Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

Q7SCL0

Protein Details
Accession Q7SCL0    Localization Confidence Low Confidence Score 8.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
310-337NEAEIKKSLARKRRRRRELAAKKGKKEABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
314-335IKKSLARKRRRRRELAAKKGKK
Subcellular Location(s) cyto 10.5, mito 7, cyto_nucl 7, E.R. 3, nucl 2.5, golg 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020472  G-protein_beta_WD-40_rep  
IPR007148  SSU_processome_Utp12  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR019775  WD40_repeat_CS  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0034388  C:Pwp2p-containing subcomplex of 90S preribosome  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0030515  F:snoRNA binding  
GO:0034511  F:U3 snoRNA binding  
GO:0000480  P:endonucleolytic cleavage in 5'-ETS of tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000447  P:endonucleolytic cleavage in ITS1 to separate SSU-rRNA from 5.8S rRNA and LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000472  P:endonucleolytic cleavage to generate mature 5'-end of SSU-rRNA from (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0030490  P:maturation of SSU-rRNA  
KEGG ncr:NCU03051  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04003  Utp12  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00678  WD_REPEATS_1  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
CDD cd00200  WD40  
Amino Acid Sequences MVKSYLKFEPSKSFGVVATSSSNLVWTSSKDKSGTGAGQAIVAANNEVLTWDIKKGELLNRWKDENCKAQVTAIAQSKTDPDVFAVGYEDGSIRLWDSKISTTIVSFNGHKSAITILAFDKSGVRLASGAKDTDVIVWDLVAEVGQYKLRGHKDQITGLRFIEPEPQIPEGGDDEEQAMVLDNEATEGFLLTTGKDALIKLWDLSSRHCIETHVAQNSGECWALGVSPDLSGCVTAGNDGEMRVWALDVAGLASSARKVDLSQAINFLHDRGTLHRSSKERAVEVIFHPRRDYFAVHGVEKSVEIWRIRNEAEIKKSLARKRRRRRELAAKKGKKEADAEEEDDKADDISKADISDVFVQHVIVRTTGKVRSVAWALSQGTKDLQLLVGGTNNLLETYTIVGKDKLKSKGDAPDYNKALAVELPGHRTDIRALSISSDDKMLASAANGSLKIWNIKTNTCIRTFECGYALCCSFLPGDKVVVVGTKEGELQLYDVASASLLESVNAHEGHAIWSLQVHPDGKSVVSGGADKTAKFWDFKIVQEQVLGTSRTTPKLKLVQSKILKVSDDILSLRFSPDAKLLAVALLDSTVKVFFVDSLKLYLNLYGHKLPVLSMDISYDNKLIVTSSADKNIRIWGLDFGDCHKALFGHQDSILQVAFVPHNSDGNGHHFFSASKDRTIKYWDADKFEQIQRIDGHHGEIWAIAVAHSGQFLISASHDKSIRVWEETDEQIFLEEEREKEIEELYESTLTTSLEQDPDAEDENREVGAASKQTVETLMAGERIAEALELGMADLNAIKEWEEAKQQNPNVAPPQRNVLFMALGNISAEQHVMNVLQKIKASALHDALLVLPFATVPMLFTFLNIFAMRSMNIPLTCRILFFMLKTHHKQIVASKTMRAMLDGIRTNLRGALKRQKDEMGYNVAALKVVGMQLQHKSVKDYVDEKWEEENEENKAVKKRAFVQVS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.35
3 0.31
4 0.24
5 0.22
6 0.2
7 0.19
8 0.17
9 0.18
10 0.14
11 0.15
12 0.14
13 0.15
14 0.21
15 0.24
16 0.28
17 0.28
18 0.29
19 0.3
20 0.34
21 0.33
22 0.3
23 0.3
24 0.26
25 0.25
26 0.24
27 0.22
