Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

V5IML7

Protein Details
Accession V5IML7    Localization Confidence High Confidence Score 18.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
15-34RDYSDRDRHGRDNRERDRDQBasic
46-86GRDDRDRDSRRYRSRSRDRHGRDHDRNRRRSRSPVRDRDGHBasic
267-286GAVRKEKKTEYRQYMNRVGGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
22-113RHGRDNRERDRDQDRSRGRGGGRGGRDDRDRDSRRYRSRSRDRHGRDHDRNRRRSRSPVRDRDGHDRRDDWARDGGRGGRRGGPKDSRRDRG
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 13.5, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013957  SNRNP27  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
KEGG ncr:NCU17009  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08648  SNRNP27  
Amino Acid Sequences MADRHARNPHRGGARDYSDRDRHGRDNRERDRDQDRSRGRGGGRGGRDDRDRDSRRYRSRSRDRHGRDHDRNRRRSRSPVRDRDGHDRRDDWARDGGRGGRRGGPKDSRRDRGDVDKDSMSKPDRDRNIRRSASPLREPEPHVKSPRSPIQAAAHDDHRLSIRSKSENVPAATTPAPAPVSFKVKGHDQRRPDSTHVEEQHQASRERTEEHEEEHVSKGRFDADPMDEDEEEDVIVEDDGLGDMASMMGFGGFGTTKNQKVKGNNVGAVRKEKKTEYRQYMNRVGGFNRPLSPSR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.6
2 0.59
3 0.6
4 0.61
5 0.58
6 0.59
7 0.58
8 0.56
9 0.58
10 0.6
11 0.65
12 0.67
13 0.72
14 0.77
15 0.81
16 0.77
17 0.74
18 0.74
19 0.73
20 0.69
21 0.68
22 0.65
23 0.61
24 0.62
25 0.62
26 0.54
27 0.5
28 0.5
29 0.48
30 0.45
31 0.48
32 0.48
33 0.47
34 0.51
35 0.48
36 0.47
37 0.5
38 0.51
39 0.5
40 0.57
41 0.62
42 0.68
43 0.74
44 0.77
45 0.77
46 0.84
47 0.86
48 0.86
49 0.87
50 0.85
51 0.86
52 0.88
53 0.88
54 0.87
55 0.88
56 0.89
57 0.89
58 0.91
59 0.9
60 0.89
61 0.83
62 0.83
63 0.83
64 0.83
65 0.84
66 0.84
67 0.81
68 0.8
69 0.8
70 0.8
71 0.77
72 0.71
73 0.64
74 0.54
75 0.51
76 0.52
77 0.48
78 0.4
79 0.39
80 0.34
81 0.31
82 0.32
83 0.34
84 0.31
85 0.33
86 0.32
87 0.31
88 0.34
89 0.37
90 0.41
91 0.45
92 0.46
93 0.54
94 0.6
95 0.61
96 0.6
97 0.6
98 0.57
99 0.57
100 0.57
101 0.5
102 0.46
103 0.41
104 0.39
105 0.36
106 0.37
107 0.3
108 0.28
109 0.27
110 0.31
111 0.36
112 0.44
113 0.51
114 0.54
115 0.62
116 0.59
117 0.57
118 0.57
119 0.57
120 0.54
121 0.52
122 0.48
123 0.41
124 0.43
125 0.45
126 0.46
127 0.44
128 0.43
129 0.41
130 0.39
131 0.38
132 0.41
133 0.44
134 0.4
135 0.35
136 0.33
137 0.33
138 0.36
139 0.37
140 0.32
141 0.27
142 0.24
143 0.23
144 0.21
145 0.17
146 0.15
147 0.13
148 0.15
149 0.17
150 0.19
151 0.21
152 0.23
153 0.27
154 0.3
155 0.3
156 0.28
157 0.24
158 0.25
159 0.23
160 0.21
161 0.16
162 0.13
163 0.13
164 0.11
165 0.13
166 0.13
167 0.18
168 0.18
169 0.19
170 0.19
171 0.26
172 0.35
173 0.39
174 0.43
175 0.44
176 0.49
177 0.54
178 0.56
179 0.51
180 0.48
181 0.46
182 0.48
183 0.45
184 0.42
185 0.4
186 0.37
187 0.4
188 0.37
189 0.34
190 0.26
191 0.27
192 0.24
193 0.24
194 0.25
195 0.27
196 0.25
197 0.26
198 0.29
199 0.28
200 0.29
201 0.29
202 0.32
203 0.25
204 0.24
205 0.22
206 0.21
207 0.19
208 0.18
209 0.19
210 0.17
211 0.18
212 0.2
213 0.23
214 0.19
215 0.2
216 0.19
217 0.15
218 0.12
219 0.1
220 0.08
221 0.05
222 0.05
223 0.04
224 0.04
225 0.04
226 0.04
227 0.04
228 0.03
229 0.03
230 0.03
231 0.03
232 0.03
233 0.03
234 0.03
235 0.02
236 0.03
237 0.02
238 0.04
239 0.04
240 0.05
241 0.1
242 0.15
243 0.21
244 0.26
245 0.31
246 0.36
247 0.42
248 0.5
249 0.56
250 0.58
251 0.57
252 0.59
253 0.6
254 0.58
255 0.63
256 0.6
257 0.54
258 0.52
259 0.54
260 0.57
261 0.62
262 0.68
263 0.68
264 0.72
265 0.76
266 0.8
267 0.82
268 0.78
269 0.72
270 0.65
271 0.57
272 0.55
273 0.51
274 0.46
275 0.41