FuNGI

V5IR27

Protein Details

Accession

V5IR27

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
118-139	DLKAAEKKKKKAAKFDPGKYST	Hydrophilic
632-661	MTKTKNWRSTIRERKDKNKKAGRSKAGGAE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
122-131	AEKKKKKAAK
642-657	IRERKDKNKKAGRSKA

Subcellular Location(s)

mito 15.5, cyto_mito 12.5, cyto 8.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR020103 PsdUridine_synth_cat_dom_sf IPR001406 PsdUridine_synth_TruA IPR020097 PsdUridine_synth_TruA_a/b_dom IPR020095 PsdUridine_synth_TruA_C IPR041707 Pus3-like IPR020094 TruA/RsuA/RluB/E/F_N
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0005634 C:nucleus GO:0009982 F:pseudouridine synthase activity GO:0003723 F:RNA binding GO:1990481 P:mRNA pseudouridine synthesis GO:0031119 P:tRNA pseudouridine synthesis
KEGG	ncr:NCU01784 -
Pfam	View protein in Pfam PF01416 PseudoU_synth_1
CDD	cd02569 PseudoU_synth_ScPus3

Amino Acid Sequences

MNSPGSIRTLSHLKASGKAIGVGGTFSKSSIGDFTSKLNRIKFQLRTFAKGPTVLSQEPSKMVHKPANYDRWPKESLVKRVMELEEELKRREQAPEIQRQERAEERALAAAVTSTEADLKAAEKKKKKAAKFDPGKYSTRLIALKFAYLGKNYNGFEYQSSAKMPSIEEELWKALVKSCLIFPERPDEVDFGPWEYSKCGRTDRGVSAFGQVIGIRVRSNKPLPKEEPEQTGNEEDDVVMVEAAQQQAKDSEKAAAEVDHQKPEWDPIADEIPYCRVLNRLLPPDIRIMAWAPDLPPNFSARFSCRERQYRYFFTQPAFAPMPSTLEPPLASSGHKSGGKQGWLDIDMMRKAAKMFEGVHDFRNFCKIDPGKQITNFSRRVFESDIVEVKDLESDLPYLGLPEFQPPAGSDGPHPKVYYFHVRGSAFLWHQIRHMVAVLFLVGQGLEPPSIVQQLLDVEKNPRKPNYVMADEVPLVLWDCIFPKLSDEEANAVVPGSSGHGQDSHDPEAEGDVEMVDSIDWVWMGEDDPMSLYGAQGLVTELWGTWRERKMDEILANRLLNFVANKPDLDRKLIKGASSAPPKGIKKVYEGGNKAQFRGTYTPLFKRQLLASAEEVNDKYAQGFGFKNAEEMTKTKNWRSTIRERKDKNKKAGRSKAGGAETPVQESSS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.38
2	0.4
3	0.4
4	0.34
5	0.34
6	0.3
7	0.25
8	0.23
9	0.19
10	0.17
11	0.14
12	0.13
13	0.12
14	0.13
15	0.11
16	0.12
17	0.13
18	0.15
19	0.16
20	0.17
21	0.23
22	0.3
23	0.36
24	0.4
25	0.42
26	0.44
27	0.48
28	0.55
29	0.58
30	0.55
31	0.6
32	0.59
33	0.61
34	0.59
35	0.58
36	0.53
37	0.47
38	0.42
39	0.38
40	0.4
41	0.35
42	0.36
43	0.33
44	0.32
45	0.32
46	0.34
47	0.31
48	0.29
49	0.33
50	0.36
51	0.36
52	0.42
53	0.48
54	0.55
55	0.6
56	0.65
57	0.64
58	0.64
59	0.64
60	0.58
61	0.58
62	0.57
63	0.58
64	0.57
65	0.54
66	0.49
67	0.52
68	0.5
69	0.43
70	0.36
71	0.33
72	0.32
73	0.33
74	0.34
75	0.31
76	0.33
77	0.32
78	0.33
79	0.32
80	0.34
81	0.4
82	0.49
83	0.54
84	0.56
85	0.59
86	0.57
87	0.57
88	0.52
89	0.49
90	0.41
91	0.36
92	0.33
93	0.31
94	0.29
95	0.24
96	0.18
97	0.14
98	0.1
99	0.09
100	0.08
101	0.06
102	0.07
103	0.07