28 0.17
29 0.14
30 0.11
31 0.08
32 0.07
33 0.07
34 0.07
35 0.07
36 0.09
37 0.1
38 0.12
39 0.12
40 0.13
41 0.15
42 0.19
43 0.26
44 0.33
45 0.4
46 0.48
47 0.52
48 0.56
49 0.58
50 0.6
51 0.6
52 0.6
53 0.57
54 0.52
55 0.47
56 0.45
57 0.45
58 0.42
59 0.41
60 0.39
61 0.35
62 0.3
63 0.31
64 0.31
65 0.3
66 0.28
67 0.21
68 0.15
69 0.16
70 0.16
71 0.16
72 0.16
73 0.13
74 0.12
75 0.12
76 0.11
77 0.09
78 0.09
79 0.09
80 0.08
81 0.11
82 0.11
83 0.12
84 0.15
85 0.17
86 0.18
87 0.2
88 0.2
89 0.18
90 0.21
91 0.21
92 0.22
93 0.21
94 0.21
95 0.23
96 0.22
97 0.21
98 0.19
99 0.18
100 0.19
101 0.17
102 0.16
103 0.14
104 0.16
105 0.16
106 0.15
107 0.15
108 0.12
109 0.15
110 0.14
111 0.13
112 0.12
113 0.14
114 0.19
115 0.19
116 0.19
117 0.17
118 0.17
119 0.17
120 0.17
121 0.17
122 0.13
123 0.1
124 0.09
125 0.09
126 0.08
127 0.08
128 0.06
129 0.04
130 0.04
131 0.06
132 0.07
133 0.08
134 0.09
135 0.17
136 0.22
137 0.27
138 0.31
139 0.38
140 0.42
141 0.49
142 0.56
143 0.52
144 0.49
145 0.45
146 0.43
147 0.35
148 0.31
149 0.31
150 0.24
151 0.24
152 0.25
153 0.25
154 0.22
155 0.22
156 0.23
157 0.16
158 0.17
159 0.14
160 0.12
161 0.11
162 0.11
163 0.1
164 0.09
165 0.08
166 0.06
167 0.06
168 0.05
169 0.04
170 0.05
171 0.05
172 0.05
173 0.05
174 0.05
175 0.05
176 0.05
177 0.06
178 0.05
179 0.07
180 0.07
181 0.07
182 0.08
183 0.08
184 0.09
185 0.11
186 0.12
187 0.11
188 0.12
189 0.16
190 0.16
191 0.19
192 0.25
193 0.26
194 0.26
195 0.26
196 0.26
197 0.26
198 0.32
199 0.35
200 0.31
201 0.29
202 0.28
203 0.28
204 0.27
205 0.25
206 0.18
207 0.11
208 0.08
209 0.07
210 0.07
211 0.07
212 0.08
213 0.06
214 0.07
215 0.07
216 0.07
217 0.07
218 0.07
219 0.06
220 0.06
221 0.05
222 0.05
223 0.06
224 0.06
225 0.07
226 0.07
227 0.07
228 0.07
229 0.07
230 0.07
231 0.06
232 0.05
233 0.05
234 0.05
235 0.04
236 0.04
237 0.04
238 0.04
239 0.04
240 0.04
241 0.05
242 0.05
243 0.05
244 0.05
245 0.06
246 0.11
247 0.18
248 0.2
249 0.21
250 0.24
251 0.24
252 0.26
253 0.26
254 0.21
255 0.15
256 0.13
257 0.13
258 0.13
259 0.18
260 0.2
261 0.23
262 0.28
263 0.31
264 0.33
265 0.38
266 0.38
267 0.34
268 0.34
269 0.33
270 0.3
271 0.3
272 0.38
273 0.34
274 0.31
275 0.31
276 0.29
277 0.29
278 0.28
279 0.27
280 0.19
281 0.25
282 0.27
283 0.26
284 0.26
285 0.25
286 0.23
287 0.21
288 0.19
289 0.13
290 0.14
291 0.14
292 0.16
293 0.18
294 0.2
295 0.2
296 0.24
297 0.28
298 0.3
299 0.34
300 0.34
301 0.34
302 0.36
303 0.43
304 0.45
305 0.49
306 0.54
307 0.61
308 0.69
309 0.78
310 0.83
311 0.84
312 0.88
313 0.9
314 0.9
315 0.91
316 0.91
317 0.87
318 0.81
319 0.8
320 0.71
321 0.62
322 0.55
323 0.47
324 0.44
325 0.39
326 0.38
327 0.32
328 0.31
329 0.28
330 0.25
331 0.21
332 0.13
333 0.1
334 0.07
335 0.06
336 0.07
337 0.07
