details
Accession Q7SHW0    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
609-630EFDQIHKLNHHKRYHERPHECTBasic
640-663TKTHLDRHINDKHKKTRQFHCTVPHydrophilic
666-694PWSRQGGRSFPRKDNWRRHMINKHQITPLHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) extr 12, mito 8, nucl 4, cyto_mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
IPR013087  Znf_C2H2_type  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0000981  F:DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific  
GO:0043565  F:sequence-specific DNA binding  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG ncr:NCU00694  -  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00028  ZINC_FINGER_C2H2_1  
PS50157  ZINC_FINGER_C2H2_2  
Amino Acid Sequences MAASLSARAVLTPRGSSLSGGAIAGAVVGSCIGFFLILLCLFPFVVRAWRRRAEKHGDIGHAEKGQAPGGPIFHNSPGSTPKRLSGEGEGYAPDTPPPGLASPAPFIPGDGHHPDQRAASHHQSQHTPALPRGVGIQQGLPSSISPPFQPPSPTTSATASFQRDQPGPDSTRTRVASIATTEAESNRDLSLDDSHGLSPPTHQVPPAVSPGGITEEPETFERPTQRHSFPHLPESIRNFIYRRQSGNSRRDSKRSTLGGTAGTRSPSLLTTTDYPVPTHQPEPVPPVFEVDTEAPGAAYEYYHGHPYLNSTSQPYPDDSSAPPPPQPTTLPTTLLRQDTLLASWEIQQGINRTDSLPPTTIVSDLPSPCVDLTVGPTASPMEMMRPTNQAESAWAVNQEIIKLENTPPAPAVSAFSPQTIPAEFAYSQQMQSPQEQYGPEPQYSEYTHVPEIQQNGQDFDLDSAALYPNDGFGLHDMSDISTPPPLSESSRQNTPSTRLTYSPSPRPDFDQNTNFAPLMVPNSPANFSSSTGGFSSNQGMSPGALSVNDYSSSQGMSPGGLLVNDYGAQVMYPQGLSLSSIPQSGMSPTTPSSSGASPRVFACDQCHREFDQIHKLNHHKRYHERPHECTHPGCTMRFGTKTHLDRHINDKHKKTRQFHCTVPECPWSRQGGRSFPRKDNWRRHMINKHQITPLQEPIEYNDVAMGDA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.21
3 0.22
4 0.21
5 0.19
6 0.17
7 0.16
8 0.14
9 0.1
10 0.09
11 0.09
12 0.07
13 0.04
14 0.03
15 0.03
16 0.03
17 0.03
18 0.03
19 0.03
20 0.03
21 0.03
22 0.04
23 0.07
24 0.07
25 0.07
26 0.08
27 0.08
28 0.09
29 0.09
30 0.09
31 0.08
32 0.17
33 0.23
34 0.3
35 0.37
36 0.46
37 0.52
38 0.58
39 0.66
40 0.66
41 0.68
42 0.71
43 0.7
44 0.65
45 0.62
46 0.58
47 0.54
48 0.45
49 0.38
50 0.31
51 0.26
52 0.23
53 0.21
54 0.2
55 0.17
56 0.17
57 0.19
58 0.18
59 0.2
60 0.21
61 0.23
62 0.22
63 0.23
64 0.3
65 0.33
66 0.35
67 0.34
68 0.36
69 0.38
70 0.39
71 0.4
72 0.37
73 0.37
74 0.34
75 0.34
76 0.29
77 0.26
78 0.24
79 0.21
80 0.15
81 0.12
82 0.1
83 0.1
84 0.11
85 0.11
86 0.12
87 0.14
88 0.16
89 0.17
90 0.17
91 0.19
92 0.16
93 0.16
94 0.15
95 0.16
96 0.19
97 0.23
98 0.26
99 0.28
100 0.3
101 0.3
102 0.3
103 0.31
104 0.29
105 0.3
106 0.34
107 0.38
108 0.41
109 0.44
110 0.45
111 0.47
112 0.49
113 0.47
114 0.43
115 0.37
116 0.38
117 0.34
118 0.31
119 0.3
120 0.25
121 0.22
122 0.2
123 0.2
124 0.16
125 0.17
126 0.17
127 0.15
128 0.13
129 0.13
130 0.14
131 0.13
132 0.12
133 0.16
134 0.18
135 0.2
136 0.23
137 0.23
138 0.28
139 0.32
140 0.33
141 0.3
142 0.31
143 0.31
144 0.3
145 0.34
146 0.31
147 0.29
148 0.29
149 0.31
150 0.3
151 0.3
152 0.3
153 0.32
154 0.3
155 0.33
156 0.35
157 0.33
158 0.39
159 0.38
160 0.36
161 0.31
162 0.3
163 0.27
164 0.24
165 0.24
166 0.17
167 0.17
168 0.16
169 0.15
170 0.16
171 0.13
172 0.13
173 0.1
174 0.1
175 0.09
176 0.1
177 0.12
178 0.12
179 0.12
180 0.12
181 0.12
182 0.13
183 0.14
184 0.13
185 0.12
186 0.15
187 0.18
188 0.17
189 0.17
190 0.17
191 0.19
192 0.21
193 0.23
194 0.19
195 0.15
196 0.15
197 0.15
198 0.18
199 0.16
200 0.14
201 0.12
202 0.12
203 0.14
204 0.15
205 0.16
206 0.13
207 0.16
208 0.2
209 0.2
210 0.25
211 0.3
212 0.33
213 0.35
214 0.42
215 0.47
216 0.45
217 0.5
218 0.49
219 0.45
220 0.45
221 0.47
222 0.44
223 0.36
224 0.36
225 0.31
226 0.31
227 0.38
228 0.37
229 0.35
230 0.35
231 0.44
232 0.51
233 0.58
234 0.63
235 0.63
236 0.63
237 0.67
238 0.67
239 0.62
240 0.61
241 0.54
242 0.47
243 0.4
244 0.38
245 0.35
246 0.31
247 0.29
248 0.22
249 0.2
250 0.17
251 0.15
252 0.14
253 0.1
254 0.12
255 0.1
256 0.11
257 0.13
258 0.16
259 0.19
260 0.19
261 0.19
262 0.18
263 0.22
264 0.22
265 0.21
266 0.21
267 0.19
268 0.2
269 0.26
270 0.25
271 0.24
272 0.21
273 0.23
274 0.2
275 0.18
276 0.19
277 0.13
278 0.13
279 0.11
280 0.11
281 0.08
282 0.07
283 0.08
284 0.05
285 0.04
286 0.04
287 0.06
288 0.07
289 0.09
290 0.09
291 0.09
292 0.09
293 0.12
294 0.15
295 0.14
296 0.14
297 0.17
298 0.18
299 0.2
300 0.21
301 0.19
302 0.18
303 0.17
304 0.19
305 0.16
306 0.2
307 0.21
308 0.21
309 0.21
310 0.2
311 0.2
312 0.2
313 0.2
314 0.18
315 0.2
316 0.2
317 0.22
318 0.22
319 0.24
320 0.25
321 0.25
322 0.22
323 0.17
324 0.16
325 0.14
326 0.13
327 0.11
328 0.08
329 0.08
330 0.09
331 0.1
332 0.09
333 0.09
334 0.1
335 0.1
336 0.11
337 0.12
338 0.11
339 0.1
340 0.12
341 0.13
342 0.13
343 0.12
344 0.11
345 0.12
346 0.12
347 0.11
348 0.1
349 0.1
350 0.11
351 0.11
352 0.12
353 0.11
354 0.11
355 0.1
356 0.1
357 0.09
358 0.06
359 0.08
360 0.1
361 0.1
362 0.09
363 0.09
364 0.09
365 0.09
366 0.09
367 0.07
368 0.06
369 0.08
370 0.09
371 0.11
372 0.13
373 0.14
374 0.14
375 0.15
376 0.13
377 0.12
378 0.13
379 0.12
380 0.1
381 0.09
382 0.09
383 0.09
384 0.09
385 0.09
386 0.07
387 0.07
388 0.07
389 0.08
390 0.09
391 0.12
392 0.12
393 0.13
394 0.13
395 0.12
396 0.12
397 0.11
398 0.11
399 0.08
400 0.11
401 0.11
402 0.11
403 0.11
404 0.1
405 0.11
406 0.1
407 0.11
408 0.08
409 0.11
410 0.11
411 0.12
412 0.16
413 0.15
414 0.15
415 0.16
416 0.18
417 0.16
418 0.19
419 0.2
420 0.16
421 0.18
422 0.18
423 0.18
424 0.23
425 0.24
426 0.22
427 0.21
428 0.21
429 0.22
430 0.22
431 0.25
432 0.18
433 0.18
434 0.19
435 0.19
436 0.19
437 0.19
438 0.21
439 0.2
440 0.22
441 0.2
442 0.2
443 0.19
444 0.18
445 0.16
446 0.13
447 0.11
448 0.07
449 0.07
450 0.06
451 0.07
452 0.06
453 0.06
454 0.05
455 0.05
456 0.05
457 0.05
458 0.05
459 0.05
460 0.07
461 0.07
462 0.08
463 0.08
464 0.08
465 0.09
466 0.09
467 0.09
468 0.08
469 0.08
470 0.08
471 0.09
472 0.1
473 0.14
474 0.19
475 0.26
476 0.28
477 0.34
478 0.37
479 0.38
480 0.39
481 0.39
482 0.4
483 0.37
484 0.36
485 0.31
486 0.33
487 0.39
488 0.43
489 0.47
490 0.47
491 0.47
492 0.46
493 0.5
494 0.53
495 0.52
496 0.53
497 0.5
498 0.46
499 0.44
500 0.45
501 0.39
502 0.31
503 0.25
504 0.18
505 0.17
506 0.15
507 0.14
508 0.13
509 0.15
510 0.16
511 0.16
512 0.18
513 0.15
514 0.16
515 0.16
516 0.15
517 0.15
518 0.15
519 0.17
520 0.15
521 0.15
522 0.17
523 0.16
524 0.16
525 0.14
526 0.14
527 0.12
528 0.12
529 0.11
530 0.07
531 0.07
532 0.08
533 0.08
534 0.09
535 0.09
536 0.09
537 0.1
538 0.1
539 0.11
540 0.1
541 0.1
542 0.09
543 0.08
544 0.08
545 0.08
546 0.08
547 0.07
548 0.07
549 0.06
550 0.06
551 0.07
552 0.06
553 0.06
554 0.05
555 0.05
556 0.05
557 0.06
558 0.06
559 0.05
560 0.05
561 0.05
562 0.06
563 0.07
564 0.08
565 0.1
566 0.1
567 0.11
568 0.11
569 0.12
570 0.12
571 0.12
572 0.13
573 0.12
574 0.13
575 0.14
576 0.16
577 0.16
578 0.17
579 0.18
580 0.19
581 0.23
582 0.26
583 0.26
584 0.25
585 0.25
586 0.29
587 0.27
588 0.26
589 0.28
590 0.33
591 0.37
592 0.39
593 0.42
594 0.38
595 0.43
596 0.44
597 0.44
598 0.45
599 0.46
600 0.46
601 0.51
602 0.58
603 0.62
604 0.69
605 0.7
606 0.67
607 0.69
608 0.77
609 0.81
610 0.82
611 0.81
612 0.79
613 0.8
614 0.8
615 0.74
616 0.66
617 0.6
618 0.57
619 0.52
620 0.46
621 0.43
622 0.38
623 0.4
624 0.4
625 0.37
626 0.35
627 0.42
628 0.46
629 0.48
630 0.54
631 0.53
632 0.54
633 0.61
634 0.64
635 0.65
636 0.69
637 0.72
638 0.73
639 0.78
640 0.84
641 0.83
642 0.84
643 0.84
644 0.82
645 0.79
646 0.78
647 0.75
648 0.68
649 0.66
650 0.65
651 0.59
652 0.55
653 0.54
654 0.51
655 0.49
656 0.53
657 0.54
658 0.55
659 0.58
660 0.65
661 0.67
662 0.67
663 0.73
664 0.76
665 0.8
666 0.8
667 0.81
668 0.82
669 0.81
670 0.84
671 0.85
672 0.86
673 0.86
674 0.83
675 0.8
676 0.76
677 0.72
678 0.69
679 0.64
680 0.61
681 0.54
682 0.46
683 0.41
684 0.39
685 0.41
686 0.34
687 0.28
688 0.21