104	0.07
105	0.07
106	0.09
107	0.16
108	0.24
109	0.32
110	0.39
111	0.47
112	0.56
113	0.65
114	0.7
115	0.73
116	0.76
117	0.78
118	0.81
119	0.82
120	0.83
121	0.79
122	0.76
123	0.68
124	0.6
125	0.5
126	0.46
127	0.4
128	0.31
129	0.32
130	0.29
131	0.27
132	0.25
133	0.26
134	0.23
135	0.21
136	0.23
137	0.19
138	0.24
139	0.23
140	0.24
141	0.23
142	0.22
143	0.21
144	0.22
145	0.22
146	0.18
147	0.19
148	0.18
149	0.18
150	0.18
151	0.17
152	0.15
153	0.18
154	0.17
155	0.17
156	0.17
157	0.17
158	0.17
159	0.17
160	0.16
161	0.14
162	0.16
163	0.15
164	0.14
165	0.15
166	0.19
167	0.22
168	0.23
169	0.21
170	0.26
171	0.27
172	0.27
173	0.27
174	0.24
175	0.21
176	0.23
177	0.22
178	0.16
179	0.16
180	0.16
181	0.15
182	0.15
183	0.17
184	0.16
185	0.18
186	0.2
187	0.22
188	0.25
189	0.3
190	0.33
191	0.35
192	0.34
193	0.32
194	0.31
195	0.29
196	0.24
197	0.2
198	0.14
199	0.11
200	0.1
201	0.1
202	0.09
203	0.12
204	0.14
205	0.19
206	0.26
207	0.3
208	0.34
209	0.42
210	0.46
211	0.49
212	0.53
213	0.51
214	0.51
215	0.48
216	0.45
217	0.39
218	0.36
219	0.3
220	0.24
221	0.2
222	0.13
223	0.11
224	0.09
225	0.07
226	0.04
227	0.04
228	0.04
229	0.06
230	0.06
231	0.07
232	0.06
233	0.07
234	0.09
235	0.11
236	0.11
237	0.11
238	0.13
239	0.13
240	0.14
241	0.14
242	0.12
243	0.14
244	0.21
245	0.22
246	0.22
247	0.21
248	0.21
249	0.21
250	0.23
251	0.21
252	0.14
253	0.13
254	0.12
255	0.14
256	0.14
257	0.14
258	0.12
259	0.12
260	0.13
261	0.12
262	0.11
263	0.1
264	0.11
265	0.16
266	0.21
267	0.23
268	0.24
269	0.25
270	0.26
271	0.27
272	0.26
273	0.21
274	0.16
275	0.13
276	0.11
277	0.11
278	0.1
279	0.09
280	0.12
281	0.13
282	0.13
283	0.13
284	0.14
285	0.14
286	0.15
287	0.16
288	0.15
289	0.2
290	0.24
291	0.3
292	0.35
293	0.42
294	0.48
295	0.54
296	0.58
297	0.58
298	0.58
299	0.56
300	0.51
301	0.44
302	0.42
303	0.34
304	0.33
305	0.28
306	0.22
307	0.19
308	0.17
309	0.19
310	0.15
311	0.16
312	0.11
313	0.11
314	0.11
315	0.11
316	0.12
317	0.1
318	0.09
319	0.1
320	0.1
321	0.14
322	0.15
323	0.14
324	0.18
325	0.21
326	0.22
327	0.21
328	0.2
329	0.18
330	0.18
331	0.18
332	0.13
333	0.13
334	0.11
335	0.12
336	0.11
337	0.1
338	0.09
339	0.09
340	0.08
341	0.08
342	0.09
343	0.11
344	0.17
345	0.18
346	0.21
347	0.22
348	0.23
349	0.21
350	0.26
351	0.23
352	0.17
353	0.25
354	0.23
355	0.27
356	0.35
357	0.39
358	0.37
359	0.39
360	0.44
361	0.4
362	0.46
363	0.45
364	0.38
365	0.36
366	0.33
367	0.35
368	0.32
369	0.29
370	0.24
371	0.22
372	0.23
373	0.2
374	0.2
375	0.16
376	0.13
377	0.12
378	0.1
379	0.08
380	0.06
