Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2A9NPA4

Protein Details
Accession A0A2A9NPA4    Localization Confidence High Confidence Score 15.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
218-244LEIARKHAKWERNKREKDQKRRDDEEABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
221-239ARKHAKWERNKREKDQKRR
476-476K
482-486RLRRR
Subcellular Location(s) nucl 14, cyto_nucl 11.5, cyto 7, pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045146  SF3A1  
IPR022030  SF3A1_dom  
IPR035563  SF3As1_ubi  
IPR000061  Surp  
IPR035967  SWAP/Surp_sf  
IPR000626  Ubiquitin-like_dom  
IPR029071  Ubiquitin-like_domsf  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0045292  P:mRNA cis splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF12230  PRP21_like_P  
PF01805  Surp  
PF00240  ubiquitin  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50128  SURP  
PS50053  UBIQUITIN_2  
CDD cd01800  Ubl_SF3a120  
Amino Acid Sequences MAHPATLPSQDPHVDTPSPAKDLTSALRFSTGLILPPPEIKCKTALFVARSANPPLFEDKIREGQRADPKFSFLNPIDPYHAYYRHRLDRVAQGDTIDENAQKDAKEDGQEPPPEPVDLGIEPPSPEFTLDLPNISTIDLDTMKLTALFTARRGRNFLATLSAREGRNYQFDFLRPTHSLFPYFNRLVEQYTKILHPNKEMLEQLKERTLEGARWKMLEIARKHAKWERNKREKDQKRRDDEEAERVAFAEIDWHDYAIVQTIEFTAADANAELPTPMSVQEVENMTLAQKRMAAMIMENTAEEVEAHRARQAAAEAEAAAAVGSAGPVVNGGDQNVEDDAAMEESDDEIQLEADARHQEERMKEIARAQALQVNTSGPMKIRTDYVPKLGTKNSKATTTTCTICGQQIPVDELQEHMRIELLDPKWKEQRDVLEARKAQASELQRGANVVTSLKNLARTRVDIFGAEADEERRKKEEEEERLRRREREKVVWDGHTASKANTLDKFSTNVNFDEQIAAIHRAKGLGPQDANAIGPGIGPAAAPPPLTTLPPAPASLPAPPQAAVNSGAYSAATVSSGPQPASAYPAQPPPVMLPPLHYQGLDAPQPFGYQPPPPGMHPSRMAAMQGPQTGMVRSADEMEGVVDELPPAKRQRVAKLPGGALYPEADWIAMHPHPITLQVQLPNDPSKPDWKLDGSIVSIPDLPMTLLVTTLRDRILQHTGSAMPVSRIRLAHMGKVLTNQSSIALYNLEDEDVVALSLRDPKKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.29
3 0.35
4 0.34
5 0.34
6 0.32
7 0.29
8 0.25
9 0.28
10 0.32
11 0.3
12 0.28
13 0.25
14 0.28
15 0.27
16 0.26
17 0.28
18 0.23
19 0.2
20 0.2
21 0.21
22 0.2
23 0.27
24 0.28
25 0.3
26 0.31
27 0.3
28 0.32
29 0.32
30 0.34
31 0.35
32 0.39
33 0.35
34 0.38
35 0.42
36 0.43
37 0.44
38 0.45
39 0.41
40 0.36
41 0.35
42 0.34
43 0.32
44 0.29
45 0.31
46 0.32
47 0.39
48 0.41
49 0.42
50 0.39
51 0.44
52 0.52
53 0.53
54 0.54
55 0.45
56 0.46
57 0.45
58 0.44
59 0.44
60 0.35
61 0.37
62 0.33
63 0.35
64 0.36
65 0.35
66 0.38
67 0.35
68 0.41
69 0.36
70 0.4
71 0.46
72 0.5
73 0.52
74 0.5
75 0.49
76 0.52
77 0.53
78 0.49
79 0.41
80 0.33
81 0.32
82 0.3
83 0.28
84 0.2
85 0.17
86 0.14
87 0.15
88 0.16
89 0.15
90 0.16
91 0.17
92 0.18
93 0.21
94 0.22
95 0.25
96 0.31
97 0.34
98 0.34
99 0.35
100 0.33
101 0.29
102 0.27
103 0.23
104 0.19
105 0.16
106 0.17
107 0.16
108 0.16
109 0.16
110 0.16
111 0.18
112 0.15
113 0.14
114 0.13
115 0.12
116 0.17
117 0.17
118 0.18
119 0.16
120 0.17
121 0.17
122 0.15
123 0.14
124 0.08