338 0.07
339 0.07
340 0.08
341 0.09
342 0.12
343 0.12
344 0.11
345 0.11
346 0.11
347 0.12
348 0.13
349 0.12
350 0.09
351 0.1
352 0.1
353 0.13
354 0.14
355 0.15
356 0.14
357 0.14
358 0.16
359 0.17
360 0.17
361 0.14
362 0.17
363 0.17
364 0.18
365 0.18
366 0.15
367 0.14
368 0.14
369 0.14
370 0.1
371 0.09
372 0.06
373 0.06
374 0.06
375 0.07
376 0.06
377 0.06
378 0.06
379 0.05
380 0.05
381 0.05
382 0.04
383 0.04
384 0.05
385 0.06
386 0.06
387 0.07
388 0.09
389 0.12
390 0.16
391 0.22
392 0.26
393 0.28
394 0.29
395 0.31
396 0.37
397 0.41
398 0.45
399 0.43
400 0.45
401 0.44
402 0.43
403 0.41
404 0.33
405 0.27
406 0.2
407 0.16
408 0.11
409 0.11
410 0.13
411 0.12
412 0.13
413 0.13
414 0.13
415 0.14
416 0.12
417 0.12
418 0.11
419 0.11
420 0.11
421 0.13
422 0.13
423 0.11
424 0.1
425 0.09
426 0.08
427 0.08
428 0.07
429 0.05
430 0.04
431 0.05
432 0.05
433 0.06
434 0.06
435 0.06
436 0.07
437 0.07
438 0.09
439 0.09
440 0.13
441 0.14
442 0.14
443 0.18
444 0.25
445 0.27
446 0.27
447 0.29
448 0.26
449 0.3
450 0.3
451 0.27
452 0.21
453 0.19
454 0.18
455 0.18
456 0.17
457 0.12
458 0.1
459 0.1
460 0.09
461 0.09
462 0.1
463 0.08
464 0.09
465 0.08
466 0.08
467 0.07
468 0.08
469 0.07
470 0.06
471 0.06
472 0.06
473 0.06
474 0.06
475 0.06
476 0.05
477 0.05
478 0.05
479 0.04
480 0.04
481 0.04
482 0.04
483 0.04
484 0.03
485 0.03
486 0.04
487 0.04
488 0.04
489 0.04
490 0.05
491 0.07
492 0.07
493 0.07
494 0.06
495 0.06
496 0.08
497 0.08
498 0.08
499 0.06
500 0.06
501 0.07
502 0.07
503 0.09
504 0.08
505 0.08
506 0.09
507 0.09
508 0.09
509 0.09
510 0.08
511 0.07
512 0.07
513 0.07
514 0.06
515 0.1
516 0.11
517 0.11
518 0.12
519 0.13
520 0.14
521 0.14
522 0.14
523 0.17
524 0.18
525 0.19
526 0.24
527 0.24
528 0.23
529 0.23
530 0.22
531 0.16
532 0.17
533 0.17
534 0.1
535 0.14
536 0.15
537 0.19
538 0.2
539 0.2
540 0.22
541 0.29
542 0.34
543 0.37
544 0.4
545 0.45
546 0.48
547 0.51
548 0.5
549 0.44
550 0.39
551 0.31
552 0.29
553 0.21
554 0.19
555 0.15
556 0.12
557 0.12
558 0.12
559 0.12
560 0.1
561 0.09
562 0.09
563 0.1
564 0.1
565 0.1
566 0.1
567 0.09
568 0.08
569 0.08
570 0.07
571 0.05
572 0.04
573 0.04
574 0.04
575 0.04
576 0.04
577 0.04
578 0.04
579 0.04
580 0.05
581 0.07
582 0.08
583 0.08
584 0.1
585 0.11
586 0.11
587 0.12
588 0.12
589 0.11
590 0.12
591 0.14
592 0.13
593 0.13
594 0.13
595 0.13
596 0.11
597 0.12
598 0.13
599 0.1
600 0.09
601 0.1
602 0.12
603 0.13
604 0.14
605 0.12
606 0.1
607 0.09
608 0.09
609 0.08
610 0.07
611 0.09
612 0.12
613 0.13
614 0.2
615 0.21
616 0.21
617 0.22
618 0.24
619 0.21
620 0.17
621 0.17
622 0.14
623 0.15
624 0.16
625 0.15
626 0.15
627 0.19
628 0.19
629 0.17
630 0.15
631 0.13
632 0.12
633 0.19
634 0.18
635 0.16
636 0.16
637 0.18
638 0.17
639 0.19
640 0.18
641 0.1
642 0.09
643 0.08
644 0.08
645 0.07
646 0.1
647 0.09
648 0.1
649 0.1
650 0.11
651 0.12
652 0.17
653 0.2
654 0.18
655 0.18
656 0.17
657 0.17
658 0.21
659 0.28
660 0.24
661 0.26
662 0.28
663 0.29
664 0.31
665 0.36
666 0.34
667 0.29
668 0.35
669 0.35
670 0.38
671 0.39
672 0.4
673 0.4
674 0.4
675 0.42
676 0.34
677 0.34
678 0.29
679 0.3
680 0.31
681 0.26
682 0.25
683 0.2
684 0.2
685 0.16
686 0.15
687 0.12
688 0.09
689 0.08
690 0.06
691 0.05
692 0.05
693 0.05
694 0.05
695 0.05
696 0.04
697 0.04
698 0.05
699 0.05
700 0.06
701 0.09
702 0.1
703 0.14
704 0.15
705 0.15
706 0.17
707 0.22
708 0.23
709 0.22
710 0.22
711 0.21
712 0.24
713 0.26
714 0.26
715 0.2
716 0.17
717 0.16
718 0.15
719 0.12
720 0.11
721 0.11
722 0.11
723 0.13
724 0.14
725 0.14
726 0.14
727 0.15
728 0.13
729 0.12
730 0.13
731 0.12
732 0.12
733 0.12
734 0.12
735 0.12
736 0.11
737 0.1
738 0.11
739 0.11
740 0.11
741 0.12
742 0.12
743 0.12
744 0.13
745 0.16
746 0.15
747 0.13
748 0.13
749 0.14
750 0.13
751 0.12
752 0.1
753 0.08
754 0.11
755 0.12
756 0.12
757 0.13
758 0.13
759 0.13
760 0.14
761 0.13
762 0.1
763 0.1
764 0.11
765 0.09
766 0.09
767 0.09
768 0.08
769 0.08
770 0.07
771 0.05
772 0.04
773 0.04
774 0.04
775 0.04
776 0.04
777 0.04
778 0.03
779 0.04
780 0.05
781 0.05
782 0.05
783 0.05
784 0.06
785 0.07
786 0.08
787 0.11
788 0.17
789 0.2
790 0.24
791 0.32
792 0.33
793 0.37
794 0.38
795 0.41
796 0.42
797 0.47
798 0.46
799 0.4
800 0.47
801 0.43
802 0.43
803 0.39
804 0.32
805 0.26
806 0.23
807 0.24
808 0.16
809 0.14
810 0.13
811 0.11
812 0.1
813 0.08
814 0.09
815 0.06
816 0.06
817 0.06
818 0.07
819 0.09
820 0.13
821 0.15
822 0.16
823 0.17
824 0.18
825 0.19
826 0.22
827 0.22
828 0.23
829 0.23
830 0.22
831 0.21
832 0.2
833 0.2
834 0.17
835 0.14
836 0.09
837 0.06
838 0.05
839 0.05
840 0.06
841 0.05
842 0.05
843 0.06
844 0.09
845 0.09
846 0.09
847 0.11
848 0.11
849 0.14
850 0.13
851 0.13
852 0.11
853 0.13
854 0.13
855 0.13
856 0.14
857 0.16
858 0.17
859 0.19
860 0.2
861 0.24
862 0.24
863 0.23
864 0.22
865 0.21
866 0.21
867 0.2
868 0.25
869 0.28
870 0.36
871 0.41
872 0.46
873 0.47
874 0.47
875 0.49
876 0.5
877 0.53
878 0.53
879 0.49
880 0.46
881 0.44
882 0.47
883 0.44
884 0.37
885 0.29
886 0.24
887 0.3
888 0.3
889 0.29
890 0.29
891 0.3
892 0.29
893 0.31
894 0.32
895 0.3
896 0.34
897 0.42
898 0.48
899 0.51
900 0.55
901 0.56
902 0.56
903 0.55
904 0.53
905 0.5
906 0.42
907 0.39
908 0.36
909 0.3
910 0.26
911 0.21
912 0.16
913 0.09
914 0.1
915 0.1
916 0.1
917 0.13
918 0.17
919 0.23
920 0.27
921 0.27
922 0.31
923 0.32
924 0.34
925 0.36
926 0.37
927 0.34
928 0.4
929 0.41
930 0.38
931 0.41
932 0.4
933 0.38
934 0.38
935 0.39
936 0.33
937 0.37
938 0.37
939 0.36
940 0.43
941 0.44
942 0.43
943 0.45
944 0.49