381	0.05
382	0.05
383	0.05
384	0.05
385	0.05
386	0.05
387	0.06
388	0.06
389	0.07
390	0.08
391	0.08
392	0.08
393	0.08
394	0.12
395	0.12
396	0.12
397	0.13
398	0.21
399	0.24
400	0.25
401	0.25
402	0.21
403	0.23
404	0.26
405	0.34
406	0.29
407	0.28
408	0.32
409	0.32
410	0.32
411	0.32
412	0.32
413	0.23
414	0.25
415	0.25
416	0.19
417	0.2
418	0.21
419	0.19
420	0.16
421	0.17
422	0.11
423	0.09
424	0.08
425	0.08
426	0.06
427	0.06
428	0.05
429	0.03
430	0.03
431	0.04
432	0.04
433	0.04
434	0.04
435	0.04
436	0.05
437	0.06
438	0.06
439	0.06
440	0.06
441	0.08
442	0.1
443	0.11
444	0.11
445	0.17
446	0.22
447	0.29
448	0.33
449	0.33
450	0.36
451	0.36
452	0.43
453	0.43
454	0.42
455	0.38
456	0.35
457	0.35
458	0.31
459	0.29
460	0.21
461	0.14
462	0.11
463	0.09
464	0.07
465	0.05
466	0.06
467	0.08
468	0.09
469	0.09
470	0.1
471	0.12
472	0.14
473	0.15
474	0.15
475	0.16
476	0.16
477	0.16
478	0.14
479	0.12
480	0.1
481	0.08
482	0.07
483	0.07
484	0.08
485	0.08
486	0.09
487	0.1
488	0.12
489	0.17
490	0.21
491	0.21
492	0.2
493	0.2
494	0.19
495	0.19
496	0.19
497	0.14
498	0.09
499	0.07
500	0.06
501	0.06
502	0.06
503	0.04
504	0.04
505	0.03
506	0.04
507	0.03
508	0.04
509	0.04
510	0.04
511	0.05
512	0.06
513	0.06
514	0.06
515	0.07
516	0.07
517	0.08
518	0.08
519	0.07
520	0.07
521	0.07
522	0.07
523	0.06
524	0.06
525	0.06
526	0.06
527	0.06
528	0.05
529	0.07
530	0.1
531	0.12
532	0.18
533	0.22
534	0.25
535	0.26
536	0.3
537	0.32
538	0.37
539	0.41
540	0.39
541	0.4
542	0.43
543	0.42
544	0.38
545	0.34
546	0.27
547	0.23
548	0.2
549	0.17
550	0.18
551	0.19
552	0.19
553	0.22
554	0.3
555	0.3
556	0.35
557	0.37
558	0.34
559	0.42
560	0.43
561	0.4
562	0.34
563	0.38
564	0.4
565	0.44
566	0.42
567	0.37
568	0.44
569	0.45
570	0.49
571	0.49
572	0.43
573	0.41
574	0.46
575	0.51
576	0.52
577	0.54
578	0.56
579	0.6
580	0.59
581	0.55
582	0.51
583	0.43
584	0.39
585	0.4
586	0.36
587	0.35
588	0.4
589	0.46
590	0.51
591	0.55
592	0.5
593	0.49
594	0.46
595	0.45
596	0.42
597	0.38
598	0.33
599	0.33
600	0.33
601	0.33
602	0.32
603	0.26
604	0.24
605	0.2
606	0.18
607	0.15
608	0.14
609	0.14
610	0.15
611	0.17
612	0.21
613	0.21
614	0.23
615	0.22
616	0.24
617	0.23
618	0.24
619	0.27
620	0.31
621	0.37
622	0.41
623	0.46
624	0.49
625	0.54
626	0.61
627	0.66
628	0.69
629	0.74
630	0.78
631	0.79
632	0.85
633	0.89
634	0.9
635	0.9
636	0.89
637	0.89
638	0.89
639	0.92
640	0.9
641	0.85
642	0.81
643	0.79
644	0.73
645	0.65
646	0.59
647	0.56
648	0.48
649	0.44

V5IR27

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer