Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

V5IPX9

Protein Details
Accession V5IPX9    Localization Confidence High Confidence Score 15.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
178-208LELSTKKWLKMRPRSRSPTRSPSPEPTRRRYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
184-206KWLKMRPRSRSPTRSPSPEPTRR
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto 4, mito 2, cyto_pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR009145  U2AF_small  
IPR000571  Znf_CCCH  
Gene Ontology GO:0000243  C:commitment complex  
GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0071004  C:U2-type prespliceosome  
GO:0089701  C:U2AF complex  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0030628  F:pre-mRNA 3'-splice site binding  
GO:0045292  P:mRNA cis splicing, via spliceosome  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG ncr:NCU03261  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00642  zf-CCCH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
PS50103  ZF_C3H1  
CDD cd12538  RRM_U2AF35  
Amino Acid Sequences MANFLASIFGTEQDKVNCSFYYKIGACRHGDRCSRKHVKPSYSQTILMPNLYHNPAFDPKNRMNASQLQNHFDAFYEDIWCEMCKYGELEELVVCDNNNDHLIGNVYARFKYEDSAQKACDDLNSRWYAARPIYCELSPVTDFREACCRLNSGEGCVRGGFCNFIHRKNPSPELERELELSTKKWLKMRPRSRSPTRSPSPEPTRRRY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.2
3 0.22
4 0.21
5 0.22
6 0.24
7 0.21
8 0.28
9 0.28
10 0.34
11 0.37
12 0.41
13 0.42
14 0.47
15 0.51
16 0.51
17 0.58
18 0.58
19 0.57
20 0.63
21 0.68
22 0.66
23 0.71
24 0.72
25 0.7
26 0.72
27 0.76
28 0.74
29 0.69
30 0.65
31 0.56
32 0.54
33 0.47
34 0.38
35 0.3
36 0.22
37 0.23
38 0.23
39 0.22
40 0.16
41 0.18
42 0.22
43 0.25
44 0.27
45 0.31
46 0.31
47 0.41
48 0.42
49 0.39
50 0.38
51 0.43
52 0.44
53 0.44
54 0.44
55 0.38
56 0.37
57 0.36
58 0.32
59 0.24
60 0.21
61 0.13
62 0.12
63 0.1
64 0.09
65 0.09
66 0.09
67 0.09
68 0.08
69 0.08
70 0.07
71 0.06
72 0.07
73 0.08
74 0.1
75 0.1
76 0.09
77 0.09
78 0.09
79 0.09
80 0.08
81 0.07
82 0.05
83 0.05
84 0.05
85 0.06
86 0.06
87 0.05
88 0.05
89 0.07
90 0.07
91 0.07
92 0.09
93 0.09
94 0.09
95 0.1
96 0.11
97 0.1
98 0.1
99 0.15
100 0.21
101 0.25
102 0.28
103 0.28
104 0.27
105 0.27
106 0.26
107 0.23
108 0.2
109 0.16
110 0.2
111 0.2
112 0.2
113 0.21
114 0.21
115 0.22
116 0.2
117 0.21
118 0.18
119 0.19
120 0.22
121 0.21
122 0.21
123 0.19
124 0.2
125 0.18
126 0.16
127 0.16
128 0.18
129 0.18
130 0.18
131 0.26
132 0.25
133 0.26
134 0.27
135 0.25
136 0.22
137 0.29
138 0.28
139 0.24
140 0.27
141 0.26
142 0.26
143 0.25
144 0.25
145 0.19
146 0.19
147 0.16
148 0.12
149 0.21
150 0.22
151 0.27
152 0.33
153 0.36
154 0.43
155 0.48
156 0.55
157 0.51
158 0.54
159 0.54
160 0.54
161 0.52
162 0.46
163 0.41
164 0.36
165 0.33
166 0.29
167 0.26
168 0.27
169 0.3
170 0.32
171 0.35
172 0.41
173 0.48
174 0.58
175 0.67
176 0.7
177 0.76
178 0.82
179 0.87
180 0.9
181 0.89
182 0.88
183 0.86
184 0.84
185 0.81
186 0.81
187 0.81
188 0.81