Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2T3ASM8

Protein Details
Accession A0A2T3ASM8    Localization Confidence High Confidence Score 25
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-21MAEPPSKRRRPDSKQMWDASEHydrophilic
37-64RDDRDGDRERHRRYRSRSPRGRGDWEREBasic
110-138RNRDDERRRSRSRSPRRERERERERERERBasic
262-282IYAVRKEKKTEYRQYMNRVGGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
8-10RRR
22-166RRAPVPRDRDRDWDRRDDRDGDRERHRRYRSRSPRGRGDWERERDREYRGGRGEERGGRGGRSEGGERIDGGARGMRDRPRERSRDRERNRDDERRRSRSRSPRRERERERERERERERERERERDVDREGKTNRDGERKPEKTK
209-219KGRAKGGKKPR
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013957  SNRNP27  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF08648  SNRNP27  
Amino Acid Sequences MAEPPSKRRRPDSKQMWDASERRAPVPRDRDRDWDRRDDRDGDRERHRRYRSRSPRGRGDWERERDREYRGGRGEERGGRGGRSEGGERIDGGARGMRDRPRERSRDRERNRDDERRRSRSRSPRRERERERERERERERERERERDVDREGKTNRDGERKPEKTKPEFAESFSKNRAATPPVSFKVGGAPPPQEHDRMDMDGTSTGSKGRAKGGKKPREEEPAEEDEDIVVEDDGMAAMQAMMGFGGFGTTHQKKVAGNDIYAVRKEKKTEYRQYMNRVGGFNRPLSPSRD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.85
2 0.83
3 0.79
4 0.76
5 0.7
6 0.65
7 0.6
8 0.51
9 0.45
10 0.48
11 0.46
12 0.48
13 0.55
14 0.58
15 0.6
16 0.62
17 0.68
18 0.69
19 0.75
20 0.72
21 0.73
22 0.68
23 0.67
24 0.68
25 0.65
26 0.62
27 0.62
28 0.63
29 0.59
30 0.65
31 0.68
32 0.7
33 0.73
34 0.77
35 0.76
36 0.77
37 0.81
38 0.82
39 0.84
40 0.86
41 0.84
42 0.86
43 0.84
44 0.86
45 0.81
46 0.79
47 0.78
48 0.77
49 0.76
50 0.68
51 0.65
52 0.58
53 0.55
54 0.54
55 0.47
56 0.46
57 0.43
58 0.46
59 0.43
60 0.44
61 0.45
62 0.41
63 0.42
64 0.39
65 0.35
66 0.3
67 0.29
68 0.27
69 0.22
70 0.2
71 0.19
72 0.16
73 0.17
74 0.17
75 0.16
76 0.16
77 0.16
78 0.13
79 0.12
80 0.12
81 0.11
82 0.12
83 0.16
84 0.19
85 0.27
86 0.31
87 0.4
88 0.46
89 0.54
90 0.59
91 0.65
92 0.72
93 0.74
94 0.76
95 0.78
96 0.76
97 0.77
98 0.79
99 0.79
100 0.76
101 0.76
102 0.78
103 0.77
104 0.76
105 0.73
106 0.75
107 0.75
108 0.79
109 0.79
110 0.8
111 0.82
112 0.86
113 0.91
114 0.89
115 0.89
116 0.88
117 0.87
118 0.85
119 0.84
120 0.79
121 0.79
122 0.76
123 0.75
124 0.7
125 0.7
126 0.67
127 0.67
128 0.67
129 0.64
130 0.62
131 0.6
132 0.56
133 0.51
134 0.49
135 0.46
136 0.42
137 0.41
138 0.39
139 0.34
140 0.34
141 0.34
142 0.34
143 0.35
144 0.35
145 0.36
146 0.46
147 0.48
148 0.52
149 0.54
150 0.58
151 0.55
152 0.62
153 0.58
154 0.55
155 0.5
156 0.48
157 0.5
158 0.45
159 0.43
160 0.38
161 0.36
162 0.29
163 0.29
164 0.28
165 0.22
166 0.23
167 0.23
168 0.28
169 0.26
170 0.29
171 0.27
172 0.25
173 0.27
174 0.26
175 0.24
176 0.2
177 0.22
178 0.2
179 0.24
180 0.26
181 0.22
182 0.22
183 0.22
184 0.22
185 0.21
186 0.21
187 0.16
188 0.16
189 0.15
190 0.15
191 0.12
192 0.1
193 0.09
194 0.11
195 0.13
196 0.13
197 0.19
198 0.25
199 0.27
200 0.37
201 0.47
202 0.54
203 0.59
204 0.61
205 0.61
206 0.64
207 0.64
208 0.58
209 0.54
210 0.5
211 0.45
212 0.42
213 0.35
214 0.25
215 0.22
216 0.18
217 0.12
218 0.07
219 0.04
220 0.04
221 0.04
222 0.04
223 0.03
224 0.03
225 0.02
226 0.02
227 0.03
228 0.03
229 0.03
230 0.03
231 0.03
232 0.03
233 0.02
234 0.03
235 0.03
236 0.04
237 0.13
238 0.15
239 0.17
240 0.18
241 0.21
242 0.22
243 0.27
244 0.36
245 0.31
246 0.29
247 0.32
248 0.36
249 0.38
250 0.39
251 0.4
252 0.36
253 0.36
254 0.4
255 0.45
256 0.5
257 0.57
258 0.65
259 0.69
260 0.74
261 0.78
262 0.83
263 0.82
264 0.78
265 0.72
266 0.65
267 0.57
268 0.54
269 0.5
270 0.45
271 0.41
272 0.39