Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

Q7SH34

Protein Details
Accession Q7SH34    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
101-128KTPRAKKEAAPKKPKAPKKKAPLTDEQKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
77-139KTRPAAAKSKKSAAEGATGAGARAKTPRAKKEAAPKKPKAPKKKAPLTDEQKKKLRIRLLKQR
Subcellular Location(s) mito 21, nucl 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
KEGG ncr:NCU02695  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF09011  HMG_box_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
CDD cd00084  HMG-box_SF  
Amino Acid Sequences MFSQIALATARQLRAGTTLVVRTAVAASTSSTTRSAAPSFLRRSGVVFQQRGYALTRAKKTAAESDDTAATATKTNKTRPAAAKSKKSAAEGATGAGARAKTPRAKKEAAPKKPKAPKKKAPLTDEQKKKLRIRLLKQRALFKEDPKTHRVPAWSAYISEHMKDVLKEGDDIATRRGYFKTLAAQWKELSDAEKARYQAKADKAHQDGVATRAAWVLTKTPMEIEDANYARHALKRLGVTSVVHPIPDDRRPKRLRSAFLFFCMSRQKDALYAGKPLPEIAKALSEEWKSMDDAAKQPYVDNAAVDKERYLSERAAAAAAHAAA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.21
3 0.18
4 0.18
5 0.19
6 0.18
7 0.19
8 0.18
9 0.16
10 0.15
11 0.13
12 0.1
13 0.09
14 0.09
15 0.11
16 0.12
17 0.13
18 0.13
19 0.14
20 0.15
21 0.18
22 0.18
23 0.2
24 0.25
25 0.32
26 0.36
27 0.39
28 0.4
29 0.36
30 0.39
31 0.39
32 0.42
33 0.42
34 0.39
35 0.36
36 0.38
37 0.38
38 0.36
39 0.35
40 0.31
41 0.28
42 0.34
43 0.37
44 0.35
45 0.36
46 0.37
47 0.37
48 0.4
49 0.37
50 0.34
51 0.32
52 0.31
53 0.3
54 0.28
55 0.25
56 0.17
57 0.14
58 0.14
59 0.15
60 0.19
61 0.23
62 0.27
63 0.35
64 0.37
65 0.45
66 0.49
67 0.55
68 0.59
69 0.63
70 0.68
71 0.66
72 0.7
73 0.64
74 0.59
75 0.53
76 0.44
77 0.4
78 0.31
79 0.26
80 0.21
81 0.18
82 0.15
83 0.14
84 0.12
85 0.09
86 0.1
87 0.14
88 0.19
89 0.26
90 0.34
91 0.39
92 0.42
93 0.46
94 0.55
95 0.62
96 0.66
97 0.69
98 0.67
99 0.71
100 0.77
101 0.81
102 0.81
103 0.81
104 0.8
105 0.81
106 0.85
107 0.83
108 0.8
109 0.81
110 0.79
111 0.79
112 0.78
113 0.75
114 0.72
115 0.71
116 0.7
117 0.65
118 0.65
119 0.63
120 0.64
121 0.68
122 0.71
123 0.69
124 0.69
125 0.71
126 0.64
127 0.63
128 0.57
129 0.51
130 0.5
131 0.51
132 0.51
133 0.48
134 0.49
135 0.42
136 0.42
137 0.39
138 0.32
139 0.27
140 0.28
141 0.23
142 0.21
143 0.2
144 0.22
145 0.2
146 0.18
147 0.16
148 0.12
149 0.12
150 0.11
151 0.12
152 0.09
153 0.08
154 0.08
155 0.08
156 0.1
157 0.1
158 0.11
159 0.11
160 0.12
161 0.11
162 0.13
163 0.13
164 0.12
165 0.12
166 0.13
167 0.16
168 0.2
169 0.27
170 0.27
171 0.28
172 0.27
173 0.27
174 0.27
175 0.22
176 0.18
177 0.14
178 0.15
179 0.15
180 0.18
181 0.19
182 0.19
183 0.2
184 0.21
185 0.24
186 0.29
187 0.35
188 0.35
189 0.41
190 0.42
191 0.43
192 0.42
193 0.37
194 0.31
195 0.25
196 0.23
197 0.16
198 0.13
199 0.11
200 0.11
201 0.1
202 0.1
203 0.1
204 0.1
205 0.11
206 0.11
207 0.1
208 0.11
209 0.13
210 0.13
211 0.14
212 0.18
213 0.18
214 0.19
215 0.18
216 0.19
217 0.17
218 0.19
219 0.19
220 0.14
221 0.17
222 0.2
223 0.21
224 0.22
225 0.22
226 0.21
227 0.21
228 0.26
229 0.22
230 0.19
231 0.18
232 0.19
233 0.23
234 0.29
235 0.37
236 0.34
237 0.44
238 0.49
239 0.55
240 0.62
241 0.65
242 0.66
243 0.63
244 0.68
245 0.61
246 0.6
247 0.59
248 0.48
249 0.45
250 0.45
251 0.4
252 0.34
253 0.32
254 0.29
255 0.27
256 0.32
257 0.33
258 0.27
259 0.3
260 0.29
261 0.3
262 0.29
263 0.28
264 0.25
265 0.19
266 0.19
267 0.15
268 0.18
269 0.17
270 0.18
271 0.24
272 0.23
273 0.23
274 0.23
275 0.23
276 0.2
277 0.21
278 0.23
279 0.21
280 0.25
281 0.28
282 0.3
283 0.28
284 0.28
285 0.28
286 0.29
287 0.25
288 0.22
289 0.19
290 0.22
291 0.23
292 0.23
293 0.21
294 0.19
295 0.2
296 0.21
297 0.23
298 0.19
299 0.2
300 0.22
301 0.22
302 0.21
303 0.19
304 0.17