Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2T3B229

Protein Details
Accession A0A2T3B229    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
208-227GSGGKAKRERERKQKQILEIBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
211-222GKAKRERERKQK
236-290ERGGRGGFRGRGGRGDGAPRGGRGEGFRGGRGDGSRGGRGRGDGPHRGGPRGPRG
Subcellular Location(s) nucl 11.5, cyto_nucl 10, cyto 7.5, pero 3, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039764  HABP4/SERBP1  
IPR006861  HABP4_PAIRBP1-bd  
IPR019084  Stm1-like_N  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF04774  HABP4_PAI-RBP1  
PF09598  Stm1_N  
Amino Acid Sequences HDEDSDKEPEPPVKVVDKTPARTTKRNAPAEAPASKAPVTDGRGARRPGGNEGAFRDRNAGSANNRGKPTDDGAQERRPRGTYEGRGGRRQFDRHSRTVGGDSEKQASHGWGATEGNAELADEEAGEAIAKTEQKEALTGEAADGEAAEPEDHSISYADYLAQLAEKKLQLGTGIPEARKPNEGSKQDKKWANAKPIVKDEEEDFVAGSGGKAKRERERKQKQILEIDQRFVEAPERGGRGGFRGRGGRGDGAPRGGRGEGFRGGRGDGSRGGRGRGDGPHRGGPRGPRGNAAPINTNDPSAFPSLGAA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.35
3 0.42
4 0.45
5 0.46
6 0.53
7 0.59
8 0.6
9 0.65
10 0.68
11 0.69
12 0.71
13 0.73
14 0.67
15 0.62
16 0.63
17 0.61
18 0.57
19 0.51
20 0.42
21 0.38
22 0.35
23 0.31
24 0.25
25 0.24
26 0.26
27 0.29
28 0.33
29 0.36
30 0.43
31 0.45
32 0.47
33 0.46
34 0.44
35 0.42
36 0.45
37 0.41
38 0.37
39 0.4
40 0.44
41 0.41
42 0.38
43 0.37
44 0.29
45 0.28
46 0.28
47 0.27
48 0.22
49 0.31
50 0.38
51 0.39
52 0.4
53 0.4
54 0.39
55 0.37
56 0.38
57 0.35
58 0.33
59 0.34
60 0.39
61 0.47
62 0.5
63 0.5
64 0.49
65 0.43
66 0.42
67 0.41
68 0.43
69 0.4
70 0.44
71 0.51
72 0.53
73 0.58
74 0.58
75 0.58
76 0.55
77 0.54
78 0.51
79 0.53
80 0.55
81 0.52
82 0.55
83 0.5
84 0.46
85 0.45
86 0.41
87 0.35
88 0.31
89 0.3
90 0.28
91 0.26
92 0.26
93 0.23
94 0.2
95 0.16
96 0.14
97 0.12
98 0.1
99 0.11
100 0.09
101 0.1
102 0.09
103 0.08
104 0.07
105 0.06
106 0.05
107 0.05
108 0.04
109 0.03
110 0.03
111 0.03
112 0.03
113 0.03
114 0.03
115 0.03
116 0.04
117 0.05
118 0.06
119 0.07
120 0.09
121 0.09
122 0.1
123 0.1
124 0.1
125 0.09
126 0.09
127 0.07
128 0.06
129 0.06
130 0.05
131 0.05
132 0.03
133 0.03
134 0.03
135 0.03
136 0.03
137 0.03
138 0.04
139 0.04
140 0.04
141 0.04
142 0.04
143 0.05
144 0.05
145 0.04
146 0.04
147 0.05
148 0.04
149 0.05
150 0.05
151 0.05
152 0.08
153 0.08
154 0.08
155 0.08
156 0.08
157 0.08
158 0.08
159 0.09
160 0.13
161 0.15
162 0.14
163 0.18
164 0.2
165 0.21
166 0.23
167 0.23
168 0.24
169 0.31
170 0.36
171 0.41
172 0.48
173 0.52
174 0.58
175 0.6
176 0.57
177 0.56
178 0.57
179 0.57
180 0.56
181 0.54
182 0.51
183 0.53
184 0.52
185 0.45
186 0.39
187 0.33
188 0.28
189 0.24
190 0.19
191 0.14
192 0.1
193 0.1
194 0.09
195 0.07
196 0.11
197 0.11
198 0.15
199 0.18
200 0.22
201 0.31
202 0.41
203 0.51
204 0.56
205 0.66
206 0.72
207 0.8
208 0.82
209 0.8
210 0.79
211 0.77
212 0.77
213 0.69
214 0.61
215 0.51
216 0.45
217 0.39
218 0.29
219 0.25
220 0.15
221 0.15
222 0.17
223 0.18
224 0.18
225 0.18
226 0.18
227 0.19
228 0.24
229 0.24
230 0.24
231 0.26
232 0.27
233 0.3
234 0.32
235 0.31
236 0.28
237 0.31
238 0.28
239 0.29
240 0.29
241 0.27
242 0.26
243 0.23
244 0.22
245 0.19
246 0.22
247 0.23
248 0.23
249 0.25
250 0.24
251 0.24
252 0.26
253 0.25
254 0.23
255 0.23
256 0.25
257 0.3
258 0.3
259 0.31
260 0.3
261 0.31
262 0.31
263 0.33
264 0.36
265 0.37
266 0.41
267 0.47
268 0.48
269 0.49
270 0.49
271 0.5
272 0.54
273 0.55
274 0.52
275 0.49
276 0.5
277 0.56
278 0.56
279 0.52
280 0.48
281 0.42
282 0.47
283 0.43
284 0.41
285 0.32
286 0.28
287 0.28
288 0.24
289 0.22