125 0.11
126 0.1
127 0.1
128 0.09
129 0.09
130 0.09
131 0.1
132 0.09
133 0.08
134 0.1
135 0.1
136 0.14
137 0.24
138 0.27
139 0.3
140 0.34
141 0.35
142 0.37
143 0.38
144 0.34
145 0.33
146 0.31
147 0.3
148 0.31
149 0.33
150 0.28
151 0.28
152 0.3
153 0.25
154 0.31
155 0.3
156 0.28
157 0.26
158 0.27
159 0.32
160 0.3
161 0.33
162 0.28
163 0.29
164 0.32
165 0.32
166 0.33
167 0.29
168 0.33
169 0.35
170 0.34
171 0.32
172 0.28
173 0.27
174 0.28
175 0.3
176 0.28
177 0.22
178 0.23
179 0.24
180 0.28
181 0.34
182 0.32
183 0.32
184 0.34
185 0.34
186 0.35
187 0.36
188 0.32
189 0.33
190 0.33
191 0.31
192 0.31
193 0.29
194 0.26
195 0.27
196 0.25
197 0.23
198 0.27
199 0.31
200 0.27
201 0.27
202 0.28
203 0.29
204 0.3
205 0.34
206 0.29
207 0.33
208 0.4
209 0.4
210 0.44
211 0.47
212 0.52
213 0.55
214 0.65
215 0.67
216 0.69
217 0.77
218 0.81
219 0.86
220 0.88
221 0.89
222 0.89
223 0.87
224 0.86
225 0.84
226 0.79
227 0.76
228 0.7
229 0.67
230 0.6
231 0.5
232 0.41
233 0.36
234 0.31
235 0.23
236 0.18
237 0.14
238 0.09
239 0.13
240 0.13
241 0.12
242 0.12
243 0.12
244 0.13
245 0.11
246 0.1
247 0.06
248 0.06
249 0.06
250 0.07
251 0.07
252 0.07
253 0.05
254 0.04
255 0.05
256 0.05
257 0.05
258 0.04
259 0.05
260 0.04
261 0.04
262 0.05
263 0.05
264 0.05
265 0.06
266 0.06
267 0.07
268 0.09
269 0.11
270 0.11
271 0.11
272 0.1
273 0.1
274 0.12
275 0.12
276 0.1
277 0.09
278 0.09
279 0.09
280 0.1
281 0.09
282 0.07
283 0.09
284 0.09
285 0.08
286 0.08
287 0.07
288 0.07
289 0.06
290 0.06
291 0.05
292 0.09
293 0.1
294 0.1
295 0.11
296 0.12
297 0.12
298 0.13
299 0.13
300 0.09
301 0.1
302 0.1
303 0.09
304 0.08
305 0.08
306 0.06
307 0.05
308 0.04
309 0.03
310 0.02
311 0.02
312 0.02
313 0.02
314 0.02
315 0.02
316 0.02
317 0.03
318 0.03
319 0.04
320 0.04
321 0.04
322 0.05
323 0.05
324 0.05
325 0.04
326 0.05
327 0.05
328 0.05
329 0.05
330 0.04
331 0.04
332 0.04
333 0.04
334 0.04
335 0.03
336 0.03
337 0.03
338 0.03
339 0.04
340 0.04
341 0.06
342 0.07
343 0.07
344 0.08
345 0.09
346 0.12
347 0.12
348 0.15
349 0.17
350 0.17
351 0.16
352 0.19
353 0.21
354 0.19
355 0.19
356 0.16
357 0.16
358 0.15
359 0.15
360 0.13
361 0.1
362 0.1
363 0.09
364 0.09
365 0.07
366 0.09
367 0.1
368 0.1
369 0.11
370 0.13
371 0.18
372 0.19
373 0.23
374 0.23
375 0.23
376 0.25
377 0.28
378 0.31
379 0.28
380 0.33
381 0.31
382 0.3
383 0.3
384 0.3
385 0.3
386 0.28
387 0.26
388 0.22
389 0.21
390 0.19
391 0.19
392 0.18
393 0.15
394 0.12
395 0.12
396 0.12
397 0.11
398 0.11
399 0.1
400 0.1
401 0.11
402 0.12
403 0.11
404 0.09
405 0.09
406 0.08
407 0.09
408 0.15
409 0.14
410 0.18
411 0.19
412 0.22
413 0.28
414 0.28
415 0.29
416 0.26
417 0.29
418 0.3
419 0.37
420 0.36
421 0.38
422 0.39
423 0.38
424 0.38
425 0.33
426 0.26
427 0.25
428 0.24
429 0.21
430 0.23
431 0.22
432 0.2
433 0.2
434 0.2
435 0.16
436 0.13
437 0.1
438 0.08
439 0.08
440 0.1
441 0.1
442 0.17
443 0.16
444 0.19
445 0.2
446 0.21
447 0.23
448 0.23
449 0.23
450 0.17
451 0.17
452 0.15
453 0.13
454 0.11
455 0.1
456 0.09
457 0.14
458 0.15
459 0.16
460 0.17
461 0.18
462 0.19
463 0.27
464 0.34
465 0.39
466 0.49
467 0.58
468 0.64
469 0.7
470 0.73
471 0.7
472 0.65
473 0.64
474 0.61
475 0.6
476 0.57
477 0.58
478 0.59
479 0.55
480 0.52
481 0.46
482 0.4
483 0.34
484 0.29
485 0.21
486 0.22
487 0.21
488 0.22
489 0.21
490 0.23
491 0.22
492 0.22
493 0.24
494 0.2
495 0.22
496 0.22
497 0.21
498 0.19
499 0.18
500 0.17
501 0.16
502 0.14
503 0.12
504 0.12
505 0.15
506 0.13
507 0.13
508 0.13
509 0.13
510 0.13
511 0.17
512 0.17
513 0.18
514 0.18
515 0.17
516 0.19
517 0.19
518 0.18
519 0.14
520 0.12
521 0.07
522 0.06
523 0.06
524 0.04
525 0.04
526 0.04
527 0.04
528 0.05
529 0.06
530 0.06
531 0.06
532 0.1
533 0.1
534 0.11
535 0.13
536 0.13
537 0.15
538 0.16
539 0.17
540 0.14
541 0.15
542 0.16
543 0.17
544 0.18
545 0.18
546 0.18
547 0.17
548 0.17
549 0.16
550 0.16
551 0.15
552 0.14
553 0.12
554 0.11
555 0.1
556 0.09
557 0.09
558 0.07
559 0.05
560 0.05
561 0.04
562 0.06
563 0.09
564 0.11
565 0.11
566 0.12
567 0.13
568 0.13
569 0.18
570 0.17
571 0.16
572 0.17
573 0.22
574 0.23
575 0.22
576 0.23
577 0.21
578 0.25
579 0.25
580 0.22
581 0.22
582 0.24
583 0.28
584 0.28
585 0.24
586 0.2
587 0.21
588 0.26
589 0.25
590 0.22
591 0.19
592 0.19
593 0.2
594 0.19
595 0.18
596 0.16
597 0.16
598 0.18
599 0.22
600 0.24
601 0.25
602 0.34
603 0.35
604 0.37
605 0.37
606 0.36
607 0.33
608 0.31
609 0.31
610 0.23
611 0.24
612 0.23
613 0.22
614 0.2
615 0.19
616 0.19
617 0.19
618 0.18
619 0.15
620 0.12
621 0.11
622 0.13
623 0.12
624 0.11
625 0.11
626 0.09
627 0.09
628 0.08
629 0.08
630 0.05
631 0.06
632 0.08
633 0.09
634 0.14
635 0.16
636 0.19
637 0.24
638 0.29
639 0.38
640 0.45
641 0.5
642 0.54
643 0.57
644 0.55
645 0.52
646 0.49
647 0.4
648 0.31
649 0.26
650 0.19
651 0.13
652 0.12
653 0.09
654 0.08
655 0.08
656 0.12
657 0.11
658 0.12
659 0.12
660 0.12
661 0.13
662 0.16
663 0.17
664 0.15
665 0.2
666 0.23
667 0.25
668 0.27
669 0.31
670 0.32
671 0.32
672 0.32
673 0.29
674 0.32
675 0.34
676 0.34
677 0.35
678 0.34
679 0.36
680 0.36
681 0.36
682 0.31
683 0.3
684 0.28
685 0.25
686 0.22
687 0.19
688 0.17
689 0.14
690 0.11
691 0.09
692 0.09
693 0.08
694 0.08
695 0.08
696 0.11
697 0.12
698 0.14
699 0.14
700 0.16
701 0.17
702 0.21
703 0.28
704 0.26
705 0.25
706 0.26
707 0.26
708 0.25
709 0.26
710 0.22
711 0.18
712 0.2
713 0.23
714 0.24
715 0.24
716 0.25
717 0.32
718 0.33
719 0.35
720 0.37
721 0.36
722 0.33
723 0.38
724 0.38
725 0.32
726 0.3
727 0.25
728 0.21
729 0.2
730 0.2
731 0.15
732 0.13
733 0.11
734 0.13
735 0.13
736 0.12
737 0.11
738 0.1
739 0.1
740 0.09
741 0.09
742 0.06
743 0.06
744 0.07
745 0.16